单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 26261 - 26280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26261 | 2024-08-09 |
Neonatally imprinted stromal cell subsets induce tolerogenic dendritic cells in mesenteric lymph nodes
2018-09-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-06423-7
PMID:30254319
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研究论文 | 本文探讨了新生儿期印记的间质细胞亚群在肠系膜淋巴结中诱导耐受性树突状细胞的作用 | 研究发现新生儿期印记过程在肠系膜淋巴结间质细胞中已经发生，并使其对生命后期的炎症扰动具有抵抗力 | NA | 研究肠系膜淋巴结在诱导外周耐受性中的作用及其机制 | 肠系膜淋巴结间质细胞和树突状细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及肠系膜淋巴结和皮肤引流淋巴结的间质细胞亚群 |
| 26262 | 2024-08-09 |
Dissecting the Global Dynamic Molecular Profiles of Human Fetal Kidney Development by Single-Cell RNA Sequencing
2018-09-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.08.056
PMID:30257215
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析了超过3,000个人类胎儿肾脏细胞，揭示了胎儿肾脏发育的动态分子特征 | 首次全面分析了人类胎儿肾脏发育的基因表达谱，并识别了两种前体细胞亚型以及关键的转录调控因子和信号通路 | NA | 探索人类胎儿肾脏发育的分子基础和调控事件 | 人类胎儿肾脏细胞 | 数字病理学 | 先天性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过3,000个人类胎儿肾脏细胞 |
| 26263 | 2024-08-09 |
Effects of 3D culturing conditions on the transcriptomic profile of stem-cell-derived neurons
2018-Jul, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-018-0219-9
PMID:30271673
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研究论文 | 研究了3D培养条件对干细胞衍生神经元转录组特征的影响 | 开发了一种快速生成3D神经元和星形胶质细胞共培养的方法，并使用单细胞测序展示了工程化组织能重现人脑细胞类型的转录模式 | NA | 探究3D培养条件对神经元转录组特征的影响，并为脑疾病开发可行的3D神经组织模型 | 干细胞衍生神经元的转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组 | NA |
| 26264 | 2024-08-09 |
Regulatory network characterization in development: challenges and opportunities
2018, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.15271.1
PMID:30271577
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综述 | 本文综述了胚胎发育和干细胞分化过程中基因调控网络（GRNs）的构建及其在谱系决定中的基本机制 | 随着单细胞RNA测序技术的发展，揭示发育和干细胞过程中的GRNs面临新的挑战和前所未有的机遇 | 目前对于动态发育调控的可靠GRN注释知识，尤其是揭示组织干细胞复杂时空结构的知识仍然不足 | 探讨基因调控网络在早期哺乳动物发育和胚胎发生中细胞类型特化过程中的调控本质 | 胚胎发育和干细胞分化过程中的基因调控网络 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 26265 | 2024-08-09 |
A Review of Matched-pairs Feature Selection Methods for Gene Expression Data Analysis
2018, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2018.02.005
PMID:30275937
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综述 | 本文综述了针对基因表达数据分析的匹配对特征选择方法 | 介绍了专门为匹配对数据设计的特征选择方法（MPFS），并比较了其在实际数据集上的性能 | 匹配对特征选择方法尚未成熟发展 | 旨在引导和全面展示匹配对特征选择方法，使读者能够轻松理解其特点并选择合适的方法进行分析 | 基因表达数据分析中的特征选择方法 | 生物信息学 | NA | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个真实数据集 |
| 26266 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of the Adult Mouse Kidney: From Molecular Cataloging of Cell Types to Disease-Associated Predictions
2019-01, American journal of kidney diseases : the official journal of the National Kidney Foundation
IF:9.4Q1
DOI:10.1053/j.ajkd.2018.07.002
PMID:30241960
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26267 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals dynamic transcriptome profiling in human early neural differentiation
2018-11-01, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giy117
PMID:30239706
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了人类早期神经分化过程中动态的转录组特征 | 本研究首次识别了在神经分化各阶段对中枢神经系统谱系承诺贡献最大的亚群，并鉴定了潜在的新型转录因子 | NA | 探究神经谱系中细胞命运决定和亚群特化的调控网络 | 人类早期神经分化过程中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 六个连续的重编程和神经分化时间点的单细胞 |
| 26268 | 2024-08-09 |
Reproducibility of Molecular Phenotypes after Long-Term Differentiation to Human iPSC-Derived Neurons: A Multi-Site Omics Study
2018-10-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2018.08.013
PMID:30245212
|
研究论文 | 本研究通过在五个不同实验室重复相同的长期神经分化协议，评估了人iPSC衍生的神经元的分子表型的可重复性。 | 本研究揭示了实验室间基因表达差异的低可重复性，并通过因子分析识别了影响可重复性的主要因素，如传代效应和前体储存。 | 研究发现了实验室间的低可重复性，表明在不同实验环境下实施相同协议时存在系统性偏差。 | 旨在建立长期神经分化协议的可重复性，并识别影响实验结果一致性的关键因素。 | 研究对象为两个相同的iPSC细胞系，通过长期神经分化后在不同实验室进行分子和细胞水平的比较。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 两个iPSC细胞系在五个不同实验室进行重复实验 |
| 26269 | 2024-08-09 |
Regulatory cocktail for dopaminergic neurons in a protovertebrate identified by whole-embryo single-cell transcriptomics
2018-10-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.317669.118
PMID:30228204
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研究论文 | 本文通过全胚胎单细胞RNA测序技术，识别了原脊椎动物中多巴胺能神经元的调控混合物 | 本文首次通过功能操作和单细胞RNA测序技术，识别了特定细胞身份的调控混合物 | NA | 识别原脊椎动物中多巴胺能神经元的调控机制 | 原脊椎动物的中枢神经系统中的多巴胺能神经元 | NA | NA | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 26270 | 2024-08-09 |
Identifying core biological processes distinguishing human eye tissues with precise systems-level gene expression analyses and weighted correlation networks
2018-10-01, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddy239
PMID:30239781
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研究论文 | 本研究整合了公开的健康人眼组织RNA-seq数据集及其他数十种组织数据，通过差异表达、聚类和基因本体论富集工具分析了不同眼组织（角膜、视网膜、视网膜色素上皮-脉络膜复合体）与其他人体组织的生物学过程和泛表达关系，并构建了首个人类加权基因相关网络以突出已知的生物途径和眼基因疾病富集。 | 首次构建了人类加权基因相关网络，并整合了小鼠视网膜的单细胞RNA-seq数据进行验证和发现。 | NA | 旨在识别区分人眼组织的核心生物学过程，并通过精确的系统级基因表达分析和加权相关网络进行研究。 | 人眼组织的基因表达模式及其与其他人体组织的比较。 | 基因表达分析 | NA | RNA-seq | 加权基因相关网络 | 基因表达数据 | 包含多个健康人眼组织及数十种其他组织的RNA-seq数据集，以及小鼠视网膜的单细胞RNA-seq数据。 |
| 26271 | 2024-08-09 |
Chronic infection stunts macrophage heterogeneity and disrupts immune-mediated myogenesis
2018-09-20, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.121549
PMID:30232283
|
研究论文 | 研究慢性感染如何影响巨噬细胞的异质性和免疫介导的肌生成 | 首次探讨了慢性感染环境下骨骼肌修复过程中巨噬细胞异质性的变化及其对组织修复功能的影响 | 研究使用了特定的cardiotoxin损伤模型，可能不完全代表所有慢性感染情况 | 探讨慢性感染对骨骼肌修复过程中免疫反应的影响 | 骨骼肌在慢性感染环境下的修复过程及其免疫机制 | 免疫学 | NA | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | NA | 细胞和基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 26272 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveal that PD-1 mediates immune tolerance by regulating proliferation of regulatory T cells
2018-09-20, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-018-0581-y
PMID:30236153
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究，揭示了PD-1通过调节调节性T细胞的增殖来介导免疫耐受的机制。 | 首次展示了PD-1在调节性T细胞增殖中的作用，以及其在移植耐受中的关键角色。 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探究PD-1在调节性T细胞增殖中的作用及其在移植耐受中的机制。 | 调节性T细胞（Treg）在移植排斥和耐受中的功能和机制。 | 免疫学 | 移植排斥 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12,964个内植CD4+ T细胞 |
| 26273 | 2024-08-09 |
Transcriptomic but not genomic variability confers phenotype of breast cancer stem cells
2018-09-19, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1186/s40880-018-0326-8
PMID:30231942
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研究论文 | 本研究旨在探讨基因组突变是否有助于获得乳腺癌干细胞样表型，并研究乳腺癌干细胞的遗传和转录特征 | 发现转录组变异性而非基因组突变是区分乳腺癌干细胞与非乳腺癌干细胞的关键因素，并鉴定出74个乳腺癌干细胞标记物 | NA | 探讨基因组突变对乳腺癌干细胞表型的影响，并研究其遗传和转录特征 | 乳腺癌干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 全基因组测序，目标深度DNA测序，RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 涉及大量细胞和单细胞样本 |
| 26274 | 2024-08-09 |
Genetic and scRNA-seq Analysis Reveals Distinct Cell Populations that Contribute to Salivary Gland Development and Maintenance
2018-09-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-018-32343-z
PMID:30232460
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和体内遗传谱系追踪技术，详细描绘了小鼠下颌下腺在胚胎发育和成年期的基底和肌上皮细胞群体的细胞命运轨迹和分支点 | 本研究揭示了p63和α-平滑肌肌动蛋白（SMA）作为基底和肌上皮细胞谱系的可靠标记，并展示了这两种细胞类型在形态发生和成年期维持不同细胞谱系的独特命运 | NA | 研究下颌下腺发育和维持中不同细胞群体的动态和复杂性，并探讨其在干细胞和祖细胞层次中的分化潜能 | 小鼠下颌下腺的基底和肌上皮细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26275 | 2024-08-09 |
Aging alters the epigenetic asymmetry of HSC division
2018-09, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.2003389
PMID:30235201
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研究论文 | 研究揭示了随着年龄增长，造血干细胞（HSCs）分裂的表观遗传不对称性变化及其机制 | 通过综合分析单细胞3D共聚焦成像、单细胞移植、单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序（ATAC-seq），展示了HSC分裂结果与分裂前极性状态的强关联 | NA | 探讨年龄对造血干细胞分裂表观遗传不对称性的影响 | 造血干细胞（HSCs）的分裂极性和表观遗传调控 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞转座酶可及染色质测序（ATAC-seq） | 数学模型 | 单细胞数据 | NA |
| 26276 | 2024-08-09 |
Experimental Considerations for Single-Cell RNA Sequencing Approaches
2018, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2018.00108
PMID:30234113
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研究论文 | 本文详细介绍了单细胞RNA测序（scRNAseq）的实验步骤和关键挑战 | 单细胞RNA测序技术使得科学家能够深入研究先前未探索的稀有细胞类型 | 由于scRNAseq的高灵敏度，实验设置和执行需要特别注意 | 探讨单细胞RNA测序技术的实验考虑和挑战 | 单细胞RNA测序的实验流程和数据分析 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 26277 | 2024-08-09 |
Single-Cell mRNA Sequencing of the Mouse Brain Vasculature
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-8712-2_21
PMID:30242769
|
研究论文 | 本文描述了一种使用单细胞转录组学分析小鼠大脑血管的方法 | 本文采用了荧光激活细胞分选（FACS）和Smart-Seq2单细胞文库构建方法，以及详细的质量控制步骤 | 单细胞测序技术成本较高 | 研究小鼠大脑血管的单细胞转录组 | 小鼠大脑血管细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | mRNA | 384孔格式细胞 |
| 26278 | 2024-08-09 |
Phylogeny and physiology of candidate phylum BRC1 inferred from the first complete metagenome-assembled genome obtained from deep subsurface aquifer
2019-Jan, Systematic and applied microbiology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.syapm.2018.08.013
PMID:30201528
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研究论文 | 本文通过从深层地下热含水层微生物群落的宏基因组中重建BRC1细菌BY40的完整基因组，进行了代谢重建和与现有基因组数据的比较分析 | 首次从深层地下含水层获得了候选门BRC1的完整宏基因组组装基因组，并提出了新的分类建议 | NA | 研究候选细菌门BRC1的系统发育和生理特性 | 候选细菌门BRC1及其成员BY40的基因组和代谢途径 | 微生物学 | NA | 宏基因组学 | NA | 基因组数据 | 单个细菌BY40的3.3Mb基因组 |
| 26279 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals diverse intratumoral heterogeneities and gene signatures of two types of esophageal cancers
2018-12-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2018.09.017
PMID:30223068
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了368个来自三种食管鳞状细胞癌（ESCC）和两种食管腺癌（EAC）的单细胞，揭示了这两种癌症在细胞转录组层面的差异和肿瘤内细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细区分了ESCC和EAC的细胞类型和状态，并发现了NOTCH信号通路在ESCC中的特异性激活 | NA | 揭示食管鳞状细胞癌和食管腺癌的细胞转录组差异及其对治疗策略的影响 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）和食管腺癌（EAC）的单细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 368个单细胞 |
| 26280 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals distinct inflammation-induced microglia signatures
2018-11, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.201846171
PMID:30206190
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和多色流式细胞术，全面分析了脂多糖（LPS）注射小鼠大脑中微胶质细胞的转录组特征 | 本文首次揭示了在炎症条件下微胶质细胞的独特激活特征，这些特征与神经退行性疾病相关的特征有显著差异 | NA | 研究微胶质细胞在神经炎症过程中的作用及其在中枢神经系统疾病中的潜在应用 | 微胶质细胞在脂多糖注射小鼠大脑中的转录组特征 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 脂多糖注射的小鼠大脑样本 |