单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 26181 - 26200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26181 | 2024-08-09 |
webCEMiTool: Co-expression Modular Analysis Made Easy
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00146
PMID:30894872
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研究论文 | 介绍了一个名为webCEMiTool的在线工具，用于自动化执行共表达模块分析，并进行功能分析和网络分析 | webCEMiTool是一个独特的在线工具，能够全面自动化地进行模块分析，并整合转录组数据与相互作用组信息 | NA | 开发一个易于使用的工具，用于共表达模块分析和功能分析 | 人类细胞中单细胞RNA测序数据，感染了寨卡病毒或登革热病毒 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 感染了寨卡病毒或登革热病毒的人类细胞 |
| 26182 | 2024-08-09 |
Probabilistic count matrix factorization for single cell expression data analysis
2019-10-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz177
PMID:30865271
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研究论文 | 本文提出了一种概率计数矩阵分解（pCMF）方法，用于单细胞表达数据分析，该方法基于稀疏Gamma-Poisson因子模型，并使用变分EM算法进行推断 | pCMF方法能够同时构建细胞和基因的低维表示，适用于单细胞数据的可视化和聚类 | NA | 探索高吞吐量单细胞测序技术在细胞转录组群体多样性研究中的应用 | 单细胞表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | Gamma-Poisson因子模型 | 表达数据 | NA |
| 26183 | 2024-08-09 |
Defining the Activated Fibroblast Population in Lung Fibrosis Using Single-Cell Sequencing
2019-07, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2018-0313OC
PMID:30848683
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序分析了博莱霉素诱导的肺纤维化模型，以表征纤维化损伤的分子反应 | 通过单细胞RNA测序技术，识别并定义了一个激活的成纤维细胞亚群，并生成了一个49基因的特征签名 | 所识别的基因并非特定于激活的细胞或疾病环境，表明激活的成纤维细胞并非独特定义，而是表现出与对照细胞相似但放大的基因表达模式 | 旨在深入理解特发性肺纤维化中成纤维细胞群体的特征 | 特发性肺纤维化中的成纤维细胞群体 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 肺细胞样本在第11天采集 |
| 26184 | 2024-08-09 |
Cell-specific network constructed by single-cell RNA sequencing data
2019-06-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz172
PMID:30864667
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法，利用单细胞RNA测序数据为每个单细胞构建细胞特异性网络（CSN） | 首次能够在单细胞分辨率水平上识别基因关联/网络，并将数据从‘不稳定’的基因表达形式转换为‘稳定’的基因关联形式 | 传统的网络方法局限于分组细胞，而不是每个单细胞，因此会消除单细胞的异质性 | 开发一种新的方法来分析单细胞RNA测序数据，以揭示单细胞水平的基因关联 | 单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 细胞特异性网络（CSN） | 基因表达数据 | 大量单细胞 |
| 26185 | 2024-08-09 |
The myriad possibility of kidney organoids
2019-05, Current opinion in nephrology and hypertension
IF:2.2Q2
DOI:10.1097/MNH.0000000000000498
PMID:30865165
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综述 | 本文综述了近年来在人多能干细胞衍生的肾脏类器官领域的最新进展，包括分化协议、分析工具及其应用 | 肾脏类器官作为一种新的体外系统，能够覆盖早期肾发生的窗口，并具有疾病建模的能力。通过全局分析工具如RNA测序和蛋白质组学，为肾脏类器官的研究提供了新的和意外的见解 | 尽管存在一些限制，但人多能干细胞衍生的肾脏类器官是研究肾脏发育和疾病的真实且实用的模型 | 旨在总结肾脏类器官的最新进展，并探讨其在组织再生、药物筛选和疾病建模方面的应用 | 人多能干细胞衍生的肾脏类器官 | NA | NA | RNA测序、蛋白质组学 | NA | 细胞 | NA |
| 26186 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Profiling of Glomerular Cells Shows Dynamic Changes in Experimental Diabetic Kidney Disease
2019-04, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2018090896
PMID:30846559
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了糖尿病肾病中肾小球细胞的基因表达变化 | 首次详细揭示了糖尿病肾病中肾小球细胞特异性基因表达的动态变化 | 研究仅限于特定的eNOS-/-小鼠模型，可能不适用于所有糖尿病肾病情况 | 阐明糖尿病肾病中肾小球细胞特异性基因表达的变化 | 糖尿病肾病中的肾小球细胞 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 来自糖尿病eNOS-/-小鼠和对照eNOS-/-小鼠的肾小球细胞 |
| 26187 | 2024-08-09 |
Altered neuronal migratory trajectories in human cerebral organoids derived from individuals with neuronal heterotopia
2019-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0371-0
PMID:30858616
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研究论文 | 研究通过分析来自DCHS1和FAT4基因突变患者的诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的脑类器官，探讨了脑皮质异位症（PH）的分子和细胞机制 | 首次使用人脑类器官模型来再现与PH相关的皮质异位症，并揭示了DCHS1和FAT4基因突变对神经元迁移动力学的影响 | 研究仅限于DCHS1和FAT4基因突变的患者，可能无法完全代表所有PH病例 | 理解导致人类皮质畸形，特别是脑皮质异位症的分子和细胞机制 | 来自DCHS1和FAT4基因突变患者的iPSCs衍生的脑类器官 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 来自DCHS1和FAT4基因突变患者的iPSCs及同基因敲除（KO）细胞系 |
| 26188 | 2024-08-09 |
Complementary Roles for Single-Nucleus and Single-Cell RNA Sequencing in Kidney Disease Research
2019-04, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019020112
PMID:30867246
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26189 | 2024-08-09 |
Microglial Function Is Distinct in Different Anatomical Locations during Retinal Homeostasis and Degeneration
2019-03-19, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.02.007
PMID:30850344
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研究论文 | 研究探讨了不同解剖位置的视网膜小胶质细胞在稳态和退化过程中的功能差异 | 首次展示了成年视网膜小胶质细胞在不同生态位中的功能差异，并揭示了其在视网膜退化模型中的转录重编程 | NA | 探究不同神经系统区域的小胶质细胞是否具有不同的功能 | 视网膜小胶质细胞及其在不同生态位中的功能 | NA | NA | 谱系追踪、单细胞转录组学、电生理学 | NA | 转录组数据 | 小鼠视网膜样本 |
| 26190 | 2024-08-09 |
Single cell RNA-seq identifies the origins of heterogeneity in efficient cell transdifferentiation and reprogramming
2019-03-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.41627
PMID:30860479
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了小鼠前B细胞向巨噬细胞的转分化及其向诱导多能干细胞（iPSCs）的重编程过程中的异质性 | 本文首次揭示了Myc活性在不同体细胞类型中对重编程效率的预测作用 | NA | 理解细胞转分化和重编程过程中的异质性 | 小鼠前B细胞的转分化和重编程 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠前B细胞 |
| 26191 | 2024-08-09 |
Insights into the Biology of Hearing and Deafness Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2019-03-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.02.053
PMID:30865901
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研究论文 | 本文介绍了一种从鼠类耳蜗中分离单个内毛细胞（IHCs）、外毛细胞（OHCs）和Deiters细胞（DCs）的方法，并利用单细胞RNA测序技术分析了这些细胞的转录组特征 | 本文首次成功分离并测序了从出生后15天到228天的鼠类耳蜗中的内毛细胞、外毛细胞和Deiters细胞，揭示了与耳聋相关基因的复杂异构体多样性 | NA | 深入了解听力和耳聋的生物学机制 | 鼠类耳蜗中的内毛细胞、外毛细胞和Deiters细胞 | 数字病理学 | 耳聋 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过200个鼠类内毛细胞、外毛细胞和Deiters细胞 |
| 26192 | 2024-08-09 |
Endothelial miR-30c suppresses tumor growth via inhibition of TGF-β-induced Serpine1
2019-03-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI123106
PMID:30855280
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研究论文 | 研究报告了在Cdh5-CreERT2 Tgfbr2fl/fl小鼠（Tgfbr2iECKO小鼠）中，通过后生删除Tgfbr2抑制血管内皮细胞（EC）中的TGF-β信号传导，从而抑制纤维蛋白介导的血管生成和肿瘤生长 | 通过使用血管趋向性纳米颗粒传递miR-30c antagomiRs绕过TGF-β信号传导，促进PAI-1依赖的肿瘤生长和增加纤维蛋白丰度，而miR-30c模拟物则抑制肿瘤生长并促进血管定向的纤维蛋白溶解 | NA | 研究miR-30c在肿瘤微环境中通过平衡EC中的Serpine1表达作为肿瘤抑制因子的功能 | 血管内皮细胞（EC）和肿瘤生长 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序，NanoString miRNA阵列 | NA | RNA | Cdh5-CreERT2 Tgfbr2fl/fl小鼠（Tgfbr2iECKO小鼠）的ECs，肺和乳腺肿瘤模型的ECs |
| 26193 | 2024-08-09 |
Generation and persistence of human tissue-resident memory T cells in lung transplantation
2019-03-08, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aav5581
PMID:30850393
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研究论文 | 研究了人类肺组织中记忆T细胞的生成、维持及其功能 | 首次在人类肺移植受者中追踪和定位供体和受体T细胞，并揭示了T细胞在肺移植中的持久性和功能 | NA | 探讨人类肺组织中记忆T细胞的生成、维持及其功能 | 人类肺组织中的记忆T细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 从人类白细胞抗原（HLA）不相容的肺移植受者中获取的气道样本 |
| 26194 | 2024-08-09 |
Evaluation of Wu et al.: Strengthening Single-Cell Bioinformatic Comparisons for Improving Organoid Differentiation
2019-03-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.02.010
PMID:30849359
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评论 | 本文是对Wu等人的论文《基于单细胞转录组学的人类PSC来源的肾脏类器官分化比较分析与改进》的同行评审过程的示例 | NA | NA | 展示对Wu等人论文的同行评审过程 | Wu等人的论文《基于单细胞转录组学的人类PSC来源的肾脏类器官分化比较分析与改进》 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 26195 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Cellular Heterogeneity of Pluripotency Transition and X Chromosome Dynamics during Early Mouse Development
2019-03-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.02.031
PMID:30840884
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠早期胚胎发育过程中EPI细胞的多能性转变和X染色体动态变化 | 首次揭示了EPI细胞在多能性转变过程中的三种细胞状态，并详细描述了X染色体在雌性胚胎中的重新激活和随机失活过程 | NA | 探究小鼠早期胚胎发育过程中EPI细胞的多能性转变和X染色体动态变化的分子机制 | 小鼠早期胚胎发育过程中的EPI细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 1,724个细胞 |
| 26196 | 2024-08-09 |
The Space-Time Continuum of Cortical Dysplasia
2019-01, Epilepsy currents
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/1535759718822039
PMID:30838928
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研究论文 | 本文探讨了mTOR通路基因突变在皮质发育不良中的作用 | 通过深度测序和单细胞测序技术，揭示了mTOR激活在皮质发育不良中的具体作用机制 | NA | 研究mTOR通路基因突变在皮质发育不良中的病理机制 | 皮质发育不良（FCD）和半巨脑症（HME）患者的大脑组织 | 神经科学 | 神经发育异常 | 深度测序，单细胞测序 | NA | 基因序列数据 | 66例FCD/HME患者的大脑组织 |
| 26197 | 2024-08-09 |
20 Years of Secretagogin: Exocytosis and Beyond
2019, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2019.00029
PMID:30853888
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综述 | 本文综述了钙结合蛋白Secretagogin在过去20年的研究进展及其在细胞信号传导中的作用 | 利用现代蛋白质组学技术，发现了大量Secretagogin的实际和潜在相互作用蛋白，揭示了其在神经细胞发育和成熟中的复杂作用 | NA | 回顾Secretagogin的最新发现，揭示其在细胞信号传导中的重要作用 | 钙结合蛋白Secretagogin及其相互作用蛋白 | NA | NA | 蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | NA |
| 26198 | 2024-08-09 |
Corrigendum: A Single-Cell Sequencing Guide for Immunologists
2019, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2019.00278
PMID:30863399
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26199 | 2024-08-09 |
State of the Future: Translational Approaches in Renal Cell Carcinoma in the Immunotherapy Era
2020-01-15, European urology focus
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.euf.2019.02.014
PMID:30827939
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review | 本文综述了在免疫治疗时代，肾细胞癌（RCC）中转化研究的新技术进展，特别是单细胞测序和基于PD-L1示踪剂的成像技术在生物标志物发现中的应用，以及体外肿瘤球体在创建肿瘤“免疫图谱”中的作用。 | 本文强调了单细胞测序和新型PD-L1示踪剂成像技术在RCC免疫治疗转化研究中的潜在价值，以及体外肿瘤球体在克服治疗抵抗中的应用。 | NA | 旨在通过新技术理解为何部分患者对免疫治疗无反应，并开发策略克服治疗抵抗，以识别哪些患者会对治疗有反应。 | 肾细胞癌（RCC）患者及其对免疫治疗的反应和抵抗机制。 | digital pathology | 肾细胞癌 | 单细胞测序 | NA | image | NA |
| 26200 | 2024-08-09 |
Therapeutic resistance and susceptibility is shaped by cooperative multi-compartment tumor adaptation
2019-Nov, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-019-0310-0
PMID:30824837
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研究论文 | 本文通过连续活检、下一代测序和单细胞转录组学技术，追踪了黑色素瘤自发性模型中多个细胞区室在一线治疗反应、复发和二线治疗干预期间的演变，揭示了治疗诱导的肿瘤复发中多个区室的变化及其对后续治疗效果的影响。 | 本文首次展示了治疗复发肿瘤在遗传稳定的情况下，通过肿瘤细胞分化状态、免疫浸润和细胞外基质（ECM）成分的显著变化，形成共享的抗性表型。 | 研究主要集中在黑色素瘤的自发性模型中，可能需要进一步的临床验证来证实这些发现。 | 探索肿瘤治疗抵抗和敏感性形成的机制，特别是在多区室肿瘤适应性方面。 | 研究对象包括肿瘤细胞、免疫细胞和细胞外基质等肿瘤微环境中的多个区室。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 下一代测序、单细胞转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 研究涉及多个肿瘤样本和细胞系 |