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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2641 | 2025-10-06 |
Coordinated regulation of self-renewal and cell cycle during human lympho-myeloid lineage restriction
2025-Aug-07, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026936
PMID:40258184
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研究论文 | 本研究开发了支持早期B淋巴细胞分化的培养系统,揭示了人类淋巴-髓系限制过程中自我更新能力丧失与细胞周期加速的协调调控机制 | 开发了新型培养系统支持早期人类淋巴样分化,首次发现B淋巴细胞和中性粒细胞/单核细胞谱系限制过程中伴随共享的细胞周期加速和转录异质性 | 研究主要基于脐带血CD34+细胞,可能不适用于其他来源的造血干细胞 | 阐明人类淋巴-髓系谱系限制过程中的生物学和分子变化 | 人类脐带血CD34+细胞及其分化的B淋巴细胞、中性粒细胞/单核细胞和树突状细胞前体 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析,克隆培养系统 | NA | 转录组数据 | 人类脐带血CD34+细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2642 | 2025-10-06 |
Insight into pericytes in glioblastoma angiogenesis: In vivo tracking by two-photon microscopy and proteomic profiling
2025-Aug-07, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70073
PMID:40772404
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研究论文 | 本研究通过双光子显微镜活体追踪和蛋白质组学分析,揭示了胶质母细胞瘤中周细胞在血管生成中的时空动态和分子重编程 | 首次结合活体成像和蛋白质组学技术,系统揭示了周细胞在胶质母细胞瘤血管生成中的时空动态和分子重编程机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究胶质母细胞瘤中周细胞的时空动态和分子变化在肿瘤血管生成中的作用 | PDGFRβ阳性周细胞、胶质母细胞瘤血管系统 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 双光子显微镜、LC-MS/MS蛋白质组学、单细胞RNA测序、流式细胞分选 | 转基因小鼠模型 | 图像、蛋白质组数据、基因表达数据 | 转基因小鼠模型,FACS分选的Pdgfrb+细胞 | NA | 蛋白质组学,单细胞RNA测序 | LC-MS/MS | 液相色谱-串联质谱分析 |
2643 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals potential novel insights into appendage-patterning and joint-development in a spider
2025-Aug-07, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.70069
PMID:40772585
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研究论文 | 通过单细胞测序技术分析蜘蛛胚胎中与附肢模式和关节发育相关的细胞簇及其标记基因 | 发现了参与节肢动物关节发育的新遗传因子(dysf、spz3、svp)并在远缘螯肢动物中验证其进化起源 | 研究结果主要基于基因表达模式分析,功能验证实验尚不充分 | 探索节肢动物附肢模式和关节发育的遗传机制 | 蜘蛛Parasteatoda tepidariorum胚胎和收割者Phalangium opilio的直系同源基因 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 蜘蛛胚胎细胞簇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2644 | 2025-10-06 |
N-Oxide-Driven Heme-Activatable Biomolecule Labeling for Visualization of Labile Heme in Living Cells and Mouse Brain
2025-Aug-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04990
PMID:40720736
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研究论文 | 开发了一种基于N-氧化物驱动血红素激活的生物分子标记策略,用于活细胞和小鼠脑中不稳定血红素的可视化检测 | 首次报道了N-氧化物驱动的不稳定血红素激活探针,能够在活体系统中实现选择性标记和检测 | NA | 开发新型化学探针以研究不稳定血红素在生理和病理过程中的作用 | 不稳定血红素(原卟啉IX与铁离子复合物) | 化学生物学 | NA | 荧光成像、3D组织可视化、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、蛋白质组数据、转录组数据 | 活细胞和小鼠脑组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
2645 | 2025-10-06 |
Unveiling the Role of Sdc4+ Monocytes in NASH: A Single-Cell RNA Sequencing Study
2025-Aug-06, Immunological investigations
IF:2.9Q3
DOI:10.1080/08820139.2025.2544180
PMID:40768295
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究揭示了Sdc4+单核细胞在非酒精性脂肪性肝炎中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示NASH中单核细胞亚群的异质性和功能转化,发现Sdc4+单核细胞的特异性作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究单核细胞在非酒精性脂肪性肝炎发病机制中的作用 | NASH小鼠和患者的肝脏非实质细胞,特别是单核细胞亚群 | 单细胞组学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序, 转染, 共培养, 免疫荧光, qPCR | NA | 单细胞转录组数据 | NASH和对照小鼠的肝脏非实质细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2646 | 2025-10-06 |
Regulatory KIR+CD8+ T cells are elevated during human pregnancy
2025-Aug-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adm7697
PMID:40768597
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研究论文 | 本研究探讨了KIR+CD8+ T细胞在人类妊娠期间作为调节性细胞亚群的作用机制 | 首次发现KIR+CD8+ T细胞在妊娠期间频率升高,特别是在携带男性胎儿的孕妇中,并证实其能抑制母体对胎儿特异性抗原的免疫反应 | 研究样本主要来自外周血和早期妊娠蜕膜组织,需要更多样本验证临床关联性 | 探究KIR+CD8+ T细胞在母胎免疫耐受中的作用机制 | 孕妇外周血和蜕膜组织中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序, 体外细胞培养实验 | NA | 基因表达数据, 细胞频率数据 | 孕妇外周血和早期妊娠蜕膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2647 | 2025-10-06 |
Function of chemokines in embryo implantation
2025-Aug-06, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2025.07.092
PMID:40769846
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综述 | 本文综述了趋化因子在胚胎植入过程中通过调节免疫微环境维持母胎免疫稳态的核心作用 | 系统整合了趋化因子网络在胚胎植入关键过程中的调控机制,并强调单细胞测序等新技术在解码趋化因子介导调控中的应用 | 作为综述文章,未涉及原始实验研究,主要基于现有文献综合分析 | 探讨趋化因子在胚胎植入过程中的功能机制 | 胚胎植入过程中的趋化因子网络和免疫微环境 | 生殖免疫学 | 生殖系统疾病 | 单细胞测序、微流控、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2648 | 2025-10-06 |
A Large-Scale Single-Cell Atlas Reveals the Peripheral Immune Panorama of Bacterial Pneumonia
2025-Aug-04, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202501-0217OC
PMID:40758632
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研究论文 | 通过大规模单细胞转录组图谱揭示细菌性肺炎外周免疫细胞的重塑特征 | 首次构建细菌性肺炎的大规模外周血单细胞图谱,揭示不同疾病严重程度下的免疫细胞组成变化和分子机制 | 样本量相对有限(100例),未涉及组织局部免疫反应 | 解析细菌性肺炎的免疫发病机制和疾病严重程度的驱动因素 | 100例受试者(39例重症肺炎,31例轻症肺炎,30例健康对照)的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 细菌性肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 100例人外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2649 | 2025-10-06 |
Multi-omics prediction of axillary treatment response and tumour microenvironment alterations in lymph node-positive luminal breast cancer
2025-Aug-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07877-6
PMID:40759637
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研究论文 | 本研究开发了一种多组学模型用于预测淋巴结阳性luminal乳腺癌患者新辅助化疗后的腋窝治疗反应 | 首次结合影像组学、临床病理特征和单细胞RNA测序构建多组学预测模型,并探索了肿瘤免疫微环境与治疗反应的关系 | 回顾性研究设计,样本量有限(仅5名患者的14个样本),需要更大规模的前瞻性验证 | 预测luminal乳腺癌患者新辅助化疗后的病理淋巴结完全缓解状态,以减少不必要的腋窝手术 | 淋巴结阳性的luminal乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,影像组学分析 | 多组学预测模型 | 影像数据,临床数据,病理数据,单细胞RNA测序数据 | 两个中心的回顾性数据,包含5名患者的14个单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2650 | 2025-10-06 |
Optimized summary-statistic-based single-cell eQTL meta-analysis
2025-Aug-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-08808-3
PMID:40759673
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研究论文 | 本文比较了不同策略并为跨单细胞RNA测序数据集的eQTL加权荟萃分析提供最佳实践建议 | 提出了针对单细胞eQTL研究的联邦加权荟萃分析方法,解决了基因型数据共享隐私限制和技术差异问题 | 单细胞研究样本量有限,不同数据集存在mRNA捕获效率、实验方案和测序策略的技术差异 | 提高检测细胞类型特异性表达数量性状位点(eQTLs)的统计功效 | 跨多个单细胞RNA测序数据集的eQTL汇总统计量 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权荟萃分析模型 | 基因表达数据、基因型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
2651 | 2025-10-06 |
Semi-supervised contrastive learning variational autoencoder Integrating single-cell multimodal mosaic datasets
2025-Aug-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06239-5
PMID:40759922
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研究论文 | 提出基于变分自编码器的半监督对比学习框架scGCM,用于整合单细胞多模态镶嵌数据集并消除批次效应 | 开发了灵活的整合框架,专门针对单细胞多模态镶嵌数据(部分模态缺失)的整合问题,结合了半监督对比学习和变分自编码器技术 | 未在摘要中明确说明研究的局限性 | 整合单细胞多模态镶嵌数据并消除批次效应 | 单细胞多模态镶嵌数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | 变分自编码器(VAE), 对比学习 | 单细胞多模态组学数据 | 多个数据集(未指定具体样本数量) | NA | 单细胞多模态组学 | NA | NA |
2652 | 2025-10-06 |
Repurposed clindamycin suppresses pyroptosis in tumor-associated macrophages through Inhibition of caspase-1
2025-Aug-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03478-5
PMID:40759978
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研究论文 | 本研究通过计算生物学方法发现克林霉素可抑制肿瘤相关巨噬细胞中caspase-1活性并减少细胞焦亡 | 开发了结合单细胞转录组学、网络分析和分子对接的新型计算流程,首次发现克林霉素对caspase-1的抑制作用 | 研究主要为体外实验验证,尚未进行体内动物模型验证 | 开发肿瘤相关巨噬细胞免疫调节的药物重定位方法 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs),特别是葡萄膜黑色素瘤和多发性骨髓瘤来源的TAMs | 计算生物学 | 葡萄膜黑色素瘤,多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学,网络分析,多标准决策技术,药效团对接模拟,分子对接 | 计算分析流程 | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2653 | 2025-10-06 |
A programmed decline in ribosome levels governs human early neurodevelopment
2025-Aug-04, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01708-8
PMID:40760247
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研究论文 | 本研究揭示了人类早期神经发育过程中核糖体水平程序性下降的调控机制及其对神经发育障碍的影响 | 首次发现神经上皮分化过程中核糖体水平的程序性下降,并阐明AIRIM/C1orf109变异通过影响特定转录本翻译导致神经发育缺陷的机制 | 研究主要基于人类大脑类器官模型,需要在体内系统中进一步验证 | 探究核糖体生物合成减少如何导致组织和发育特异性神经发育缺陷 | 人类大脑类器官和神经上皮细胞 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 单类器官翻译分析 | 人类大脑类器官模型 | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 翻译效率数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2654 | 2025-10-06 |
Identification of IQGAP3 prognostic potential and involvement in immune cell infiltration in LUAD
2025-Aug-04, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02976-8
PMID:40760442
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研究论文 | 本研究探讨IQGAP3在肺腺癌中的预后价值及其通过RAS-ERK信号通路调控肿瘤进展和免疫细胞浸润的机制 | 首次系统揭示IQGAP3通过激活RAS-ERK信号通路诱导T细胞耗竭并上调PD-L1表达的新机制 | 研究主要基于临床标本和动物模型,需要进一步验证IQGAP3作为治疗靶点的临床转化潜力 | 阐明IQGAP3在肺腺癌进展和肿瘤免疫微环境调控中的作用机制 | 肺腺癌临床标本、LUAD细胞系、C57BL/6小鼠皮下移植瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, CCK-8, 集落形成, EdU掺入, 迁移侵袭实验, RT-qPCR, Western blotting, 多重免疫荧光染色 | NA | RNA测序数据, 实验数据, 影像数据 | 临床标本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
2655 | 2025-10-06 |
Blocking CXCR4+ CD4+ T cells reprograms Treg-mediated immunosuppression via modulating the Rho-GTPase/NF-κB signaling axis
2025-Aug-04, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01515-8
PMID:40760450
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研究论文 | 本研究揭示了阻断CXCR4+ CD4+ T细胞通过调节Rho-GTPase/NF-κB信号轴重编程Treg介导的免疫抑制机制 | 首次阐明CXCR4通过调控Rho-GTPase/NF-κB信号轴驱动Treg细胞介导的免疫抑制机制 | NA | 探究CXCR4在调节肿瘤微环境中Treg细胞介导的免疫抑制作用 | CD4+ T细胞、调节性T细胞(Treg)、小鼠宫颈癌模型、人类宫颈癌类器官 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 磷酸化蛋白质组学, ChIP-seq | NA | 转录组数据, 表观遗传数据, 蛋白质组数据, 临床试验数据 | 多个癌症类型的单细胞RNA-seq数据集, 两个临床试验数据集(NCT02826486和NCT04516616) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
2656 | 2025-10-06 |
Identification and validation of ANXA3 and SOCS3 as biomarkers for acute myocardial infarction related to sphingolipid metabolism
2025-Aug-04, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00515-3
PMID:40760666
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和机器学习方法鉴定并验证了ANXA3和SOCS3作为与鞘脂代谢相关的急性心肌梗死生物标志物 | 首次将鞘脂代谢相关基因与急性心肌梗死联系起来,并通过单细胞RNA测序确定了关键细胞类型及其功能 | 研究基于公共数据集,需要进一步实验验证生物标志物的临床实用性 | 探索鞘脂代谢相关基因在急性心肌梗死中的作用,为临床诊断提供支持 | 急性心肌梗死患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 人工神经网络, 分子对接, RT-qPCR | 人工神经网络(ANN) | 基因表达数据 | 基于GSE48060和GSE123342两个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
2657 | 2025-10-06 |
Sex-dependent effects of peptidylarginine deiminases on neutrophil function and long-term outcomes after spinal cord injury
2025-Aug-04, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2025.115414
PMID:40769386
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研究论文 | 本研究探讨肽基精氨酸脱亚胺酶对脊髓损伤后中性粒细胞功能和长期预后的性别依赖性影响 | 首次描述脊髓损伤后PAD介导的中性粒细胞功能存在性别差异,并强调临床前研究中纳入两性的重要性 | Padi4基因敲除小鼠的运动功能恢复未观察到变化,组织保护效果存在性别依赖性 | 研究PADs在脊髓损伤后恢复中的作用及性别差异 | 小鼠脊髓损伤模型中的中性粒细胞功能 | 神经科学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, 基因敲除 | Padi4基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学数据, 行为学数据 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2658 | 2025-10-06 |
A multi-tissue human knee single-cell atlas identifies that osteoarthritis reduces regenerative tissue stem cells while increasing inflammatory pain macrophages
2025-Aug-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08586-8
PMID:40753276
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研究论文 | 构建首个膝关节骨关节炎单细胞图谱,揭示多组织分子互作机制 | 创建首个膝关节多组织单细胞图谱,首次系统揭示骨关节炎中组织干细胞减少与炎症性疼痛巨噬细胞增加的关键变化 | NA | 研究骨关节炎在多组织层面的分子互作机制 | 人类膝关节组织(关节软骨、半月板、滑膜、软骨下骨) | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2659 | 2025-10-06 |
Neurobiological subtypes of adolescent depression: a multimodal integration of morphometric similarity network and spatial transcriptomics
2025-Aug-02, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03133-7
PMID:40753308
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研究论文 | 通过整合形态相似性网络和空间转录组学识别青少年重度抑郁症的神经生物学亚型及其分子机制 | 首次将形态相似性网络与空间转录组学相结合,揭示了AMDD的两种神经生物学亚型及其特异性分子通路 | 研究样本量未明确说明,需要进一步验证亚型分类的普适性 | 识别青少年重度抑郁症的神经生物学亚型并解析其分子机制 | 青少年重度抑郁症患者 | 神经科学 | 抑郁症 | 形态相似性网络分析,空间转录组学,HYDRA算法 | NA | 神经影像数据,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2660 | 2025-10-06 |
Predicting Single-Cell Drug Sensitivity Utilizing Adaptive Weighted Features for Multi-Source Domain Adaptation
2025-Aug, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3553126
PMID:40111773
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研究论文 | 提出一种基于自适应重要性感知表示学习的多源域适应模型scAdaDrug,用于预测单个细胞的药物反应 | 引入即插即用模块生成重要性感知且相互独立的权重,以元素级方式自适应调节源域和目标域之间的潜在表示 | NA | 在单细胞水平预测药物反应,识别肿瘤中的耐药细胞亚群 | 单细胞转录组数据,包括细胞系、患者来源异种移植模型和临床肿瘤患者队列 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞测序 | 多源域适应模型,对抗域适应 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |