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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2601 | 2025-11-15 |
Single-cell meta-analysis of inflammatory bowel disease with scIBD
2023-06, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00464-9
PMID:38177426
|
研究论文 | 开发了一个用于炎症性肠病单细胞元分析的交互式可视化平台scIBD | 首次提供了炎症性肠病单细胞RNA测序数据集的综合集成分析平台,能够识别罕见细胞类型并解析溃疡性结肠炎与克罗恩病的异同 | 未提及具体的数据集规模限制或分析灵敏度限制 | 揭示炎症性肠病的异质性肠道微环境发病机制 | 炎症性肠病患者的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2602 | 2025-11-15 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-Jan-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.17.523241
PMID:36711968
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了凋亡识别受体在小鼠皮肤组织修复中的调控机制 | 首次在皮肤伤口炎症期间系统描绘细胞动态图谱,发现Axl和Timd4两种凋亡清除受体在组织修复中具有不同作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类糖尿病足伤口数据相对有限 | 探究凋亡细胞识别和清除机制如何调控组织修复过程 | 小鼠皮肤伤口模型和人类糖尿病足伤口 | 单细胞组学 | 皮肤创伤/糖尿病足 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2603 | 2025-11-14 |
Computational identification of FOXP3-associated spatial prognostic markers in HCC via digital pathology
2026-Jan, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.109119
PMID:41135296
|
研究论文 | 本研究通过计算分析数字病理切片,识别了肝细胞癌中与FOXP3相关的空间预后标志物 | 首次在点水平分辨率上计算识别空间差异基因,提供了一种经济高效且可扩展的空间生物标志物发现方法 | 样本量有限且统计功效可能不足,存在观察到的种族差异 | 识别肝细胞癌中具有预后意义的空间标志物 | TCGA-LIHC队列的肝细胞癌患者数字病理切片 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学分析,数字病理分析 | 计算流程,空间基因推断 | 数字病理切片,基因表达数据 | TCGA-LIHC队列样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2604 | 2025-11-14 |
Investigating the Shared Genetic Architecture of 3 Age-Related Ocular Disorders
2026-Jan, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2025.100942
PMID:41211298
|
研究论文 | 本研究通过遗传关联分析探索年龄相关性黄斑变性、白内障和原发性开角型青光眼三种年龄相关性眼病的共享遗传结构、因果关系及细胞类型特异性表达模式 | 首次综合运用跨性状荟萃分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术系统揭示三种年龄相关性眼病间的遗传关联和分子机制 | 依赖于公开可用的GWAS数据库数据,可能存在样本选择偏差 | 探索年龄相关性眼病的共享遗传结构和分子机制,为靶向治疗提供依据 | 年龄相关性黄斑变性(AMD)、白内障和原发性开角型青光眼(POAG)三种年龄相关性眼病 | 遗传学 | 眼科疾病 | 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化分析 | NA | 遗传数据、基因表达数据 | 来自公开GWAS数据库的三种眼病相关数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2605 | 2025-11-14 |
Effects of esketamine on electrophysiology and metabolic reprogramming in brain organoids: insights into antidepressant mechanisms
2025-Dec, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03198-4
PMID:40885845
|
研究论文 | 本研究通过脑类器官探究艾司氯胺酮对电生理和代谢重编程的影响 | 首次在人类脑类器官模型中系统研究艾司氯胺酮对电生理和代谢的浓度与时间依赖性影响 | 研究仅限于体外脑类器官模型,未进行体内验证 | 探究艾司氯胺酮的抗抑郁作用机制 | 健康对照和抑郁症患者来源的iPSC脑类器官 | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序,电生理记录,代谢分析 | 脑类器官模型 | 电生理数据,单细胞转录组数据,代谢数据 | 健康对照和抑郁症患者来源的脑类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2606 | 2025-11-14 |
Influence of Age on Fracture Healing in Young and Middle-Aged Mice in a Proximal Femur Fracture Model
2025-Dec, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society
IF:2.1Q2
DOI:10.1002/jor.70063
PMID:40931376
|
研究论文 | 本研究通过小鼠股骨近端骨折模型探讨年龄对骨折愈合的影响 | 首次在年轻和中年小鼠中系统比较股骨近端骨折愈合差异,并发现衰老细胞和SASP因子在年龄相关愈合延迟中的作用 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别差异和更老年齡组 | 确定年龄对小鼠股骨近端骨折愈合的影响及分子机制 | 12周和52周龄雄性C57BL/6J小鼠 | 骨生物学 | 骨质疏松性骨折 | 多重细胞因子分析,µCT分析,组织形态计量学,免疫染色,空间转录组学 | NA | 图像,分子表达数据 | 年轻和中年雄性C57BL/6J小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2607 | 2025-11-14 |
Time-Series Transcriptomics Identifies Xanthine Dehydrogenase in Injured Neurons Correlated With Orthodontic Pain
2025-Dec, Orthodontics & craniofacial research
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/ocr.70036
PMID:41002069
|
研究论文 | 本研究通过时间序列转录组学分析,发现黄嘌呤脱氢酶(Xdh)在正畸疼痛高峰期的受损神经元中高表达,并开发了OTMPTGTA网络平台供研究人员探索疼痛相关基因 | 首次将时间序列转录组学应用于正畸疼痛研究,识别出Xdh在Atf3+受损神经元中的关键作用,并开发了用户友好的数据分析平台 | 研究基于小鼠模型,需要进一步验证其在人类中的适用性;样本量相对有限 | 探索正畸牙齿移动疼痛的分子和细胞机制 | 小鼠三叉神经节组织和神经元 | 转录组学 | 正畸疼痛 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠三叉神经节组织样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2608 | 2025-11-14 |
Tregs With High CD29 Expression Promote Cell Adhesion and Contribute to the Malignant Transformation of MASLD
2025-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70421
PMID:41200753
|
研究论文 | 本研究揭示了CD29高表达调节性T细胞通过促进细胞粘附驱动MASLD恶性转化为肝癌的机制 | 首次发现Tregs通过上调CD29表达促进细胞粘附,从而驱动代谢功能障碍相关脂肪肝病向肝癌的恶性转化 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Tregs在MASLD向HCC恶性转化过程中的作用机制 | MASLD小鼠模型中的调节性T细胞 | 单细胞生物学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | MASLD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2609 | 2025-11-14 |
Esaxerenone inhibits renal macrophage proliferation through MR/TGF-β1 pathway in db/db mice
2025-Dec-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.124008
PMID:41067301
|
研究论文 | 本研究探讨了盐皮质激素受体阻滞剂esaxerenone通过MR/TGF-β1通路抑制db/db小鼠肾脏巨噬细胞增殖的作用机制 | 首次揭示esaxerenone通过MR/TGF-β1信号通路特异性抑制高糖诱导的巨噬细胞增殖,特别是M1亚型 | 研究仅使用db/db小鼠模型,未在其他糖尿病模型验证;体外实验使用骨髓来源巨噬细胞,与肾脏原位巨噬细胞存在差异 | 研究盐皮质激素受体阻滞对糖尿病肾病中巨噬细胞增殖的影响及其机制 | db/db糖尿病模型小鼠和骨髓来源巨噬细胞 | 分子病理学 | 糖尿病肾病 | 免疫组织化学、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 动物模型 | 分子标记表达数据、细胞表型数据、基因表达数据 | 8周龄db/db小鼠,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2610 | 2025-11-14 |
The epidermal immune microenvironment plays a central role in the pathogenesis of psoriasis
2025-Dec, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2025.102674
PMID:41072151
|
研究论文 | 本文探讨了表皮免疫微环境在银屑病发病机制中的核心作用 | 揭示了表皮免疫微环境作为银屑病核心致病机制,强调角质形成细胞既是炎症效应器又是疾病驱动者的双重角色 | NA | 阐明银屑病的发病机制并探索新的治疗靶点 | 银屑病患者的皮肤免疫微环境 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2611 | 2025-11-14 |
A Tertiary Lymphoid Structure-Related Gene Signature Predicts Prognosis and Treatment Response in Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec, World journal of oncology
IF:2.1Q3
DOI:10.14740/wjon2646
PMID:41208844
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一个与三级淋巴结构相关的六基因特征,用于预测肝细胞癌患者的预后和治疗反应 | 首次建立了基于三级淋巴结构的六基因特征评分系统,并在多个独立队列中验证了其对免疫治疗反应的预测价值 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性临床试验进一步验证 | 开发预测肝细胞癌预后和治疗反应的生物标志物 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,LASSO-Cox回归 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 多个独立肝细胞癌队列(包括TCGA和GEO数据库) | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 2612 | 2025-11-14 |
Analysis of the SH3-Domain Kinase Binding Protein 1 Predictive Model for Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and CCCTC-Binding Factor Transcriptional Regulatory Study
2025-Dec, World journal of oncology
IF:2.1Q3
DOI:10.14740/wjon2668
PMID:41208840
|
研究论文 | 通过多组学整合分析系统评估SH3KBP1在胰腺导管腺癌中的表达模式、生物学功能及调控机制 | 首次通过机器学习算法结合多组学数据鉴定SH3KBP1作为胰腺癌关键预测生物标志物,并揭示CTCF转录因子对其的调控机制 | 样本量相对有限(179例肿瘤样本和171例非肿瘤样本),需更大规模验证 | 系统研究SH3KBP1在胰腺导管腺癌中的表达特征、生物学功能及转录调控机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤组织及细胞系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,CRISPR基因敲除,转录因子结合位点预测 | 支持向量机(SVM),LASSO回归,SHAP分析 | mRNA表达数据,蛋白质组学数据,单细胞RNA测序数据,空间转录组学数据 | 179例PDAC肿瘤样本,171例非肿瘤样本(包括4例癌旁组织和167例正常对照),300对PDAC和非肿瘤样本的蛋白质组学数据 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 所有分析均在R平台上使用专业软件包完成 |
| 2613 | 2025-11-14 |
Bioinformatics driven in gene targeting platform for gold anticancer strategy delivery
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102438
PMID:41209699
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别TNBC中高表达基因SDC1,并构建金纳米簇靶向核酸递送系统抑制肿瘤血管生成 | 首次发现SDC1基因与TNBC预后及依托泊苷耐药性的正相关性,并开发了基于肿瘤微环境响应性的金纳米簇靶向递送系统 | NA | 发现新的靶向基因并开发核酸递送系统用于三阴性乳腺癌治疗 | 三阴性乳腺癌细胞及肿瘤微环境 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 基因芯片数据分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2614 | 2025-11-14 |
Probiotics derived sodium benzoate improves social behavior of offspring exposed in the maternal immune activation through regulation of histone lysine benzoylation in astrocytes
2025-Dec, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03164-0
PMID:40855005
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研究论文 | 本研究揭示益生菌衍生的苯甲酸钠通过调控星形胶质细胞组蛋白赖氨酸苯甲酰化改善母体免疫激活后代社交行为 | 首次发现益生菌代谢物苯甲酸钠通过组蛋白赖氨酸苯甲酰化表观遗传机制调节星形胶质细胞功能,揭示微生物-肠-脑轴新作用通路 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证 | 探索益生菌代谢物改善自闭症谱系障碍社交行为的分子机制 | 母体免疫激活诱导的自闭症小鼠模型及星形胶质细胞 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,RNA测序,Cut & Tag分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据,表观遗传数据 | 自闭症队列人群及MIA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,表观遗传分析 | NA | NA |
| 2615 | 2025-11-14 |
Comparative transcriptomics of lateral hypothalamic cell types reveals conserved growth hormone-tachykinin dynamics in feeding
2025-Dec, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102251
PMID:40947010
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研究论文 | 本研究通过比较转录组学分析揭示了侧下丘脑细胞类型中生长激素-速激肽动态在摄食行为中的保守机制 | 首次在斑马鱼和老鼠中鉴定出共表达生长激素受体和速激肽的保守GABA能神经元集群,并发现其在摄食状态下的激活机制 | 研究主要基于幼虫斑马鱼模型,在成年动物和人类中的保守性需要进一步验证 | 阐明侧下丘脑神经元在食欲调控中的分子和细胞特征及其进化保守性 | 斑马鱼和老鼠的侧下丘脑神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序,Act-seq方法,整合比较转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 幼虫斑马鱼侧下丘脑神经元(饥饿和饱食状态) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Act-seq方法(活动依赖性转录特征捕获) |
| 2616 | 2025-11-14 |
LILRB4 regulates circadian disruption-induced mammary tumorigenesis via non-canonical WNT signaling pathway
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03597-5
PMID:41102383
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研究论文 | 本研究探讨了昼夜节律紊乱通过LILRB4和非经典WNT信号通路促进乳腺肿瘤发生的作用机制 | 首次揭示LILRB4作为昼夜节律紊乱与侵袭性乳腺肿瘤发生之间的关键连接分子,并证明靶向LILRB4免疫疗法可抑制肿瘤转移 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明昼夜节律紊乱促进乳腺肿瘤发生的分子机制 | 侵袭性乳腺癌基因工程小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫染色,实时PCR | 基因工程小鼠模型 | 单细胞测序数据,流式数据,图像数据,基因表达数据 | LD12:12和昼夜节律紊乱小鼠的肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2617 | 2025-11-14 |
Mapping atherogenesis mechanisms in smooth muscle cells by targeting genes linked to coronary artery disease
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113698
PMID:41210961
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研究论文 | 本研究结合冠状动脉疾病GWAS与单细胞RNA测序,识别平滑肌细胞中的风险基因并揭示其在动脉粥样硬化中的调控机制 | 首次将CAD GWAS与动脉粥样硬化斑块单细胞RNA测序整合,通过扰动实验发现不同风险基因共同调控收缩装置、细胞周期等关键通路 | 研究主要聚焦于平滑肌细胞,未全面评估其他血管细胞类型的贡献 | 解析冠状动脉疾病中平滑肌细胞的发病机制 | 人类动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞及SMC来源的间充质细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2618 | 2025-11-14 |
CHD7 regulates cardiac neural crest cell differentiation through SOX5-mediated self-activation
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113726
PMID:41210995
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CHD7通过SOX5介导的自我激活机制调控心脏神经嵴细胞分化的新机制 | 首次发现CHD7通过与SOX5在上游增强子相互作用实现自我激活,并证明SOX5过表达可恢复CHD7表达和挽救心肌细胞分化 | 研究主要基于体外细胞培养模型,需要进一步体内验证 | 阐明CHARGE综合征相关先天性心脏缺陷的分子机制 | 心脏神经嵴细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2619 | 2025-11-14 |
From plasma proteomics Mendelian randomization to neuropathological validation: The potential role of CTSH-GRN-TMEM106B and TREM2-IL-34 networks of microglia in Alzheimer's disease
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178297
PMID:41138838
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研究论文 | 本研究通过双向孟德尔随机化框架结合神经病理学验证,揭示了外周生物标志物与阿尔茨海默病之间的因果关系及小胶质细胞相关网络的作用机制 | 首次采用双向孟德尔随机化方法系统分析血浆、脑脊液和脑组织蛋白质与AD的因果关系,并结合单细胞转录组数据和神经病理学验证构建了小胶质细胞相关网络 | 研究主要基于遗传工具变量和相关性分析,无法完全排除潜在混杂因素的影响,且样本来源主要为死后脑组织 | 阐明外周生物标志物与中枢系统在阿尔茨海默病发生发展中的相互作用机制 | 血浆蛋白质(734种)、脑脊液蛋白质(151种)、脑组织蛋白质(1296种)及AD患者死后脑组织标本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 蛋白质相互作用分析 | 双向孟德尔随机化框架 | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 神经病理学图像数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及734种血浆蛋白、151种脑脊液蛋白、1296种脑蛋白及AD死后脑组织标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2620 | 2025-11-14 |
Paraptosis landscape reveals distinct prognoses and immune microenvironments in osteosarcoma: Experimental validation of key regulator TNK2
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178304
PMID:41167410
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法描绘了骨肉瘤中副凋亡相关基因的景观及其与预后和免疫微环境的关联 | 首次系统描绘骨肉瘤中副凋亡相关基因景观,发现TNK2在副凋亡调控中的关键作用 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索骨肉瘤中副凋亡相关基因的预后价值和免疫微环境特征 | 骨肉瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归, 共识聚类, 通路富集分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | TARGET和GSE21257队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |