单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 26706 篇文献，本页显示第 26641 - 26660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26641 | 2024-08-09 |
Massively parallel single-cell RNA-seq for marker-free decomposition of tissues into cell types
2014-Feb-14, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1247651
PMID:24531970
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研究论文 | 本文介绍了一种自动化的大规模并行单细胞RNA测序方法，用于分析数千个单细胞在体内的转录状态，并结合无监督分类算法，对脾脏组织的细胞类型进行从头鉴定。 | 本文创新性地使用大规模并行单细胞RNA测序技术，结合无监督分类算法，实现了对复杂组织中细胞类型的全面分解。 | NA | 研究目的是开发一种新的方法，用于解析多细胞生物中由异质细胞类型组成的复杂器官的细胞组成。 | 研究对象包括脾脏组织中的树突状细胞和其他造血细胞类型。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督分类算法 | 转录组数据 | 数千个单细胞 |
| 26642 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2771
PMID:24524131
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26643 | 2024-08-09 |
Entering the era of single-cell transcriptomics in biology and medicine
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2764
PMID:24524133
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26644 | 2024-08-09 |
The promise of single-cell sequencing
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2769
PMID:24524134
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26645 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals dynamic, random monoallelic gene expression in mammalian cells
2014-Jan-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1245316
PMID:24408435
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了哺乳动物细胞中动态且随机的单等位基因表达现象 | 首次在单细胞水平上进行全基因组范围内的等位基因表达分析，发现了大量的单等位基因表达现象，并揭示了其随机性和动态性 | NA | 研究哺乳动物细胞中单等位基因表达的动态性和随机性 | 小鼠着床前胚胎的单细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 混合背景的小鼠着床前胚胎细胞 |
| 26646 | 2024-08-09 |
Full-length RNA-seq from single cells using Smart-seq2
2014-Jan, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2014.006
PMID:24385147
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research paper | 本文介绍了使用Smart-seq2方法从单个细胞中进行全长RNA-seq的详细协议 | Smart-seq2方法优化了灵敏度、准确性和全长转录本覆盖范围 | 目前方法缺乏链特异性，且无法检测非多聚腺苷酸化（polyA(-)）RNA | 揭示细胞间变异的程度、功能和起源 | 单个细胞中的基因表达 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | RNA | 单个细胞 |
| 26647 | 2024-08-09 |
Base preferences in non-templated nucleotide incorporation by MMLV-derived reverse transcriptases
2013, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0085270
PMID:24392002
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研究论文 | 研究了MMLV衍生逆转录酶在非模板核苷酸掺入中的碱基偏好性，并优化了单细胞cDNA扩增的模板切换条件 | 首次详细确定了模板切换位点处非模板核苷酸的碱基偏好性，并基于此结果优化了模板切换条件 | 文章未提及具体的局限性 | 研究MMLV衍生逆转录酶的非模板核苷酸掺入机制，并优化单细胞RNA测序中的模板切换效率 | MMLV衍生逆转录酶的非模板核苷酸掺入机制及其在单细胞cDNA扩增中的应用 | NA | NA | 逆转录酶 | NA | 核酸序列 | 文章未提及具体的样本数量 |
| 26648 | 2024-08-09 |
Quantitative single-cell RNA-seq with unique molecular identifiers
2014-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2772
PMID:24363023
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研究论文 | 本文介绍了使用独特分子标识符（UMI）进行定量单细胞RNA测序的方法，以减少cDNA合成和扩增过程中的量化误差。 | 通过使用分子标签和微流体样品制备技术，实现了mRNA捕获效率的五倍提升，并几乎消除了扩增噪声。 | NA | 提高单细胞RNA测序的定量准确性，以揭示细胞异质性和肿瘤微进化。 | 单细胞RNA测序中的cDNA合成和扩增过程。 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA |
| 26649 | 2024-08-09 |
From single-cell to cell-pool transcriptomes: stochasticity in gene expression and RNA splicing
2014-Mar, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.161034.113
PMID:24299736
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研究论文 | 本文使用SMART-seq单细胞RNA测序技术研究GM12878淋巴母细胞系，通过插入量化标准估计每个基因的RNA分子绝对数量，并探讨细胞间基因表达和RNA剪接的随机性 | 本文通过池/分割设计直接测量技术随机性，发现细胞间表达存在显著差异，并评估了细胞间可变剪接和等位基因偏倚的差异 | NA | 探索细胞间基因表达、转录处理和编辑以及调控模块活性的变异 | GM12878淋巴母细胞系的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(SMART-seq) | NA | 转录组数据 | 涉及50,000至300,000个转录本每细胞 |
| 26650 | 2024-08-09 |
Using phage display selected antibodies to dissect microbiomes for complete de novo genome sequencing of low abundance microbes
2013-Nov-27, BMC microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/1471-2180-13-270
PMID:24279426
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研究论文 | 本文介绍了一种结合抗体噬菌体展示和荧光激活细胞分选（FACS）的新方法，用于从微生物群中测序单个物种的基因组 | 该方法通过抗体噬菌体展示选择特定抗体，结合FACS技术，能够有效富集低丰度的微生物，实现完整的从头基因组测序 | NA | 提高复杂微生物群中低丰度微生物基因组测序的覆盖率 | 乳酸杆菌（Lactobacillus acidophilus）及其在微生物群中的富集 | 微生物学 | NA | 抗体噬菌体展示，荧光激活细胞分选（FACS） | NA | 基因组数据 | 实验室培养和商业来源的细菌混合物 |
| 26651 | 2024-08-09 |
Serotonergic neuron regulation informed by in vivo single-cell transcriptomics
2014-Feb, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.13-240267
PMID:24192459
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研究论文 | 本文通过使用单细胞转录组学技术，研究了背侧中缝（DR）的血清素能（5-HT）神经元在抑郁症和焦虑症中的分子组成和潜在药物靶点 | 首次通过单细胞RNA测序分析，识别了超过500种G蛋白偶联受体（GPCRs），并发现催产素和溶血磷脂酸1受体与α1-肾上腺素受体共同刺激DR 5-HT神经元的放电活动 | NA | 揭示血清素能神经元的分子调控机制 | 背侧中缝的血清素能神经元 | NA | 抑郁症，焦虑症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单个血清素能神经元 |
| 26652 | 2024-08-09 |
Mosaic copy number variation in human neurons
2013-Nov-01, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1243472
PMID:24179226
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研究论文 | 本研究利用单细胞基因组学方法，在从人诱导多能干细胞（hiPSC）系和死后人脑中获得的神经元中绘制DNA拷贝数变异（CNV） | 发现了神经元中存在大量的亚染色体CNV，以及神经元中CNV的大小和类型与成纤维细胞和神经前体细胞的差异 | NA | 研究人类神经元中的拷贝数变异 | 人诱导多能干细胞（hiPSC）系和死后人脑中获得的神经元 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 涉及多个hiPSC系和死后人脑样本，具体数量未详述 |
| 26653 | 2024-08-09 |
RNA single-cell sequencing could lead to eight-cell embryo genetic testing
2013-Oct, Bioanalysis
IF:1.9Q3
PMID:24195119
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26654 | 2024-08-09 |
Investigating intratumour heterogeneity by single-cell sequencing
2013-Nov, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.1038/aja.2013.106
PMID:24141534
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术探讨肿瘤内异质性 | 采用单细胞测序技术作为新兴方法来研究肿瘤内异质性 | NA | 探讨肿瘤内异质性的存在及其在研究和临床环境中的相关性 | 肿瘤内异质性及其对疾病起始和进展的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 26655 | 2024-08-09 |
Genome-wide association and sequencing studies on colorectal cancer
2013-Dec, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2013.09.005
PMID:24096009
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研究论文 | 本文通过全基因组关联研究和测序分析，探讨了结直肠癌的遗传机制 | 采用了全基因组突变分析和新兴的元基因组及单细胞测序技术 | 仍需解决结直肠癌流行病学变化、遗传检测问题及基因组数据的临床应用 | 提高结直肠癌的风险预测、预后评估和治疗效果 | 结直肠癌的遗传机制 | NA | 结直肠癌 | 全基因组关联研究、元基因组测序、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 26656 | 2024-08-09 |
Assembling single-cell genomes and mini-metagenomes from chimeric MDA products
2013-Oct, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2013.0084
PMID:24093227
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研究论文 | 本文介绍了用于识别和解析de Bruijn图中镶嵌边缘和复杂凸起的算法，显著提高了单细胞组装的质量，并描述了单细胞组装器SPAdes在捕获和测序“微生物暗物质”中的应用。 | 提出了新的算法来处理单细胞基因组学中的高镶嵌读取问题，并开发了SPAdes组装器，该组装器在单细胞细菌数据集上优于其他专门为单细胞测序设计的组装器。 | NA | 改进单细胞基因组和迷你元基因组的组装方法，以更好地进行全基因组测序。 | 单细胞基因组和迷你元基因组的组装算法及应用。 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | de Bruijn图 | 基因组数据 | 随机选择的单细胞组成的小池（迷你元基因组） |
| 26657 | 2024-08-09 |
Accounting for technical noise in single-cell RNA-seq experiments
2013-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2645
PMID:24056876
|
研究论文 | 本文开发了一种定量统计方法，用于区分单细胞RNA测序实验中的真实生物变异与高水平的实验技术噪声 | 提出了一个量化统计方法来区分单细胞RNA测序中的生物变异和技术噪声 | NA | 旨在区分单细胞RNA测序实验中的生物变异和技术噪声 | 单细胞RNA测序实验中的生物变异和技术噪声 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计方法 | 基因表达数据 | 使用了来自拟南芥和老鼠的两个独立数据集 |
| 26658 | 2024-08-09 |
BAIT: Organizing genomes and mapping rearrangements in single cells
2013, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/gm486
PMID:24028793
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研究论文 | 本文介绍了一种名为BAIT的软件，用于分析单细胞测序技术Strand-seq产生的数据，主要用于精细映射姐妹染色单体交换（SCEs）和其他重排 | BAIT软件能够识别和定位SCEs，并能改进已完成的参考基因组装配，识别出大约21 Mb的错误方向片段，并将超过一半的孤立片段定位到mm10/GRCm38中 | NA | 开发和验证一种新的软件工具，用于分析单细胞测序数据中的基因组重排 | 单细胞测序数据中的姐妹染色单体交换（SCEs）和其他重排 | 基因组学 | NA | 单细胞测序技术（Strand-seq） | NA | 基因组数据 | NA |
| 26659 | 2024-08-09 |
SAMstrt: statistical test for differential expression in single-cell transcriptome with spike-in normalization
2013-Nov-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btt511
PMID:23995393
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研究论文 | 本文介绍了SAMstrt，一个用于单细胞转录组差异表达分析的统计测试方法，支持内参标准化 | SAMstrt扩展了SAMseq方法，引入了内参标准化，并基于估计的每细胞绝对转录本数量进行统计测试 | NA | 重新审视单细胞转录组研究的统计假设 | 单细胞RNA-seq数据中的差异表达分析 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | SAMseq | 转录组数据 | NA |
| 26660 | 2024-08-09 |
Single cells from human primary colorectal tumors exhibit polyfunctional heterogeneity in secretions of ELR+ CXC chemokines
2013-Oct, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1039/c3ib40059j
PMID:23995780
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研究论文 | 本文通过微刻技术和亚纳升孔阵列直接分析了数千个人类原发性结直肠肿瘤和基质细胞分泌的ELR+ CXC趋化因子的分泌行为 | 首次详细描述了单个细胞分泌ELR+ CXC趋化因子的多功能异质性 | NA | 研究肿瘤细胞分泌状态的复杂性和动态变化 | 人类原发性结直肠肿瘤和基质细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 微刻技术 | NA | 细胞分泌物 | 数千个单细胞 |