单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 26821 - 26840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26821 | 2024-08-09 |
Gene expression profiles of brain endothelial cells during embryonic development at bulk and single-cell levels
2017-07-11, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.aag2476
PMID:28698213
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研究论文 | 本文通过翻译核糖体亲和纯化和单细胞RNA测序技术，生成了小鼠胚胎脑内皮细胞的高分辨率基因表达谱，以探索脑血管发育和分化的分子机制 | 本文首次在批量和单细胞水平上分析了脑内皮细胞在胚胎发育过程中的基因表达变化，并识别了与血脑屏障成熟相关的特定转录因子 | NA | 探索脑内皮细胞在胚胎发育过程中的分子机制 | 小鼠胚胎脑内皮细胞的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎脑内皮细胞 |
| 26822 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of East-Asian pancreatic islets cells
2017-07-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-05266-4
PMID:28694456
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了东亚人群胰腺胰岛细胞的基因表达特征 | 首次在东亚人群中进行胰腺胰岛细胞的单细胞RNA测序，并发现了与欧洲人群不同的基因表达特征 | 样本量较小，仅包括三名东亚非糖尿病患者 | 评估东亚人群胰腺胰岛细胞的基因表达特征 | 东亚人群的胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 448个胰岛细胞，来自三名东亚非糖尿病患者 |
| 26823 | 2024-08-09 |
Massively parallel nanowell-based single-cell gene expression profiling
2017-07-07, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-017-3893-1
PMID:28687070
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研究论文 | 本文介绍了一种新型纳米孔单细胞RNA测序系统ICELL8，该系统能够高效处理数千个细胞样本，提供单细胞水平的基因表达谱分析 | ICELL8系统采用含有5,184个纳米孔的微芯片，每个纳米孔包含预印的寡核苷酸编码多聚dT、独特的孔条形码和独特的分子标识符，实现了简单且高通量的单细胞表达谱分析 | NA | 开发一种简单且高通量的单细胞表达谱分析方法 | 人源和鼠源的培养细胞以及鼠源的实体组织样本 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过一千个人源和鼠源培养细胞以及468个鼠源胰腺胰岛细胞 |
| 26824 | 2024-08-09 |
Vibrissa sensory neurons: Linking distinct morphology to specific physiology and function
2018-Jan-01, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本文探讨了啮齿动物的触须感觉神经元，通过形态学和电生理特征的结合，研究其生理特性和功能 | 文章提出使用单细胞转录组测序和光遗传学辅助的在体电生理技术，填补了触须感觉系统中形态学定义的神经元类型与其生理特性和功能之间的知识空白 | NA | 旨在揭示触须感觉神经元的形态学特征与其生理功能之间的联系 | 啮齿动物的触须感觉神经元及其在物体定位和辨别中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序，光遗传学 | NA | 电生理记录 | 多个不同类型的三叉神经（TG）感觉神经元 |
| 26825 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptomics of pluripotent stem cells: reprogramming and differentiation
2017-Oct, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2017.06.003
PMID:28675884
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在多能干细胞重编程和分化中的应用及其最新进展和重要发现 | 单细胞转录组学技术提供了高分辨率的细胞状态识别和细胞群体内异质性解析的新视角 | NA | 探讨单细胞转录组学在多能干细胞研究中的应用 | 多能干细胞的重编程和分化过程 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 26826 | 2024-08-09 |
Human induced pluripotent stem cell (hiPSC)-derived neurons respond to convulsant drugs when co-cultured with hiPSC-derived astrocytes
2017-08-15, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2017.06.010
PMID:28666936
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研究论文 | 本文研究了人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的神经元在与hiPSC衍生的星形胶质细胞共培养时对致痉挛药物的反应 | 首次探讨了hiPSC衍生的神经元与hiPSC衍生的星形胶质细胞共培养系统在药物诱导癫痫风险评估中的应用 | 尚未完全解决hiPSC衍生的神经元在药物诱导癫痫风险评估中的应用，尤其是在与hiPSC衍生的星形胶质细胞共培养的情况下 | 探讨hiPSC衍生的神经元在与hiPSC衍生的星形胶质细胞共培养时如何用于评估药物诱导的癫痫风险 | hiPSC衍生的神经元和星形胶质细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 共培养8周的hiPSC衍生的神经元与星形胶质细胞 |
| 26827 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing made simple
2017-07-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/547125a
PMID:28682345
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26828 | 2024-08-09 |
Identifying Cell Subpopulations and Their Genetic Drivers from Single-Cell RNA-Seq Data Using a Biclustering Approach
2017-Jul, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2017.0049
PMID:28657835
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研究论文 | 本文介绍了一种基于SNN-Cliq算法的快速简单迭代双聚类方法BiSNN-Walk，用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞亚群及其相关的遗传驱动因子 | BiSNN-Walk方法返回一个按可靠性排序的聚类列表，并根据基因与相关细胞聚类的关联程度对基因进行排序，使结果更具生物学解释性 | NA | 开发一种新的双聚类方法，用于分析单细胞RNA测序数据，以识别细胞亚群及其遗传驱动因子 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群及其遗传驱动因子 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双聚类方法 | 基因表达数据 | 三项大型单细胞RNA测序研究 |
| 26829 | 2024-08-09 |
IFNγ-Dependent Tissue-Immune Homeostasis Is Co-opted in the Tumor Microenvironment
2017-Jun-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2017.06.016
PMID:28666115
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研究论文 | 本文探讨了IFNγ依赖的组织免疫稳态在肿瘤微环境中的作用 | 发现IFNγ依赖的稳态程序在多种人类原发性肿瘤中富集，并影响患者的生存 | NA | 研究免疫稳态如何影响肿瘤监测及其在肿瘤微环境中的作用 | 免疫单核吞噬细胞在健康组织中的稳态程序及其在肿瘤中的作用 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类原发性肿瘤样本，包括黑色素瘤 |
| 26830 | 2024-08-09 |
BRIE: transcriptome-wide splicing quantification in single cells
2017-06-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-017-1248-5
PMID:28655331
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研究论文 | 本文介绍了BRIE模型，用于单细胞转录组中剪接事件的定量分析 | BRIE模型通过学习序列特征的先验分布，解决了单细胞RNA测序技术在RNA加工事件分析中的局限性 | NA | 探索单细胞RNA测序实验中RNA加工的随机性 | 单细胞转录组中的剪接事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯层次模型 | 转录组数据 | NA |
| 26831 | 2024-08-09 |
Independent regulation of gene expression level and noise by histone modifications
2017-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1005585
PMID:28665997
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研究论文 | 研究通过计算分析单细胞RNA测序数据和酵母流式细胞术实验，探讨了组蛋白修饰在人类胚胎细胞和酵母中独立调控基因表达水平和噪声的机制 | 揭示了组蛋白修饰通过影响基因表达的爆发大小和频率，实现对基因表达水平和噪声的独立调控，扩展了“组蛋白密码”假说 | NA | 探讨组蛋白修饰如何独立调控基因表达水平和噪声 | 人类胚胎细胞和酵母中的基因表达噪声 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 26832 | 2024-08-09 |
Time-lapse observation and transcriptome analysis of a case with repeated multiple pronuclei after IVF/ICSI
2017-Sep, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-017-0972-9
PMID:28643089
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研究论文 | 本研究通过时间流逝观察和转录组分析，探讨了一位患者在接受体外受精（IVF）和胞浆内单精子注射（ICSI）后反复形成多原核合子的原因 | 本研究首次通过时间流逝观察和转录组分析，识别了影响原核形成的几个候选基因，为不孕症提供了新的病因 | 本研究为个案研究，样本量较小，需要进一步的大样本研究验证结果 | 探讨IVF/ICSI后反复形成多原核合子的原因 | 一位不明原因原发性不孕患者的多原核合子 | NA | 不孕症 | 荧光原位杂交（FISH），单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者1例，捐赠者4例 |
| 26833 | 2024-08-09 |
Inflammatory Ly6Chi monocytes and their conversion to M2 macrophages drive atherosclerosis regression
2017-Aug-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI75005
PMID:28650342
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研究论文 | 研究探讨了在正常血脂小鼠中，炎症性Ly6Chi单核细胞转化为M2巨噬细胞在动脉粥样硬化消退中的起源和功能需求 | 首次证实了Ly6Chi炎症性单核细胞的持续招募及其通过STAT6依赖性极化为M2状态在动脉粥样硬化炎症消退和斑块消退中的必要性 | 研究仅在实验小鼠模型中进行，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 开发促进动脉粥样硬化消退的治疗方法 | 动脉粥样硬化斑块中的M2巨噬细胞和Ly6Chi单核细胞 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了WT、Ccr2-/-、Cx3cr1-/-和Ccr5-/-等多种基因型的小鼠进行移植实验 |
| 26834 | 2024-08-09 |
A TRPV1-to-secretagogin regulatory axis controls pancreatic β-cell survival by modulating protein turnover
2017-07-14, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.201695347
PMID:28637794
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研究论文 | 本文探讨了TRPV1通道通过招募Sp1转录因子诱导secretagogin表达，从而调控胰腺β细胞生存和胰岛素释放的机制 | 揭示了TRPV1与secretagogin之间的调控轴，这一机制在糖尿病胰腺中对维持β细胞结构完整性和信号传递能力至关重要 | NA | 研究TRPV1与secretagogin在胰腺β细胞生存和胰岛素释放中的调控作用 | 胰腺β细胞、TRPV1通道、secretagogin蛋白 | 生物医学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自糖尿病供体的β细胞和secretagogin敲除小鼠的胰腺胰岛 |
| 26835 | 2024-08-09 |
Reconstructing cell cycle pseudo time-series via single-cell transcriptome data
2017-06-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-00039-z
PMID:28630425
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研究论文 | 本文开发了一种基于旅行商问题和隐马尔可夫模型的计算方法reCAT，用于从非同步单细胞转录组数据中恢复细胞周期时间序列 | reCAT方法能够准确可靠地恢复细胞周期，并展示细胞周期相关基因的表达波峰，以及细胞周期中的甲基化变化 | NA | 研究单细胞转录组数据中的细胞周期解析 | 单细胞转录组数据中的细胞周期阶段 | 生物信息学 | NA | 单细胞mRNA测序 | 隐马尔可夫模型 | 转录组数据 | 多个数据集 |
| 26836 | 2024-08-09 |
Dosage compensation in the process of inactivation/reactivation during both germ cell development and early embryogenesis in mouse
2017-06-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-03829-z
PMID:28623283
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研究论文 | 本研究通过获取小鼠在生殖细胞发育和早期胚胎发生过程中经历失活/再激活的细胞的RNA-seq数据，特别是单细胞RNA-seq数据，计算X:A比率，以探讨哺乳动物中X染色体的上调机制。 | 本研究提供了直接证据，表明单个活跃的X染色体的平均基因剂量被上调，以达到与两个活跃的X染色体和两份常染色体相似的水平。 | NA | 探讨哺乳动物中X染色体的失活和上调机制。 | 小鼠在生殖细胞发育和早期胚胎发生过程中经历失活/再激活的细胞。 | NA | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据，特别是单细胞RNA-seq数据 | 多个小鼠预植入胚胎的单个细胞 |
| 26837 | 2024-08-09 |
Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing
2017-Jun-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2017.05.035
PMID:28622514
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了肝癌患者肿瘤浸润T细胞的转录组特征 | 首次详细描述了肝癌中11种T细胞亚群的分子和功能特性及其发育轨迹，并鉴定了各亚群的特征基因 | 研究样本仅来自六名肝细胞癌患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示肝癌中浸润T细胞的景观，为免疫治疗和临床反应预测提供依据 | 肝细胞癌患者的肿瘤浸润T细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 5,063个单个T细胞，来自六名肝细胞癌患者的外周血、肿瘤和邻近正常组织 |
| 26838 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome of early embryos and cultured embryonic stem cells of cynomolgus monkeys
2017, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/sdata.2017.67
PMID:28649393
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研究论文 | 本文提供了食蟹猴早期胚胎和培养的胚胎干细胞的单细胞转录组数据集 | 首次提供了食蟹猴早期胚胎和胚胎干细胞的单细胞转录组数据，填补了灵长类动物胚胎发育研究的空白 | NA | 研究灵长类动物，包括人类的发育生物学过程 | 食蟹猴的早期胚胎细胞、原始生殖细胞和胚胎干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 26839 | 2024-08-09 |
Somatosensory Neuron Typing with High-Coverage Single-Cell RNA Sequencing and Functional Analysis
2018-Feb, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-017-0147-9
PMID:28612318
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综述 | 本文综述了基于单细胞RNA测序和功能分析的背根神经节（DRG）神经元分类方法及其在体感神经元研究中的应用 | 介绍了基于单细胞RNA测序和功能分析的DRG神经元分类方法 | NA | 探讨体感神经元的基因表达谱及其在体感信号生成、传递和调控中的作用 | 背根神经节（DRG）神经元的基因表达和功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26840 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-sequencing of the brain
2017-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1186/s40169-017-0150-9
PMID:28597408
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在解析大脑细胞异质性及其特定功能和状态中的应用 | scRNA-seq技术使得研究人员能够在大脑多个区域中识别出多种细胞亚群，确定基因特征和新细胞标记物，并解决功能差异 | 由于大脑的复杂性，仍有许多工作需要完成，包括定义特定的大脑细胞类型和功能 | 旨在通过scRNA-seq技术深入理解大脑细胞的基因组、转录组和表观基因组景观，以及它们在发育、健康和疾病中的整体功能 | 哺乳动物大脑中的细胞异质性及其特定功能和状态 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及多个小鼠大脑区域的研究 |