单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27241 篇文献，本页显示第 26541 - 26560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26541 | 2024-08-09 |
A general and flexible method for signal extraction from single-cell RNA-seq data
2018-01-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-02554-5
PMID:29348443
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研究论文 | 本文提出了一种通用的零膨胀负二项模型（ZINB-WaVE），用于从单细胞RNA测序数据中提取信号 | ZINB-WaVE模型能够处理零膨胀（dropouts）、过度离散和数据计数性质，无需预先归一化步骤 | NA | 开发一种新的方法来更稳定和准确地从单细胞RNA测序数据中提取低维表示 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 零膨胀负二项模型（ZINB-WaVE） | 基因表达数据 | NA |
| 26542 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals Cellular Diversity and Intercommunication in the Mouse Heart
2018-01-16, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.12.072
PMID:29346760
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠心脏非心肌细胞的转录组，揭示了心脏细胞的多样性和细胞间通信网络 | 本研究首次详细分析了小鼠心脏非心肌细胞的单细胞转录组，揭示了心脏细胞的多样性和细胞间通信网络，并发现了心脏基因表达中的性别二态性 | NA | 理解心脏发育和正常器官功能，并为制定精确的治疗策略以对抗心脏病提供基础 | 小鼠心脏的非心肌细胞 | 数字病理学 | 心脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 26543 | 2024-08-09 |
Early B cell changes predict autoimmunity following combination immune checkpoint blockade
2018-02-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI96798
PMID:29309048
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研究论文 | 本文分析了黑色素瘤患者在接受抗CTLA4或抗PD1单一治疗或联合治疗后B细胞的变化，发现联合免疫检查点阻断（CCB）治疗导致循环B细胞数量下降及CD21lo B细胞和浆细胞样细胞增加，这些早期B细胞变化与免疫相关不良事件（IRAEs）的发生频率和时间相关。 | 首次揭示了CCB治疗后B细胞的早期变化与IRAEs风险增加之间的关系，并提出通过靶向B细胞的预防策略可能减少这些患者的毒性反应。 | NA | 研究CCB治疗后B细胞的变化及其与免疫相关不良事件的关系。 | 黑色素瘤患者在接受抗CTLA4或抗PD1单一治疗或联合治疗后的B细胞变化。 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 26544 | 2024-08-09 |
Troy+ brain stem cells cycle through quiescence and regulate their number by sensing niche occupancy
2018-01-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1715911114
PMID:29311336
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研究论文 | 本文提出了一种模型，其中活跃的神经干细胞（NSCs）的命运与共享微环境中邻近NSCs的总数相关联 | 使用敲入报告基因和单细胞RNA测序技术，发现Wnt靶标Troy可以识别活跃和静止的NSCs，并揭示了NSCs在稳态或损伤响应中的快速扩增和部分返回静止状态的行为 | NSCs的分子特征、自我更新能力和命运行为仍未完全明确 | 研究神经干细胞在成年小鼠侧脑室下区的微环境中的行为和调控机制 | 神经干细胞（NSCs）及其在微环境中的行为 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 成年小鼠的神经干细胞 |
| 26545 | 2024-08-09 |
Reply to Edemir: Physiological regulation and single-cell RNA sequencing
2018-01-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1720333115
PMID:29311339
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26546 | 2024-08-09 |
The epigenetic control of stemness in CD8+ T cell fate commitment
2018-Jan-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aah6499
PMID:29326266
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研究论文 | 研究探讨了组蛋白甲基转移酶Suv39h1在感染后激活的小鼠CD8 T细胞中通过H3K9三甲基化调控干细胞相关记忆基因表达的作用 | 首次揭示了Suv39h1在CD8 T细胞效应分化过程中通过标记染色质沉默干细胞/记忆基因的关键作用 | NA | 探究染色质动态变化如何影响基因表达程序，进而控制CD8+ T细胞的命运承诺 | CD8+ T细胞的命运承诺及其与干细胞特性的关系 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠CD8 T细胞 |
| 26547 | 2024-08-09 |
Clonal analysis of lineage fate in native haematopoiesis
2018-01-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature25168
PMID:29323290
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研究论文 | 本研究使用转座子标记技术在未受干扰的造血过程中对前体细胞和干细胞的命运进行克隆追踪 | 研究揭示了在未受干扰的造血过程中，巨核细胞谱系主要独立于其他造血命运，并表明传统的长期造血干细胞是巨核细胞限制性前体细胞的重要来源 | NA | 探讨在未受干扰的造血过程中，造血干细胞和多能前体细胞的谱系命运 | 造血干细胞和多能前体细胞 | NA | NA | 转座子标记技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 26548 | 2024-08-09 |
Exploration of the Germline Genome of the Ciliate Chilodonella uncinata through Single-Cell Omics (Transcriptomics and Genomics)
2018-01-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.01836-17
PMID:29317511
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研究论文 | 本文通过单细胞组学技术探索纤毛虫奇洛登尼亚的生殖系基因组结构 | 首次使用单细胞转录组学和基因组学技术，克服了获取纯化生殖系DNA的困难，揭示了奇洛登尼亚生殖系基因组的结构特征 | 研究仅限于奇洛登尼亚这一种纤毛虫，且依赖于其高度碎片化的体细胞基因组 | 探索纤毛虫生殖系与体细胞基因组之间的基因组重排进化 | 纤毛虫奇洛登尼亚的生殖系基因组 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学和基因组学 | NA | 基因组数据 | 有限数量的奇洛登尼亚样本 |
| 26549 | 2024-08-09 |
Variation in Activity State, Axonal Projection, and Position Define the Transcriptional Identity of Individual Neocortical Projection Neurons
2018-01-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.12.046
PMID:29320739
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研究论文 | 本文通过比较单层6皮质丘脑神经元在体感皮层的基因表达谱，揭示了转录子类型主要反映了轴突投射模式、皮质层位置和神经元活动状态 | 本文首次展示了轴突投射模式、皮质层位置和活动状态如何定义个体神经元的转录身份及其在每个神经元亚型中的转录异质性 | NA | 探讨细胞过程如何贡献于神经元亚型指定和转录异质性 | 单层6皮质丘脑神经元在体感皮层的基因表达 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1,023个细胞响应 |
| 26550 | 2024-08-09 |
Single-Cell Expression Profiling and Proteomics of Primordial Germ Cells, Spermatogonial Stem Cells, Adult Germ Stem Cells, and Oocytes
2018, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/5584_2017_117
PMID:29299873
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综述 | 本文综述了利用现代分子技术对不同类型的人类生殖细胞进行单细胞表达谱和蛋白质组学分析的研究进展 | 介绍了针对单细胞分析优化的现代分子技术，如单细胞荧光激活细胞分选（FACS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和微流控高通量实时定量PCR（qRT-PCR）等 | NA | 探讨和理解生殖细胞和干细胞的分子基础、细胞命运可塑性和决定机制 | 原始生殖细胞（PGCs）、精原干细胞（SSCs）、成人生殖干细胞（haGSCs）和卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、微流控高通量实时定量PCR（qRT-PCR）、液相色谱-串联质谱（LC-MSMS） | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | NA |
| 26551 | 2024-08-09 |
visnormsc: A Graphical User Interface to Normalize Single-cell RNA Sequencing Data
2018-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-017-0277-9
PMID:29280088
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研究论文 | 本文介绍了一个名为 visnormsc 的图形用户界面，用于标准化单细胞 RNA 测序数据 | 提供了一个用户友好的替代方案，使得不具备 R 编程能力的生物学家也能轻松使用 | NA | 简化单细胞 RNA 测序数据的标准化过程 | 单细胞 RNA 测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26552 | 2024-08-09 |
Developmental Emergence of Adult Neural Stem Cells as Revealed by Single-Cell Transcriptional Profiling
2017-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.12.017
PMID:29281841
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析胚胎期小鼠大脑皮层，以揭示成年神经干细胞的起源和发展 | 首次通过单细胞转录组分析揭示了成年神经干细胞从胚胎前体细胞到成年的转录身份维持过程 | NA | 探讨成年神经干细胞的起源和发展过程 | 胚胎期小鼠大脑皮层的细胞类型及其转录特征 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个发育时间点的胚胎小鼠大脑皮层样本 |
| 26553 | 2024-08-09 |
Clustering single cells: a review of approaches on high-and low-depth single-cell RNA-seq data
2018-07-01, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elx044
PMID:29236955
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综述 | 本文综述了在高深度和低深度单细胞RNA测序数据上进行细胞类型聚类的不同方法 | 研究发现，基于PCA的算法最适合低读取深度数据集，而基于基因聚类和双聚类算法在高通量数据集上表现更好 | 目前尚不清楚不同的计算细胞类型识别方法是否更适合于一种或另一种实验范式 | 探讨不同深度单细胞RNA测序数据的细胞类型聚类方法的适用性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, 基因聚类, 双聚类 | RNA测序数据 | 大量单细胞 |
| 26554 | 2024-08-09 |
Human-specific subcellular compartmentalization of P-element induced wimpy testis-like (PIWIL) granules during germ cell development and spermatogenesis
2018-02-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/dex365
PMID:29237021
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研究论文 | 研究了人类胚胎发育和精子发生过程中P-element induced wimpy testis-like (PIWIL)蛋白在生殖细胞中的表达动态及其亚细胞定位 | 发现了PIWIL蛋白在人类生殖细胞中的表达模式与小鼠不同，特别是在女性卵母细胞中PIWIL1的免疫染色显示出单一的密集核周体 | 研究受限于样本数量有限，因此分析的阶段也有限 | 探讨PIWIL蛋白在人类胚胎发育和精子发生过程中的表达动态及其在生殖细胞中的亚细胞定位 | PIWIL1, PIWIL2, PIWIL3和PIWIL4蛋白在人类生殖细胞中的表达和定位 | NA | NA | 免疫荧光 | NA | 组织样本 | 8个男性胚胎样本，6个女性胚胎样本，5个成年男性睾丸样本，242个单细胞转录组数据 |
| 26555 | 2024-08-09 |
Clinical Applications of and Challenges in Single-Cell Analysis of Circulating Tumor Cells
2018-Feb, DNA and cell biology
IF:2.6Q2
DOI:10.1089/dna.2017.3981
PMID:29265876
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review | 本文综述了单细胞分析循环肿瘤细胞（CTCs）的技术原理及其在基础研究和临床应用中的进展与挑战 | 利用单细胞测序技术发现了癌症细胞群体的异质性、化疗耐药的新驱动突变及肿瘤转移机制等新发现 | 目前面临的挑战包括技术限制和临床应用中的问题 | 探讨单细胞分析CTCs在癌症管理中的应用及面临的挑战 | 循环肿瘤细胞（CTCs）及其分子层面的检测与分析 | digital pathology | NA | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组、转录组和表观遗传数据 | NA |
| 26556 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq study determines the ontogeny of macrophages in glioblastomas
2017-Dec-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-017-1375-z
PMID:29262851
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研究论文 | 本文通过大规模单细胞RNA测序分析，揭示了胶质瘤相关巨噬细胞的发育过程及其在复杂肿瘤微环境中的新作用和新生物标志物 | 本文通过单细胞RNA测序技术，首次详细揭示了胶质瘤相关巨噬细胞的发育过程及其在肿瘤微环境中的新作用 | NA | 研究胶质瘤相关巨噬细胞的发育过程及其在肿瘤微环境中的作用 | 胶质瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 大规模样本 |
| 26557 | 2024-08-09 |
Integrated Bayesian analysis of rare exonic variants to identify risk genes for schizophrenia and neurodevelopmental disorders
2017-Dec-20, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-017-0497-y
PMID:29262854
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研究论文 | 本文通过集成贝叶斯分析罕见外显子变异，识别了精神分裂症和神经发育障碍的风险基因 | 本文扩展了用于自闭症研究的流程，并应用于推断精神分裂症和四种神经发育障碍的罕见遗传参数 | NA | 识别精神分裂症和神经发育障碍的风险基因 | 精神分裂症和神经发育障碍的风险基因 | 遗传学 | 神经发育障碍 | 贝叶斯建模 | 贝叶斯模型 | 全外显子序列数据 | 精神分裂症数据包括1,077个三联体家庭、6,699个病例和13,028个对照；四种神经发育障碍数据包括10,792个三联体家庭和4,058个病例和对照 |
| 26558 | 2024-08-09 |
[Study on the spatial expression of trophectoderm cells in human embryonic prenatal blastocysts]
2017-Dec-18, Beijing da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Peking University. Health sciences
PMID:29263466
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研究论文 | 本研究探讨了人类胚胎前卵泡期囊胚中滋养层细胞的空间表达 | 首次确定了从人类囊胚中分离出的极性和壁滋养层细胞的全局基因表达模式 | NA | 研究人类胚胎前卵泡期囊胚中滋养层细胞的空间表达 | 人类胚胎前卵泡期囊胚中的滋养层细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自辅助生殖技术的Gardner评分5AA囊胚，采集于受精后第6天 |
| 26559 | 2024-08-09 |
A Single-Cell RNA Sequencing Study Reveals Cellular and Molecular Dynamics of the Hippocampal Neurogenic Niche
2017-Dec-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.11.050
PMID:29241552
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究，揭示了海马神经发生微环境的细胞和分子动力学 | 本文通过单细胞RNA测序技术，全面描述了齿状回细胞，并识别了独特的细胞类型特异性标记，定义了神经干细胞（NSC）和前体细胞的发展阶段及转录动力学 | NA | 全面理解成年神经发生 | 神经干细胞（NSC）和前体细胞的发展阶段、分子决定因素以及微环境的细胞和分子组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 所有非神经细胞群体 |
| 26560 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals intrinsic and extrinsic regulatory heterogeneity in yeast responding to stress
2017-12, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.2004050
PMID:29240790
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了在盐胁迫下和无胁迫条件下，单个酿酒酵母细胞的转录异质性，并探讨了影响应激响应转录组的细胞协变量 | 本研究揭示了酵母细胞在应激前后的显著调控变异，并发现部分细胞在一定程度上解耦了核糖体蛋白基因表达与环境应激反应，这与细胞周期有关但与酵母超日代谢周期无关 | NA | 探究同源细胞群体中个体细胞在应激耐受性上的显著变异及其本质 | 酿酒酵母细胞在盐胁迫下的转录异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个酿酒酵母细胞 |