单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 26301 - 26320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26301 | 2024-08-09 |
Lgr5+ stem and progenitor cells reside at the apex of a heterogeneous embryonic hepatoblast pool
2019-06-12, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.174557
PMID:31142540
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研究论文 | 本研究揭示了在小鼠胚胎发育过程中，肝细胞祖细胞（hepatoblasts）的转录和功能异质性，并发现了一个新的早期胆管细胞命运承诺的亚群，以及表达成人干细胞标记物的双潜能肝祖细胞亚群。 | 本研究首次展示了hepatoblasts的转录和功能异质性，并发现了新的早期胆管细胞命运承诺的亚群，以及表达成人干细胞标记物的双潜能肝祖细胞亚群。 | NA | 研究小鼠胚胎发育过程中肝细胞祖细胞的异质性及其功能。 | 小鼠胚胎发育过程中的肝细胞祖细胞（hepatoblasts）。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及E9.5-E10.0的肝细胞祖细胞亚群 |
| 26302 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing unveils the shared and the distinct cytotoxic hallmarks of human TCRVδ1 and TCRVδ2 γδ T lymphocytes
2019-06-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1818488116
PMID:31118283
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人类TCRVδ1和TCRVδ2 γδ T淋巴细胞的共同和独特的细胞毒性标志 | 首次通过高分辨率聚类和基因签名组合在大规模scRNA-seq数据集中特异性检测和识别人类γδ T淋巴细胞及其TCRVδ1和TCRVδ2亚群 | NA | 研究人类γδ T淋巴细胞的细胞毒性标志及其在不同条件下的特性 | 人类γδ T淋巴细胞及其TCRVδ1和TCRVδ2亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个来自不同CMV和CMV供体的单个γδ T淋巴细胞 |
| 26303 | 2024-08-09 |
Benchmarking single cell RNA-sequencing analysis pipelines using mixture control experiments
2019-06, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0425-8
PMID:31133762
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研究论文 | 本文通过混合控制实验生成单细胞RNA测序（scRNA-seq）的基准数据集，并比较了多种数据分析方法的性能 | 提出了一个包含单细胞和混合细胞或RNA的现实基准实验，用于系统比较多种scRNA-seq分析方法 | NA | 为scRNA-seq分析方法提供一个全面的基准框架 | 单细胞RNA测序数据分析方法的性能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 14个数据集，包含来自多达五个不同癌细胞系的细胞 |
| 26304 | 2024-08-09 |
Molecular Logic of Spinocerebellar Tract Neuron Diversity and Connectivity
2019-05-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.04.113
PMID:31141687
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和遗传操作技术，探讨了脊髓小脑束神经元（SCTNs）多样性和连接性的分子逻辑。 | 首次揭示了Hox基因在SCTN亚型特异性转录程序中的作用，以及这些基因在神经回路组装中的关键角色。 | NA | 阐明脊髓小脑束神经元多样性和连接性的分子机制。 | 脊髓小脑束神经元（SCTNs）及其在感觉信息传递中的作用。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 26305 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Profiling of Aortic Endothelium Identifies a Hierarchy from Endovascular Progenitors to Differentiated Cells
2019-05-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.04.102
PMID:31141696
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了主动脉内皮细胞的异质性及其从内皮祖细胞到分化细胞的层次结构 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了主动脉内皮细胞的亚群及其层次结构，并验证了这些细胞群的异质性 | NA | 阐明循环系统内皮细胞的细胞和分子特征 | 主动脉内皮细胞的异质性及其层次结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 26306 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Estrogen Signaling Coordinately Augments One-Carbon, Polyamine, and Purine Synthesis in Breast Cancer
2019-May-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.05.047
PMID:31141700
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26307 | 2024-08-09 |
Dissecting lung development and fibrosis at single-cell resolution
2019-05-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-019-0645-7
PMID:31126351
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组测序技术，对肺部发育和纤维化过程中的细胞群体进行了高分辨率分析 | 本文创新性地使用单细胞RNA测序技术，研究了肺部发育和纤维化疾病中免疫细胞与组织成分的相互作用机制 | NA | 研究肺部发育和纤维化过程中的细胞机制 | 肺部发育和纤维化过程中的细胞群体 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 26308 | 2024-08-09 |
Systematic expression analysis of ligand-receptor pairs reveals important cell-to-cell interactions inside glioma
2019-05-22, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-019-0363-1
PMID:31118022
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，揭示了胶质瘤内部细胞间的相互作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据和TCGA数据，系统地揭示了胶质瘤内部细胞间的相互作用，并构建了预测胶质瘤患者预后的机器学习模型 | NA | 揭示胶质瘤内部细胞间的相互作用，并发现潜在的预后标志物 | 胶质瘤细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 6341个胶质瘤细胞 |
| 26309 | 2024-08-09 |
Decomposing Cell Identity for Transfer Learning across Cellular Measurements, Platforms, Tissues, and Species
2019-05-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.04.004
PMID:31121116
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研究论文 | 本文介绍了scCoGAPS和projectR工具，用于从源单细胞RNA测序数据集定义潜在空间，并通过迁移学习在独立目标数据集中评估这些潜在空间 | 提出了scCoGAPS和projectR工具，通过迁移学习在不同生物学背景下识别共享的生物学特征，超越了依赖标记基因或整体分子身份的传统方法 | NA | 探索单细胞RNA测序数据通过潜在空间表示的分析方法 | 单细胞RNA测序数据集及其在不同组织和物种中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括发育中的小鼠视网膜、成年小鼠视网膜、人类视网膜发育时间序列、发育中的大脑单细胞RNA测序数据集、染色质可及性数据和鼠细胞类型图谱 |
| 26310 | 2024-08-09 |
Wnt Signaling Separates the Progenitor and Endocrine Compartments during Pancreas Development
2019-05-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.04.083
PMID:31116975
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析人胚胎干细胞在球状聚集体中分化时，Wnt信号通路在胰腺发育中分离祖细胞和内分泌细胞区室的作用 | 揭示了Wnt信号通路抑制在体外分化过程中对内分泌细胞比例增加的作用，为1型糖尿病治疗提供了新的见解 | NA | 探索体外分化过程中人胚胎干细胞自主反应，提高分化效率并控制细胞群体的最终组成 | 人胚胎干细胞在球状聚集体中的分化过程及Wnt信号通路的作用 | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 26311 | 2024-08-09 |
An Atlas of Vagal Sensory Neurons and Their Molecular Specialization
2019-05-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.04.096
PMID:31116992
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对神经嵴（颈静脉）和基板（结节）来源的迷走神经节中的神经元类型进行了全面的识别、分类和验证 | 本文揭示了来自不同胚胎起源的神经元之间的重要差异，并发现了多种先前未预料到的神经元类型 | NA | 研究迷走神经的感觉功能及其在心血管和胃肠道系统中的作用 | 迷走神经节中的神经元类型及其分子特化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 26312 | 2024-08-09 |
Differential microglia and macrophage profiles in human IDH-mutant and -wild type glioblastoma
2019-May-03, Oncotarget
DOI:10.18632/oncotarget.26863
PMID:31139325
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术、免疫荧光技术和单细胞RNA测序，比较了IDH突变型和野生型胶质母细胞瘤中与肿瘤相关的微胶质细胞和巨噬细胞的差异 | 首次直接比较了未经治疗的IDH突变型与野生型胶质母细胞瘤中与肿瘤相关的微胶质细胞和巨噬细胞的差异 | 研究样本仅限于四个未经治疗的IDH突变型胶质母细胞瘤 | 探讨IDH突变型和野生型胶质母细胞瘤中微胶质细胞和巨噬细胞的差异及其对预后的影响 | IDH突变型和野生型胶质母细胞瘤中的微胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 四个未经治疗的IDH突变型胶质母细胞瘤 |
| 26313 | 2024-08-09 |
NormExpression: An R Package to Normalize Gene Expression Data Using Evaluated Methods
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00400
PMID:31114611
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为NormExpression的R包，用于使用评估方法对基因表达数据进行标准化 | 提出了一种新的评估指标AUCVC，并结合mSCC评估了14种常用标准化方法，确保了指标和数据集的一致性 | NA | 旨在建立指导标准化方法评估的原则，并提供一个框架帮助研究人员选择最佳标准化方法 | 基因表达数据的标准化方法及其评估 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用scRNA-seq和bulk RNA-seq数据评估了14种常用标准化方法 |
| 26314 | 2024-08-09 |
Tracking tumor evolution one-cell-at-a-time
2019, Molecular & cellular oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.1080/23723556.2019.1590089
PMID:31131309
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学研究了口腔鳞状细胞癌中表型性肿瘤内异质性对药物诱导肿瘤演化的影响 | 采用单细胞转录组学技术，从单细胞层面追踪肿瘤演化 | NA | 探究肿瘤内异质性对药物治疗反应的影响 | 口腔鳞状细胞癌中的肿瘤内异质性 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自患者的原代细胞 |
| 26315 | 2024-08-09 |
Aging Human Hematopoietic Stem Cells Manifest Profound Epigenetic Reprogramming of Enhancers That May Predispose to Leukemia
2019-08, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-18-1474
PMID:31085557
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研究论文 | 研究揭示了人类造血干细胞随着年龄增长出现的表观遗传重编程现象，这种重编程可能增加患白血病的风险 | 首次综合分析了人类正常衰老过程中造血干细胞的表观基因组和转录组变化，特别是单细胞RNA测序的应用 | NA | 探讨年龄相关的造血干细胞表观遗传重编程及其与白血病风险的关联 | 人类造血干细胞的表观遗传和转录组变化 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 涉及4,646个活跃增强子、3,091个双价启动子以及多个表观遗传修饰因子和关键造血转录因子 |
| 26316 | 2024-08-09 |
RNA-seq in Skeletal Biology
2019-08, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-019-00517-x
PMID:31093870
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综述 | 本文综述了最先进的转录组分析方法及其在骨骼生物学领域的最新应用 | 介绍了单细胞RNA测序等先进技术在识别骨骼组织中新细胞类型的应用 | NA | 综述转录组分析方法在骨骼生物学中的应用 | 骨骼生物学中的基因和转录因子 | NA | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 小动物模型、大动物模型、人类组织和细胞 |
| 26317 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals distinct dynamic behavior of sex chromosomes during early human embryogenesis
2019-07, Molecular reproduction and development
IF:2.7Q2
DOI:10.1002/mrd.23162
PMID:31094050
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了1607个来自99个人类早期胚胎的单细胞，揭示了性染色体在人类早期胚胎发育中的动态行为 | 首次系统地比较了男性与女性胚胎在胚胎基因组激活后的性染色体表达差异，揭示了性染色体在早期胚胎发育中的动态表达和沉默过程 | 研究样本量有限，且仅使用了现有的单细胞RNA测序数据 | 探讨性染色体在人类早期胚胎发育中的分子机制及其对胚胎发育的影响 | 人类早期胚胎的性染色体表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1607个单细胞来自99个人类早期胚胎 |
| 26318 | 2024-08-09 |
Tubular cell and keratinocyte single-cell transcriptomics applied to lupus nephritis reveal type I IFN and fibrosis relevant pathways
2019-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0386-1
PMID:31110316
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检样本，揭示了I型干扰素和纤维化相关通路 | 首次应用单细胞RNA测序技术于狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检样本，揭示了I型干扰素反应和纤维化相关通路 | NA | 研究狼疮性肾炎的分子和细胞过程，以及其异质性 | 狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检样本 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 26319 | 2024-08-09 |
Regulation of Feeding-Related Behaviors by Arcuate Neuropeptide Y Neurons
2019-06-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/en.2019-00056
PMID:31089694
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综述 | 本文综述了下丘脑弓状核中的神经肽Y（NPY）神经元在调节与进食相关行为中的作用 | 结合遗传小鼠模型和化学遗传学及光遗传学技术，揭示了NPY神经元在能量消耗、产热、身体活动、食物寻求行为及焦虑控制中的额外功能 | NA | 探讨NPY神经元在个体生存回路中潜在的交互途径中的整合作用 | 下丘脑弓状核中的NPY神经元及其在行为控制中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 26320 | 2024-08-09 |
Novel insights into cell cycle regulation of cell fate determination
2019-Jun, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B1900197
PMID:31090272
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综述 | 本文综述了细胞周期调控在细胞命运决定中的最新进展 | 利用高分辨率表观基因组分析、单细胞转录组学和细胞周期报告系统提供了新的见解 | NA | 探讨细胞周期调控在细胞命运决定中的作用及其在转化医学中的潜在应用 | 干细胞/祖细胞的自我更新和多谱系分化能力 | NA | NA | 高分辨率表观基因组分析、单细胞转录组学 | NA | 表观基因组数据、转录组数据 | NA |