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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2621 - 2640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2621 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics of healthy and fibrotic human liver at single-cell resolution
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55325-4
PMID:39747812
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研究论文 | 本研究通过空间转录组技术绘制了健康与纤维化人类肝脏的单细胞分辨率空间图谱 | 首次在单细胞分辨率下描述人类肝脏的空间组织结构，并揭示纤维化过程中的细胞空间重塑 | NA | 探索人类肝脏在健康和纤维化状态下的空间细胞组织和基因表达特征 | 人类肝脏组织（健康和纤维化样本） | 空间转录组学 | 肝纤维化 | MERFISH, snRNA-seq | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | 多重错误稳健荧光原位杂交(MERFISH)，单核RNA测序(snRNA-seq) |
| 2622 | 2025-10-06 |
Isolation of Mouse Bone Marrow Niche Cells for Single-Cell Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2025_630
PMID:40397275
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方法论文 | 介绍从小鼠股骨和胫骨中分离骨髓微环境细胞用于单细胞RNA测序的方法 | 通过荧光激活细胞分选技术实现高质量骨髓微环境细胞的分离，确保高活性和纯度 | NA | 开发骨髓微环境细胞分离方法以支持单细胞测序研究 | 小鼠骨髓微环境细胞 | 单细胞生物学 | NA | 荧光激活细胞分选，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2623 | 2025-10-06 |
Stem Cell Niche: iPSC-Based Assembloids for Modeling Human Hematopoiesis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2025_629
PMID:40459837
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研究论文 | 开发了一种基于iPSC的3D骨髓模拟组装体用于模拟人类造血过程 | 建立了患者特异性3D骨髓模拟组装体平台，可精确控制细胞组成和遗传背景，成功重现了骨髓增生性肿瘤的关键特征 | NA | 研究造血调控机制和骨髓微环境重塑 | 诱导多能干细胞(iPSCs)、人类原代间充质基质细胞(MSCs) | 干细胞研究 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 3D组装体模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2624 | 2025-10-06 |
Integrated Bioinformatics and Experimental Validation Reveal Macrophage Polarization-Related Biomarkers for Osteoarthritis Diagnosis
2025, Journal of multidisciplinary healthcare
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/JMDH.S537507
PMID:40765736
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证构建与巨噬细胞极化相关的骨关节炎诊断模型 | 首次整合WGCNA、差异表达分析和多种机器学习算法识别巨噬细胞极化相关关键基因，并构建骨关节炎诊断模型 | 需要进一步的临床研究和实验评估来验证研究结果 | 识别骨关节炎中巨噬细胞极化相关关键基因并构建诊断模型 | 骨关节炎患者的滑膜组织和基因表达数据 | 生物信息学 | 骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, IHC | LASSO, 随机森林, SVM-RFE | 基因表达数据 | 15例临床样本(OA:10, 对照:5)用于RT-qPCR，11例样本(OA:6, 对照:5)用于IHC | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2625 | 2025-10-06 |
The novel diagnostic markers for systemic lupus erythematosus and periodontal disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1614044
PMID:40766309
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别系统性红斑狼疮和牙周病的共同诊断标志物 | 首次通过WGCNA和机器学习方法识别出LY96和TMEM140作为SLE和PD的共同诊断标志物 | 研究主要基于公共数据库的微阵列数据，需要进一步实验验证 | 探索系统性红斑狼疮和牙周病的共同遗传标志物及其诊断治疗价值 | 系统性红斑狼疮和牙周病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮,牙周病 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,免疫组织化学 | 随机森林 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE61635,GSE16134,GSE10334,GSE50772) | NA | 单细胞RNA测序,微阵列 | NA | NA |
| 2626 | 2025-10-06 |
Integrating proteomics and machine learning reveals characteristics and risks of lymph node-independent distant metastasis in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1622528
PMID:40766310
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研究论文 | 本研究通过整合蛋白质组学和机器学习方法，揭示了结直肠癌中不依赖淋巴结转移的远处转移特征和风险 | 首次开发了淋巴结非依赖性转移基因特征来预测I-II期结直肠癌患者的同步远处转移风险，并发现ITGA11在早期转移中的关键作用 | 样本量相对较小（12例患者），需要在更大规模队列中进一步验证 | 探索结直肠癌中不依赖淋巴结转移的远处转移的生物学特征和预测方法 | 结直肠癌患者组织样本和SW480细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | 数据非依赖性采集质谱、单细胞RNA测序、免疫组织化学、伤口愈合实验、transwell实验 | 机器学习模型 | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 | 12例结直肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱分析 | NA | NA |
| 2627 | 2025-10-06 |
Single-cell and multi-omics analysis reveals the role of stem cells in prognosis and immunotherapy of lung adenocarcinoma patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1634830
PMID:40766320
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学分析构建基于干细胞的预后模型，用于预测肺腺癌患者的生存和免疫治疗反应 | 首次通过单细胞RNA测序识别干细胞群体，结合多组学数据和多种机器学习算法构建干细胞预后模型，能够预测免疫治疗反应和肿瘤免疫微环境特征 | 模型验证主要依赖回顾性队列，需要在前瞻性研究中进一步验证 | 研究干细胞在肺腺癌预后和免疫治疗中的作用 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 机器学习 | CoxBoost+Enet, 多种机器学习算法 | 基因表达数据, 突变数据, 拷贝数变异数据 | 7个独立肺腺癌队列和免疫治疗数据集，外加内部医院队列 | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 2628 | 2025-10-06 |
Targeting PDCD4 in cancer and atrial fibrillation: mechanistic insights from integrated multi-omics and single-cell analysis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1593815
PMID:40766329
|
研究论文 | 通过整合多组学和单细胞分析揭示PDCD4在癌症和心房颤动中的调控机制 | 首次整合蛋白质相互作用网络、转录组分析和单细胞RNA测序数据系统研究PDCD4在心房颤动中的作用机制 | 样本量有限，主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索PDCD4相关关键基因及其在心房颤动中的调控机制 | 心房颤动患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 分子对接 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络, miRNA-mRNA调控网络 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 心房颤动患者和健康对照者的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | NA | NA |
| 2629 | 2025-10-06 |
Inferring Metabolic Flux from Gene Expression Data Using METAFlux
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4566-6_10
PMID:40779111
|
研究论文 | 开发了一种名为METAFlux的计算方法，用于从基因表达数据推断代谢通量 | 首次将通量平衡分析(FBA)应用于从bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据推断代谢反应活性 | 依赖于代谢组学技术的当前限制，可能无法完全表征肿瘤代谢组 | 解决肿瘤代谢重编程研究的计算分析缺口 | 恶性肿瘤细胞和肿瘤微环境中的细胞 | 计算生物学 | 癌症 | 通量平衡分析(FBA), RNA测序 | METAFlux | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2630 | 2025-10-06 |
Inferring Phenotypes of Copy Number Clones in Cancer Populations Using TreeAlign
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4566-6_7
PMID:40779108
|
研究论文 | 介绍使用TreeAlign方法联合分析单细胞全基因组测序和单细胞RNA测序数据中的拷贝数和基因表达 | 开发了能够匹配scRNA数据与scWGS推断克隆的系统发育感知方法，能够稳健建模基因剂量对基因表达的影响 | 需要同时具备单细胞RNA测序和单细胞全基因组测序数据，两种模式的联合测量并不常见 | 在单细胞水平上关联表达变化与拷贝数变化 | 癌症细胞群体中的拷贝数克隆 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞全基因组测序 | TreeAlign | 基因表达数据, 拷贝数变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞全基因组测序 | NA | NA |
| 2631 | 2025-10-06 |
Genome-scale modeling identifies dynamic metabolic vulnerabilities during the epithelial to mesenchymal transition
2024-Dec-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07408-7
PMID:39730911
|
研究论文 | 通过基因组尺度代谢建模识别上皮-间质转化过程中的动态代谢脆弱性 | 整合时间序列转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学数据，结合机制性计算模型揭示EMT过程中的时间动态代谢依赖关系 | 研究基于TGF-β刺激的细胞培养模型，可能无法完全反映体内EMT过程的复杂性 | 探索上皮-间质转化过程中的代谢网络重编程机制 | 上皮-间质转化过程中的细胞代谢变化 | 计算生物学 | 肺癌 | 基因组尺度代谢建模，时间序列转录组学，时间序列蛋白质组学，单细胞转录组学，CRISPR-Cas9筛选 | 机制性计算模型 | 转录组数据，蛋白质组数据，单细胞数据 | 多个细胞培养模型的EMT数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq，蛋白质组学 | NA | NA |
| 2632 | 2025-10-06 |
Associations between cuprotosis-related genes and the spectrum of metabolic dysfunction-associated fatty liver disease: An exploratory study
2024-12, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.15946
PMID:39285685
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研究论文 | 本研究探索铜死亡相关基因与代谢功能障碍相关脂肪肝疾病谱系之间的关联 | 首次系统研究铜死亡相关基因在MAFLD不同疾病阶段（包括肝癌）中的表达变化和功能作用 | 样本量相对有限，需要进一步功能验证实验 | 探索铜死亡相关基因在MAFLD疾病进展中的作用机制 | 代谢功能障碍相关脂肪肝疾病患者和MAFLD相关肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序，全基因组关联分析 | 逻辑回归分析，差异相关性分析 | 基因表达数据，临床数据 | MAFLD患者331例，MAFLD相关HCC患者271例，验证队列656例 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2633 | 2025-10-06 |
Mapping the gene space at single-cell resolution with gene signal pattern analysis
2024-Dec, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00734-0
PMID:39706866
|
研究论文 | 提出一种名为基因信号模式分析(GSPA)的图信号处理方法，用于从单细胞数据中学习基因表征 | 首次系统性地构建了基因嵌入问题，并开发了基于细胞-细胞图上扩散小波字典的基因表征学习方法 | NA | 开发能够从单细胞数据中学习基因表征的计算方法 | 单细胞测序数据中的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序，图信号处理 | GSPA（基因信号模式分析） | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2634 | 2025-10-06 |
[Ionizing radiation-induced damage (IRD) to and repair mechanisms of the male reproductive system: Report of testicular function changes in a case of IRD]
2024-Aug, Zhonghua nan ke xue = National journal of andrology
PMID:40778793
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研究论文 | 研究电离辐射对睾丸结构和功能的损伤机制及L-肉碱的干预效果 | 首次结合单细胞转录组测序与动物模型验证，揭示电离辐射通过干扰Leydig细胞和巨噬细胞的脂代谢通路导致生殖损伤 | 仅基于单个病例报告和小鼠模型，样本量有限 | 探究电离辐射对男性生殖系统的损伤机制及防治策略 | 人类睾丸组织和小鼠模型 | 生殖医学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组测序, 辐射剂量模拟, 精液分析, 激素检测, 电子显微镜 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据, 精液样本, 激素水平数据, 电子显微镜图像 | 1例人类病例+小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2635 | 2025-10-06 |
Distinct mesenchymal cell states mediate prostate cancer progression
2024-01-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-44210-1
PMID:38191471
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示前列腺癌进展中不同间充质细胞状态的关键作用 | 首次在跨物种水平系统鉴定前列腺癌间质细胞亚群，发现晚期小鼠疾病与人类骨转移的间质特征相似性，并建立超越Gleason评分的转移预测基因标签 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 解析前列腺癌肿瘤微环境中间充质细胞的分子特征及其在癌症进展中的作用 | 基因工程小鼠模型和人类前列腺癌样本中的间充质细胞 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四个基因工程小鼠模型及对应人类肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2636 | 2025-10-06 |
Distinct mesenchymal cell states mediate prostate cancer progression
2023-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.29.534769
PMID:37034687
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析前列腺癌间质细胞状态及其在癌症进展中的作用 | 识别了8个转录和功能不同的基质细胞群体，建立了能预测前列腺癌转移进展的基因特征 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究前列腺癌进展中基质-上皮细胞相互作用的分子机制 | 基因工程小鼠模型和人类前列腺癌样本中的间质细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 4种基因工程小鼠模型及其野生型对照，以及具有相似基因型的人类肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2637 | 2025-10-06 |
Universal prediction of cell-cycle position using transfer learning
2022-01-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02581-y
PMID:35101061
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研究论文 | 开发了一种名为tricycle的R/Bioconductor软件包，通过迁移学习实现细胞周期位置的通用预测 | 利用细胞周期生物学特性、周期性函数主成分分析的数学特性和迁移学习，克服了数据集依赖嵌入的学习限制 | NA | 从单细胞RNA-seq数据高分辨率推断细胞周期位置 | 细胞周期 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 迁移学习，主成分分析 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2638 | 2025-10-06 |
Single cell analyses of the HIV reservoir in the CNS and CSF: recent insights and implications
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000958
PMID:40742782
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综述 | 本综述重点介绍了单细胞组学技术在解析HIV在中枢神经系统和脑脊液中病毒储存库的最新进展 | 应用多种单细胞组学技术揭示HIV在中枢神经系统中的持续存在机制和细胞特异性特征 | NA | 探讨单细胞技术对HIV中枢神经系统储存库研究的推动作用 | HIV感染者的尸检脑组织和脑脊液样本 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, ATAC-seq, CITE-seq, AIRR-seq, 多组学平台, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组, 表观基因组, 空间转录组 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2639 | 2025-08-08 |
Single-cell sequencing technologies: a multiomics toolbox for investigating HIV-1 persistence
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000966
PMID:40772512
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2640 | 2025-10-06 |
HDGF derived from Müller cells enhances the activation of microglia in diabetic retinopathy
2025-Aug-25, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.38.20240386
PMID:40770862
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研究论文 | 本研究揭示了Müller细胞来源的HDGF在糖尿病视网膜病变中通过激活小胶质细胞促进炎症反应的作用机制 | 首次发现HDGF在糖尿病视网膜病变中主要由Müller细胞产生并靶向作用于小胶质细胞，阐明了HDGF-整合素β2-NCL信号轴在介导小胶质细胞过度活化中的新机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在人类临床样本中充分验证 | 探究HDGF在糖尿病视网膜病变炎症反应中的具体作用机制 | 糖尿病视网膜病变患者房水样本、Müller细胞、小胶质细胞、糖尿病小鼠模型 | 眼科疾病分子机制研究 | 糖尿病视网膜病变 | ELISA, qPCR, western blot, 荧光免疫染色, 单细胞RNA测序分析 | NA | 分子生物学数据, 单细胞测序数据, 免疫荧光图像 | 未明确说明具体样本数量，包括患者房水、细胞培养和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |