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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2661 - 2680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2661 | 2025-10-06 |
Anatomical Region-Specific Transcriptomic Signatures and the Role of Epithelial Cells in Pterygium Inflammation: A Multi-Omics Analysis
2025-Aug-01, Translational vision science & technology
IF:2.6Q2
DOI:10.1167/tvst.14.8.13
PMID:40772680
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示翼状胬肉不同解剖区域的转录组特征及上皮细胞在炎症中的作用 | 首次区分翼状胬肉主体区和附属区的分子特征，发现上皮细胞在ANPTL、IL1和KLK信号网络中的关键作用 | 样本量较小（6例批量RNA-seq，2例单细胞RNA-seq） | 理解翼状胬肉不同解剖区域的细胞和分子模式差异，重点关注炎症和线粒体能量代谢 | 翼状胬肉患者组织样本 | 生物信息学 | 翼状胬肉 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | 转录组数据 | 6例批量RNA-seq样本，2例单细胞RNA-seq样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2662 | 2025-10-06 |
CYCLONE: recycle contrastive learning for integrating single-cell gene expression data
2025-Jul-30, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06214-0
PMID:40739171
|
研究论文 | 提出一种基于循环对比学习的单细胞基因表达数据整合方法CYCLONE | 采用循环对比学习网络，通过循环更新MNN对并增强KNN对来识别批次特异性细胞类型，避免批次效应过度校正 | NA | 整合单细胞转录组测序数据以减少批次效应 | 单细胞基因表达数据 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习网络, VAE | 基因表达数据 | 模拟和真实scRNA-seq数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2663 | 2025-10-06 |
Columbianadin targets TRIM7 to maintain P2X7 palmitoylation, inhibiting cuproptosis in synovial M2 macrophages
2025-Jul-30, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157091
PMID:40768810
|
研究论文 | 本研究揭示了天然植物化学物质Columbianadin通过靶向TRIM7维持P2X7棕榈酰化，从而抑制滑膜M2巨噬细胞铜死亡的分子机制 | 首次鉴定TRIM7作为新型铜死亡警报蛋白，并阐明了CBN通过TRIM7-ZDHHC5-P2X7轴调控铜流出的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值仍需进一步验证 | 探究CBN治疗创伤性滑膜炎的分子机制，为其临床转化提供理论依据 | 小鼠滑膜组织和M2巨噬细胞 | 分子生物学 | 创伤性滑膜炎 | 单细胞测序,生物信息学分析,荧光共定位,ICP-MS,酰基-生物素交换实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质定位数据,金属离子浓度数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2664 | 2025-10-06 |
Exploration and Application of Malignant Cell Heterogeneity Analysis with Single-Cell Transcriptome Sequencing Technology
2025-Jul-25, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2025.0836
PMID:40768639
|
综述 | 探讨单细胞转录组测序技术在恶性肿瘤细胞异质性分析中的应用与前景 | 提出将单细胞测序技术的研究重点从肿瘤微环境中的免疫和基质细胞转向恶性肿瘤细胞本身的范式转变 | 当前单细胞RNA测序应用仍主要集中于免疫和基质细胞群体，对肿瘤细胞异质性的研究相对不足 | 阐明肿瘤细胞异质性，提高诊断精度和治疗效果 | 恶性肿瘤细胞及其异质性 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2665 | 2025-10-06 |
Role of APE1 redox function in chronic rhinosinusitis pathogenesis: Implications for targeted therapy
2025-Jul-17, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.07.004
PMID:40683569
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研究论文 | 本研究探讨APE1氧化还原功能在慢性鼻窦炎发病机制中的作用及其靶向治疗潜力 | 首次系统阐明APE1氧化还原功能在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病中的关键作用，并验证其抑制剂C10的治疗效果 | 研究样本来源和数量未明确说明，动物模型与人体病理可能存在差异 | 阐明APE1氧化还原功能在慢性鼻窦炎发病机制中的作用并评估其靶向治疗潜力 | 人类鼻组织、CRS小鼠模型、气液界面培养的人鼻上皮细胞和BEAS-2B细胞 | 病理机制研究 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序、免疫组化、Western blot、定量RT-PCR、转录组分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2666 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptomics map senescent vascular cells in arterial remodeling during atherosclerosis in mice
2025-Jul-14, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00889-z
PMID:40660002
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术绘制了小鼠动脉粥样硬化过程中衰老血管细胞的图谱 | 首次系统揭示了动脉粥样硬化中衰老血管细胞的异质性，并鉴定出包含Spp1、Ctsb和Tnfrsf11b的血管特异性衰老转录组特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类验证仅限于体外VSMC衰老模型 | 系统研究动脉粥样硬化中衰老血管细胞的异质性及其在血管重塑中的作用 | 小鼠主动脉血管细胞（血管平滑肌细胞、成纤维细胞、T细胞）和人类VSMC体外模型 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 两种小鼠动脉粥样硬化模型（p16-tdTomato和Ldlr;p16-3MR） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2667 | 2025-10-06 |
miRNA centered regulatory networks identify FN1 and miR27b as metastatic drivers in HPV negative head and neck cancer
2025-Jul-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-08646-3
PMID:40593296
|
研究论文 | 本研究通过构建miRNA中心调控网络，识别了FN1和miR-27b作为HPV阴性头颈癌转移的关键驱动因子 | 开发了基于miRNA调控网络的转移预测模型，在大型HPV阴性HNSC队列中验证了FN1/miR-27b轴在转移中的作用机制 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步的功能验证和临床前瞻性研究 | 揭示HPV阴性头颈鳞状细胞癌转移的调控机制并开发预测模型 | HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 头颈癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，体外功能验证 | miRNA中心调控网络模型 | RNA-seq数据，单细胞RNA-seq数据 | 333例HPV阴性HNSC肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2668 | 2025-10-06 |
Identification of MACF1 as a causative gene of generalised epilepsy
2025-Jun-24, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2025-110699
PMID:40350249
|
研究论文 | 本研究通过全外显子测序发现MACF1基因是全面性癫痫的潜在致病基因 | 首次将MACF1基因与全面性癫痫联系起来，揭示了其双等位基因错义变异与癫痫的关联 | 样本量相对较小，仅包含10名无关患者 | 探索MACF1基因在癫痫和神经发育中的作用 | 来自中国癫痫基因1.0项目的全面性癫痫患者队列 | 医学遗传学 | 癫痫 | 全外显子测序, 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据, 基因表达数据 | 10名无关患者 | NA | 全外显子测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 2669 | 2025-10-06 |
Nanoparticles may influence mast cells gene expression profiles without affecting their degranulation function
2025-06, Nanomedicine : nanotechnology, biology, and medicine
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.nano.2025.102818
PMID:40185352
|
研究论文 | 开发了一种体外监测纳米颗粒对IgE依赖性肥大细胞脱颗粒影响的方法 | 首次通过单细胞测序揭示纳米材料对肥大细胞基因表达谱的影响与其脱颗粒功能的不一致性 | 仅为体外研究，未进行体内验证 | 评估纳米颗粒对肥大细胞功能的影响 | 肥大细胞 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 七种纳米材料（四种临床级纳米药物和三种商业研究级纳米材料） | NA | NA | NA | NA |
| 2670 | 2025-10-06 |
Comprehensive single-cell profiling of T and B cell subsets in mice reveals impacts on memory immune responses in FMDV infection
2025-05, Virology
IF:2.8Q3
DOI:10.1016/j.virol.2025.110496
PMID:40090183
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析FMDV感染对小鼠T细胞和B细胞亚群记忆免疫反应的影响 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统揭示FMDV感染对记忆免疫细胞的影响机制，并发现Fos相关基因的关键作用 | 研究工具有限，仅针对小鼠脾脏细胞进行分析 | 研究FMDV感染对记忆免疫反应的影响机制 | 小鼠脾脏中的T细胞和B细胞亚群 | 免疫学 | 口蹄疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2671 | 2025-10-06 |
Activated polyreactive B cells are clonally expanded in autoantibody positive and patients with recent-onset type 1 diabetes
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115425
PMID:40117290
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示1型糖尿病患者中胰岛抗原反应性B细胞的基因表达和BCR谱系变化 | 首次在1型糖尿病中发现胰岛抗原反应性B细胞存在克隆扩增和多反应性特征 | 样本量有限，仅分析了外周血中的B细胞而未直接研究胰腺组织 | 探究1型糖尿病中自身反应性B细胞的表型和功能特征 | 非糖尿病自身抗体阴性一级亲属、自身抗体阳性者和新发1型糖尿病供者的外周血胰岛抗原反应性B细胞 | 单细胞基因组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 | 来自三类供者群体的外周血B细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2672 | 2025-10-06 |
SIGMAR1 screened by a GPCR-related classifier regulates endoplasmic reticulum stress in bladder cancer
2025-Apr-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06393-7
PMID:40211230
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研究论文 | 本研究通过构建GPCR-TME分类器筛选出SIGMAR1，并验证其在膀胱癌中通过调节内质网应激影响肿瘤进展的机制 | 首次构建膀胱癌相关的GPCR-TME分类器，并发现SIGMAR1通过调节内质网应激影响膀胱癌进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多独立队列验证GPCR-TME分类器的临床应用价值 | 探究GPCR相关基因在膀胱癌中的作用机制，特别是SIGMAR1对内质网应激的调控功能 | 膀胱癌患者数据、膀胱癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 免疫治疗反应分析, 蛋白质印迹, 基因集富集分析, CIBERSORT免疫细胞浸润分析 | GPCR-TME分类器 | 批量测序数据, 单细胞RNA测序数据, 临床病理数据 | 从公共数据库获取的多组膀胱癌数据集，包含细胞系和组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2673 | 2025-10-06 |
Protocol to boost the robustness and accuracy of spatial transcriptomics algorithms using ensemble techniques
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103608
PMID:39879360
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研究论文 | 提出一种使用加权集成方法提升空间转录组学算法稳健性和准确性的协议 | 开发了WEST协议，首次将集成技术系统应用于空间转录组学算法优化 | NA | 提升空间转录组学算法的稳健性和准确性 | 空间转录组学数据分析算法 | 空间转录组学 | NA | 集成学习 | 加权集成方法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2674 | 2025-10-06 |
A unified framework for cell-type-specific eQTL prioritization by integrating bulk and scRNA-seq data
2025-Feb-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2024.12.018
PMID:39824189
|
研究论文 | 提出一种整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据的统计框架IBSEP，用于增强细胞类型特异性eQTL的优先排序 | 开发了首个整合bulk和单细胞RNA-seq数据的统一框架，通过分层线性模型结合两种数据类型的优势 | 样本量相对较小，存在技术限制 | 提高细胞类型特异性eQTL的识别精度，揭示复杂疾病的遗传基础 | 外周血单核细胞和大脑皮层数据集 | 生物信息学 | 复杂疾病 | RNA-seq | 分层线性模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2675 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of polyamine metabolism-related genes in gliomas: implications for prognosis and therapy
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1517557
PMID:40761256
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研究论文 | 本研究通过整合分析多胺代谢相关基因构建了胶质瘤预后风险模型 | 首次基于多胺代谢相关基因构建胶质瘤预后风险模型并系统分析肿瘤免疫微环境特征 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 开发基于多胺代谢相关基因的胶质瘤预后预测模型和治疗策略 | 胶质瘤患者和肿瘤组织 | 生物信息学 | 胶质瘤 | RNA测序，单细胞RNA测序，LASSO Cox回归，WGCNA | LASSO Cox回归模型，风险评分模型 | mRNA表达数据，临床数据 | 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的多个胶质瘤队列 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2676 | 2025-10-06 |
Identification of novel molecular subtypes and construction of a prognostic signature via multi-omics analysis and machine learning in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1590216
PMID:40761262
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研究论文 | 通过多组学分析和机器学习识别肺腺癌新分子亚型并构建预后特征 | 应用10种聚类算法识别新分子亚型，整合单细胞RNA测序数据表征亚型特异性免疫微环境，构建多组学机器学习预后特征并在多个独立数据集中验证 | NA | 识别肺腺癌新分子亚型并构建预后特征以改善患者分层 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, western blotting, 细胞增殖实验, 流式细胞术, transwell迁移实验 | 机器学习算法 | 多组学数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA肺腺癌数据集和6个独立GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 2677 | 2025-10-06 |
ScaleSC: a superfast and scalable single-cell RNA-seq data analysis pipeline powered by GPU
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf167
PMID:40761324
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研究论文 | 开发了一个基于GPU加速的超快速可扩展单细胞RNA-seq数据分析流程ScaleSC | 通过GPU计算实现超过20倍加速，能够处理1000多个批次的1000-2000万细胞数据集，解决了单张A100卡上的内存瓶颈，远超现有工具的处理能力 | NA | 解决大规模单细胞RNA-seq数据处理速度慢的问题 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1000-2000万细胞，超过1000个批次 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2678 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Integrated with Bulk-RNA Sequencing Analysis Reveals Prognostic Signatures Based on PANoptosis in Hepatocellular Carcinoma
2025, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S533777
PMID:40761429
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研究论文 | 通过单细胞和批量RNA测序结合机器学习识别肝细胞癌中PANoptosis相关的预后特征和治疗靶点 | 首次将PANoptosis机制与肝细胞癌进展联系起来，发现YIF1B作为双重预后生物标志物和肿瘤驱动因子 | 需要进一步实验验证YIF1B的临床转化价值 | 研究肝细胞癌中PANoptosis相关机制，识别可操作的治疗靶点并优化患者特异性治疗结果 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学,机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,机器学习,生物信息学分析 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 2679 | 2025-10-06 |
Chevreul: an R bioconductor package for exploratory analysis of full-length single cell sequencing
2025, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.158
PMID:40761736
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研究论文 | 介绍了一个用于单细胞RNA测序数据探索性分析的R Bioconductor软件包Chevreul | 专注于全长度RNA测序数据分析，支持外显子覆盖度和转录本异构体推断，提供批处理校正功能，且为非编程研究人员设计 | NA | 开发用于单细胞RNA测序数据处理的软件工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2680 | 2025-10-06 |
Unraveling NK cell heterogeneity through single-cell sequencing: insights from physiological and tumor contexts for clinical applications
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1612352
PMID:40761786
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综述 | 通过单细胞测序技术解析NK细胞的异质性，探讨其在生理和肿瘤环境中的特征及临床应用前景 | 系统阐述单细胞测序技术在揭示NK细胞异质性方面的应用，分析肿瘤微环境中NK细胞的动态变化及治疗响应机制 | NA | 探讨NK细胞异质性机制及其在肿瘤免疫治疗中的临床应用价值 | 自然杀伤细胞（NK细胞） | 单细胞生物学 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |