单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
26301	2024-08-09	Dissecting Cell Lineages: From Microscope to Kaleidoscope 2019-02-21, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2019.01.054 PMID:30794779	研究论文	Gehart等人（2019）利用单细胞转录组学与动态双色荧光技术，实时解析成年哺乳动物细胞轨迹，特别是肠道内分泌细胞的分化过程	揭示了新的细胞谱系特征和细胞身份的转变，并在类器官实验中发现了通过该方法鉴定的转录调控因子的特定作用	NA	解析成年哺乳动物细胞轨迹，特别是肠道内分泌细胞的分化过程	成年哺乳动物的细胞谱系和肠道内分泌细胞的分化	单细胞转录组学	NA	单细胞转录组学，动态双色荧光	NA	转录组数据	NA
26302	2024-08-09	[Identification and single-cell sequencing analysis of rare tumor cells in malignant pleural effusion of lung cancer patients] 2019-Feb-20, Yi chuan = Hereditas DOI:10.16288/j.yczz.18-182 PMID:30803947	研究论文	本研究通过单细胞测序方法分析肺癌患者恶性胸腔积液中的转移性肿瘤细胞	首次采用单细胞测序技术研究肺癌患者恶性胸腔积液中的转移性肿瘤细胞，并分析其拷贝数变异模式	NA	探讨肿瘤异质性及转移机制	肺癌患者恶性胸腔积液中的转移性肿瘤细胞	数字病理学	肺癌	单细胞测序	NA	细胞	具体样本数量未提及
26303	2024-08-09	Expression Cloning of Antibodies from Single Human B Cells 2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-4939-9151-8_5 PMID:30779032	研究论文	本文描述了一种从单个人类B细胞中克隆抗体的策略	该方法允许在单细胞水平上无偏差地表征人类抗体谱，通过从单个原代人类B细胞生成重组单克隆抗体	NA	研究B细胞受体在淋巴瘤发展或生存中的作用	人类B细胞的抗体反应性	NA	淋巴瘤	RT-PCR	NA	Ig转录本	单个人类B细胞
26304	2024-08-09	Studying Cancer Heterogeneity by Single-Cell RNA Sequencing 2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-4939-9151-8_14 PMID:30779041	研究论文	本文介绍了一种名为mcSCRB-seq的高灵敏度和强大的基于平板单细胞RNA测序方法，用于研究癌症细胞的转录组数据	mcSCRB-seq方法具有高灵敏度、简便的工作流程、低单细胞成本且无需特殊设备	该方法在临床样本中的应用仍然具有挑战性	通过单细胞RNA测序技术研究癌症异质性	癌症细胞的基因表达变异	数字病理学	癌症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	未具体说明样本数量
26305	2024-08-09	Tissue Repair in the Mouse Liver Following Acute Carbon Tetrachloride Depends on Injury-Induced Wnt/β-Catenin Signaling 2019-06, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1002/hep.30563 PMID:30762896	研究论文	研究了在小鼠肝脏中，急性四氯化碳损伤后组织修复依赖于损伤诱导的Wnt/β-Catenin信号通路	发现内皮细胞是急性四氯化碳毒性后Wnt的主要来源，并且Wnt/β-Catenin信号通路在恢复组织完整性中起重要作用	NA	探讨Wnt/β-Catenin信号通路在急性肝脏毒性后组织修复中的作用	小鼠肝脏在急性四氯化碳损伤后的Wnt基因表达和信号传导	NA	NA	原位杂交、单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
26306	2024-08-09	Microdiversity and temporal dynamics of marine bacterial dimethylsulfoniopropionate genes 2019-05, Environmental microbiology IF:4.3Q2 DOI:10.1111/1462-2920.14560 PMID:30761723	研究论文	研究评估了在蒙特利湾为期三周的时间内，海洋细菌中与气候相关的二甲基硫代丙酸酯（DMSP）基因的多样性和丰度，以及这些基因与浮游植物群落组成的关系	首次展示了特定细菌DMSP降解群组与浮游植物种类之间的相关性	NA	研究海洋细菌中DMSP基因的多样性和时间动态，以及这些基因与浮游植物群落的关系	海洋细菌中的DMSP基因及其与浮游植物群落的关系	NA	NA	元基因组装和单细胞测序	NA	基因序列	为期三周的时间跨度，2014年9月至10月在蒙特利湾
26307	2024-08-09	Multimodal Single-Cell Analysis Reveals Physiological Maturation in the Developing Human Neocortex 2019-04-03, Neuron IF:14.7Q1 DOI:10.1016/j.neuron.2019.01.027 PMID:30770253	研究论文	本文通过结合单细胞RNA测序和神经递质受体激动剂引起的细胞内Ca2+升高测量，揭示了发育中的人类新皮层中细胞类型的生理异质性	首次将生理反应特性与分子细胞身份相结合，揭示了单细胞转录组学未能捕捉到的多样性	NA	研究发育中的人类新皮层中细胞类型的生理成熟过程	人类新皮层中的前体细胞和新生神经元	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	多个单细胞样本
26308	2024-08-09	Emerging approaches and technologies in transplantation: the potential game changers 2019-04, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1 DOI:10.1038/s41423-019-0207-3 PMID:30760918	综述	本文综述了三种新兴技术在器官移植领域的应用，旨在解决终身免疫抑制和扩大供体池的关键挑战	介绍了单细胞RNA测序技术、纳米技术和CRISPR/Cas9基因编辑技术在移植医学中的创新应用	NA	探讨新兴技术如何改变传统器官移植方法，以解决移植医学中的关键挑战	器官移植中的免疫抑制和供体池扩展问题	NA	NA	单细胞RNA测序技术、纳米技术、CRISPR/Cas9基因编辑技术	NA	单细胞RNA测序数据	NA
26309	2024-08-09	The transcription factor Duxbl mediates elimination of pre-T cells that fail β-selection 2019-03-04, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20181444 PMID:30765463	研究论文	本文研究了转录因子Duxbl在T细胞发育中对未通过β选择的前T细胞的消除作用	首次识别出Duxbl在β选择前高重组活性阶段的特异性表达，并揭示了Duxbl通过诱导凋亡来调控β选择	NA	探讨T细胞发育中β选择失败的细胞命运及其调控机制	前T细胞和转录因子Duxbl	NA	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	Duxbl转基因小鼠
26310	2024-08-09	Defining Macrophages in the Heart One Cell at a Time 2019-03, Trends in immunology IF:13.1Q1 DOI:10.1016/j.it.2019.01.010 PMID:30745266	研究论文	本研究通过结合遗传命运图谱和单细胞转录组学技术，揭示了健康心脏和心肌梗死后心脏中不同巨噬细胞群体的扩展和分化情况	本研究首次通过单细胞转录组学技术详细分析了心脏巨噬细胞在健康和心肌梗死后的功能和变化	NA	探讨心脏巨噬细胞在心肌梗死后的损伤和修复中的双重作用	心脏巨噬细胞	NA	心血管疾病	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	NA
26311	2024-08-09	Single-Cell Analysis of Diverse Pathogen Responses Defines a Molecular Roadmap for Generating Antigen-Specific Immunity 2019-02-27, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2019.01.001 PMID:30772378	研究论文	本文通过使用荧光病原体结合大规模单细胞RNA测序技术，全面分析了多种病原体感染后48小时内先天免疫反应的特征	发现罕见抗原阳性细胞在免疫接种后24小时即显示出病原体特异性的转录程序，并揭示了NK细胞驱动的IFNγ反应在病原体激活中的作用	NA	揭示先天免疫细胞类型和途径，以指导强健的适应性免疫反应，并可能促进安全有效疫苗的进一步开发	多种病原体感染后的先天免疫反应	免疫学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	多种病原体感染的淋巴结细胞
26312	2024-08-09	Resolving Cell Fate Decisions during Somatic Cell Reprogramming by Single-Cell RNA-Seq 2019-02-21, Molecular cell IF:14.5Q1 DOI:10.1016/j.molcel.2019.01.042 PMID:30772174	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，研究了体细胞重编程过程中细胞命运的连续性	开发了SOT方法分析细胞命运连续性，并揭示了细胞在重编程过程中分为重编程潜力（RP）和非重编程（NR）两类的新模型	NA	揭示体细胞重编程过程中细胞命运决策的普遍分叉模型	体细胞重编程过程中的细胞命运连续性	生物技术	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq数据	超过150,000个单细胞
26313	2024-08-09	Human Fetal TNF-α-Cytokine-Producing CD4+ Effector Memory T Cells Promote Intestinal Development and Mediate Inflammation Early in Life 2019-02-19, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2018.12.010 PMID:30770246	研究论文	本文研究了人类胎儿肠道中肿瘤坏死因子-α（TNF-α）CD4CD69 T效应记忆（Tem）细胞的作用，发现这些细胞在胎儿肠道发育中起到促进作用，但在早产儿中可能导致炎症。	发现了人类胎儿肠道中一种独特的TNF-α产生CD4 T细胞群体，这些细胞在胎儿肠道黏膜发育中起到促进作用，但也可能在早产儿中引发炎症。	NA	探讨人类胎儿肠道中TNF-α产生CD4 T细胞在肠道发育和早期生命中的炎症作用。	人类胎儿肠道中的TNF-α产生CD4 T细胞及其在肠道发育和炎症中的作用。	免疫学	肠道炎症	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
26314	2024-08-09	Single-Cell Transcriptome Analysis Maps the Developmental Track of the Human Heart 2019-02-12, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2019.01.079 PMID:30759401	research paper	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了约4000个人类胚胎心脏细胞的基因表达图谱，并确定了四种主要细胞类型：心肌细胞、心脏成纤维细胞、内皮细胞和瓣膜间质细胞	研究揭示了人类心脏发育过程中不同细胞类型的基因表达变化，并比较了人类与小鼠心脏发育的基因表达特征	NA	阐明人类心脏在体发育的机制，并提供理解心脏再生的潜在线索	人类胚胎心脏细胞及其发育过程中的基因表达变化	digital pathology	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	约4000个人类胚胎心脏细胞
26315	2024-08-09	PyMINEr Finds Gene and Autocrine-Paracrine Networks from Human Islet scRNA-Seq 2019-02-12, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2019.01.063 PMID:30759402	研究论文	本文介绍了一种名为PyMINEr的信息学工具，该工具能够自动化地进行细胞类型识别、细胞类型特异性通路分析、基于图论的基因调控分析以及自分泌-旁分泌信号网络的检测。	PyMINEr工具能够自动化处理scRNA-seq数据，进行细胞类型识别和基因调控网络分析，这在生物信息学领域具有创新性。	NA	开发和验证一种新的信息学工具PyMINEr，用于深入分析scRNA-seq数据。	人类胰腺胰岛的scRNA-seq数据。	生物信息学	NA	scRNA-seq	图论	scRNA-seq数据	七个数据集
26316	2024-08-09	Quality Control of Single-Cell RNA-seq 2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-4939-9057-3_1 PMID:30758816	研究论文	本文介绍了一种结合基因表达模式和数据质量来检测单细胞RNA测序（scRNA-seq）样本中技术伪影的协议	本文提出了一种新的方法来整合基因表达模式和数据质量，以检测scRNA-seq样本中的技术伪影	NA	旨在解决scRNA-seq技术中技术噪声与生物变异性的分离问题	单细胞RNA测序样本中的技术伪影	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NA
26317	2024-08-09	Normalization for Single-Cell RNA-Seq Data Analysis 2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-4939-9057-3_2 PMID:30758817	研究论文	本文描述了一种针对单细胞RNA测序数据的稳健归一化方法SCnorm	提出了SCnorm方法，并提供了诊断功能以可视化归一化性能	NA	开发和评估单细胞RNA测序数据的归一化方法	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
26318	2024-08-09	Analysis of Technical and Biological Variability in Single-Cell RNA Sequencing 2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-4939-9057-3_3 PMID:30758818	研究论文	本文描述了一种计算流程，用于检测在单细胞RNA测序（scRNA-seq）中表现出高于技术噪声预期的高变异基因	提出了一个使用scater和scran R/Bioconductor包的计算流程，用于检测和分析单细胞数据中的高变异基因	NA	旨在解决单细胞RNA测序中的技术变异性问题，以正确分析单细胞数据	单细胞RNA测序中的高变异基因	生物信息学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	包括来自小鼠胚胎干细胞和齿状回细胞的样本
26319	2024-08-09	Identification of Cell Types from Single-Cell Transcriptomic Data 2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-4939-9057-3_4 PMID:30758819	研究论文	本文介绍了利用单细胞转录组测序（scRNA-seq）数据进行细胞类型识别的方法和技术	本文提出了一个生物信息学流程，为进入该领域的研究人员提供了一个逐步指导的示例	随着数据集的大小和复杂性不断增加，计算挑战也随之增多，需要分析方法具有可扩展性、灵活性和鲁棒性	利用scRNA-seq测量数据识别复杂组织中形成的细胞类型	单细胞转录组测序数据中的细胞类型	生物信息学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
26320	2024-08-09	scMCA: A Tool to Define Mouse Cell Types Based on Single-Cell Digital Expression 2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-4939-9057-3_6 PMID:30758821	研究论文	本文构建了一个基于scRNA-seq数据集的“单细胞小鼠细胞图谱（scMCA）分析”流程，用于定义小鼠细胞类型。	提出了基于scRNA-seq数据集的scMCA工具，用于更精确地匹配单细胞数字表达与其最接近的细胞类型。	NA	开发一种新的工具来定义小鼠细胞类型。	小鼠细胞类型。	单细胞测序	NA	scRNA-seq	NA	scRNA-seq数据	覆盖所有小鼠细胞类型的数据集