单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 26361 - 26380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26361 | 2024-08-09 |
McImpute: Matrix Completion Based Imputation for Single Cell RNA-seq Data
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00009
PMID:30761179
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研究论文 | 本文介绍了一种基于低秩矩阵完成的单细胞RNA测序数据填补技术mcImpute | mcImpute技术显著改善了真实数据集中真零与缺失值的区分、细胞聚类、差异表达分析、细胞类型可分离性、细胞可视化的降维技术性能以及基因分布 | NA | 开发一种新技术来填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 生物信息学 | NA | 低秩矩阵完成 | NA | RNA测序数据 | 多个真实数据集 |
| 26362 | 2024-08-09 |
PROSSTT: probabilistic simulation of single-cell RNA-seq data for complex differentiation processes
2019-09-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz078
PMID:30715210
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PROSSTT的概率模拟方法，用于生成具有复杂拓扑结构的单细胞RNA测序数据集，以支持细胞谱系树重建工具的测试和开发 | PROSSTT能够模拟具有任意复杂度、噪声水平、噪声模型和大小的单细胞RNA测序数据集，并提供脚本量化预测谱系树的质量 | NA | 开发和测试用于细胞谱系树重建的工具 | 单细胞RNA测序数据集及其谱系树 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率模拟 | RNA测序数据 | 任意大小 |
| 26363 | 2024-08-09 |
Defining the Cell Types That Drive Idiopathic Pulmonary Fibrosis Using Single-Cell RNA Sequencing
2019-Jun-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.201901-0197ED
PMID:30715901
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26364 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Resolves Molecular Relationships Among Individual Plant Cells
2019-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1104/pp.18.01482
PMID:30718350
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研究论文 | 本研究利用商业化的基于液滴的微流控平台进行高通量单细胞RNA测序，从超过10,000个拟南芥根细胞的原生质体中获得了单细胞转录组 | 首次广泛应用单细胞RNA测序技术于植物细胞，揭示了拟南芥根细胞的主要组织和发育阶段，并识别了不同的亚群和稀有细胞类型 | NA | 展示单细胞RNA测序在植物中的可行性和实用性，并提供拟南芥根细胞的单细胞分辨率基因表达图谱 | 拟南芥根细胞的单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过10,000个拟南芥根细胞的原生质体 |
| 26365 | 2024-08-09 |
Sensitive high-throughput single-cell RNA-seq reveals within-clonal transcript correlations in yeast populations
2019-04, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-018-0346-9
PMID:30718850
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研究论文 | 本文开发了一种敏感、可扩展且成本低廉的酵母单细胞RNA测序（yscRNA-seq）方法，用于检测酵母克隆群体中的转录相关性 | yscRNA-seq方法能够以链特异性和异构体特异性的方式数字化计数转录起始位点，检测低丰度的非编码RNA和至少一半的蛋白质编码基因 | 尽管检测到每个基因平均约3.5个分子，但单细胞水平上表达的异构体数量受到限制 | 揭示酵母克隆群体中的转录相关性 | 酵母单细胞RNA表达 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 酵母克隆细胞群体 |
| 26366 | 2024-08-09 |
MicroRNA-155 coordinates the immunological landscape within murine melanoma and correlates with immunity in human cancers
2019-03-21, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.126543
PMID:30721153
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了在野生型和miR-155 T细胞条件性敲除小鼠中生长的B16F10小鼠黑色素瘤肿瘤中CD45+免疫细胞群体的动态变化，揭示了miR-155在调节肿瘤内免疫细胞动态中的作用及其在人类癌症中的免疫相关性 | 首次详细分析了miR-155在实验性黑色素瘤肿瘤中免疫细胞类型和基因表达特征的作用，并阐明了其在哺乳动物肿瘤中协调抗肿瘤免疫反应的角色 | NA | 探讨miR-155在肿瘤内免疫细胞动态中的作用及其在人类癌症中的免疫相关性 | B16F10小鼠黑色素瘤肿瘤中的CD45+免疫细胞群体 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型和miR-155 T细胞条件性敲除小鼠的B16F10小鼠黑色素瘤肿瘤样本，以及TCGA数据库中29种其他人类实体肿瘤的基因表达数据 |
| 26367 | 2024-08-09 |
Fast interpolation-based t-SNE for improved visualization of single-cell RNA-seq data
2019-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-018-0308-4
PMID:30742040
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研究论文 | 本文提出了一种基于快速插值的t-SNE方法，用于改进单细胞RNA测序数据的可视化 | 本文显著加速了t-SNE算法，无需数据下采样，从而能够可视化稀有细胞群，并实现了一种基于一维t-SNE的热图样式可视化方法 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的可视化方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | t-SNE | t-SNE | 基因表达数据 | 大量单细胞样本 |
| 26368 | 2024-08-09 |
Specification of diverse cell types during early neurogenesis of the mouse cerebellum
2019-02-08, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.42388
PMID:30735127
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了胚胎期13.5天的小鼠小脑中约9400个细胞的全基因组表达情况，并通过迭代聚类和伪时间排序重建发育轨迹，揭示了小脑细胞类型和亚群的多样性及其调控机制。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了小脑发育过程中细胞命运指定的新转录程序，并发现了一些先前未知的亚群，这些亚群可能在小脑的形成和功能中起着关键作用。 | NA | 研究小鼠小脑早期神经发生过程中细胞类型的多样性及其分子调控机制。 | 小鼠胚胎期13.5天的小脑细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约9400个细胞 |
| 26369 | 2024-08-09 |
Lymphocyte innateness defined by transcriptional states reflects a balance between proliferation and effector functions
2019-02-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-08604-4
PMID:30737409
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研究论文 | 本文通过低输入和单细胞RNA测序研究人类淋巴细胞群体，揭示了固有T细胞的转录状态及其效应状态的维持机制 | 发现了连续的'固有性梯度'和四种广泛的固有状态，揭示了固有性由预形成的效应功能mRNA编码，但细胞增殖受损 | NA | 探讨固有T细胞如何维持准备好的效应状态 | 固有T细胞，包括不变自然杀伤T细胞、黏膜相关不变T细胞和γδ T细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类淋巴细胞群体 |
| 26370 | 2024-08-09 |
Human Spermatogonial Stem Cells Scrutinized under the Single-Cell Magnifying Glass
2019-02-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.01.010
PMID:30735645
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术详细研究了人类精原干细胞（SSCs）的分子特征 | 利用单细胞RNA测序技术对人类精原干细胞进行详细定义和分子特征分析 | NA | 研究人类精原干细胞的分子特征 | 人类精原干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 包括具有人类SSCs特征的精原子集的多种人类睾丸细胞群体 |
| 26371 | 2024-08-09 |
The Neonatal and Adult Human Testis Defined at the Single-Cell Level
2019-02-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.01.045
PMID:30726734
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了人类新生期和成年期的睾丸细胞 | 首次在单细胞水平上详细描述了人类新生期和成年期睾丸的细胞组成，并鉴定了原始精原细胞状态的蛋白质标记物 | NA | 深入理解人类精子发生过程 | 人类新生期和成年期的睾丸细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 多个新生期和成年期睾丸样本 |
| 26372 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: A general and flexible method for signal extraction from single-cell RNA-seq data
2019-02-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-08614-2
PMID:30718493
|
correction | 本文是针对原始文章中的两个方程错误进行的更正 | NA | NA | 更正原始文章中的数学方程错误 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26373 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals midbrain dopamine neuron diversity emerging during mouse brain development
2019-02-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-08453-1
PMID:30718509
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了在小鼠大脑发育过程中表达转录因子Pitx3的中脑多巴胺神经元的多样性 | 首次在全基因表达水平上系统地分类了中脑多巴胺神经元的多样性，并发现了七个神经元亚群，其中五个表达多巴胺能标记，两个分别表达谷氨酸能和GABA能标记 | NA | 揭示中脑多巴胺神经元在哺乳动物大脑中的亚群发育和功能 | 中脑多巴胺神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠大脑发育过程中的多个阶段的中脑多巴胺神经元 |
| 26374 | 2024-08-09 |
Neutrophils escort circulating tumour cells to enable cell cycle progression
2019-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-0915-y
PMID:30728496
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了中性粒细胞与循环肿瘤细胞（CTCs）的相互作用，揭示了中性粒细胞在促进CTCs细胞周期进展和增强转移潜能中的作用 | 首次详细描述了中性粒细胞与CTCs的相互作用及其对CTCs细胞周期进展的影响，为乳腺癌治疗提供了新的靶点 | 研究主要基于乳腺癌患者和鼠模型，可能需要进一步验证在其他类型癌症中的普遍性 | 探究癌症细胞与免疫细胞在癌症扩散过程中的相互作用，为开发新的癌症疗法提供依据 | 乳腺癌患者和鼠模型中的循环肿瘤细胞及其伴随的中性粒细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 乳腺癌患者和鼠模型的样本 |
| 26375 | 2024-08-09 |
Stem Cells and Cellular Origins of Mammary Gland: Updates in Rationale, Controversies, and Cancer Relevance
2019, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2019/4247168
PMID:30728840
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综述 | 本文综述了乳腺干细胞的特征及其在乳腺发育和癌症中的作用 | 介绍了单细胞测序技术对乳腺上皮细胞层次结构和谱系特征的全面理解 | NA | 探讨乳腺干细胞的异质性及其多样化的分化，并阐述乳腺干细胞与乳腺癌干细胞的关系 | 乳腺干细胞及其在乳腺发育和癌症中的作用 | NA | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 26376 | 2024-08-09 |
Dissociation of Tissues for Single-Cell Analysis
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9021-4_5
PMID:30742262
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研究论文 | 本文介绍了一种冷活性蛋白酶方法，用于器官和组织的单细胞解离，以更好地保留体内基因表达模式 | 提出了一种新的冷活性蛋白酶方法，用于单细胞解离，以保留细胞的体内基因表达模式 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序技术，以创建人体所有细胞类型的基因表达图谱 | 人体器官和组织的单细胞 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数千个细胞 |
| 26377 | 2024-08-09 |
Neural crest migration with continuous cell states
2019-11-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2019.01.029
PMID:30707976
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研究论文 | 本文探讨了颅神经嵴细胞迁移的连续状态模型，并通过实验数据验证了其有效性 | 提出了连续状态模型，包括信号选择和信号组合两种版本，这些模型在细胞迁移距离上优于离散状态模型 | 需要进一步调整模型参数以更好地匹配实验观察结果 | 验证连续状态模型在描述神经嵴细胞迁移中的有效性 | 颅神经嵴细胞的迁移行为 | NA | NA | 单细胞转录组数据分析 | 连续状态模型 | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 26378 | 2024-08-09 |
Clinical features and mechanistic insights regarding IgG4-related dacryoadenitis and sialoadenitis: a review
2019-Jul, International journal of oral and maxillofacial surgery
IF:2.2Q2
DOI:10.1016/j.ijom.2019.01.006
PMID:30686634
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综述 | 本文综述了IgG4相关性泪腺炎和唾液腺炎的临床特征及机制性见解 | 近年来通过应用新一代和单细胞RNA测序等分子生物学方法，揭示了与IgG4相关性疾病发病机制相关的重要机制性见解 | NA | 探讨IgG4相关性泪腺炎和唾液腺炎的临床特征及发病机制 | IgG4相关性泪腺炎和唾液腺炎 | NA | IgG4相关性疾病 | 下一代测序、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 26379 | 2024-08-09 |
Neuronal cell types in the annelid Platynereis dumerilii
2019-06, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2018.12.008
PMID:30685735
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综述 | 本文综述了海洋环节动物Platynereis dumerilii中神经细胞类型的多样性 | Platynereis dumerilii具有一些在主要无脊椎模型生物（如C. elegans和Drosophila）中缺失的生物学特征和细胞类型，如纤毛运动、去甲肾上腺素能神经元和纤毛光感受器细胞 | NA | 探讨Platynereis dumerilii中神经细胞类型的多样性及其功能 | Platynereis dumerilii的神经细胞类型及其功能 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、全基因表达图谱、连续电子显微镜重建 | NA | 细胞类型数据 | NA |
| 26380 | 2024-08-09 |
Integrative single-cell analysis
2019-05, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-019-0093-7
PMID:30696980
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术成熟与多种单细胞测量技术结合的最新进展，重点讨论了基因表达数据与其他类型单细胞测量数据的整合分析方法。 | 文章介绍了整合多种单细胞数据类型的新方法，这些方法能够跨数据类型学习，发现细胞模态间的关系，并学习细胞状态的整体表示。 | NA | 探讨单细胞分辨率下不同数据类型的收集与整合，特别是基因表达数据与其他单细胞测量数据的整合。 | 单细胞RNA测序数据与其他单细胞测量数据的整合分析。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据、遗传数据、表观遗传数据、空间数据、蛋白质组数据、谱系信息 | NA |