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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2601 | 2026-06-10 |
PM10 Impairs CD56dim NK Cell Cytotoxicity via FNBP1 Suppression to Exacerbate Rheumatoid Arthritis: Insights from Multimodal Multi-Omics
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514260
PMID:41717845
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研究论文 | 本研究整合流行病学、生物信息学、单细胞转录组学和动物模型,探究空气污染物PM10通过抑制FNBP1损害CD56dim NK细胞毒性进而加剧类风湿性关节炎的机制 | 首次揭示“PM-FNBP1-NK细胞”轴这一全新的类风湿性关节炎发病机制假说 | 未具体说明研究的局限性 | 阐明空气污染物PM10对类风湿性关节炎的分子和免疫学影响 | 类风湿性关节炎患者、胶原诱导关节炎小鼠模型及人源细胞 | 机器学习 | 类风湿性关节炎 | 单细胞测序 | 机器学习 | 单细胞转录组数据、流行病学数据 | 全球超过95%国家的流行病学数据及类风湿性关节炎患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2602 | 2026-06-10 |
Trichosanthes kirilowii extract alleviated liver fibrosis and acute myocardial infarction by inhibiting VCAN to restrain monocyte senescence: Insights from bioinformatic analyses and experimental validation
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157941
PMID:41720002
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证,揭示栝楼提取物通过抑制VCAN延缓单核细胞衰老,从而缓解肝纤维化和急性心肌梗死 | 首次发现VCAN是肝纤维化和急性心肌梗死的共享关键基因,并揭示栝楼提取物通过抑制VCAN介导的单核细胞衰老发挥双器官保护作用 | 未明确说明研究的局限性 | 探究栝楼提取物对肝纤维化和急性心肌梗死的共同保护机制 | 肝纤维化和急性心肌梗死的共享关键基因及单核细胞衰老 | 生物信息学 | 肝纤维化, 急性心肌梗死 | 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型:CCl₄诱导的肝纤维化和左前降支冠状动脉结扎诱导的急性心肌梗死模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2603 | 2026-06-10 |
Single-cell transcriptomics reveals the toxic mechanism and therapeutic target of ubiquitously distributed mycotoxin deoxynivalenol
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157927
PMID:41720013
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示呕吐毒素(DON)对睾丸的毒性机制及潜在治疗靶点 | 首次构建了DON诱导睾丸损伤的单细胞图谱,并鉴定KDM5A为霉菌毒素损害精子发生过程中调控网络的关键组分 | 未提及本研究的局限性 | 阐明呕吐毒素(DON)诱导睾丸毒性的细胞和分子机制,并寻找潜在治疗靶点 | 性成熟大鼠的睾丸细胞 | 单细胞转录组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、核铺展免疫染色、Western blot、抑制剂补充 | NA | 单细胞基因表达数据 | 70,000个大鼠睾丸细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2604 | 2026-06-10 |
From laboratory bench to surgical room: Molecular profiling and single-cell technologies in precision surgery for colorectal cancer patients
2026-Apr, Surgical oncology
DOI:10.1016/j.suronc.2026.102382
PMID:41722207
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综述 | 本文综述了分子谱分析和单细胞技术在结直肠癌精准手术中的进展,探讨了如何整合这些技术到围手术期策略中以支持肿瘤学精准手术概念 | 将分子谱分析与单细胞技术综合应用于结直肠癌精准围手术期管理,强调手术切除作为转化肿瘤学最终整合步骤的新视角 | 未明确提及局限性,但作为综述可能缺乏原始实验验证,且技术整合的临床实施细节有待进一步探讨 | 总结结直肠癌生物学最新进展,阐述类器官和单细胞技术的转化机遇,并讨论其整合入围手术期策略以推动精准手术 | 结直肠癌肿瘤细胞、肿瘤微环境中的基质与免疫细胞、循环肿瘤DNA、类器官模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | NGS, 单细胞测序, 空间多组学, 液体活检, 类器官培养 | NA | 基因组数据、转录组数据、空间转录组数据、类器官功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2605 | 2026-06-10 |
Sex specific genomic insights into type 1 diabetes through GWAS and single cell transcriptome analysis
2026-Apr, Diabetes research and clinical practice
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.diabres.2026.113181
PMID:41724362
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研究论文 | 通过性别分层全基因组关联研究(GWAS)和单细胞转录组分析,揭示了1型糖尿病的性别特异性遗传结构,并优化了风险预测 | 首次在1型糖尿病中系统进行性别分层GWAS,整合scRNA-seq数据发现性别特异性基因表达模式,并验证性别特异性多基因风险分数(PRS)在独立队列中优于传统PRS的预测性能 | 样品量有限(9对男女儿童PBMC样本),PRS验证队列规模较小(471例病例,2300例对照),欧洲血统人群限制泛化性 | 探究1型糖尿病的性别特异性遗传机制并改善风险预测 | 1型糖尿病患者(6599例)及对照(12350例)的遗传数据,9对男女儿童的PBMC单细胞转录组数据,独立验证队列(471例病例,2300例对照) | 机器学习和单细胞转录组学 | 1型糖尿病 | GWAS, scRNA-seq | NA | 遗传变异数据, 单细胞转录组数据 | GWAS:6599例病例(3483男,3109女)和12350例对照(6665男,5658女);scRNA-seq:9对男女儿童患者;验证队列:471例病例和2300例对照 | NA | scRNA-seq | NA | NA |
| 2606 | 2026-06-10 |
PPAR-γ suppresses macrophage senescence and allergic airway inflammation through controlling lipid metabolic pathways
2026-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106226
PMID:41864062
|
研究论文 | 本研究探讨PPAR-γ通过调控脂质代谢途径抑制巨噬细胞衰老和过敏性气道炎症的机制 | 首次发现PPAR-γ通过调控脂质代谢途径抑制巨噬细胞衰老,并利用巨噬细胞靶向递送罗格列酮减轻过敏性气道炎症 | 未明确PPAR-γ调控巨噬细胞衰老的具体分子机制及其在人类哮喘中的直接验证 | 探究PPAR-γ在过敏性气道炎症中通过调控巨噬细胞衰老的作用及其机制 | 过敏性哮喘小鼠模型、巨噬细胞谱系特异性PPAR-γ条件敲除小鼠 | 机器学习和免疫学 | 过敏性哮喘 | 单细胞RNA测序、条件基因敲除、脂质代谢通路分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型,具体样本数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3 |
| 2607 | 2026-06-10 |
Intracellular bacteria modulate the immune microenvironment of oral squamous cell carcinoma
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117019
PMID:41722049
|
研究论文 | 利用INVADEseq技术揭示细胞内细菌如何调节口腔鳞状细胞癌的免疫微环境,影响新辅助免疫检查点阻断疗法的效果 | 首次应用INVADEseq技术同时捕获宿主单细胞RNA测序数据和细菌特征,揭示细胞内细菌通过多种机制影响免疫检查点阻断疗法的疗效 | 未明确说明局限性,但研究中提及细胞内细菌可能降低治疗效果的机制仍需进一步验证 | 探索细胞内细菌在口腔鳞状细胞癌微环境中调节免疫功能的机制,特别是对新辅助免疫检查点阻断疗法的影响 | 口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | INVADEseq、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、细菌特征数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | INVADEseq技术基于10x Chromium平台进行单细胞RNA测序及细菌特征捕获 |
| 2608 | 2026-06-10 |
Single-cell profiling of the subgingival bacteria reveals transcriptional heterogeneity and niche-specific programs
2026-Mar-11, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.01.017
PMID:41720093
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序框架分析龈下细菌异质性和生态位特异性程序,揭示牙周炎发病机制 | 首次在单细胞分辨率下分析龈下细菌的转录异质性,构建了包含285个物种、133,458个细胞的图谱,并鉴定出与疾病相关的功能亚群 | 未提及方法局限性,但可能存在低微生物量和宿主污染的技术挑战 | 探索健康与牙周炎状态下龈下细菌的功能异质性和生态位特异性程序 | 龈下细菌群落 | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16个龈下样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2609 | 2026-06-10 |
Nuclear condensates of BZU2/ZmMUTE modulate transcription to realize structural heterogeneity of the maize stomatal complex
2026-Mar-03, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag040
PMID:41718014
|
研究论文 | 本文揭示了玉米BZU2/ZmMUTE核凝聚体通过液-液相分离调控气孔复合体细胞异质性的机制 | 首次发现转录因子ZmMUTE通过液-液相分离形成核凝聚体,调控玉米四细胞气孔复合体的功能与空间异质性,并揭示其内在无序区IDR4在DNA结合、靶基因激活及细胞间移动中的多重作用 | 未明确说明具体局限性 | 探究转录因子ZmMUTE在玉米气孔发育中如何通过动态活性实现细胞命运决定的结构异质性 | 玉米四细胞气孔复合体及其发育过程中的细胞类型异质性 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 玉米样本的基因型和单细胞RNA-seq分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于细胞类型特异性转录程序分析 |
| 2610 | 2026-06-10 |
Aging-associated differences in mammary tumor-initiating populations and immune evasion pathways in breast cancer
2026-Feb-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2523254123
PMID:41719331
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研究论文 | 利用大鼠乳腺肿瘤模型整合多组学分析,揭示衰老如何影响乳腺癌起始细胞群体和免疫逃逸通路 | 首次在体内模型中揭示衰老通过染色体不稳定驱动抗原呈递缺陷促进免疫逃逸的分子机制,并发现人类乳腺癌中同源染色体区域缺失与预后相关性 | 主要基于大鼠模型,人类数据为关联分析,未进行功能验证实验 | 解析衰老对乳腺癌发生发展、分子表型和免疫逃逸的影响机制 | N-甲基-N-亚硝基脲诱导的大鼠乳腺肿瘤模型及对应的人类乳腺癌数据 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | bulk和单细胞转录组测序、全外显子测序、组织病理分析 | NA | 转录组数据、外显子测序数据、组织病理图像 | 大鼠模型(具体样本量未提供),人类乳腺癌数据(具体数量未提供) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, whole-exome sequencing | NA | NA |
| 2611 | 2026-06-10 |
Tumor cell villages define the co-dependency of tumor and microenvironment in liver cancer
2026-Feb-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69797-z
PMID:41723121
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研究论文 | 通过空间单细胞成像和单细胞RNA测序分析肝癌中肿瘤细胞与微环境的共依赖性关系 | 提出深度学习策略将肿瘤细胞状态与其周围环境架构进行空间映射,并发现不同的肿瘤细胞状态可形成独特的“村庄”结构,每个村庄由特定的微环境支持 | 未提及具体局限性 | 理解肿瘤如何建立其独特的空间景观以及驱动肿瘤适应性的因素 | 来自50个肿瘤标本的超过200万个细胞,以及740名肝癌患者的单细胞、空间和批量转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间单细胞成像、单细胞RNA测序 | 深度学习 | 图像、转录组数据 | 50个肿瘤标本、740名肝癌患者 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2612 | 2026-06-10 |
Utilizing bulk and single-cell RNA sequencing to identify potential biomarkers linked to angiogenesis and integrated stress response in chondrosarcoma
2026-Feb-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-40800-3
PMID:41723200
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研究论文 | 利用批量与单细胞RNA测序识别与软骨肉瘤血管生成和整合应激反应相关的潜在生物标志物 | 首次通过综合批量与单细胞RNA测序分析,确定HSPA8、LMNA和SERPINH1作为软骨肉瘤中与血管生成和整合应激反应相关的潜在生物标志物,并揭示其调控网络及细胞互作机制 | 样本量有限且主要依赖公开数据库,部分分析结果尚未在独立队列中验证,分子机制验证仍停留在表达水平 | 鉴定软骨肉瘤中与血管生成和整合应激反应相关的潜在生物标志物,并阐明其分子机制 | 软骨肉瘤患者样本 | 机器学习 | 软骨肉瘤 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来源于GEO数据库的多个数据集(GSE30835、GSE22855、GSE184118) | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2613 | 2026-06-10 |
Milk fat globule-EGF factor 8 enhances the proliferation and migration of thyroid carcinoma cells through epithelial-mesenchymal transition and PI3K/AKT signaling pathway
2026-Feb-21, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-026-04242-5
PMID:41723511
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研究论文 | 发现MFG-E8通过EMT和PI3K/AKT信号通路促进甲状腺癌细胞增殖和迁移 | 首次揭示MFG-E8在甲状腺癌中的表达和功能,特别是其与侵袭性亚型的关系及潜在临床应用价值 | 未提及具体局限性,需进一步验证临床转化价值 | 研究MFG-E8在甲状腺癌中的表达、功能及作用机制 | 甲状腺癌细胞系及乳头状甲状腺癌组织样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组测序、质谱分析、免疫组化、Western blotting、RT-PCR | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像 | 包含甲状腺癌组织和细胞系样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 未提供具体平台配置细节 |
| 2614 | 2026-06-10 |
Multi-species integration, alignment and annotation of single-cell RNA-seq data with CAMEX
2026-Feb-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69696-3
PMID:41723123
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research paper | 介绍CAMEX,一种利用异构图神经网络进行多物种单细胞RNA-seq数据整合、比对和注释的工具 | 利用多对多同源关系进行跨物种整合,并在多种跨物种基准数据集上表现优于现有方法 | 未在标题和摘要中明确提及,可能包括对极远缘物种的适用性验证不足 | 解决跨物种单细胞RNA-seq数据整合和注释的挑战,揭示细胞起源与进化机制 | 来自一个到十一个物种的单细胞RNA-seq数据 | machine learning | NA | scRNA-seq | 异构图神经网络 (GNN) | 单细胞RNA-seq数据 | 多个跨物种基准数据集,物种数量从1到11种 | NA | scRNA-seq | NA | NA |
| 2615 | 2026-06-10 |
Spatial multiomics reveals irreversible electroporation-induced immuno-metabolic characteristics of the inflammatory margin in liver cancer
2026-Feb-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09742-4
PMID:41714782
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研究论文 | 结合空间转录组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序和CyTOF技术,揭示不可逆电穿孔(IRE)诱导的肝癌炎症边缘中的免疫代谢特征 | 首次通过多组学方法精确定位IRE诱导的炎症边缘,并发现Ly6CPD-L1+脂质相关巨噬细胞(LAMs)的显著浸润及其免疫抑制表型与脂质代谢重编程的关联 | 研究仅在雄性C57BL/6小鼠原位肝癌模型中进行,尚未在人类样本中验证 | 阐明IRE消融后肝癌炎症边缘的免疫和代谢变化,为联合治疗提供潜在代谢靶点 | 雄性C57BL/6小鼠的原位肝癌模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, CyTOF | NA | 空间转录组数据, 空间代谢组数据, 单细胞RNA测序数据, CyTOF数据 | 未指定具体样本数量 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 单细胞RNA测序, CyTOF | NA | NA |
| 2616 | 2026-06-10 |
Single-cell transcriptomic analysis and machine learning identify ATAD3A as a key gene that stabilizes mitochondrial-endoplasmic reticulum membranes, promoting bladder cancer progression
2026-Feb-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07857-0
PMID:41715136
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析和机器学习识别ATAD3A作为稳定线粒体内质网膜的关键基因,促进膀胱癌进展 | 首次将线粒体相关内质网膜(MAM)与膀胱癌化疗耐药联系起来,通过机器学习和多组学分析鉴定ATAD3A为预测耐药的关键基因 | 未提及具体局限性 | 探究线粒体内质网膜在膀胱癌进展和化疗耐药中的作用机制 | 膀胱癌患者样本、细胞模型和动物模型 | 机器学习 | 膀胱癌 | RNA测序、单细胞转录组分析、空间转录组学 | 随机森林模型、LASSO-Cox回归 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2617 | 2026-06-10 |
Intratumoral Parvimonas micra promotes esophageal squamous cell carcinoma via p-cresol-induced Treg differentiation
2026-Feb-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady1644
PMID:41719397
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研究论文 | 本研究通过宏基因组测序和单细胞RNA测序,发现肿瘤内微小单胞菌通过分泌p-甲酚诱导调节性T细胞分化,从而促进食管鳞状细胞癌的进展 | 首次揭示了肿瘤内微生物(微小单胞菌)与食管鳞状细胞癌免疫微环境之间的直接机制联系,阐明了其通过代谢物p-甲酚诱导Treg分化的具体途径 | 未提及研究的具体局限性 | 探究肿瘤内微生物群在食管鳞状细胞癌发生与发展中的组成和功能影响 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤与配对正常组织,以及调节性T细胞 | 机器学习 | 食管癌 | 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 119对肿瘤-正常组织样本,45个单细胞RNA测序样本 | Illumina | 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 2618 | 2026-06-10 |
Calibrating tissue level PDE models of ligand dynamics using single cell and spatial transcriptomics data
2026-Feb-19, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00657-8
PMID:41714655
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据校准组织水平的配体动力学偏微分方程模型 | 提出了一个计算流程,将有限体积求解器、生物信息学预处理、近似贝叶斯计算和基于梯度的优化相结合,利用单细胞和空间转录组数据校准组织尺度上的反应扩散模型参数 | 该方法依赖于高质量的空间转录组和单细胞数据,公开数据集的可用性和质量可能限制其广泛应用;此外,校准过程计算成本较高 | 开发一种灵活且严谨的方法,利用现代转录组学数据校准组织层次的机械模型参数 | 转化生长因子β的亚型,这是组织修复和纤维化的关键调节因子 | 机器学习, 数字病理学 | 纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 反应扩散偏微分方程, 近似贝叶斯计算, 梯度优化 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 两个公开的人类皮肤数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2619 | 2026-06-10 |
Poly-l-lactic acid electrospun membrane with specific morphology promotes bone regeneration through macrophage reprogramming
2026-Feb-19, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04182-y
PMID:41715106
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研究论文 | 通过巨噬细胞重编程促进骨再生的特定形态聚左旋乳酸电纺膜研究 | 首次揭示不同形貌(取向与随机)和尺寸(纳米与微米)的聚左旋乳酸电纺膜通过调控巨噬细胞亚型转化促进骨再生的分子机制,特别是发现取向600nm组具有最佳骨修复效果 | 仅在大鼠颅骨缺损模型中验证,缺乏临床人体样本研究;单细胞RNA测序分析主要聚焦免疫微环境,其他细胞类型的作用未充分探讨 | 探究聚左旋乳酸电纺膜的物理形貌对骨免疫微环境的影响及其促进骨再生的分子机制 | 大鼠颅骨缺损模型中的骨组织及巨噬细胞与骨髓间充质干细胞共培养体系 | 数字病理学, 机器学习 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 大鼠骨组织样本(各组数量未明确提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2620 | 2026-06-10 |
In situ electrospinning at the operating table to immobilise mesenchymal stem cells on the bony wall for the regeneration of osteoporotic bone defects
2026-Feb-19, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04165-z
PMID:41715169
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研究论文 | 利用手持静电纺丝装置在手术中将间充质干细胞直接固定于骨缺损部位,促进骨质疏松性骨缺损再生 | 提出一种新型干细胞递送策略,通过手持静电纺丝装置在体内骨缺损部位原位固定间充质干细胞,解决了现有方法依赖支架等载体、细胞难以直接粘附于复杂骨壁表面的问题 | 未提及具体限制,可能与样本量较小或动物模型局限性有关 | 开发一种改进的间充质干细胞递送策略,以增强骨质疏松性骨缺损的骨修复 | 骨质疏松大鼠的颅骨缺损模型及间充质干细胞 | 机器学学 | 骨质疏松性骨缺损 | 单细胞测序、组织mRNA测序、流式细胞术 | NA | 测序数据 | 骨质疏松大鼠(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |