单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 26541 - 26560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26541 | 2024-08-09 |
Analysis of Single-Cell RNA-Seq Identifies Cell-Cell Communication Associated with Tumor Characteristics
2018-11-06, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.10.047
PMID:30404002
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，分析了肿瘤微环境中细胞间的配体-受体相互作用，并探讨了这些相互作用与肿瘤特征的关系 | 提出了一种新的方法来表征肿瘤微环境中所有细胞类型的配体-受体相互作用，并应用于六种同基因小鼠肿瘤模型中 | 对于哪些相互作用在肿瘤中发生以及这些相互作用如何影响结果的知识仍然有限 | 研究细胞间相互作用，其在不同肿瘤中的变异性及其与结果的关系 | 肿瘤微环境中的细胞间配体-受体相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 六种同基因小鼠肿瘤模型及一个公开的人类黑色素瘤数据集 |
| 26542 | 2024-08-09 |
The Mammalian Spermatogenesis Single-Cell Transcriptome, from Spermatogonial Stem Cells to Spermatids
2018-11-06, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.10.026
PMID:30404016
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，分析了从小鼠和人类中获取的超过62,000个生精细胞的转录组数据，揭示了从精原干细胞到精子细胞的基因表达模式。 | 首次全面展示了从精原干细胞到精子细胞的单细胞转录组图谱，为男性生殖相关疾病的研究和避孕方法的开发提供了丰富的信息资源。 | NA | 研究精原干细胞到精子细胞的基因表达变化，以及这些变化在男性生殖和相关疾病中的应用。 | 小鼠和人类的生精细胞。 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 超过62,000个生精细胞 |
| 26543 | 2024-08-09 |
AutoImpute: Autoencoder based imputation of single-cell RNA-seq data
2018-11-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-018-34688-x
PMID:30397240
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研究论文 | 本文介绍了一种基于自编码器的单细胞RNA测序数据插补方法AutoImpute | AutoImpute能够学习输入scRNA-seq数据的固有分布，并根据此分布插补缺失值，同时对生物学上静默的基因进行最小程度的修改 | NA | 开发一种新的方法来解决单细胞RNA测序数据中由于RNA量不足导致的零计数问题 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达矩阵 | NA |
| 26544 | 2024-08-09 |
Combination cancer immunotherapy targeting PD-1 and GITR can rescue CD8+ T cell dysfunction and maintain memory phenotype
2018-11-02, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aat7061
PMID:30389797
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研究论文 | 本文研究了联合癌症免疫疗法，通过靶向PD-1和GITR来恢复CD8+ T细胞功能并维持记忆表型 | 本文通过单细胞RNA测序发现，联合使用PD-1和GITR抗体可以协同增强CD8 T细胞的效应功能，通过恢复关键稳态调节因子CD226和TIGIT的平衡，从而显著提高生存效益 | NA | 研究如何通过激活共刺激途径来提高检查点抑制的疗效，并促进持久的免疫T细胞记忆 | 肿瘤浸润的CD8 T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过2000个肿瘤浸润的CD8 T细胞 |
| 26545 | 2024-08-09 |
Spatial organization of the somatosensory cortex revealed by osmFISH
2018-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-018-0175-z
PMID:30377364
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研究论文 | 本文介绍了一种循环单分子荧光原位杂交方法，并定义了体感皮层的细胞组织结构 | 开发了一种新的循环单分子荧光原位杂交技术，能够在大面积组织区域上同时映射大量细胞类型特异性标记 | 缺乏空间信息 | 创建脑的分子普查，通过单细胞转录组学产生大量分子定义的细胞类型目录 | 体感皮层的细胞组织 | NA | NA | osmFISH | NA | 分子数据 | 大面积组织区域 |
| 26546 | 2024-08-09 |
Shared and distinct transcriptomic cell types across neocortical areas
2018-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0654-5
PMID:30382198
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研究论文 | 本研究通过深度单细胞RNA测序分析了来自小鼠新皮质两个远端区域的23,822个细胞，定义了133种转录组细胞类型 | 研究结合单细胞RNA测序和逆行标记，将兴奋性神经元的转录组类型与其长距离投射特异性相匹配，建立了结合转录组和投射的皮质细胞类型分类 | NA | 探索小鼠新皮质中跨功能不同区域的细胞类型多样性 | 小鼠新皮质中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 23,822个细胞 |
| 26547 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing paints diverse pictures of the brain
2018-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/d41586-018-07027-3
PMID:30382219
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26548 | 2024-08-09 |
Disease-relevant transcriptional signatures identified in individual smooth muscle cells from healthy mouse vessels
2018-11-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-06891-x
PMID:30385745
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研究论文 | 本文通过结合单细胞转录组学和谱系追踪技术，研究了健康小鼠血管中血管平滑肌细胞（VSMCs）的异质性 | 发现了与疾病相关的转录特征，这些特征反映了VSMCs的区域特异性发育历史及其在炎症、粘附和迁移相关基因中的异质性表达 | NA | 探讨血管平滑肌细胞在健康血管中的异质性及其与疾病的关系 | 健康小鼠血管中的单个血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个健康小鼠血管中的单个血管平滑肌细胞 |
| 26549 | 2024-08-09 |
Tissue Unit-ed: Lung Cells Team up to Drive Alveolar Macrophage Development
2018-11-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.10.031
PMID:30388447
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研究论文 | Cohen等人利用单细胞RNA测序技术研究发育中的肺部免疫和非免疫细胞，绘制了在肺泡巨噬细胞发育过程中候选细胞间相互作用的地图 | 揭示了上皮细胞、ILC2s、嗜碱性粒细胞与发育中的巨噬细胞之间的潜在交叉对话，并在体外和体内进行了验证 | NA | 研究肺泡巨噬细胞发育过程中的细胞间相互作用 | 发育中的肺部免疫和非免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 26550 | 2024-08-09 |
A Cancer Cell Program Promotes T Cell Exclusion and Resistance to Checkpoint Blockade
2018-11-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.09.006
PMID:30388455
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和计算分析方法，探讨了促进免疫逃避的恶性细胞状态，并发现了一种与T细胞排除和免疫逃避相关的抗性程序。 | 本研究首次识别出一种在免疫治疗前表达的抗性程序，该程序在体内外模型中与CDK4/6抑制剂联合使用时能减少黑色素瘤肿瘤的生长。 | NA | 旨在揭示免疫检查点抑制剂抵抗的分子基础，并探索新的治疗策略以克服免疫治疗抵抗。 | 黑色素瘤肿瘤中的恶性细胞状态及其对免疫治疗的影响。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 33个黑色素瘤肿瘤样本和112名黑色素瘤患者 |
| 26551 | 2024-08-09 |
Chromium sequencing: the doors open for genomics of obligate plant pathogens
2018-11, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2018-0019
PMID:30394132
|
研究论文 | 本文使用Chromium 10X技术成功测序并组装了1.2吉碱基的专性植物病原菌Austropuccinia psidii的基因组 | 首次将Chromium 10X技术应用于专性植物病原菌的基因组测序，提供了更优的组装结果，且所需DNA量更少，成本更低 | NA | 探索Chromium 10X技术在专性植物病原菌基因组测序中的应用 | Austropuccinia psidii的基因组 | 基因组学 | 植物病害 | Chromium 10X | NA | 基因组数据 | 一个Austropuccinia psidii样本 |
| 26552 | 2024-08-09 |
A single-cell survey of the human first-trimester placenta and decidua
2018-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aau4788
PMID:30402542
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人类孕早期胎盘绒毛和蜕膜组织的细胞类型和功能 | 发现了许多已知和一些先前未知的胎盘绒毛和蜕膜细胞亚型，并揭示了细胞增殖亚群、细胞类型特异性转录因子的富集以及潜在的细胞间通讯 | NA | 进一步理解这些细胞在维持早期妊娠和妊娠相关疾病发病机制中的作用 | 人类孕早期胎盘绒毛和蜕膜组织 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 14,341个胎盘绒毛细胞和6,754个蜕膜细胞 |
| 26553 | 2024-08-09 |
Hiding in plain sight: time to unlock autoimmune clues in human CD5+ B cells by using nextgen technology
2018-09, Discovery medicine
IF:2.0Q3
PMID:30399325
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研究论文 | 本文探讨了使用下一代技术（如高通量测序和单细胞RNA测序）来揭示CD5+ B细胞在自身免疫疾病中的作用 | 利用新技术分析CD5+ B细胞，可能揭示与自身免疫疾病相关的公共B细胞受体，并阐明其与传统B细胞的关系 | NA | 探索CD5+ B细胞在自身免疫疾病中的作用，并开发新的治疗策略 | CD5+ B细胞及其在自身免疫疾病中的作用 | 分子生物学 | 自身免疫疾病 | 高通量测序, 单细胞RNA测序 | NA | B细胞受体数据, 转录组数据 | NA |
| 26554 | 2024-08-09 |
Centrosome aberrations and chromosome instability contribute to tumorigenesis and intra-tumor heterogeneity
2018, Journal of cancer metastasis and treatment
IF:1.4Q4
DOI:10.20517/2394-4722.2018.24
PMID:30381801
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研究论文 | 本文探讨了中心体异常和染色体不稳定在肿瘤发生和肿瘤内异质性中的作用 | 最近研究表明，特定组织中中心体数量或结构异常可在小鼠中引发肿瘤和侵袭 | 中心体异常与癌症的关系一直存在争议，且其在癌症中的作用高度依赖于具体情境 | 研究中心体异常和染色体不稳定在癌症中的作用及其对肿瘤内异质性的影响 | 中心体异常、染色体不稳定、肿瘤内异质性 | NA | 癌症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 26555 | 2024-08-09 |
Maintenance of human haematopoietic stem and progenitor cells in vitro using a chemical cocktail
2018, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-018-0059-5
PMID:30393564
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研究论文 | 本文研究了使用化学混合物在体外维持和可能扩展人类造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的有效培养条件 | 发现了一种由CHIR-99021、Forskolin和OAC1（CFO）组成的化学组合，能够有效维持人类CD34阳性细胞 | NA | 确定在体外维持和可能扩展人类HSPCs的有效培养条件 | 人类造血干细胞和祖细胞（HSPCs） | NA | NA | 流式细胞术，集落形成试验，异种移植，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 186种化学物质，人类CD34阳性细胞 |
| 26556 | 2024-08-09 |
An assessment of prognostic immunity markers in breast cancer
2018, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-018-0088-0
PMID:30393759
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研究论文 | 本文评估了肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）和免疫基因标记在乳腺癌中的预后价值，并构建了一个包含72个基因的免疫评分面板，用于预测乳腺癌的复发风险。 | 首次将17个免疫基因与TIL的活性状态关联，并构建了一个包含72个基因的免疫评分面板，用于预测乳腺癌的复发风险。 | NA | 评估免疫基因在乳腺癌中的预后价值，并开发一个用于预测乳腺癌复发风险的基因评分模型。 | 乳腺癌患者中的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）和免疫基因表达。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | Cox模型 | 基因表达数据 | 包括1951名患者的Affymetrix基因表达数据，以及来自Illumina beads array数据METABRIC的1997名患者和TCGA的996名患者的全转录组mRNA-seq数据。 |
| 26557 | 2024-08-09 |
A Single-Cell Sequencing Guide for Immunologists
2018, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2018.02425
PMID:30405621
|
研究论文 | 本文比较了四种常用的单细胞测序平台在免疫学领域的优势和局限性 | 探讨了不同单细胞测序平台的数据集成方法以及如何使用无偏见的生物信息学方法识别未知单细胞群体 | 未具体说明每种平台的具体局限性 | 帮助免疫学家选择最适合其生物学问题的单细胞测序协议/平台 | 四种常用的单细胞测序平台 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 (scRNA-seq) | NA | 数据集 | 未具体说明样本数量 |
| 26558 | 2024-08-09 |
ArrayExpress update - from bulk to single-cell expression data
2019-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky964
PMID:30357387
|
研究论文 | 本文更新了ArrayExpress数据库，从批量表达数据扩展到单细胞表达数据 | 引入了新的提交工具Annotare，收集必要的元数据以解释实验，并开发了BioStudies数据库以整合不同检测模式的多组学实验数据 | NA | 更新和扩展ArrayExpress数据库，以适应基于测序技术特别是RNA-seq实验的增加以及单细胞研究的显著增长 | 功能基因组学数据，特别是基于RNA-seq的单细胞表达数据 | 功能基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26559 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals the platinum resistance gene COX7B and the surrogate marker CD63
2018-12, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.1828
PMID:30367559
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了与铂类化疗耐药相关的基因COX7B和替代标记物CD63 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了COX7B基因与铂类化疗耐药性的关联，并发现了CD63作为替代标记物 | 研究主要集中在尿膀胱癌样本上，可能需要进一步验证其他类型癌症中的适用性 | 探索铂类化疗耐药性的分子机制及其潜在的治疗靶点 | 铂类化疗耐药性的基因和标记物 | 数字病理学 | 尿膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个癌症患者的肿瘤样本 |
| 26560 | 2024-08-09 |
Electrical Lysis and RNA Extraction from Single Cells Fixed by Dithiobis(succinimidyl propionate)
2018-11-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.8b02338
PMID:30350601
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research paper | 本文介绍了一种微流控方法，用于从单个固定细胞中进行电击穿和RNA提取，利用可逆交联剂二硫双(琥珀酰亚胺基丙酸酯)(DSP) | 提出了一种新的微流控系统，该系统能够在芯片上完成单个DSP固定细胞的捕获、DSP分子的反向交联、质膜的电击穿以及利用等速电泳辅助的核酸提取进行细胞质RNA的提取 | NA | 开发一种高效的微流控方法，用于从单个固定细胞中进行电击穿和RNA提取 | K562白血病细胞 | digital pathology | 白血病 | 微流控技术 | NA | RNA | 单个细胞 |