单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 26841 - 26860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26841 | 2024-08-09 |
Multilineage communication regulates human liver bud development from pluripotency
2017-06-22, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature22796
PMID:28614297
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，从多能性细胞出发，在二维和三维培养系统中重建肝细胞样谱系进展，并探讨异型细胞间相互作用对肝芽发育的影响 | 首次通过三维肝芽类器官模型，揭示了肝细胞前体细胞在肝芽发育中的谱系分化和迁移特征，以及血管内皮生长因子在促进内皮网络形成和肝细胞前体分化中的作用 | NA | 探讨多谱系细胞间通信在人肝芽从多能性细胞发育过程中的作用 | 肝细胞样谱系进展、肝芽类器官发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 26842 | 2024-08-09 |
Generation of Single-Cell Transcript Variability by Repression
2017-Jun-19, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2017.05.028
PMID:28602650
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，探讨了Dictyostelium分化过程中转录变异性的产生机制，发现这种变异性主要由抑制而非激活驱动 | 本研究揭示了细胞间差异的产生可能是转录调控基本机制的直接结果，并提出了一个简单的转录产物生成模型，其中表达由转录事件的频率而非幅度控制 | NA | 探讨基因表达变异性的产生机制及其在细胞命运多样性中的作用 | Dictyostelium分化过程中的单细胞转录变异性 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录数据 | NA |
| 26843 | 2024-08-09 |
Single-Cell mRNA Sequencing in Cancer Research: Integrating the Genomic Fingerprint
2017, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2017.00073
PMID:28620412
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综述 | 本文综述了单细胞mRNA测序（scRNA-seq）在癌症研究中的最新进展，特别是其在评估肿瘤内异质性中的应用 | scRNA-seq与DNA测序结合，能够推断基因组改变对基因表达的影响，并可靠地区分肿瘤细胞与非肿瘤细胞 | 讨论了scRNA-seq与DNA测序结合的挑战和前景 | 评估肿瘤内异质性 | 单细胞mRNA测序在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26844 | 2024-08-09 |
Revealing allele-specific gene expression by single-cell transcriptomics
2017-09, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2017.05.029
PMID:28578186
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在常染色体和X染色体基因背景下研究等位基因特异性表达（ASE）的最新进展，并回顾了用于识别单倍型相位的生物信息学工具。 | 单细胞测序技术提供了前所未有的分辨率和规模，对生物学和医学产生了重大影响。 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在等位基因特异性表达研究中的应用。 | 常染色体和X染色体基因的等位基因特异性表达。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 26845 | 2024-08-09 |
The comparison of the performance of four whole genome amplification kits on ion proton platform in copy number variation detection
2017-08-31, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20170252
PMID:28572171
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研究论文 | 本文比较了四种全基因组扩增试剂盒在Ion Proton平台上检测拷贝数变异的性能 | 首次针对Ion Proton平台进行不同全基因组扩增策略的性能比较研究 | NA | 评估四种商业化全基因组扩增试剂盒在Ion Proton平台上检测拷贝数变异的性能 | 六种不同核型的细胞系 | 基因组学 | NA | 全基因组扩增 | NA | 基因组数据 | 六种不同核型的细胞系 |
| 26846 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Expanded Clones of Islet Antigen-Reactive CD4+ T Cells in Peripheral Blood of Subjects with Type 1 Diabetes
2017-07-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1700172
PMID:28566371
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了1型糖尿病患者和健康对照组外周血中胰岛抗原反应性CD4+记忆T细胞的TCR克隆型和转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了1型糖尿病患者外周血中胰岛抗原反应性CD4+ T细胞的扩展克隆，并发现这些克隆具有独特的抗原特异性和表型 | 研究样本量较小，且未涉及更广泛的疾病阶段和人群 | 探讨1型糖尿病患者外周血中胰岛抗原反应性CD4+ T细胞的特征及其在疾病进展中的作用 | 1型糖尿病患者和健康对照组的外周血中的胰岛抗原反应性CD4+记忆T细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及1型糖尿病患者和健康对照组的外周血样本 |
| 26847 | 2024-08-09 |
De Novo Gene Expression Reconstruction in Space
2017-07, Trends in molecular medicine
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.molmed.2017.05.004
PMID:28571832
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研究论文 | 本文讨论了空间中新基因表达重建的下一代方法，并提出了更有效的方法来检测基因表达的远距离空间变化 | 提出了更有效的方法来检测基因表达的远距离空间变化，并讨论了未来用于组织中生物途径和过程可视化的原位测序化学 | NA | 探讨空间中新基因表达重建的方法，以更好地应用于人类健康和疾病状况 | 基因表达的空间重建和远距离空间变化的检测 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，原位RNA成像 | NA | 基因组数据 | NA |
| 26848 | 2024-08-09 |
Defining epithelial cell dynamics and lineage relationships in the developing lacrimal gland
2017-07-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.150789
PMID:28576768
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序和其他分子工具，揭示了泪腺发育过程中的新型细胞身份和上皮细胞谱系动态 | 首次展示了泪腺从早期发育阶段开始由多种免疫、上皮和间充质细胞谱系组成，并揭示了上皮细胞谱系在发育过程中的转录状态变化 | NA | 探究泪腺发育过程中的细胞类型和谱系关系 | 泪腺的上皮细胞动态和谱系关系 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 多种免疫、上皮和间充质细胞谱系 |
| 26849 | 2024-08-09 |
Controlled Human Malaria Infection Leads to Long-Lasting Changes in Innate and Innate-like Lymphocyte Populations
2017-07-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1601989
PMID:28576979
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研究论文 | 本研究通过分析坦桑尼亚人群中受控人类疟疾感染（CHMI）的血样，探讨了先天性淋巴细胞及其类似细胞群在感染后的长期变化 | 发现疟疾感染后，先天性淋巴细胞类似细胞群的变化持续数月，且这种变化由类似稳态扩增的机制介导 | 研究仅限于坦桑尼亚的特定人群，可能限制了结果的普遍性 | 探讨疟疾感染后人体先天性淋巴细胞群的长期变化及其对后续感染和疫苗设计的影响 | 先天性淋巴细胞及其类似细胞群在疟疾感染后的变化 | NA | 疟疾 | 单细胞RNA测序和TCR αβ链使用分析 | NA | 血液样本 | 坦桑尼亚的志愿者群体 |
| 26850 | 2024-08-09 |
Early Detection of Cancer in Blood Using Single-Cell Analysis: A Proposal
2017-07, Trends in molecular medicine
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.molmed.2017.05.005
PMID:28587830
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研究论文 | 本文探讨了利用单细胞基因组分析血液进行癌症早期检测的潜力 | 提出了一种基于稀疏单细胞测序的拷贝数变异模式筛查方法 | 目前仅基于模拟分析，实际应用中需进一步验证 | 研究单细胞基因组分析在血液中早期检测癌症的可行性 | 单细胞基因组数据和癌症拷贝数变异模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 多个已发表的肿瘤样本 |
| 26851 | 2024-08-09 |
Single-cell entropy for accurate estimation of differentiation potency from a cell's transcriptome
2017-06-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms15599
PMID:28569836
|
研究论文 | 本文通过计算单细胞转录组在交互网络中的信号混杂度（熵），展示了如何准确估计单细胞的分化潜能 | 提出了一种新的方法，通过计算信号熵来更准确和稳健地估计单细胞的分化潜能，无需特征选择 | NA | 研究如何量化单细胞的分化潜能 | 单细胞的分化潜能 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq | NA | 转录组数据 | 超过7,000个单细胞 |
| 26852 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Maps Development of Human Germline Cells and Gonadal Niche Interactions
2017-06-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2017.05.009
PMID:28575695
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26853 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-Seq of Defined Subsets of Retinal Ganglion Cells
2017-05-22, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/55229
PMID:28570514
|
研究论文 | 本文提出了一种新技术，用于在分离和测序前识别细胞的形态和功能，以便更容易地鉴定亚型特异性标记 | 该技术克服了单细胞RNA测序的许多障碍，并可能适用于非神经元细胞类型和具有微小变化的稀有细胞群体 | 需要严格的验证方法来确保聚类包含具有相同功能的细胞 | 旨在识别定义各种细胞亚群的基因表达，并研究与特定视觉功能相关的脑目标 | 视网膜神经节细胞的亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 许多单细胞的测序深度超过2000万读数 |
| 26854 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Sequencing: Assessment of Differential Expression Analysis Methods
2017, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2017.00062
PMID:28588607
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研究论文 | 本文比较了四种单细胞RNA测序差异表达分析工具以及两种最初为批量RNA测序数据开发但广泛应用于单细胞数据的方法 | 探讨了单细胞差异表达分析的前景，并探索了方法在四种不同数据分布场景下的性能 | 研究结果表明难以确定最佳表现的工具，并指出需要改进单细胞RNA测序数据分析方法以提高结果的准确性 | 评估和比较单细胞RNA测序差异表达分析方法 | 单细胞RNA测序数据分析工具 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个真实数据集和一个合成数据集 |
| 26855 | 2024-08-09 |
ASAP: a web-based platform for the analysis and interactive visualization of single-cell RNA-seq data
2017-Oct-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btx337
PMID:28541377
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研究论文 | 本文介绍了一个名为ASAP的网络平台，用于单细胞RNA测序数据的分析和交互式可视化 | ASAP平台整合了多种常用算法和高级可视化工具，使缺乏计算专业知识的研究人员也能轻松处理和分析单细胞RNA测序数据 | NA | 开发一个用户友好的网络平台，用于单细胞RNA测序数据的全面分析和可视化 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 91个鼠细胞，涉及五种不同的细胞类型 |
| 26856 | 2024-08-09 |
Digital Assays Part II: Digital Protein and Cell Assays
2017-08, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/2472630317705681
PMID:28548029
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综述 | 本文是关于数字分析技术的第二部分，重点介绍了数字蛋白质和细胞分析方法 | 数字分析技术通过将样本分隔成多个容器，每个容器包含离散数量的生物实体，从而提高了核酸定量、蛋白质及其酶活性测量以及单细胞基因型和表型探测的精确度 | NA | 旨在为有兴趣将数字分析技术纳入其工作流程的科学家提供广泛的视角 | 数字酶分析、数字酶联免疫分析（ELISA）和数字细胞分析 | 生物技术 | NA | 数字分析技术 | NA | 蛋白质和细胞 | NA |
| 26857 | 2024-08-09 |
Plant genetics: Spatial transcriptomics in plants
2017-07, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg.2017.41
PMID:28529334
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26858 | 2024-08-09 |
Identification of innate lymphoid cells in single-cell RNA-Seq data
2017-07, Immunogenetics
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s00251-017-1002-x
PMID:28534222
|
研究论文 | 本文提出并验证了一种新的框架，用于使用单细胞RNA测序数据在转录组水平上研究先天淋巴细胞（ILCs） | 该框架结合了无监督聚类和基于小鼠ILC基因表达数据训练的新型细胞类型分类器，仅依赖于跨脊椎动物保守的基因，因此原则上适用于任何脊椎动物物种 | NA | 研究ILC2细胞在单细胞转录组数据中的识别及其在远缘脊椎动物物种中的保守性 | 先天淋巴细胞（ILCs）及其亚型ILC2细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类和细胞类型分类器 | 基因表达数据 | 小鼠和人类ILC基因表达数据 |
| 26859 | 2024-08-09 |
Lineage Establishment and Progression within the Inner Cell Mass of the Mouse Blastocyst Requires FGFR1 and FGFR2
2017-06-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2017.05.003
PMID:28552559
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研究论文 | 本文研究了在小鼠胚泡的内细胞团（ICM）中，纤维母细胞生长因子受体1（FGFR1）和FGFR2在原始内胚层（PrE）和多能外胚层（EPI）分化中的作用 | 通过单细胞分辨率的定量成像和单细胞转录组学，结合野生型和Fgf受体突变胚胎的研究，揭示了FGFR1和FGFR2在ICM细胞中的独特和加性活动 | NA | 探究FGF4信号在小鼠胚泡ICM细胞中的受体响应机制 | 小鼠胚泡的内细胞团（ICM）中的FGFR1和FGFR2 | NA | NA | 单细胞分辨率定量成像，单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 534个单ICM细胞 |
| 26860 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-Seq unveils tumor microenvironment
2017-Jun, BMB reports
IF:2.9Q3
DOI:10.5483/bmbrep.2017.50.6.086
PMID:28539161
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组分析技术揭示肿瘤微环境 | 本文通过单细胞RNA测序技术，深入解析了肿瘤微环境中复杂的细胞类型和亚群 | NA | 研究肿瘤微环境的组成和功能，探索其作为抗癌靶点的潜力 | 肿瘤微环境中的细胞类型和亚群 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |