单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27271 篇文献，本页显示第 26421 - 26440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26421 | 2024-08-09 |
Current and Future Methods for mRNA Analysis: A Drive Toward Single Molecule Sequencing
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7834-2_11
PMID:29767365
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综述 | 本文综述了当前和未来的mRNA分析方法，特别是单分子测序技术的发展 | 介绍了长读长RNA测序和单细胞RNA测序等新技术，这些技术在从头组装转录组和异构体定量方面具有优势 | 短读长RNA测序在从头转录组组装和异构体定量方面存在局限性 | 探讨当前RNA测序技术的现状及其未来发展方向 | 转录组，包括mRNA和其他非编码RNA | 生物信息学 | NA | RNA测序（RNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 26422 | 2024-08-09 |
Muscle fiber type diversity revealed by anti-myosin heavy chain antibodies
2018-10, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.14502
PMID:29761627
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研究论文 | 本文通过抗肌球蛋白重链抗体揭示了肌肉纤维类型的多样性 | 本文利用特定的抗肌球蛋白重链抗体，为定义骨骼肌中的纤维类型、功能特性及其在肌肉疾病中的变化提供了强有力的工具 | NA | 探讨肌球蛋白重链的不同形式在肌肉纤维类型多样性中的作用 | 骨骼肌中的纤维类型及其在肌肉疾病中的变化 | NA | 肌肉疾病 | 抗体技术 | NA | NA | NA |
| 26423 | 2024-08-09 |
In silico analysis of single-cell RNA sequencing data from 3 and 7 days old mouse spermatogonial stem cells to identify their differentially expressed genes and transcriptional regulators
2018-09, Journal of cellular biochemistry
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/jcb.27066
PMID:29749669
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研究论文 | 本研究通过分析3天和7天龄小鼠精原干细胞的单细胞RNA测序数据，识别差异表达基因及其转录调控因子 | 本研究发现了68个上调基因和203个下调基因，并识别了这些基因的主要转录调控因子，这些因子可能在精原干细胞的发育过程中起关键作用 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序数据分析，识别不同发育阶段小鼠精原干细胞的差异表达基因及其调控因子 | 3天和7天龄小鼠精原干细胞 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 3天和7天龄小鼠精原干细胞 |
| 26424 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Meets Lineage Tracing
2018-Aug-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.04.014
PMID:29754780
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综述 | 本文讨论了基于转录组的细胞谱系轨迹预测算法、单细胞遗传谱系追踪以及这些技术在干细胞和癌症研究中的结合应用 | 近年来，技术的发展使得单细胞转录组学与遗传谱系追踪策略得以结合 | 单细胞转录组学提供的详细表型信息并不一定能反映遗传关系 | 重建组织或生物体内细胞间的谱系关系 | 细胞谱系关系及其在干细胞和癌症研究中的应用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 26425 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq of human induced pluripotent stem cells reveals cellular heterogeneity and cell state transitions between subpopulations
2018-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.223925.117
PMID:29752298
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了18,787个人类诱导多能干细胞，揭示了细胞异质性和亚群间的细胞状态转换 | 开发了一种无监督聚类方法，提高了预测准确性和特异性，并创新性地预测了细胞在亚群间的转换 | NA | 研究人类诱导多能干细胞的细胞异质性和细胞状态转换 | 人类诱导多能干细胞的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 18,787个人类诱导多能干细胞 |
| 26426 | 2024-08-09 |
Feasibility and biological rationale of repurposing sunitinib and erlotinib for dengue treatment
2018-07, Antiviral research
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.antiviral.2018.05.001
PMID:29753658
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研究论文 | 研究探讨了使用sunitinib和erlotinib治疗登革热病毒感染的可行性和生物学基础 | 首次证明了sunitinib和erlotinib组合在登革热病毒感染的小鼠模型中能够持续抑制系统性感染，并揭示了这些药物通过调节AAK1和GAK激酶的表达来发挥抗病毒作用 | 尽管sunitinib和erlotinib能够延迟但无法阻止免疫缺陷小鼠模型的晚期瘫痪，且这些药物无法穿透血脑屏障 | 评估sunitinib和erlotinib作为登革热治疗药物的可行性和潜在机制 | 登革热病毒感染的小鼠和人类原代单核细胞衍生的树突状细胞 | NA | 登革热 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及登革热病毒感染的小鼠和人类细胞样本 |
| 26427 | 2024-08-09 |
Transcriptomic analysis of the harvested endothelial cells in a swine model of mechanical thrombectomy
2018-Jul, Neuroradiology
IF:2.4Q2
DOI:10.1007/s00234-018-2033-1
PMID:29761220
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研究论文 | 本研究通过机械取栓术（MT）的猪模型，对采集的血管内皮细胞进行转录组分析 | 首次在机械取栓术的猪模型中，使用单细胞RNA测序技术分析采集的内皮细胞的分子特征 | 研究仅限于猪模型，尚未在人类临床实践中广泛应用 | 旨在通过细胞培养和转录组技术，分析机械取栓术中采集的内皮细胞的分子特性 | 机械取栓术中采集的血管内皮细胞 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 共获得37个包含CD31阳性细胞的样本 |
| 26428 | 2024-08-09 |
Isolation and genome sequencing of individual circulating tumor cells using hydrogel encapsulation and laser capture microdissection
2018-06-12, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/c8lc00184g
PMID:29762619
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研究论文 | 本文开发了一种结合生物物理富集和激光捕获显微切割（LCM）的单细胞样品制备和基因组测序流程，用于从循环肿瘤细胞（CTCs）中进行基因组分析 | 通过在水凝胶矩阵中封装富集的CTC样品，提高了LCM单细胞分离的效率，并兼容下游测序 | 单细胞测序技术在分离单个CTCs时存在细胞损失和操作困难、耗时的问题 | 开发一种新的方法来克服CTCs基因型鉴定的挑战，特别是解决白细胞污染和肿瘤细胞亚群异质性的问题 | 循环肿瘤细胞（CTCs）及其基因组 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 激光捕获显微切割（LCM） | NA | 基因组数据 | 单个患者的单个CTCs和无细胞DNA（cfDNA） |
| 26429 | 2024-08-09 |
The Polycomb-Dependent Epigenome Controls β Cell Dysfunction, Dedifferentiation, and Diabetes
2018-Jun-05, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2018.04.013
PMID:29754954
|
研究论文 | 本文通过结合深度表观基因组映射和单细胞转录组学，研究了染色质失调在2型糖尿病中的作用 | 发现了两种染色质状态特征，追踪了小鼠和人类β细胞功能障碍，并表明PRC2失调对疾病有贡献 | NA | 探索染色质机制在复杂疾病易感性和进展中的作用 | 2型糖尿病中的染色质失调 | 表观遗传学 | 糖尿病 | 深度表观基因组映射，单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类样本 |
| 26430 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptomics in neuroscience: cell classification and beyond
2018-06, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2018.04.021
PMID:29738987
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在神经科学中细胞分类及其相关应用的研究进展 | 单细胞转录组学的应用有助于发现不同细胞类型中差异表达的基因，从而深入理解细胞功能并实现对特定细胞类型的访问 | NA | 探讨单细胞转录组学在神经科学中的应用，特别是细胞分类及其相关研究 | 神经科学中的细胞分类及其相关研究 | 自然语言处理 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 26431 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing reveals the origin and the order of mutation acquisition in T-cell acute lymphoblastic leukemia
2018-06, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-018-0127-8
PMID:29740158
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研究论文 | 本研究利用靶向单细胞测序技术，分析了四例T细胞急性淋巴母细胞白血病（T-ALL）患者的骨髓细胞和CD34CD38多能祖细胞，揭示了T-ALL中突变获取的顺序及其起源 | 开发了一种基于图的算法来确定突变获取的顺序，并首次展示了T-ALL发展可能始于多能祖细胞 | 研究样本仅限于四例T-ALL患者，可能需要更多样本以验证结果的普遍性 | 探究T细胞急性淋巴母细胞白血病中突变获取的顺序及其起源 | T细胞急性淋巴母细胞白血病患者的骨髓细胞和CD34CD38多能祖细胞 | 数字病理学 | 血液病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 四例T-ALL患者 |
| 26432 | 2024-08-09 |
Marsarchaeota are an aerobic archaeal lineage abundant in geothermal iron oxide microbial mats
2018-06, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-018-0163-1
PMID:29760463
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研究论文 | 本文报道了在黄石国家公园的多种热化学环境中的铁氧化物微生物垫中发现并描述了一个新的门级古菌系，命名为'火星古菌（Marsarchaeota）'。 | 首次发现并描述了火星古菌，这是一种在微氧环境下富集于酸性铁氧化物微生物垫中的古菌，可能参与铁的还原过程。 | NA | 探索和理解古菌在地球生命树和进化历史中的作用。 | 火星古菌及其在铁氧化物微生物垫中的生态和生物化学角色。 | 微生物学 | NA | 宏基因组学，单细胞测序，富集培养，原位转录分析 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 多个铁氧化物微生物垫样本 |
| 26433 | 2024-08-09 |
Parental haplotype-specific single-cell transcriptomics reveal incomplete epigenetic reprogramming in human female germ cells
2018-05-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-04215-7
PMID:29760424
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研究论文 | 本文通过结合人类胎儿和母体组织的基因组测序与单细胞RNA测序，研究了人类女性生殖细胞中的不完全表观遗传重编程现象 | 首次揭示了人类女性生殖细胞中不同阶段的转录和表观遗传重塑的复杂性和细胞间异质性 | NA | 探究人类女性生殖细胞中表观遗传重编程的过程及其与转录阶段的关系 | 人类女性生殖细胞的表观遗传重编程和转录活动 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 五名捐赠者的细胞样本 |
| 26434 | 2024-08-09 |
Functional genetics of early human development
2018-10, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2018.04.005
PMID:29729430
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序和基因组编辑技术在人类细胞和胚胎中进行功能遗传学研究的最新进展 | 结合转录组分析和基因组工程，为人类胚胎中的关键过程如合子基因组激活、谱系指定、X染色体失活及植入后发育提供了新的见解 | NA | 探讨早期人类发育的遗传基础 | 早期人类发育的遗传机制 | 干细胞生物学 | 先天性疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 26435 | 2024-08-09 |
BCseq: accurate single cell RNA-seq quantification with bias correction
2018-08-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky308
PMID:29718338
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research paper | 本文提出了一种名为BCseq的稳健模型，用于从单细胞RNA测序（scRNA-seq）中准确量化基因表达 | BCseq通过数据自适应方式校正scRNA-seq的固有偏差，有效去除技术噪声，并通过加权考虑相似细胞来挽救丢失数据 | NA | 提高scRNA-seq数据分析的鲁棒性，准确检测差异表达基因和细胞亚型分类 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达量化 | digital pathology | NA | scRNA-seq | BCseq | 基因表达数据 | NA |
| 26436 | 2024-08-09 |
Pharmacological effect of human melanocortin-2 receptor accessory protein 2 variants on hypothalamic melanocortin receptors
2018-07, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-018-1596-2
PMID:29704154
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研究论文 | 本文研究了人黑色素皮质素-2受体辅助蛋白2（MRAP2）变体对下丘脑黑色素皮质素受体的影响 | 首次描述了中枢神经系统中单细胞转录组特征的Mrap2、Mc3r和Mc4r，并提供了MRAP2突变对MC3R信号传导的独特二聚体形成、构象变化和药理作用的证据 | NA | 探索MRAP2变体如何影响黑色素皮质素信号传导 | MRAP2变体对MC3R和MC4R信号传导的影响 | NA | 肥胖症 | RNA测序 | NA | RNA | 来自两个独立研究的单细胞分辨率的鼠下丘脑RNA测序数据集 |
| 26437 | 2024-08-09 |
bigSCale: an analytical framework for big-scale single-cell data
2018-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.230771.117
PMID:29724792
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研究论文 | bigSCale是一个可扩展的分析框架，用于处理大规模单细胞数据集 | bigSCale通过使用大样本量来估计噪声的准确数值模型，并采用定向卷积策略处理极大数据集，同时保留单个细胞的转录信息 | NA | 开发一个能够有效分析大规模单细胞数据集的分析框架 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞数据 | 130万细胞 |
| 26438 | 2024-08-09 |
Integrated Single-Cell Analysis Maps the Continuous Regulatory Landscape of Human Hematopoietic Differentiation
2018-05-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.03.074
PMID:29706549
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研究论文 | 本文通过收集10种免疫表型定义的人类造血细胞类型的单细胞染色质可及性数据，构建了人类造血分化的染色质可及性景观，并结合单细胞RNA测序数据，探索了复杂的调控动态。 | 本文首次在单细胞水平上整合了染色质可及性和RNA测序数据，揭示了人类造血分化过程中的调控变异和分化轨迹。 | NA | 研究人类造血分化过程中的细胞调控变异和分化轨迹。 | 人类造血细胞类型的单细胞染色质可及性和RNA测序数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞染色质可及性数据 | 10种免疫表型定义的人类造血细胞类型 |
| 26439 | 2024-08-09 |
Evolution of pallium, hippocampus, and cortical cell types revealed by single-cell transcriptomics in reptiles
2018-05-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aar4237
PMID:29724907
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研究论文 | 本研究通过大规模单细胞mRNA测序构建了两种爬行动物大脑皮层的基因表达图谱，探讨了哺乳动物大脑皮层神经元和区域的进化过程。 | 研究揭示了哺乳动物新皮层各层的神经元类型是由祖先基因调控程序的多样化产生的，而爬行动物皮层GABA能神经元的多样性表明，已知的哺乳动物中间神经元类别在所有羊膜动物的共同祖先中已经存在。 | NA | 探讨哺乳动物大脑皮层神经元和区域的进化过程 | 爬行动物的大脑皮层 | 数字病理学 | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种爬行动物的大脑皮层样本 |
| 26440 | 2024-08-09 |
Parabiosis and single-cell RNA sequencing reveal a limited contribution of monocytes to myofibroblasts in kidney fibrosis
2018-05-03, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.99561
PMID:29720573
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研究论文 | 研究通过诱导遗传命运追踪和共生模型，结合单细胞RNA测序技术，探讨了肾纤维化中肌成纤维细胞的来源 | 首次通过共生模型和单细胞RNA测序技术证实了循环中的单核细胞对肾肌成纤维细胞的贡献有限，并揭示了其通过旁分泌而非直接机制参与肾纤维化 | 研究仅限于共生模型和单细胞RNA测序技术，未涉及其他模型或技术 | 探讨肾纤维化中肌成纤维细胞的细胞来源 | 肾纤维化中的肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |