单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 26241 - 26260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26241 | 2024-08-09 |
Simplified Drop-seq workflow with minimized bead loss using a bead capture and processing microfluidic chip
2019-04-23, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/c9lc00014c
PMID:30920557
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研究论文 | 本文介绍了一种简化的Drop-seq工作流程，通过使用微流控芯片捕获和处理珠子，减少了珠子损失 | 重新设计了原始的dropleting设备，使其兼容空气压力系统和注射泵，并设计了一个用于封装后珠子处理的芯片，从而简化了Drop-seq的细胞处理效率 | NA | 优化和重新设计Drop-seq技术，提高其灵活性和效率 | 单细胞RNA测序技术中的Drop-seq平台 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 微流控芯片 | 细胞 | 数千个细胞 |
| 26242 | 2024-08-09 |
A knowledge-guided kidney cell census-reconciling bulk omics with cellular heterogeneity?
2019-04, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2018.12.016
PMID:30904059
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research paper | Clark等人基于对肾脏总质量和分子标记物表达的计算贡献，提出了一份基于知识的43种已知典型肾脏细胞类型的名录 | 研究展示了如何结合单细胞转录组学与批量测序数据集，以促进肾脏研究中整合组学分析的利用 | 研究指出了批量转录组学的局限性 | 旨在调和批量组学与细胞异质性之间的关系 | 43种已知的典型肾脏细胞类型 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 43种细胞类型 |
| 26243 | 2024-08-09 |
Spatiotemporal Developmental Trajectories in the Arabidopsis Root Revealed Using High-Throughput Single-Cell RNA Sequencing
2019-03-25, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2019.02.022
PMID:30913408
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研究论文 | 本研究利用高通量单细胞RNA测序技术，揭示了拟南芥根部细胞的时空发育轨迹 | 首次构建了拟南芥根部的高分辨率单细胞RNA测序表达图谱，详细展示了主要细胞类型的表达特征 | NA | 探索植物根部细胞的发育过程及其调控机制 | 拟南芥根部细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个独立分析的细胞 |
| 26244 | 2024-08-09 |
Genetics of Alzheimer's Disease
2018-Dec, Dementia and neurocognitive disorders
DOI:10.12779/dnd.2018.17.4.131
PMID:30906402
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研究论文 | 本文通过先进的遗传技术阐明了与阿尔茨海默病（AD）相关的基因 | 利用CRISPR-CAS9和单细胞RNA测序等新技术，为遗传学开启了新纪元，并直接将遗传知识与未来治疗联系起来 | NA | 阐明阿尔茨海默病的遗传基础 | 阿尔茨海默病相关的基因 | 遗传学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR-CAS9, 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | NA |
| 26245 | 2024-08-09 |
False signals induced by single-cell imputation
2018, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.16613.2
PMID:30906525
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研究论文 | 本文评估了使用六种不同方法进行单细胞RNA测序数据插补时产生假阳性或不可重复差异表达的风险 | 首次系统评估了不同插补方法在单细胞RNA测序数据中引入假阳性的程度，并提出了减少这些影响的策略 | 所有插补方法都降低了细胞类型特异性标记的可重复性，尽管可以通过选择具有较大效应量和显著性的标记来缓解 | 评估单细胞RNA测序数据插补方法的可靠性和潜在风险 | 单细胞RNA测序数据的插补方法及其对基因表达分析的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种模拟数据集和真实单细胞RNA测序数据集 |
| 26246 | 2024-08-09 |
Single-Cell Genomics
2019-08, Clinical chemistry
IF:7.1Q1
DOI:10.1373/clinchem.2017.283895
PMID:30872376
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学的当前状态，并描述了其在临床研究和医学应用中的机会 | 单细胞基因组学技术的发展提高了可靠性和商业化单细胞分离平台的开发，为临床实验室应用开辟了潜力 | NA | 探讨单细胞基因组学在细胞异质性和分子特征识别中的应用 | 单细胞基因组学技术及其在多个生物学领域的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 26247 | 2024-08-09 |
Growth Plate Borderline Chondrocytes Behave as Transient Mesenchymal Precursor Cells
2019-08, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.3719
PMID:30888720
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研究论文 | 本文研究了生长板边缘软骨细胞在体内作为短暂间充质前体细胞的行为，特别是它们转化为成骨细胞和骨髓基质细胞的过程。 | 首次揭示了生长板边缘软骨细胞在体内转化为成骨细胞和骨髓基质细胞的命运，并展示了这些细胞在成年后显著减少的现象。 | NA | 探讨生长板边缘软骨细胞在体内的细胞命运及其在成骨和骨髓基质细胞生成中的作用。 | 生长板边缘软骨细胞及其在体内的转化过程。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Col2a1-creER标记的新生软骨细胞的亚群 |
| 26248 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis of Physcomitrella leaf cells during reprogramming using microcapillary manipulation
2019-05-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz181
PMID:30873540
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研究论文 | 本文介绍了一种使用微毛细管操纵的单细胞数字基因表达（1cell-DGE）方法，用于在保持细胞位置信息的同时，从完整组织中提取单个活细胞的内容物进行单细胞RNA测序（scRNA-seq），并分析了苔藓Physcomitrella patens叶片细胞在重编程过程中的差异表达基因。 | 本文创新性地开发了1cell-DGE方法，能够在不分离细胞的情况下，通过微毛细管操纵技术获取单个细胞的转录组信息，并保留细胞的位置信息。 | 该方法的应用受限于能够从原始组织中分离的细胞类型，且难以在原位获得这些细胞的精确位置信息。 | 研究目的是开发一种新的单细胞RNA测序方法，用于分析细胞在重编程过程中的基因表达变化。 | 研究对象是苔藓Physcomitrella patens的叶片细胞在重编程过程中的基因表达。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 在0小时和24小时后切除的叶片细胞中，识别了6382个差异表达基因 |
| 26249 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Sequencing and Optical Electrophysiology of Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes Reveal Discordance Between Cardiac Subtype-Associated Gene Expression Patterns and Electrophysiological Phenotypes
2019-05-15, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2019.0030
PMID:30892143
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序和光学电生理学技术，分析人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞的基因表达模式与电生理表型之间的一致性 | 发现心肌细胞亚型相关的基因表达模式无法准确分类细胞的电生理功能，但某些基因表达的变化可以影响电生理成熟 | 单细胞基因表达模式无法区分心肌细胞的亚型，如心房、心室或结节型 | 评估单细胞基因表达是否足以预测iPSC衍生心肌细胞的电生理特性 | 人诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数百个hiPSC衍生的心肌细胞 |
| 26250 | 2024-08-09 |
Cell composition analysis of bulk genomics using single-cell data
2019-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0355-5
PMID:30886410
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cell Population Mapping (CPM)的解卷积算法，利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据来推断复杂组织中细胞类型和状态的组成 | CPM算法能够重建异质组织中细胞状态的连续谱，并揭示了细胞丰度与临床症状之间的关系是细胞状态特异性的 | NA | 研究细胞类型和状态的组成及其与临床症状的关系 | 流感病毒感染的小鼠肺部组织 | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 解卷积算法 | 转录组数据 | 流感病毒感染的小鼠肺部组织样本 |
| 26251 | 2024-08-09 |
Scalable analysis of cell-type composition from single-cell transcriptomics using deep recurrent learning
2019-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0353-7
PMID:30886411
|
研究论文 | 本文介绍了scScope方法，该方法利用深度学习技术从大量噪声单细胞基因表达数据中准确快速地识别细胞类型组成 | 提出了scScope方法，利用深度学习技术处理大规模单细胞RNA测序数据，实现了细胞类型组成的快速准确识别 | NA | 开发一种能够从大规模单细胞转录组数据中快速准确识别细胞类型组成的方法 | 单细胞转录组数据中的细胞类型组成 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | 数百万个单细胞 |
| 26252 | 2024-08-09 |
Functional Heterogeneity of Mouse Prostate Stromal Cells Revealed by Single-Cell RNA-Seq
2019-Mar-29, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2019.02.032
PMID:30878879
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了成年小鼠前列腺基质细胞的表型和功能异质性 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，详细描述了小鼠前列腺基质细胞的三种主要细胞群体及其功能特性 | NA | 探究成年小鼠前列腺基质细胞的表型和功能异质性 | 小鼠前列腺基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26253 | 2024-08-09 |
PAGA: graph abstraction reconciles clustering with trajectory inference through a topology preserving map of single cells
2019-03-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1663-x
PMID:30890159
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研究论文 | 本文介绍了基于估计数据流形分区连接性的图抽象方法PAGA，用于单细胞RNA-seq数据的解释性图映射 | PAGA方法能够保留数据的全局拓扑结构，允许在不同分辨率下分析数据，并显著提高典型探索性数据分析工作流的计算效率 | NA | 开发一种新的方法来解释单细胞RNA-seq数据中的细胞类型和细胞过渡 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图抽象方法 | 数据流形 | 四个造血数据集、成年涡虫和斑马鱼胚胎以及一百万个神经元 |
| 26254 | 2024-08-09 |
Molecular profiling of resident and infiltrating mononuclear phagocytes during rapid adult retinal degeneration using single-cell RNA sequencing
2019-03-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-41141-0
PMID:30890724
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了在快速成年视网膜退化过程中，驻留和浸润的单核吞噬细胞的分子特征 | 本研究揭示了中枢神经系统中细胞自主退化时先天免疫反应的先前无法测量的分子异质性 | NA | 探讨在神经退化过程中驻留和浸润免疫细胞的具体作用 | 视网膜中的驻留和浸润单核吞噬细胞 | 数字病理学 | 视网膜退化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 整个CD11bCD45细胞群体 |
| 26255 | 2024-08-09 |
In Vivo Generation of Post-infarct Human Cardiac Muscle by Laminin-Promoted Cardiovascular Progenitors
2019-03-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.02.083
PMID:30893597
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研究论文 | 本文研究了通过层粘连蛋白促进心血管前体细胞生成后梗死人心脏肌肉的方法 | 首次识别并生产了人类重组层粘连蛋白-221，并展示了其促进人类胚胎干细胞向心肌细胞分化的能力 | NA | 探索再生受损人心脏肌肉的新方法 | 人类胚胎干细胞衍生的心血管前体细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | RNA | 使用了来自不同人类胚胎干细胞系的样本 |
| 26256 | 2024-08-09 |
Dissecting Cell Lineage Specification and Sex Fate Determination in Gonadal Somatic Cells Using Single-Cell Transcriptomics
2019-03-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.02.069
PMID:30893600
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了卵巢Nr5a1-GFP体细胞在性别决定过程中的细胞谱系特化和性别命运决定 | 首次通过时间序列单细胞RNA测序，揭示了早期前体细胞如何分化为支持细胞以及性特异性细胞的分子机制 | NA | 探究哺乳动物性决定过程中分子和细胞的基础 | 卵巢Nr5a1-GFP体细胞在性别决定过程中的细胞谱系特化和性别命运决定 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | XX和XY体细胞 |
| 26257 | 2024-08-09 |
ST viewer: a tool for analysis and visualization of spatial transcriptomics datasets
2019-03-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty714
PMID:30875427
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research paper | 本文介绍了一种名为ST Viewer的工具，用于实时交互、分析和可视化空间转录组学数据集 | ST Viewer提供了一个无缝且流畅的用户界面，使得空间转录组学数据集的分析和可视化变得更加便捷 | NA | 开发一种新的工具，以简化空间转录组学数据集的分析和可视化过程 | 空间转录组学数据集 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 26258 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis identifies distinct cell types and niche signaling in a primary gastric organoid model
2019-03-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-40809-x
PMID:30872643
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了胃器官模型中的细胞类型和微环境信号 | 首次使用单细胞RNA测序技术在胃器官模型中识别了特定的细胞类型和微环境信号 | NA | 研究胃组织微环境中的细胞类型和信号传导 | 胃器官模型中的细胞类型和微环境信号 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 转录组 | 4,391个单细胞 |
| 26259 | 2024-08-09 |
Human genes escaping X-inactivation revealed by single cell expression data
2019-Mar-12, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-019-5507-6
PMID:30871455
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术检测了体细胞中逃逸X染色体失活的基因 | 首次在单细胞水平上系统地研究了X染色体失活及其逃逸现象，并发现了新的长非编码RNA逃逸基因 | 研究仅使用了有限数量的细胞样本，且主要集中在纤维母细胞和淋巴母细胞两种细胞类型 | 探究X染色体失活及其逃逸现象，并识别新的逃逸基因 | 体细胞中的X染色体失活逃逸基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 104个健康纤维母细胞和25个具有测序亲本基因组的克隆淋巴母细胞 |
| 26260 | 2024-08-09 |
Dynamic transcriptome profiles within spermatogonial and spermatocyte populations during postnatal testis maturation revealed by single-cell sequencing
2019-03, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1007810
PMID:30893341
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研究论文 | 本研究利用单细胞mRNA测序技术，揭示了在青春期睾丸成熟过程中，精原细胞和精母细胞群体的动态转录组特征 | 本研究首次无偏差地采集了睾丸成熟期间精原细胞和精母细胞的高分辨率单细胞深度数据集，揭示了高度过渡性细胞群体的先前未知的转录动态，并开始揭示发育中的精原细胞和精母细胞在生物途径利用上的关键差异 | NA | 探索睾丸成熟过程中发育细胞阶段的转录组特征 | 精原细胞和精母细胞的转录组特征 | NA | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |