单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 26766 篇文献，本页显示第 26321 - 26340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26321 | 2024-08-09 |
High-throughput screening of rare metabolically active tumor cells in pleural effusion and peripheral blood of lung cancer patients
2017-03-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1612229114
PMID:28223509
|
研究论文 | 本文描述了一种高灵敏度的方法，通过利用肿瘤细胞与良性细胞之间葡萄糖代谢的改变，快速检测恶性胸腔积液中的代谢活跃肿瘤细胞 | 该方法通过高吞吐量的荧光筛选技术，在一个包含200,000个可寻址微孔的芯片中识别并收集代谢活跃的肿瘤细胞，用于恶性确认 | NA | 开发一种新的诊断方法，用于准确检测恶性胸腔积液中的肿瘤细胞，并帮助识别驱动致癌基因和导致耐药的突变 | 恶性胸腔积液和外周血中的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 图像 | 分析了一组肺癌患者的恶性胸腔积液样本 |
| 26322 | 2024-08-09 |
Exploratory bioinformatics investigation reveals importance of "junk" DNA in early embryo development
2017-02-23, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-017-3566-0
PMID:28231763
|
研究论文 | 本研究通过探索性数据分析重新分析大量基因组数据，探讨了小鼠植入前发育中复杂的基因调控机制 | 发现转座元件在早期胚胎发育中的基因表达调控中起重要作用，特别是长末端重复序列和SINE元件的作用 | NA | 探索性数据分析以发现数据中的信息，特别是转座元件在早期胚胎发育中的作用 | 小鼠植入前发育阶段的基因表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 259个来自小鼠从受精卵到囊胚阶段的胚胎细胞 |
| 26323 | 2024-08-09 |
Position- and Hippo signaling-dependent plasticity during lineage segregation in the early mouse embryo
2017-02-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.22906
PMID:28226240
|
研究论文 | 本文研究了小鼠早期胚胎中由位置依赖的Hippo信号传导决定的滋养层（TE）与内细胞团（ICM）的分化过程 | 通过单细胞RNA测序揭示了TE转录组比ICM更早稳定，且在胚泡形成之前 | Hippo信号传导的响应窗口、谱系承诺的确切时间和细胞承诺与全局基因表达变化之间的关系仍不清楚 | 探讨Hippo信号传导在小鼠早期胚胎谱系分离中的作用及其与基因表达动态的关系 | 小鼠早期胚胎中的滋养层（TE）和内细胞团（ICM） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 个体胚细胞 |
| 26324 | 2024-08-09 |
[Advances in Classification and Research Methods of Lung Epithelial Stem
and Progenitor Cells]
2017-Feb-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
综述 | 本文综述了肺上皮干细胞和祖细胞的分类及研究方法的最新进展 | 总结了肺上皮干细胞和祖细胞的区域特异性分类以及多种研究方法，如肺损伤模型、谱系追踪实验、三维培养、移植、慢性标记细胞和单细胞转录组分析 | NA | 探讨肺上皮干细胞和祖细胞在肺生理病理中的特定作用，以及它们在预防和控制肺疾病中的应用 | 肺上皮干细胞和祖细胞 | NA | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA |
| 26325 | 2024-08-09 |
cgCorrect: a method to correct for confounding cell-cell variation due to cell growth in single-cell transcriptomics
2017-05-11, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/aa609a
PMID:28198357
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为cgCorrect的统计框架，用于校正单细胞转录组数据中由于细胞生长引起的细胞间变异 | cgCorrect框架能够基于细胞周期中细胞体积与转录本数量成比例增加的假设，校正细胞大小差异带来的影响 | NA | 开发一种方法来校正单细胞转录组数据中由于细胞生长引起的细胞间变异 | 单细胞转录组数据中的细胞大小差异 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | 转录组数据 | 模拟数据和小鼠血液干细胞及前体细胞的单细胞定量实时PCR数据，以及小鼠胚胎干细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 26326 | 2024-08-09 |
Seq-Well: portable, low-cost RNA sequencing of single cells at high throughput
2017-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4179
PMID:28192419
|
研究论文 | 本文介绍了一种便携式、低成本的高通量单细胞RNA测序平台Seq-Well | Seq-Well平台通过使用条形码mRNA捕获珠和单细胞密封在亚纳升孔阵列中，实现了高效的细胞裂解和转录本捕获 | NA | 开发一种适用于低输入样本的高通量单细胞RNA测序方法 | 主要研究了暴露于结核分枝杆菌的人类巨噬细胞 | 测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个 |
| 26327 | 2024-08-09 |
Advances in understanding tumour evolution through single-cell sequencing
2017-Apr, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2017.02.001
PMID:28193548
|
综述 | 本文综述了通过单细胞测序技术理解肿瘤演化的最新进展 | 介绍了通过单细胞测序分析肿瘤演化历史和伴随异质性的新计算挑战和建模框架 | NA | 探讨如何通过单细胞测序数据理解肿瘤的亚克隆组成和突变历史，以设计针对个体患者的治疗方案 | 肿瘤的亚克隆组成和突变历史 | 数字病理学 | NA | 下一代测序(NGS) | NA | 单细胞测序数据 | 大量肿瘤样本 |
| 26328 | 2024-08-09 |
Modeling the Genetic Regulation of Cancer Metabolism: Interplay between Glycolysis and Oxidative Phosphorylation
2017-04-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-16-2074
PMID:28202516
|
研究论文 | 本研究采用系统生物学方法，解析了癌症细胞中糖酵解和氧化磷酸化之间的调控原理 | 提出了癌症细胞中糖酵解和氧化磷酸化共存的混合状态，并开发了量化这两种代谢活性的特征 | NA | 揭示癌症代谢的调控原理，并设计针对代谢的癌症治疗策略 | 癌症细胞中的糖酵解和氧化磷酸化调控 | 数字病理学 | 癌症 | 系统生物学 | NA | 转录组数据 | 多癌症类型的癌症基因组图谱患者转录组数据及肺腺癌的单细胞RNA测序数据 |
| 26329 | 2024-08-09 |
Detection of Imprinted Genes by Single-Cell Allele-Specific Gene Expression
2017-Mar-02, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2017.01.028
PMID:28190458
|
研究论文 | 本文报道了一种结合单细胞RNA测序和全基因组测序的原创且稳健的方法，用于分析特定细胞类型和不同个体中的基因组印记 | 本文提出的单细胞方法相较于传统的批量RNA测序，能更有效地识别印记基因 | NA | 验证已知印记基因的印记状态并发现新的印记基因 | 人类和小鼠模型中的印记基因 | 基因组学 | 糖尿病, 癌症 | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | RNA序列 | 1,084个初级成纤维细胞样本 |
| 26330 | 2024-08-09 |
Spatial transcriptomic analysis of cryosectioned tissue samples with Geo-seq
2017-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2017.003
PMID:28207000
|
研究论文 | 本文介绍了使用Geo-seq方法结合激光捕获显微切割（LCM）和单细胞RNA测序技术进行空间转录组分析的过程 | Geo-seq方法能够同时解析细胞异质性和空间变异，保留了细胞的原生空间信息 | 数据分析时间较长，取决于数据量和处理器速度 | 探索细胞特性的生物学和病理学问题，如潜在的细胞命运、生物学功能和基因调控网络 | 小鼠早期胚胎、小鼠大脑、病理肝脏和精子组织的空间转录组 | 数字病理学 | NA | Geo-seq | NA | 转录组数据 | 少量细胞 |
| 26331 | 2024-08-09 |
The impact of melanoma genetics on treatment response and resistance in clinical and experimental studies
2017-03, Cancer metastasis reviews
DOI:10.1007/s10555-017-9657-1
PMID:28210865
|
研究论文 | 本文探讨了黑色素瘤遗传学对治疗反应和耐药性的影响，特别是在临床和实验研究中 | 利用高通量测序技术识别了新的黑色素瘤相关基因和通路，并探讨了肿瘤异质性对治疗反应的影响 | 目前的研究主要集中在大量肿瘤的测序上，未充分考虑肿瘤内的小部分耐药细胞 | 旨在理解黑色素瘤的分子发病机制、治疗反应和耐药性 | 黑色素瘤的遗传变异及其对治疗反应和耐药性的影响 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 高通量测序技术 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 26332 | 2024-08-09 |
Comparative Analysis of Single-Cell RNA Sequencing Methods
2017-Feb-16, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2017.01.023
PMID:28212749
|
研究论文 | 本文通过比较六种单细胞RNA测序方法在583个小鼠胚胎干细胞中的表现，评估了各方法的性能 | 首次系统性地比较了六种主要的单细胞RNA测序方法的性能 | 仅限于小鼠胚胎干细胞样本，未涵盖其他细胞类型或物种 | 评估和比较不同单细胞RNA测序方法的性能 | 六种单细胞RNA测序方法在583个小鼠胚胎干细胞中的表现 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 583个小鼠胚胎干细胞 |
| 26333 | 2024-08-09 |
Dpath software reveals hierarchical haemato-endothelial lineages of Etv2 progenitors based on single-cell transcriptome analysis
2017-02-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms14362
PMID:28181481
|
research paper | 本文开发了一种名为dpath的算法，利用metagene熵概念对细胞进行基于其分化潜能的排序，并结合自组织映射（SOM）和随机游走重启（RWR）算法，从分化细胞中分离出前体细胞并重建无偏的谱系层次结构。 | 提出了一种新的算法dpath，结合SOM和RWR算法，能够无偏地评估单细胞RNA-seq数据集中的前体细胞和分化状态。 | NA | 旨在通过单细胞转录组分析揭示Etv2前体细胞的血细胞-内皮细胞谱系层次结构。 | Etv2-EYFP转基因小鼠胚胎的单细胞。 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing | SOM, RWR | transcriptome | Etv2-EYFP转基因小鼠胚胎的单细胞 |
| 26334 | 2024-08-09 |
Expression of β-globin by cancer cells promotes cell survival during blood-borne dissemination
2017-02-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms14344
PMID:28181495
|
研究论文 | 本文通过比较乳腺癌、前列腺癌和肺癌中单细胞RNA测序（RNA-Seq）的CTCs（循环肿瘤细胞），观察到β-globin（HBB）的一致诱导现象，并探讨了其在肿瘤细胞血液传播中的生存机制。 | 首次发现并证实了β-globin在肿瘤细胞中的特异性表达，及其在循环肿瘤细胞中的保护作用。 | 研究主要集中在乳腺癌、前列腺癌和肺癌的CTCs上，可能不适用于所有类型的癌症。 | 探讨循环肿瘤细胞在血液中生存的机制，特别是β-globin的作用。 | 乳腺癌、前列腺癌和肺癌的循环肿瘤细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及乳腺癌、前列腺癌和肺癌的循环肿瘤细胞 |
| 26335 | 2024-08-09 |
New RNA-seq approaches for the study of bacterial pathogens
2017-02, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2017.01.001
PMID:28214646
|
研究论文 | 本文探讨了利用新型RNA测序方法研究细菌病原体的基因表达和调控 | 介绍了超越标准mRNA分析的新型RNA测序方法，包括捕获由小RNA控制的转录后网络和发现相关的RNA结合蛋白，以及同时分析病原体和宿主的双RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 深入了解细菌如何引发疾病，特别是基因表达和调控在感染过程中的作用 | 细菌病原体的基因表达和调控 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 26336 | 2024-08-09 |
DNA copy number profiling using single-cell sequencing
2018-09-28, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbx004
PMID:28159966
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的工具包SCNV，用于从单细胞DNA测序数据中检测拷贝数变异并构建全基因组拷贝数图谱 | SCNV采用了一种高效的无需分箱的分割方法，提供了最高分辨率的断点检测和随后的拷贝数调用 | NA | 开发用于单细胞DNA测序数据中拷贝数变异检测和全基因组拷贝数图谱构建的软件工具 | 单细胞DNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 一组来自同一批次的正常细胞 |
| 26337 | 2024-08-09 |
Whole-genome single-cell copy number profiling from formalin-fixed paraffin-embedded samples
2017-Mar, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/nm.4279
PMID:28165479
|
研究论文 | 本文开发并验证了一种稳健准确的方法，用于从福尔马林固定石蜡包埋的临床肿瘤样本中获取的单个细胞核进行全基因组拷贝数分析 | 首次实现了从福尔马林固定石蜡包埋样本中进行单细胞全基因组拷贝数分析 | NA | 研究肿瘤内遗传异质性及其对精准医疗实施的挑战 | 从福尔马林固定石蜡包埋的临床肿瘤样本中获取的单个细胞核 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 26338 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of the human placenta: inferring the cell communication network of the maternal-fetal interface
2017-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.207597.116
PMID:28174237
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，研究了胎盘滋养层细胞与母体子宫内膜基质细胞间的细胞互作网络 | 发现G蛋白偶联受体的高度细胞类型特异性表达，以及子宫蜕膜细胞作为细胞互作中心的特性 | NA | 探究人类胎盘中母胎界面的细胞通信网络 | 胎盘滋养层细胞与母体子宫内膜基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26339 | 2024-08-09 |
BASIC: BCR assembly from single cells
2017-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw631
PMID:28172415
|
research paper | 本文开发了一种名为BASIC的新软件工具，用于从单细胞RNA测序数据中组装B细胞受体序列 | BASIC软件首次实现了从单细胞RNA测序数据中组装全长重链和轻链序列 | NA | 开发一种新的软件工具，用于从单细胞RNA测序数据中组装B细胞受体序列 | 单个人B细胞的B细胞受体序列 | NA | NA | RNA-seq | NA | RNA | 近200个单个人B细胞 |
| 26340 | 2024-08-09 |
Human iPSC-Derived Cerebral Organoids Model Cellular Features of Lissencephaly and Reveal Prolonged Mitosis of Outer Radial Glia
2017-04-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2016.12.007
PMID:28111201
|
研究论文 | 本研究通过分析从正常和Miller-Dieker综合征（MDS）诱导的多能干细胞（iPSCs）衍生的脑类器官，探讨MDS对控制神经元输出和影响脑拓扑结构的人类前体细胞亚型的影响。 | 本研究首次揭示了MDS相关的外放射状胶质细胞的延长有丝分裂缺陷，并展示了脑类器官在模拟人类神经发育障碍方面的广泛应用。 | NA | 探讨Miller-Dieker综合征对人类前体细胞亚型的影响及其在神经发育障碍中的作用。 | 从正常和MDS诱导的多能干细胞衍生的脑类器官。 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 时间流逝成像、免疫染色和单细胞RNA测序。 | NA | 细胞 | NA |