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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2601 | 2025-10-06 |
Dual Roles of SIRT7 Inhibition by Oroxylin A Reprogram HSCs Fate: PRMT5 Succinylation-Driven Senescence and Ecto-Calreticulin-Dependent NK Cell Immune Clearance in Liver Fibrosis
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0808
PMID:40777599
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研究论文 | 本研究揭示了木蝴蝶素A通过抑制SIRT7的双重作用调控肝星状细胞命运的新机制 | 首次发现SIRT7抑制可通过PRMT5琥珀酰化依赖性降解诱导细胞衰老,同时通过外露钙网蛋白促进NK细胞免疫清除的双重调控机制 | 酶活性缺失突变体SIRT7(H187Y)仍能抑制ecto-CRT表达,表明该过程不依赖其去琥珀酰酶活性,具体机制仍需进一步研究 | 探究木蝴蝶素A在肝纤维化中通过调控SIRT7抑制肝星状细胞活化的分子机制 | 肝星状细胞(HSCs)、自然杀伤细胞(NK cells) | 分子生物学 | 肝纤维化 | 单细胞转录组测序、生物信息学分析、Western blotting、免疫荧光、免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 人类样本、动物模型和原代培养细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2602 | 2025-10-06 |
PCLDA: An interpretable cell annotation tool for single-cell RNA-sequencing data based on simple statistical methods
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.07.019
PMID:40778314
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研究论文 | 提出了一种基于简单统计方法的可解释单细胞RNA测序数据细胞注释工具PCLDA | 在保持原始假设、计算效率和可解释性的同时,通过两个新颖的增强模块显著提升了性能和鲁棒性 | NA | 开发准确、一致且可解释的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, LDA | 基因表达数据 | 22个公共scRNA-seq数据集和35个不同的评估场景 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2603 | 2025-10-06 |
Thrombopoietin mimetic reduces mouse lung inflammation and fibrosis after radiation by attenuating activated endothelial phenotypes
2024-Nov-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181330
PMID:39513364
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研究论文 | 本研究探讨了血小板生成素模拟物通过抑制内皮细胞活化减轻辐射诱导的小鼠肺损伤 | 首次发现血小板生成素模拟物能通过调节毛细血管内皮细胞表型减轻辐射诱导的肺损伤 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体验证 | 评估血小板生成素模拟物对辐射诱导肺损伤的保护作用及机制 | 小鼠肺组织和原代肺微血管内皮细胞 | 病理生理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序,组织学分析 | NA | 基因表达数据,组织学图像 | 小鼠实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2604 | 2025-10-06 |
[Identification of prognostic genes in prostate cancer by single-cell sequencing combined with Mendelian randomization]
2024-Nov, Zhonghua nan ke xue = National journal of andrology
PMID:40783865
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研究论文 | 通过单细胞测序结合孟德尔随机化方法识别前列腺癌预后相关基因 | 首次将单细胞测序与孟德尔随机化方法相结合识别前列腺癌预后基因 | 样本量较小(仅4例前列腺癌单细胞数据),需要更大样本验证 | 识别前列腺癌发展和预后的关键基因 | 前列腺癌患者组织样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 孟德尔随机化, 差异表达分析, 富集分析 | 单变量COX回归 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | 4例前列腺癌单细胞数据 + TCGA和GEO数据库前列腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2605 | 2025-10-06 |
Single Cell Profiling in the Sox10 Dom/+ Hirschsprung Mouse Implicates Hoxa6 in Enteric Neuron Lineage Allocation
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.18.613729
PMID:39345473
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析Sox10 Dom/+小鼠模型,揭示了Hoxa6在肠神经系统神经元谱系分配中的作用 | 首次报道Hox基因参与肠神经元谱系多样化,发现Sox10 Dom/+突变导致新的祖细胞簇和神经元轨迹改变 | 研究仅限于小鼠模型,人类肠神经系统的直接适用性需要进一步验证 | 探究Sox10缺陷如何改变肠神经元亚型比例及其分子机制 | Sox10 +/+和Sox10 Dom/+同窝小鼠的肠神经系统祖细胞、发育中神经元和肠胶质细胞 | 单细胞生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 杂交链式反应(HCR) | NA | 单细胞转录组数据 | Sox10 +/+和Sox10 Dom/+同窝小鼠的肠神经系统细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2606 | 2025-10-06 |
Cellular dynamics in pig-to-human kidney xenotransplantation
2024-Aug-09, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.05.003
PMID:38776915
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和纵向RNA测序分析猪到人肾脏异种移植中的细胞动态变化和免疫反应 | 首次在猪到人肾脏异种移植中应用纵向单细胞转录组分析,揭示了时间分辨的细胞动态变化和免疫反应 | 仅分析了两例异种移植案例,样本量有限 | 研究异种移植过程中移植肾脏与受体之间的相互作用和免疫反应 | 猪肾脏异种移植受体和移植肾脏组织 | 单细胞生物学 | 器官移植 | 单细胞RNA测序, 纵向RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据 | 2例猪到人肾脏异种移植案例 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
2607 | 2025-10-06 |
B cells expressing mutated IGHV1-69-encoded antigen receptors related to virus neutralization show lymphoma-like transcriptomes in patients with chronic HCV infection
2024-08-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000503
PMID:39082968
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研究论文 | 本研究通过分析慢性HCV感染患者的B细胞受体库和单细胞转录组,揭示了表达病毒中和性抗原受体的B细胞具有淋巴瘤样转录组特征 | 首次发现表达IGHV1-69编码的HCV中和性抗原受体的B细胞在慢性HCV感染患者中表现出持续的致癌转录组特征,即使病毒清除后仍长期存在 | 研究样本量有限,体外信号传导实验可能无法完全反映体内复杂环境 | 探究慢性HCV感染与B细胞异常增殖及淋巴瘤风险增加的机制关联 | 慢性HCV感染患者和经直接抗病毒治疗获得持续病毒学应答的患者 | 免疫学 | 丙型肝炎病毒感染 | B细胞受体测序,单细胞RNA测序,体外信号传导实验 | TKO模型 | 基因组测序数据,转录组数据 | 慢性HCV感染患者和HCV SVR患者的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2608 | 2025-10-06 |
Pan-cancer analysis of acetylcholinesterase (AChE) expression by a data-driven approach: future directions of AChE in cancer neuroscience
2025-Oct-08, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2025.111647
PMID:40651751
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研究论文 | 通过数据驱动方法对乙酰胆碱酯酶(AChE)进行泛癌分析,揭示其在癌症神经科学中的潜在作用 | 首次从泛癌角度系统分析AChE表达特征,并利用单细胞RNA测序数据预测其在胶质母细胞瘤进展中的功能 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索AChE表达与癌症发展和预后的相关性 | 多种癌症类型及其配对正常组织 | 生物信息学 | 泛癌分析(包括胰腺癌、胶质母细胞瘤、黑色素瘤等) | 生物信息学分析,单细胞RNA测序 | 生存分析模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GTEx数据库的泛癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
2609 | 2025-10-06 |
The m5C reader Alyref regulates cardiac remodeling post-myocardial infarction by modulating extracellular matrix protein synthesis in cardiac fibroblasts
2025-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2025.120011
PMID:40562236
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研究论文 | 本研究揭示了m5C阅读器Alyref通过调控心脏成纤维细胞外基质蛋白合成影响心肌梗死后心脏重塑的机制 | 首次发现m5C阅读器Alyref在心肌梗死后心脏重塑中的关键作用,并阐明其通过Fbln1/Loxl1通路调控细胞外基质蛋白合成的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和原代细胞实验,尚未在人类临床样本中验证 | 探究m5C修饰在心肌梗死后心脏重塑中的作用机制 | 心肌梗死小鼠模型和缺氧诱导的原代新生小鼠心脏成纤维细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 生物信息学分析、免疫荧光、组织病理学、Western blot、腺相关病毒感染、RNA免疫沉淀测序、单细胞测序 | NA | 测序数据、图像数据、蛋白质印迹数据 | 小鼠心肌梗死模型和原代心脏成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序,RNA免疫沉淀测序 | NA | NA |
2610 | 2025-10-06 |
Current insight into HIV-1 persistence from single-cell transcriptome profiling in acutely treated cohorts of infection
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000962
PMID:40638066
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学技术研究急性HIV-1感染患者中病毒储存库细胞特征的最新进展 | 应用单细胞RNA测序技术揭示HIV-1感染急性期治疗队列中病毒储存库细胞的异质性和分子标记 | NA | 探讨单细胞转录组学在解析HIV-1病毒持久性机制中的应用 | HIV感染者的免疫细胞 | 生物信息学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数十万个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2611 | 2025-10-06 |
CYBB as a potential therapeutic target through influencing ferroptosis and macrophage in ovarian cancer
2025-Aug-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02891-8
PMID:40782134
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和体外实验验证了CYBB基因在卵巢癌中通过调控铁死亡和巨噬细胞极化影响肿瘤进展的关键作用 | 首次揭示CYBB基因在卵巢癌中铁死亡与肿瘤相关巨噬细胞之间的调控关系,并证明其通过影响巨噬细胞极化参与肿瘤微环境调控 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索铁死亡与肿瘤相关巨噬细胞在卵巢癌进展中的相互作用机制,寻找潜在治疗靶点 | 卵巢癌相关基因、铁死亡相关基因、巨噬细胞 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、体外细胞实验、共培养模型 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 4410个免疫相关卵巢基因和483个铁死亡相关基因 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
2612 | 2025-10-06 |
Single cell approaches define the murine leptomeninges:cortical brain interface as a distinct cellular neighborhood comprised of neural and nonneural cell types
2025-Aug-08, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0046-25.2025
PMID:40780964
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了小鼠大脑皮层与软脑膜界面由神经和非神经细胞类型组成的独特细胞微环境 | 首次系统性地定义了大脑界面屏障的细胞组成,发现了转录特征独特的PDGFRα阳性软脑膜细胞、边界星形胶质细胞和组织驻留巨噬细胞三种主要细胞类型 | 研究仅限于成年小鼠皮层界面,发育过程中的动态变化和人类中的适用性尚未验证 | 阐明大脑表面与脑膜界面屏障的细胞组成和相互作用机制 | 成年小鼠大脑皮层与软脑膜界面细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学, 形态谱系追踪, 免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
2613 | 2025-10-06 |
Durable B-Cell Impairment While Sparing IgA B Cells After Ocrelizumab Therapy in Multiple Sclerosis
2025-Aug-08, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70135
PMID:40781066
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研究论文 | 本研究评估了奥瑞珠单抗治疗多发性硬化症患者前后B细胞谱系的变化 | 首次使用光谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析奥瑞珠单抗治疗期间和停药后的B细胞动态变化,发现治疗部分保留IgA记忆B细胞 | 样本量较小,特别是停药后分析仅包含3名患者 | 探索奥瑞珠单抗的作用机制和多发性硬化症的疾病病理生理学 | 早期、未接受过治疗的多发性硬化症患者和健康志愿者 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 光谱流式细胞术, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 细胞表型数据, 基因表达数据 | 18名多发性硬化症患者和10名健康志愿者,停药后分析3名患者 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
2614 | 2025-10-06 |
LSGI: interpretable spatial gradient analysis for spatial transcriptomics data
2025-Aug-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03716-1
PMID:40781324
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研究论文 | 提出用于空间转录组数据的可解释空间梯度分析计算框架LSGI | 开发了首个系统识别空间转录组梯度(STG)的计算框架,能够识别具有显著梯度模式的肿瘤通路 | NA | 分析空间转录组数据中的梯度模式,揭示肿瘤空间异质性 | 肿瘤空间转录组数据集 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组测序 | LSGI计算框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2615 | 2025-10-06 |
Combining single-cell and bulk RNA sequencing to identify CAF-related signature for prognostic prediction and treatment response in patients with melanoma
2025-Aug-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-14979-w
PMID:40781483
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研究论文 | 本研究结合单细胞和bulk RNA测序数据,构建了黑色素瘤中癌症相关成纤维细胞(CAF)相关特征用于预后预测和治疗反应评估 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据构建CAF相关特征,能够预测黑色素瘤患者对化疗和免疫治疗的疗效 | 研究样本量有限,需要在更大规模队列中进一步验证 | 构建CAF相关特征用于黑色素瘤患者的预后预测和治疗反应评估 | 黑色素瘤患者 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, LASSO回归, 免疫组化, 免疫荧光, qPCR | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | TCGA数据集和GSE65904验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
2616 | 2025-10-06 |
Targeting immune microenvironment in cervical cancer: current research and advances
2025-Aug-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06896-3
PMID:40781691
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综述 | 本文全面探讨宫颈癌免疫微环境的组成特征、研究进展及免疫治疗策略 | 整合高分辨率空间图谱和单细胞测序技术揭示肿瘤免疫微环境异质性,系统评估不同疾病阶段和治疗方法的差异 | NA | 通过靶向肿瘤免疫微环境改善宫颈癌患者治疗效果 | 宫颈癌肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 空间图谱技术, 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
2617 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome profiling reveals blast cell heterogeneity and identifies novel therapeutic target IKZF2 in t(8;21) acute myeloid leukaemia
2025-Aug-08, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.70077
PMID:40781784
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示t(8;21)急性髓系白血病中白血病细胞的异质性,并识别IKZF2作为潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平揭示t(8;21)AML的肿瘤内异质性,发现造血干细胞样亚群,并鉴定IKZF2为该亚群的关键调控因子 | NA | 研究t(8;21)急性髓系白血病的细胞异质性和复发机制 | t(8;21)急性髓系白血病患者样本和小鼠模型 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2618 | 2025-10-06 |
Hybrid identity and distinct methylation profiles of incomplete intestinal metaplasia in the stomach
2025-Aug-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335793
PMID:40691053
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和表观遗传学分析揭示了胃不完全肠上皮化生的分子特征及其与胃癌的关系 | 首次发现不完全肠上皮化生具有胃、小肠和大肠的混合转录组特征,并证明其是胃癌的真正前驱病变 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 阐明不完全肠上皮化生的分子特征、分化潜能和致癌相关性 | 胃肠上皮化生和胃癌组织 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析, 染色质可及性分析 | 类器官模型 | 转录组数据, 表观遗传数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 定制谱系富集panel |
2619 | 2025-10-06 |
Unlocking the secret of glioblastoma multiforme: the role of lactylation in tumor progression, drug resistance and immune microenvironment
2025-Aug-07, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03933-5
PMID:40770332
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研究论文 | 本研究探讨乳酸化修饰在胶质母细胞瘤恶性进展、替莫唑胺耐药和免疫微环境中的作用 | 首次系统研究乳酸化相关基因在GBM中的作用,建立基于TMZ耐药乳酸化相关基因的风险预测模型 | 研究主要基于公共数据库的单细胞数据,需要更多临床样本验证 | 阐明乳酸化修饰在胶质母细胞瘤发生发展中的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞及患者数据 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | scRNA-seq, 差异基因表达分析, 体内外实验验证 | 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库中的GBM单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2620 | 2025-10-06 |
Empagliflozin targeted the immune-related gene PIK3CA in type 2 diabetes mellitus treatment: network pharmacology analysis and experimental evidence
2025-Aug-07, Diabetology & metabolic syndrome
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13098-025-01895-2
PMID:40770763
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研究论文 | 本研究通过网络药理学分析和实验验证探讨恩格列净在2型糖尿病治疗中通过靶向免疫相关基因PIK3CA发挥作用的机制 | 首次发现恩格列净可直接靶向PIK3CA基因并调节PI3K/AKT信号通路,揭示了其在2型糖尿病中的免疫调节新机制 | 研究主要基于细胞实验,缺乏动物模型和临床样本的进一步验证 | 探究恩格列净在2型糖尿病治疗中的免疫相关作用机制 | 2型糖尿病患者基因数据和高糖诱导的RAW264.7巨噬细胞 | 生物信息学与分子生物学 | 2型糖尿病 | 网络药理学分析、分子对接、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blotting | NA | 基因表达谱、单细胞RNA测序数据、实验数据 | 109个免疫相关差异表达基因,RAW264.7巨噬细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |