单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 26681 - 26700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26681 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq study determines the ontogeny of macrophages in glioblastomas
2017-Dec-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-017-1375-z
PMID:29262851
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研究论文 | 本文通过大规模单细胞RNA测序分析，揭示了胶质瘤相关巨噬细胞的发育过程及其在复杂肿瘤微环境中的新作用和新生物标志物 | 本文通过单细胞RNA测序技术，首次详细揭示了胶质瘤相关巨噬细胞的发育过程及其在肿瘤微环境中的新作用 | NA | 研究胶质瘤相关巨噬细胞的发育过程及其在肿瘤微环境中的作用 | 胶质瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 大规模样本 |
| 26682 | 2024-08-09 |
Integrated Bayesian analysis of rare exonic variants to identify risk genes for schizophrenia and neurodevelopmental disorders
2017-Dec-20, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-017-0497-y
PMID:29262854
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研究论文 | 本文通过集成贝叶斯分析罕见外显子变异，识别了精神分裂症和神经发育障碍的风险基因 | 本文扩展了用于自闭症研究的流程，并应用于推断精神分裂症和四种神经发育障碍的罕见遗传参数 | NA | 识别精神分裂症和神经发育障碍的风险基因 | 精神分裂症和神经发育障碍的风险基因 | 遗传学 | 神经发育障碍 | 贝叶斯建模 | 贝叶斯模型 | 全外显子序列数据 | 精神分裂症数据包括1,077个三联体家庭、6,699个病例和13,028个对照；四种神经发育障碍数据包括10,792个三联体家庭和4,058个病例和对照 |
| 26683 | 2024-08-09 |
[Study on the spatial expression of trophectoderm cells in human embryonic prenatal blastocysts]
2017-Dec-18, Beijing da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Peking University. Health sciences
PMID:29263466
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研究论文 | 本研究探讨了人类胚胎前卵泡期囊胚中滋养层细胞的空间表达 | 首次确定了从人类囊胚中分离出的极性和壁滋养层细胞的全局基因表达模式 | NA | 研究人类胚胎前卵泡期囊胚中滋养层细胞的空间表达 | 人类胚胎前卵泡期囊胚中的滋养层细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自辅助生殖技术的Gardner评分5AA囊胚，采集于受精后第6天 |
| 26684 | 2024-08-09 |
A Single-Cell RNA Sequencing Study Reveals Cellular and Molecular Dynamics of the Hippocampal Neurogenic Niche
2017-Dec-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.11.050
PMID:29241552
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究，揭示了海马神经发生微环境的细胞和分子动力学 | 本文通过单细胞RNA测序技术，全面描述了齿状回细胞，并识别了独特的细胞类型特异性标记，定义了神经干细胞（NSC）和前体细胞的发展阶段及转录动力学 | NA | 全面理解成年神经发生 | 神经干细胞（NSC）和前体细胞的发展阶段、分子决定因素以及微环境的细胞和分子组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 所有非神经细胞群体 |
| 26685 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals intrinsic and extrinsic regulatory heterogeneity in yeast responding to stress
2017-12, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.2004050
PMID:29240790
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了在盐胁迫下和无胁迫条件下，单个酿酒酵母细胞的转录异质性，并探讨了影响应激响应转录组的细胞协变量 | 本研究揭示了酵母细胞在应激前后的显著调控变异，并发现部分细胞在一定程度上解耦了核糖体蛋白基因表达与环境应激反应，这与细胞周期有关但与酵母超日代谢周期无关 | NA | 探究同源细胞群体中个体细胞在应激耐受性上的显著变异及其本质 | 酿酒酵母细胞在盐胁迫下的转录异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个酿酒酵母细胞 |
| 26686 | 2024-08-09 |
Medical bioinformatics in melanoma
2018-03, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000000428
PMID:29227308
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综述 | 本文综述了下一代测序技术在黑色素瘤生物学、治疗抵抗和新治疗途径方面的应用 | 通过全基因组测序、全外显子测序和RNA测序重新定义了黑色素瘤的分子分类，揭示了定义临床亚型的独特遗传畸变，并揭示了个体肿瘤中存在的多样性异质性 | NA | 总结近期全基因组研究，探讨单细胞RNA测序研究以及个性化疫苗方法在黑色素瘤治疗中的应用 | 黑色素瘤的分子分类、遗传畸变、肿瘤异质性及治疗抵抗 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 下一代测序(NGS), 全基因组测序, 全外显子测序, RNA测序 | NA | 基因组数据, RNA数据 | 多个黑色素瘤亚型, 单细胞水平 |
| 26687 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq Reveals a Subpopulation of Prostate Cancer Cells with Enhanced Cell-Cycle-Related Transcription and Attenuated Androgen Response
2018-02-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-17-1924
PMID:29233929
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了144个经过或未经过雄激素处理的同步化LNCaP前列腺癌细胞的转录组，识别出八个潜在的LNCaP细胞亚群，揭示了前列腺癌细胞对雄激素刺激的先前未被重视的细胞异质性 | 本研究首次揭示了一个具有干细胞样特征的亚群，该亚群表现出较慢的细胞倍增率、增强的球体形成能力和对有丝分裂抑制剂诱导的G-M阻滞的抵抗性，以及对雄激素受体信号依赖性的降低 | NA | 研究前列腺癌中存在的少数细胞亚群，这些亚群在雄激素剥夺治疗后可能成为优势克隆 | LNCaP前列腺癌细胞的亚群及其对雄激素处理的响应 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 144个单细胞 |
| 26688 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals that cell division cycle 5-like protein is essential for porcine oocyte maturation
2018-02-02, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.M117.809608
PMID:29222335
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序研究了细胞分裂周期5-样蛋白（CDC5L）在猪卵母细胞成熟中的作用 | 首次揭示了CDC5L蛋白在猪卵母细胞减数分裂和早期胚胎发育中的潜在新作用 | NA | 探索BCB测试背后的分子机制，并研究CDC5L蛋白在猪卵母细胞成熟中的作用 | 猪卵母细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | BCB阴性和BCB阳性猪卵母细胞 |
| 26689 | 2024-08-09 |
SIDR: simultaneous isolation and parallel sequencing of genomic DNA and total RNA from single cells
2018-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.223263.117
PMID:29208629
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研究论文 | 本文报道了一种名为SIDR的新方法，用于从单个细胞中同时分离基因组DNA和总RNA，该方法通过低渗裂解保留核膜完整性，并使用抗体偶联的磁性微珠捕获细胞裂解物，实现了高回收率和低交叉污染。 | SIDR方法能够同时高效地从单个细胞中分离基因组DNA和总RNA，适用于单细胞水平的基因组和转录组测序分析。 | 尽管SIDR-seq在捕获拷贝数和单核苷酸变异方面比传统的单细胞RNA测序更准确，但拷贝数变异与相应基因表达水平之间存在正相关关系。 | 开发一种新技术，用于在单细胞水平上同时分析基因组和转录组，以揭示基因组和转录组的变异及其相关性。 | 单个细胞中的基因组DNA和总RNA。 | 基因组学 | NA | 实时PCR | NA | 基因组和转录组数据 | 单个细胞 |
| 26690 | 2024-08-09 |
Spatial reconstruction of immune niches by combining photoactivatable reporters and scRNA-seq
2017-12-22, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aao4277
PMID:29217582
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研究论文 | 本文开发了一种名为NICHE-seq的方法，结合光激活荧光报告基因、双光子显微镜和单细胞RNA测序，用于推断细胞和分子组成的微环境 | NICHE-seq方法能够高度重现空间组织重建，识别特定微环境的稀有免疫亚群和基因程序 | NA | 阐明细胞类型及其分子途径的高阶空间组织 | 免疫细胞网络的高阶组装 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 图像 | 包括感染的B细胞滤泡中的自然杀伤细胞和脾脏及肿瘤中的不同骨髓状态 |
| 26691 | 2024-08-09 |
Estimation of immune cell content in tumour tissue using single-cell RNA-seq data
2017-12-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-02289-3
PMID:29230012
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研究论文 | 本文通过数学解卷积方法，利用肿瘤来源的单细胞RNA测序数据中的指示特异性和细胞类型特异的参考基因表达谱（RGEPs），深入分析了如何从批量基因表达数据中推导出实体肿瘤的细胞组成 | 本文证明了肿瘤来源的RGEPs对于成功解卷积至关重要，而外周血的RGEPs是不够的 | NA | 预测患者对免疫治疗的反应 | 实体肿瘤的免疫细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26692 | 2024-08-09 |
scRNASeqDB: A Database for RNA-Seq Based Gene Expression Profiles in Human Single Cells
2017-Dec-05, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes8120368
PMID:29206167
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research paper | 本文介绍了scRNASeqDB数据库，该数据库收集并整理了几乎所有目前可用的人类单细胞转录组数据集，涵盖200种人类细胞系或细胞类型及13,440个样本 | scRNASeqDB是首个能够全面收集、整理和比较人类单细胞RNA测序数据表达特征的数据库 | NA | 构建一个全面的人类单细胞RNA测序数据表达特征数据库 | 人类单细胞转录组数据集 | natural language processing | NA | scRNA-Seq | NA | text | 涵盖200种人类细胞系或细胞类型及13,440个样本 |
| 26693 | 2024-08-09 |
Transcriptional Noise and Somatic Mutations in the Aging Pancreas
2017-12-05, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2017.11.009
PMID:29211979
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研究论文 | 研究探讨了胰腺β细胞异质性的潜在机制及其功能意义 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了随着年龄增长，胰腺细胞转录噪声增加和体细胞突变积累的现象 | NA | 探讨胰腺β细胞异质性的机制及其功能意义 | 人类胰腺细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 26694 | 2024-08-09 |
High-Resolution Single-Cell Sequencing of Malaria Parasites
2017-12-01, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evx256
PMID:29220419
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研究论文 | 本文介绍了一种高分辨率的单细胞测序方法，用于分析恶性疟原虫的多重感染 | 通过荧光激活细胞分选和全基因组测序，实现了对恶性疟原虫基因组的高效、近完整捕获 | NA | 旨在理解恶性疟原虫感染的复杂性 | 恶性疟原虫的单细胞基因组 | 基因组学 | 疟疾 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 48个单细胞基因组 |
| 26695 | 2024-08-09 |
Comparative analysis of single-cell RNA sequencing data from mouse spermatogonial and mesenchymal stem cells to identify differentially expressed genes and transcriptional regulators of germline cells
2018-07, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.26303
PMID:29194616
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研究论文 | 本研究通过比较单细胞RNA测序数据，分析了小鼠精原干细胞和间充质干细胞中差异表达基因及调控生殖细胞转录的因子 | 本研究首次鉴定了1,584个上调的差异表达基因，并识别了12个基础转录因子和3个序列特异性转录因子，以及两个重要的蛋白质相互作用网络中的蛋白质复合物 | NA | 揭示精原干细胞生物学的分子机制，并为细胞类型转换方法和生殖细胞的生产提供候选因子 | 小鼠精原干细胞和间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 12个精原干细胞和16个间充质干细胞 |
| 26696 | 2024-08-09 |
Cross-platform single cell analysis of kidney development shows stromal cells express Gdnf
2018-02-01, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2017.11.006
PMID:29183737
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研究论文 | 本研究使用三种独立平台（Drop-Seq、Chromium 10x Genomics和Fluidigm C1）进行单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析，研究E14.5小鼠肾脏发育过程中的细胞群体和分子机制 | 通过一种新的整合监督计算策略，成功地协调和比较了所有三种技术平台的细胞谱，并意外发现间质细胞表达GDNF，这推翻了之前认为的只有肾小管祖细胞是GDNF唯一来源的观点 | 使用无监督方法ICGS未能识别和确认16种不同细胞群体的存在 | 研究肾脏发育过程中的细胞群体和分子机制 | E14.5小鼠肾脏的单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | E14.5小鼠肾脏样本 |
| 26697 | 2024-08-09 |
Transcriptional Regulation and Genes Involved in First Lineage Specification During Preimplantation Development
2018, Advances in anatomy, embryology, and cell biology
DOI:10.1007/978-3-319-63187-5_4
PMID:29177763
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review | 本文综述了哺乳动物植入前发育过程中第一谱系指定相关的转录调控机制和关键基因 | 强调了通过基因组操作、活体成像、单细胞转录组学和功能缺失研究获得的最新见解 | NA | 探讨哺乳动物植入前发育中第一谱系指定的转录调控和相关基因 | 转录因子如Oct4、Sox2、Nanog、Cdx2和Eomes在细胞谱系指定中的作用 | NA | NA | 基因组操作、活体成像、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26698 | 2024-08-09 |
Synaptic and peptidergic connectome of a neurosecretory center in the annelid brain
2017-12-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.26349
PMID:29199953
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研究论文 | 本研究利用透射电子显微镜和基因表达图谱分析了海洋环节动物幼体脑中神经分泌中心的突触和肽能连接组 | 首次重建了78个神经分泌神经元，并绘制了它们在脑中的突触连接，揭示了神经分泌中心内广泛的肽能信号网络及其与突触脑的连接 | NA | 理解动物脑中神经分泌中心的功能 | 神经分泌中心的细胞类型、突触和肽能网络 | 神经科学 | NA | 透射电子显微镜、基因表达图谱 | NA | 单细胞转录组数据 | 78个神经分泌神经元 |
| 26699 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis of avian neural crest migration reveals signatures of invasion and molecular transitions
2017-12-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.28415
PMID:29199959
|
研究论文 | 本文首次对鸡胚中颅神经嵴细胞迁移的三个进展阶段进行了单细胞转录组分析，并确定了细胞位置与时间特异性转录特征之间的层次关系 | 发现了神经嵴细胞中最具侵袭性的Trailblazer细胞的新转录特征，并揭示了神经嵴细胞迁移流中的分子多样性和动态变化 | 基因敲降实验显示对总迁移距离的影响较小，且在体内表达分析中发现了某些盐和胡椒模式 | 探究神经嵴细胞如何在胚胎中以定向和集体的方式迁移 | 鸡胚中的颅神经嵴细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 约900个基因 |
| 26700 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-Seq analysis reveals dynamic trajectories during mouse liver development
2017-Dec-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-017-4342-x
PMID:29202695
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研究论文 | 本研究利用无标记单细胞RNA测序技术，分析了小鼠肝脏发育过程中胎儿肝脏干细胞/祖细胞（LSPCs）的转录组动态变化 | 采用无标记单细胞RNA测序技术，揭示了LSPCs在发育过程中的动态轨迹，并提供了新的生物标志物评估和预测方法 | NA | 探究小鼠肝脏发育过程中LSPCs的分化和成熟轨迹 | 小鼠肝脏发育过程中的LSPCs | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 507个细胞从胚胎第11.5天到出生后第2.5天的七个阶段随机选择，以及52个出生后第3.25天的小鼠肝脏Epcam阳性胆管细胞 |