单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27271 篇文献，本页显示第 26401 - 26420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26401 | 2024-08-09 |
Ontogeny and Biology of Human Small Airway Epithelial Club Cells
2018-12-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.201710-2107OC
PMID:29874100
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研究论文 | 研究人类小气道上皮杯状细胞的发育和生物学特性 | 揭示了人类杯状细胞的分子表型和生物学功能，并识别出基底细胞作为杯状细胞的前体细胞 | NA | 定义人类小气道上皮杯状细胞的发育和生物学特性 | 人类小气道上皮杯状细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 从正常人肺中通过支气管镜和刷取样的小气道上皮细胞 |
| 26402 | 2024-08-09 |
Histone Variant H2A.Z Is Required for the Maintenance of Smooth Muscle Cell Identity as Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2018-11-13, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了组蛋白变体H2A.Z在维持血管平滑肌细胞身份中的关键作用 | 首次揭示了H2A.Z在控制血管疾病中细胞身份的作用，并提出了其作为干预节点的潜力 | NA | 探索组蛋白变体在血管疾病中控制细胞身份的作用 | 人类动脉中的血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及疾病和正常的人类血管组织样本 |
| 26403 | 2024-08-09 |
T Cell-Dependent Affinity Maturation and Innate Immune Pathways Differentially Drive Autoreactive B Cell Responses in Rheumatoid Arthritis
2018-11, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.40578
PMID:29855173
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研究论文 | 本研究探讨了类风湿性关节炎（RA）中抗瓜氨酸蛋白抗体（ACPA）和类风湿因子（RF）阳性B细胞通过不同分子机制打破耐受性的情况 | 通过单细胞RNA测序分析了ACPA+和RF+ B细胞的免疫球蛋白谱和转录程序，发现这两种B细胞具有不同的转录调控网络 | NA | 研究ACPA+和RF+ B细胞在类风湿性关节炎中打破耐受性的分子机制 | ACPA+和RF+ B细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 2,349个B细胞来自6名RA患者和1名健康供体 |
| 26404 | 2024-08-09 |
Spatial transcriptomic survey of human embryonic cerebral cortex by single-cell RNA-seq analysis
2018-07, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-018-0053-3
PMID:29867213
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，对人类胚胎期大脑皮层的22个脑区进行了空间转录组调查 | 首次基于单细胞转录组分析对整个人类大脑皮层进行区域性特征描述 | NA | 揭示人类胚胎期大脑皮层的区域化基因表达和神经元成熟度的系统景观 | 人类胚胎期大脑皮层的22个脑区的4000多个单个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 4000多个单个细胞 |
| 26405 | 2024-08-09 |
A Single-Cell Transcriptomic Atlas of Thymus Organogenesis Resolves Cell Types and Developmental Maturation
2018-06-19, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2018.04.015
PMID:29884461
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，构建了一个胸腺器官发生的高分辨率转录组图谱，解析了细胞类型和发育成熟过程 | 首次在单细胞分辨率下全面捕捉胸腺器官发生的转录组框架，并揭示了胸腺上皮细胞的成熟动态及其在暴露于外源视黄酸时的内在能力 | NA | 研究胸腺发育的关键过程，并为生物学发现和胸腺器官发生的分子分析提供转录组框架 | 胸腺发育过程中的细胞类型和发育成熟 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 转录组数据 | 24,279个细胞 |
| 26406 | 2024-08-09 |
SINC-seq: correlation of transient gene expressions between nucleus and cytoplasm reflects single-cell physiology
2018-06-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1446-9
PMID:29871653
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research paper | 本文报道了一种微流控系统，该系统能够从单个细胞中物理分离核RNA（nucRNA）和细胞质RNA（cytRNA），并实现单细胞整合的nucRNA和cytRNA测序（SINC-seq） | SINC-seq构建了每个细胞的两个独立的RNA-seq文库，nucRNA和cytRNA，量化了亚细胞区室的基因表达，并将它们结合起来创建了新颖的单细胞RNA-seq数据 | NA | 利用SINC-seq发现细胞质RNA和核RNA之间的相关性的不同性质，这些性质反映了单细胞的瞬态生理状态 | 单个细胞的核RNA和细胞质RNA | NA | NA | SINC-seq | NA | RNA-seq | 单个细胞 |
| 26407 | 2024-08-09 |
Progressive Recruitment of Mesenchymal Progenitors Reveals a Time-Dependent Process of Cell Fate Acquisition in Mouse and Human Nephrogenesis
2018-06-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.05.010
PMID:29870722
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研究论文 | 本文通过高分辨率图像分析和三维重建技术，研究了人类和小鼠肾脏发育过程中间充质前体细胞向肾单位前体细胞的渐进性招募过程 | 提出了一个时间依赖性的招募模型，用于解释肾单位极性和模式化的形成 | NA | 揭示人类和小鼠肾脏发育中细胞命运获取的时间依赖性过程 | 人类和小鼠的肾脏发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA |
| 26408 | 2024-08-09 |
Identification and characterization of HIV-specific resident memory CD8+ T cells in human lymphoid tissue
2018-06-01, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aar4526
PMID:29858286
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研究论文 | 研究通过比较血液、胸导管淋巴液和淋巴组织中CD8 T细胞的特性，揭示了HIV特异性记忆CD8 T细胞在淋巴组织中的存在和特征 | 首次展示了淋巴组织中HIV特异性记忆CD8 T细胞的表型、转录和表观遗传特征，并发现这些细胞在自发控制HIV复制的个体中富集了效应相关免疫基因 | 研究主要集中在淋巴组织，未涉及其他可能影响HIV特异性CD8 T细胞分布的组织 | 探讨HIV感染中CD8 T细胞介导的保护机制，特别是在淋巴组织中的作用 | HIV特异性记忆CD8 T细胞在淋巴组织中的分布和特性 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及不同物种的血液、胸导管淋巴液和淋巴组织样本 |
| 26409 | 2024-08-09 |
Cnidarian Cell Type Diversity and Regulation Revealed by Whole-Organism Single-Cell RNA-Seq
2018-05-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.05.019
PMID:29856957
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研究论文 | 本研究通过全组织单细胞RNA测序技术，揭示了刺胞动物Nematostella vectensis的细胞类型多样性和调控机制 | 首次对非两侧对称动物Nematostella vectensis进行了全组织单细胞转录组分析，揭示了其细胞类型的复杂性和特异性基因表达的调控代码 | NA | 探索动物细胞类型多样性和特异性基因表达调控的进化机制 | 刺胞动物Nematostella vectensis的成体和幼体细胞类型及其基因调控程序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 26410 | 2024-08-09 |
ShinyCortex: Exploring Single-Cell Transcriptome Data From the Developing Human Cortex
2018, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2018.00315
PMID:29867326
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研究论文 | 本文介绍了ShinyCortex资源，该资源整合了来自发育中的人类和小鼠皮质的多项scRNA-seq研究数据，以便进一步分析 | ShinyCortex提供了一个基于R的动态且易于访问的平台，用于生物学家探索scRNA-seq数据 | NA | 探索单细胞转录组数据在发育中的人类皮质研究中的应用 | 发育中的人类和小鼠皮质细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 26411 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Neural Stem Cells
2017-Apr, Current pharmacology reports
DOI:10.1007/s40495-017-0084-3
PMID:29862164
|
综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在神经干细胞（NSCs）研究中的最新进展 | 介绍了scRNA-seq技术及其在NSC研究中的应用，探讨了该技术在基础研究和再生医学中的未来方向 | 讨论了scRNA-seq技术面临的挑战 | 探讨scRNA-seq技术在神经干细胞研究中的应用及其未来发展 | 成年中枢神经系统中的神经干细胞（NSCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 26412 | 2024-08-09 |
The Use of the Fluidigm C1 for RNA Expression Analyses of Single Cells
2018-04, Current protocols in molecular biology
DOI:10.1002/cpmb.55
PMID:29851244
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研究论文 | 本文描述了使用Fluidigm C1系统进行单细胞RNA表达分析的流程 | 开发了基于微流控技术的自动化平台，用于同时分离数十个单细胞并进行RNA测序分析 | NA | 理解单细胞水平上的转录异质性，以揭示发育和疾病中的基因调控机制 | 单细胞的转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数十个单细胞 |
| 26413 | 2024-08-09 |
Introduction to Single-Cell RNA Sequencing
2018-04, Current protocols in molecular biology
DOI:10.1002/cpmb.57
PMID:29851283
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研究论文 | 本文介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的方法及其在生物学研究中的应用 | scRNA-seq通过分离单个细胞并生成测序文库，允许以空前的分辨率评估细胞群体和生物系统的基本生物学特性 | NA | 介绍和讨论当前使用的最常见的scRNA-seq协议及其数据分析基础，以及在规划和设计scRNA-seq项目时需要考虑的因素 | 单细胞RNA测序技术及其数据分析方法 | 生物学 | NA | RNA测序（RNA-seq） | NA | 文本 | NA |
| 26414 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Protozoan and Metazoan Parasites
2018-09, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2018.04.009
PMID:29807759
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术（scRNAseq）探讨了原生动物和后生动物寄生虫的转录组特征 | 利用scRNAseq技术无偏差地表征细胞群组成 | NA | 探讨scRNAseq技术在寄生虫学中的应用潜力 | 原生动物和后生动物寄生虫的单细胞转录组 | digital pathology | NA | scRNAseq | NA | 转录组数据 | NA |
| 26415 | 2024-08-09 |
Tracing the temporal-spatial transcriptome landscapes of the human fetal digestive tract using single-cell RNA-sequencing
2018-06, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-018-0105-4
PMID:29802404
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了人类胎儿消化道主要器官（包括食道、胃、小肠和大肠）在6至25周妊娠期以及成人大肠的转录组时空景观 | 首次系统揭示了这些细胞类型的关键生物学特征，包括发育过程、信号传导途径、细胞周期、营养消化吸收代谢及转录因子网络，并通过比较胚胎和成人阶段的转录组轮廓，深入研究了大肠的分化与成熟过程 | NA | 研究人类胎儿消化道及成人大肠的基因调控网络 | 人类胎儿消化道的主要器官及成人大肠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 共分析了5,227个单个细胞，并清晰识别了40种细胞类型 |
| 26416 | 2024-08-09 |
Long noncoding RNAs exchange during zygotic genome activation in goat
2018-10-01, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioy118
PMID:29771291
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研究论文 | 本文研究了山羊中合子基因组激活（ZGA）过程中长非编码RNA（lncRNA）的交换情况 | 首次在山羊中确定了ZGA阶段，并使用单细胞RNA测序技术识别了关键分子候选物 | 研究主要集中在山羊的早期胚胎阶段，未涉及后续发育阶段 | 探讨山羊早期胚胎发育中ZGA过程及其调控机制 | 山羊的早期胚胎和lncRNA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 800个mRNA和250个lncRNA |
| 26417 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing for the study of development, physiology and disease
2018-08, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-018-0021-7
PMID:29789704
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序技术在研究发育、生理和疾病中的应用 | 单细胞RNA测序技术能够揭示细胞群体中的异质性，区分复杂细胞群体中的所有细胞类型 | 尽管技术不断进步，但仍存在一些限制需要克服 | 提高对正常和疾病相关生理过程的理解，并发现新的治疗途径 | 单细胞RNA测序技术在发育、生理和疾病研究中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 单个细胞 |
| 26418 | 2024-08-09 |
A Single-Cell Transcriptome Atlas of the Mouse Glomerulus
2018-08, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2018030238
PMID:29794128
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研究论文 | 本研究使用基于纳米液滴的高通量转录组测序技术，对纯化的野生型小鼠肾小球细胞进行了单细胞转录组分析 | 首次揭示了健康肾小球细胞群中的细胞异质性，并发现了新的标记基因和亚群 | NA | 全面表征肾小球细胞的基因表达，并为健康和疾病状态下肾小球功能的单细胞水平解析奠定基础 | 小鼠肾小球的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 基于纳米液滴的高通量转录组测序 | NA | 转录组 | 近13,000个单细胞 |
| 26419 | 2024-08-09 |
Interpretable dimensionality reduction of single cell transcriptome data with deep generative models
2018-05-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-04368-5
PMID:29784946
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scvis的稳健统计模型，用于捕捉和可视化单细胞基因表达数据中的低维结构 | scvis模型能够同时保留数据的局部和全局邻域结构，并且对数据点的数量具有鲁棒性，还能学习概率参数映射函数以添加新数据点到现有嵌入中 | NA | 开发一种新的方法来解释单细胞转录组数据中的结构 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度生成模型 | 基因表达数据 | 四组单细胞RNA测序数据 |
| 26420 | 2024-08-09 |
Transcriptomic Profiling of Zebrafish Hair Cells Using RiboTag
2018, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2018.00047
PMID:29765956
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研究论文 | 本文开发了一种转基因斑马鱼模型，用于评估内耳和侧线毛细胞在其原始组织环境中的翻译组 | 该模型通过表达GFP和HA标记基因，使得斑马鱼幼体的毛细胞mRNA可以通过免疫沉淀方法富集，从而在不诱导基因表达变化的情况下识别新的毛细胞表达基因 | NA | 研究斑马鱼毛细胞特异性基因表达的变化 | 斑马鱼的毛细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | mRNA | NA |