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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2621 | 2025-10-06 | 
         Dissecting the immune landscape in pediatric high-grade glioma reveals cell state changes under therapeutic pressure 
        
          2025-May-20, Cell reports. Medicine
          
         
        
          DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102095
          PMID:40315846
         
       | 
      
      研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析儿童高级别胶质瘤免疫景观 | 首次全面揭示儿童高级别胶质瘤免疫微环境在治疗压力下的细胞状态变化,并与成人胶质瘤进行对比 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 解析儿童高级别胶质瘤免疫微环境特征及其在治疗过程中的变化 | 儿童弥漫性高级别胶质瘤和高级别室管膜瘤患者的恶性细胞、髓系细胞和T细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 2622 | 2025-10-06 | 
         Central control of dynamic gene circuits governs T cell rest and activation 
        
          2025-Jan, Nature
          
          IF:50.5Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41586-024-08314-y
          PMID:39663454
         
       | 
      
      研究论文 | 通过CRISPR筛选和单细胞转录组学揭示MED12调控T细胞静息与激活状态转换的动态基因回路 | 发现约90%的IL-2Rα调控因子在不同细胞类型和刺激状态下具有可变效应,其中MED12作为动态协调者通过COMPASS复合物控制组蛋白甲基化 | 研究主要聚焦于CD4 T细胞,未涵盖其他免疫细胞类型 | 阐明T细胞在不同状态下维持身份和响应环境信号的动态基因调控机制 | 原代人CD4 T细胞 | 基因调控网络 | 免疫相关疾病 | CRISPR筛选, 单细胞转录组学, 免疫沉淀-质谱分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | 多种原代人CD4 T细胞环境 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 2623 | 2025-10-06 | 
         Decoding the mosaic of inflammatory bowel disease: Illuminating insights with single-cell RNA technology 
        
          2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
          
          IF:4.4Q2
          
         
        
          DOI:10.1016/j.csbj.2024.07.011
          PMID:39421242
         
       | 
      
      综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在炎症性肠病研究中的最新进展与应用 | 系统整合单细胞转录组、蛋白质组、T细胞受体谱和表观遗传分析,提供IBD发病机制的全面视角 | 缺乏纵向研究数据,需要整合多种单细胞和空间转录组技术 | 探索单细胞测序技术在炎症性肠病研究中的应用价值 | 炎症性肠病(包括溃疡性结肠炎和克罗恩病)患者细胞 | 数字病理 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组分析, T细胞受体谱分析, 表观遗传分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 2624 | 2025-10-06 | 
         Methods to Enable Spatial Transcriptomics of Bone Tissues 
        
          2024-May-03, Journal of visualized experiments : JoVE
          
         
        
          DOI:10.3791/66850
          PMID:38767376
         
       | 
      
      研究论文 | 开发了一种用于骨组织空间转录组学分析的方法,能够有效处理新鲜骨组织和存档样本 | 解决了硬组织样本在空间转录组学分析中的技术难题,特别是骨组织的脱钙处理与RNA保存的平衡 | 方法主要针对骨组织,对其他硬组织的适用性需要进一步验证 | 开发适用于骨组织的空间转录组学分析方法 | 骨组织样本,包括新鲜骨组织和组织库中的存档样本 | 空间转录组学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据,组织形态学数据 | 骨肉瘤原发肿瘤和肺转移样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 2625 | 2025-10-06 | 
         Integrating single-cell and spatial analysis reveals MUC1-mediated cellular crosstalk in mucinous colorectal adenocarcinoma 
        
          2024-05, Clinical and translational medicine
          
          IF:7.9Q1
          
         
        
          DOI:10.1002/ctm2.1701
          PMID:38778448
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,系统分析黏液性结直肠腺癌的肿瘤微环境,揭示MUC1介导的细胞间相互作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统解析MCA肿瘤微环境,发现MUC1+肿瘤细胞与ZEB1+内皮细胞的关键相互作用 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证发现 | 深入理解黏液性结直肠腺癌肿瘤微环境的细胞间相互作用机制 | 黏液性结直肠腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 三维生物打印, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 2626 | 2025-10-06 | 
         Melanocyte stem cells in the skin: Origin, biological characteristics, homeostatic maintenance and therapeutic potential 
        
          2024-05, Clinical and translational medicine
          
          IF:7.9Q1
          
         
        
          DOI:10.1002/ctm2.1720
          PMID:38778457
         
       | 
      
      综述 | 本文全面概述皮肤黑色素细胞干细胞的起源、生物学特性、稳态维持及治疗潜力 | 重点强调单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9技术和实用模型在黑色素细胞干细胞研究中的重要意义 | NA | 探讨黑色素细胞干细胞在皮肤组织稳态维持和疾病治疗中的潜在应用价值 | 哺乳动物毛囊、表皮或汗腺中的黑色素细胞干细胞 | 再生医学 | 皮肤色素障碍疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2627 | 2025-10-06 | 
         Landscape of gut mucosal immune cells showed gap of follicular or memory B cells into plasma cells in immunological non-responders 
        
          2024-05, Clinical and translational medicine
          
          IF:7.9Q1
          
         
        
          DOI:10.1002/ctm2.1699
          PMID:38783408
         
       | 
      
      研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析HIV感染者肠道黏膜免疫细胞,揭示免疫无应答者B细胞向浆细胞分化存在缺陷 | 首次在单细胞水平描绘HIV感染者肠道黏膜免疫细胞图谱,发现免疫无应答者滤泡/记忆B细胞向浆细胞分化存在障碍 | 样本量较小(仅17名参与者),需要更大规模研究验证 | 探究HIV感染者肠道黏膜免疫细胞在免疫恢复中的作用机制 | HIV感染者肠道黏膜免疫细胞 | 单细胞生物学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序,免疫组化,16S rRNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,微生物组数据,流式细胞数据 | 17名参与者(5名HIV阴性对照,9名免疫应答者,3名免疫无应答者),54,475个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序,16S rRNA测序 | NA | NA | 
| 2628 | 2024-08-07 | 
         Integrated single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics analysis reveals the tumour microenvironment in patients with endometrial cancer responding to anti-PD-1 treatment 
        
          2024-04, Clinical and translational medicine
          
          IF:7.9Q1
          
         
        
          DOI:10.1002/ctm2.1668
          PMID:38649737
         
       | 
      
      NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 2629 | 2025-10-06 | 
         Regulatory T cells in skin mediate immune privilege of the hair follicle stem cell niche 
        
          2024-01-05, Science immunology
          
          IF:17.6Q1
          
         
        
          DOI:10.1126/sciimmunol.adh0152
          PMID:38181095
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了皮肤中调节性T细胞通过IL-2信号通路保护毛囊干细胞生态位的免疫豁免机制 | 开发了皮肤特异性Treg细胞基因重组技术,首次证明非淋巴器官中存在局部免疫耐受机制 | 研究主要依赖基因工程小鼠模型,人类疾病验证仅限于罕见脱发类型 | 探究皮肤局部调节性T细胞维持自身免疫耐受的生物学机制 | 皮肤调节性T细胞、毛囊干细胞生态位、脱发疾病模型 | 免疫学 | 脱发症 | 空间转录组学、遗传重组技术 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 2630 | 2025-10-06 | 
         Denoising sparse microbial signals from single-cell sequencing of mammalian host tissues 
        
          2023-Sep, Nature computational science
          
          IF:12.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s43588-023-00507-1
          PMID:37946872
         
       | 
      
      研究论文 | 开发SAHMI计算方法从哺乳动物组织单细胞测序数据中识别真实存在的微生物核酸并过滤污染物 | 首次提出专门针对单细胞和空间基因组数据中稀疏微生物信号去噪的计算方法 | NA | 解决宿主-微生物组生态系统研究中微生物信号与污染物区分的技术难题 | 哺乳动物组织中的微生物核酸 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序, 空间基因组测序, 转录组测序 | NA | 基因组测序数据, 转录组测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 2631 | 2025-10-06 | 
         Drosophila Voltage-Gated Sodium Channels Are Only Expressed in Active Neurons and Are Localized to Distal Axonal Initial Segment-like Domains 
        
          2020-10-14, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
          
         
        
          DOI:10.1523/JNEUROSCI.0142-20.2020
          PMID:32928889
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过标记果蝇中唯一的电压门控钠通道Para,揭示了其在神经元中的表达模式和亚细胞定位 | 首次发现果蝇钠通道仅表达于活跃神经元,并定位于轴突远端起始段样结构 | 研究主要聚焦果蝇模型,在其它无脊椎动物中的普适性需要进一步验证 | 探究无脊椎神经元中动作电位的起始位置和钠通道的表达特征 | 果蝇胚胎期、幼虫期和成年期中枢神经系统神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 全细胞膜片钳电生理记录, 基因标记技术 | NA | 基因表达数据, 电生理记录数据, 转录组数据 | 果蝇第三龄幼虫全脑单细胞转录组图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2632 | 2025-10-06 | 
         A revised airway epithelial hierarchy includes CFTR-expressing ionocytes 
        
          2018-08, Nature
          
          IF:50.5Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41586-018-0393-7
          PMID:30069044
         
       | 
      
      研究论文 | 通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术,重新定义了小鼠气管上皮细胞的组成和层级结构,发现表达CFTR的离子细胞在囊性纤维化中的关键作用 | 识别出新型Foxi1肺离子细胞、定位依赖的功能性club细胞变异、高周转鳞状上皮结构中的'hillocks'细胞,并开发了结合单细胞测序和谱系追踪的'pulse-seq'技术 | 研究主要基于小鼠模型,人类验证数据有限 | 探索气道上皮细胞的组成、层级结构及其在呼吸系统疾病中的作用 | 小鼠气管上皮细胞 | 单细胞生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序, 体内谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2633 | 2025-10-06 | 
         Lamin A/C Expression in Hematopoietic Cells Declines During Human Aging and Constrains Atherosclerosis in Mice 
        
          2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
          
         
        
          DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322893
          PMID:40605747
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨了人类衰老过程中造血细胞Lamin A/C表达下降对动脉粥样硬化的影响机制 | 首次发现人类衰老与血液白细胞Lamin A/C表达下降相关,并创建了首个体内Lamin A功能获得性模型 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的直接验证有限 | 研究衰老过程中Lamin A/C表达变化对动脉粥样硬化发展的影响 | 人类循环白细胞、Ldlr-/-缺陷小鼠、Lmna-null小鼠和Lmnatg转基因小鼠 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、骨髓移植、活体显微镜检查、油红O染色 | NA | 基因表达数据、图像数据、测序数据 | 人类白细胞样本和多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2634 | 2025-10-06 | 
         Tricuspid Aortic Valve Regurgitation Associates With Ascending Aortic Aneurysm Through Endothelial Activation and Lipoprotein Infiltration 
        
          2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
          
         
        
          DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323112
          PMID:40740135
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨了三尖瓣主动脉瓣反流通过内皮细胞间质激活和脂蛋白浸润与升主动脉瘤形成的关联机制 | 首次揭示了主动脉瓣反流通过双向血流介导的内皮细胞间质激活和载脂蛋白B脂蛋白浸润在升主动脉瘤形成中的独特病理作用 | 研究样本仅限于三尖瓣主动脉瓣患者,未包含其他类型主动脉瓣病变患者 | 研究主动脉瓣反流与血管激活和炎症的关系,探索升主动脉瘤的发病机制 | 接受择期开胸手术的三尖瓣主动脉瓣患者和器官捐献者的主动脉标本 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组学,免疫组织化学,超声心动图 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,影像数据 | 未明确具体样本数量,包括患者和器官捐献者标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 2635 | 2025-10-06 | 
         Improving reproducibility of differentially expressed genes in single-cell transcriptomic studies of neurodegenerative diseases through meta-analysis 
        
          2025-Aug-12, Nature communications
          
          IF:14.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41467-025-62579-z
          PMID:40796563
         
       | 
      
      研究论文 | 开发了一种基于相对差异表达排序可重复性的非参数元分析方法,用于提高单细胞转录组研究中差异表达基因的可重复性 | 提出了SumRank元分析方法,基于跨数据集相对差异表达排序的可重复性来识别差异表达基因,相比传统方法具有更好的预测能力 | 未明确说明样本量限制,且方法在不同疾病类型中的效果存在差异 | 提高单细胞转录组研究中差异表达基因的可重复性 | 帕金森病、亨廷顿病、阿尔茨海默病、精神分裂症和COVID-19的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 非参数元分析方法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 2636 | 2025-10-06 | 
         Galectin-9 inhibition of the MIF-CD74/CD44 pathway suppresses chronic arthritis 
        
          2025-Aug-11, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
          
          IF:12.1Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.016
          PMID:40798883
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现类风湿关节炎中MIF亚群的作用,并证明galectin-9通过抑制MIF-CD74/CD44通路可有效抑制关节炎破坏性表型 | 首次在单细胞水平识别RA-FLSs中的MIF功能亚群,并发现sGal-9作为新型抗MIF剂可通过阻断CD44抑制关节炎破坏进程 | 目前尚无临床批准药物,研究主要基于动物模型和体外实验 | 探索galectin-9通过抑制MIF-CD74/CD44通路治疗类风湿关节炎的机制和效果 | 类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞(RA-FLSs)和小鼠关节炎模型 | 单细胞测序 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序,异种移植关节炎模型,胶原诱导性关节炎模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2637 | 2025-10-06 | 
         Impact of intercellular adhesion molecule 1-positive dental pulp stem cells in deep caries progression 
        
          2025-08, International endodontic journal
          
          IF:5.4Q1
          
         
        
          DOI:10.1111/iej.14248
          PMID:40343788
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨了ICAM1阳性牙髓干细胞在深龋进展中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示了深龋组织中ICAM1+ DPSCs的增多及其与单核巨噬细胞的相互作用 | 研究主要基于体外实验,需要进一步在体验证 | 研究ICAM1+ DPSCs在深龋免疫微环境中的作用以开发治疗策略 | 人源和小鼠模型的牙髓组织及THP-1细胞系 | 单细胞生物学 | 牙科疾病 | 单细胞测序, 免疫荧光, 流式细胞术, RT-qPCR, Western Blot, ELISA, SCENIC, RNA-seq | NA | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 人源和小鼠深龋及健康牙髓组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2638 | 2025-10-06 | 
         Astrocytic AEG-1 drives neuroinflammation and enhances seizure susceptibility 
        
          2025-08, Neurobiology of disease
          
          IF:5.1Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.nbd.2025.106957
          PMID:40383165
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨星形胶质细胞中AEG-1基因在神经炎症和癫痫易感性中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示AEG-1表达星形胶质细胞亚群与炎症反应的关联,并证实AEG-1通过NF-κB信号通路介导神经炎症和癫痫易感性 | 研究主要基于LPS诱导的小鼠模型和体外培养模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究星形胶质细胞AEG-1在神经炎症和癫痫易感性中的分子机制 | 小鼠模型和体外星形胶质细胞培养模型 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2639 | 2025-10-06 | 
         Multi-omics characterization of oncosis in spinal cord injury 
        
          2025-08, Neurobiology of disease
          
          IF:5.1Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.nbd.2025.106982
          PMID:40467009
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过多组学方法首次系统描绘了脊髓损伤后oncosis相关基因的时空表达图谱 | 首次在脊髓损伤中系统研究oncosis的作用,揭示了6个关键基因的时空表达模式和细胞特异性 | 研究主要基于动物模型,需要进一步验证在人类脊髓损伤中的适用性 | 阐明oncosis在脊髓损伤中的作用机制并寻找潜在治疗靶点 | 脊髓损伤大鼠模型和LPS处理的PC12细胞系 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qRT-PCR, 免疫荧光, 透射电镜 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 多个时间点的脊髓损伤大鼠样本和细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 2640 | 2025-10-06 | 
         Emerging molecular Therapeutic targets in breast Cancer: Pathologic identification and clinical implications 
        
          2025-Aug, Human pathology
          
          IF:2.7Q2
          
         
        
          DOI:10.1016/j.humpath.2025.105881
          PMID:40759284
         
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      综述 | 本文总结了乳腺癌当前和新兴的分子生物标志物及其在精准肿瘤学中的应用 | 系统梳理了包括液体活检、空间转录组学和高通量技术在内的新兴生物标志物发现方法及其临床转化潜力 | 生物标志物的标准化、可重复性和临床验证仍面临挑战 | 总结乳腺癌分子治疗靶点的病理学识别和临床意义 | 乳腺癌分子生物标志物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 下一代测序, 液体活检, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 基因组数据, 分子标志物数据, 肿瘤微环境数据 | NA | NA | 空间转录组学, 液体活检 | NA | NA |