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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2601 | 2025-10-06 |
New insights into interstitial cystitis/bladder pain syndrome at single-cell resolution
2025-Aug, BJUI compass
IF:1.6Q3
DOI:10.1002/bco2.70051
PMID:40765664
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综述 | 通过单细胞RNA测序技术对间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征的细胞异质性进行系统性综述 | 首次在单细胞分辨率水平系统揭示IC/BPS中膀胱细胞亚型的改变特征,发现TLR3-NR2F6信号通路异常、特定成纤维细胞亚型及HPV感染可能病因 | 基于已发表研究的二次分析,缺乏原始实验数据验证;物种间差异(人类与小鼠模型)尚未完全阐明 | 总结单细胞RNA测序在间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征研究中的最新发现 | 健康与IC/BPS患者的膀胱组织细胞,包括尿路上皮细胞、间质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2602 | 2025-10-06 |
CXCR4-Mediated Chemokine Signaling Orchestrates the Progression of Conjunctival Melanocytic Lesions
2025-Aug-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.11.23
PMID:40778698
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了CXCR4介导的趋化因子信号通路在结膜黑色素瘤恶性进展中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统描绘结膜黑色素病变微环境异质性,并证实CXCR4拮抗剂AMD3100通过抑制PI3K/Akt和MEK/ERK通路发挥抗肿瘤作用 | 样本量有限,需要更大规模研究验证临床转化潜力 | 阐明结膜良恶性黑色素病变的微环境差异及趋化因子信号在病变进展中的作用机制 | 结膜黑色素病变组织标本、PIG1黑色素细胞、结膜黑色素瘤细胞系(CRMM1, CRMM2, CM2005.1) | 数字病理学 | 结膜黑色素瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 蛋白质印迹法, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 组织图像数据 | 多个细胞系和未明确数量的组织标本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
2603 | 2025-10-06 |
Innate Immune Remodeling Drives Therapy Resistance via Macrophage-NK Cell Crosstalk
2025-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.22.666055
PMID:40777338
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了靶向治疗过程中肿瘤免疫微环境的动态演变,发现巨噬细胞-NK细胞相互作用是治疗耐药的关键机制 | 首次识别了治疗过程中的免疫转折点,发现独特的巨噬细胞亚群通过CCR2/5信号调控NK细胞招募,并证实Ptpn22抑制可恢复NK细胞浸润 | 主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限,需要更大规模临床研究确认 | 探究靶向治疗过程中肿瘤免疫微环境的动态变化及其对治疗耐药的影响 | 小鼠黑色素瘤模型、人类黑色素瘤和肺癌患者样本 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤, 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2604 | 2025-10-06 |
Programmable microparticles rewire CAR signaling to enable super-physiological expansion of human T cells in vitro
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.17.665438
PMID:40777491
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研究论文 | 利用可编程PLGA微粒重编程CAR信号通路,实现人类T细胞的超生理扩增 | 首次使用可编程微粒通过外部控制CAR信号通路,实现人类CAR-T细胞持续100天以上的超生理扩增 | 研究仅限于体外实验,尚未进行体内验证 | 探索如何通过外部编程最大化人类CAR-T细胞的增殖能力 | 人类CD8 CAR-T细胞 | 细胞工程 | NA | 单细胞测序,转录组分析 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
2605 | 2025-10-06 |
Disruption of E-cadherin in the airway led to dysplastic stressed cells and asthma-like phenotypes
2025-Jul-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.030
PMID:40683251
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研究论文 | 本研究通过破坏小鼠气道上皮细胞中的E-钙黏蛋白,揭示了其缺失导致细胞应激、增殖增加和哮喘样表型的机制 | 首次证明E-钙黏蛋白缺失可通过上皮细胞内在机制和上皮-免疫互导引发气道重塑,无需过敏原暴露 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究E-钙黏蛋白在气道上皮细胞命运决定和哮喘样表型形成中的作用机制 | 小鼠气道上皮祖细胞(club细胞)和终末分化纤毛细胞 | 单细胞生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量的小鼠气道组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2606 | 2025-10-06 |
Pan-cancer human brain metastases atlas at single-cell resolution
2025-Jul-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.025
PMID:40215980
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析构建泛癌种人类脑转移图谱,揭示脑转移的细胞特征和肿瘤微环境 | 首次在单细胞分辨率下构建跨癌种的脑转移综合图谱,识别出脑转移相关的恶性细胞元程序和五种不同的脑转移生态型 | 样本量相对有限,可能无法完全代表所有脑转移亚型 | 研究不同癌种脑转移的细胞状态特征和肿瘤微环境重塑 | 108例脑转移样本和111例原发肿瘤样本 | 单细胞基因组学 | 脑转移癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 219个样本(108个脑转移,111个原发肿瘤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2607 | 2025-10-06 |
Gland- and cell-level heterogeneity in the prostate: A narrative review of related diseases
2025-Jul, Current urology
IF:0.9Q4
DOI:10.1097/CU9.0000000000000269
PMID:40765528
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综述 | 本文综述了前列腺腺体和细胞水平异质性与相关疾病的关系 | 系统阐述了前列腺不同区域细胞类型分布异质性及其对疾病分布的影响,提出了club/hillock细胞的干细胞特性和免疫细胞诱导的炎症环境对疾病机制的新解释 | 当前研究尚无法精确回答前列腺异质性的具体机制问题 | 探讨前列腺腺体和细胞水平异质性及其与疾病分布的关系 | 前列腺组织、良性前列腺增生(BPH)、前列腺癌(PCa) | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序技术、分子组学研究 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
2608 | 2025-10-06 |
Mosaic loss of chromosome Y in blood is associated with male susceptibility for idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Jun-28, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-025-00966-9
PMID:40581694
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研究论文 | 本研究探讨血液中Y染色体嵌合缺失与男性特发性肺纤维化易感性之间的关联 | 首次在人类中证实Y染色体嵌合缺失通过上调促纤维化基因和增强TGF-β信号通路加剧IPF的疾病机制 | 研究主要基于观察性数据和回顾性分析,需要进一步实验验证机制 | 研究Y染色体嵌合缺失是否导致人类纤维化疾病过程 | 男性特发性肺纤维化患者 | 生物医学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、临床数据、测序数据 | UK Biobank数据库和两个队列研究中的男性参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2609 | 2025-10-06 |
Lineage-resolved analysis of embryonic gene expression evolution in C. elegans and C. briggsae
2025-Jun-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adu8249
PMID:40536976
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较秀丽隐杆线虫和布里格斯线虫胚胎发育过程中基因表达模式的进化约束 | 首次在具有保守不变胚胎谱系的模式生物中系统比较细胞类型特异性基因表达的进化分歧 | 仅研究两种线虫物种,未涵盖更广泛的进化谱系 | 探究发育过程中基因表达模式进化的约束机制 | 秀丽隐杆线虫和布里格斯线虫的胚胎发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种线虫物种的胚胎细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2610 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals new epithelial-stromal associated mesenchymal-like subsets in recurrent gliomas
2025-06-07, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02036-6
PMID:40483536
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序发现复发性胶质瘤中新的上皮-基质相关间充质样亚群 | 首次在复发性胶质母细胞瘤中发现富含EGR1和SERPINE1等EMT相关基因的新型间充质样亚群 | 样本量相对有限(52例),需要更大规模研究验证 | 探索驱动胶质瘤复发的转录和调控机制 | 52例IDH野生型胶质母细胞瘤标本(26例原发,26例复发) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单核RNA测序,空间转录组学 | 基因调控网络分析,非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 52例IDH野生型GBM标本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
2611 | 2025-10-06 |
Myeloid Fatty Acid Metabolism Activates Neighboring Hematopoietic Stem Cells to Promote Heart Failure With Preserved Ejection Fraction
2025-May-20, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了骨髓细胞脂肪酸代谢通过激活邻近造血干细胞促进射血分数保留型心力衰竭的新机制 | 首次发现骨髓细胞脂肪酸代谢通过VCAM1促进造血干细胞增殖,构成HFpEF的新干细胞特征 | 动物模型与人类疾病存在差异,机制研究仍需进一步验证 | 探究HFpEF发病机制中免疫细胞与造血干细胞的相互作用 | HFpEF患者样本和高脂饮食高血压小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 射血分数保留型心力衰竭 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,质谱分析,碳标记 | NA | 单细胞转录组数据,质谱数据,流式细胞数据 | 患者样本和动物模型(具体数量未明确说明) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
2612 | 2025-10-06 |
Identification and characterization of early human photoreceptor states and cell-state-specific retinoblastoma-related features
2025-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.28.530247
PMID:38915659
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研究论文 | 通过全长单细胞RNA测序识别早期人类光感受器状态及视网膜母细胞瘤相关特征 | 首次揭示未解决的感光细胞前体状态,发现早期锥细胞前体内在基因表达在视网膜母细胞瘤起始中的作用 | NA | 理解人类锥感光细胞与杆细胞的发育差异及其在视网膜母细胞瘤发生中的作用 | 人类锥感光细胞和杆感光细胞的发育状态 | 单细胞基因组学 | 视网膜母细胞瘤 | 全长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2613 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial genomic landscape of non-small cell lung cancer brain metastases
2025-Apr, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03530-z
PMID:40016452
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研究论文 | 通过多模态单细胞测序和空间转录组学揭示非小细胞肺癌脑转移的基因组景观 | 首次在初治NSCLC患者中整合单核RNA/T细胞受体测序、单细胞空间转录组和全基因组测序,发现染色体不稳定性是脑转移的显著特征 | 样本量相对有限,需要更大规模验证 | 探索非小细胞肺癌脑转移的生物学机制 | 非小细胞肺癌患者的脑转移灶和原发肿瘤 | 数字病理学 | 肺癌 | 单核RNA测序, T细胞受体测序, 单细胞空间转录组学, 全基因组测序, 多重免疫荧光 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 初治NSCLC患者样本(具体数量未明确)+ 4,869名独立患者验证队列 + 12,275名NSCLC患者新队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 全基因组测序 | NA | NA |
2614 | 2025-10-06 |
STANCE: a unified statistical model to detect cell-type-specific spatially variable genes in spatial transcriptomics
2025-Feb-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57117-w
PMID:39979358
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研究论文 | 提出一种统一统计模型STANCE,用于检测空间转录组学中的空间变异基因和细胞类型特异性空间变异基因 | 在线性混合效应模型框架下整合基因表达、空间位置和细胞类型组成信息,确保组织空间旋转不变性的结果 | 未在论文摘要中明确说明 | 开发能够准确检测空间变异基因和细胞类型特异性空间变异基因的统计方法 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | 线性混合效应模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2615 | 2025-10-06 |
The use of deidentified organ donor testes for research
2025-Feb-06, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70008
PMID:39912553
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综述 | 探讨使用去标识化器官捐赠者睾丸组织进行人类睾丸发育与功能研究的价值与应用 | 系统阐述利用遗体捐赠者完整睾丸组织作为研究资源的独特价值,弥补活检样本的局限性 | 未涉及具体实验数据,主要基于现有研究进行综述分析 | 推动人类睾丸发育与功能的基础科学研究 | 去标识化人类捐赠者睾丸组织 | 生殖医学 | 不育症 | 单细胞转录组分析、表观基因组分析、细胞技术开发 | 体外模型 | 分子数据、细胞学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、表观基因组学 | NA | NA |
2616 | 2025-10-06 |
Identification of therapeutic targets for Alzheimer's Disease Treatment using bioinformatics and machine learning
2025-01-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-88134-w
PMID:39890844
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研究论文 | 通过生物信息学和机器学习方法识别阿尔茨海默病的潜在治疗靶点 | 整合多种生物信息学方法和机器学习算法识别出五个与AD相关的枢纽基因,其中PLCB1具有最高诊断价值 | NA | 识别阿尔茨海默病的潜在治疗靶点 | 阿尔茨海默病相关基因 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 差异基因表达分析、加权基因共表达网络分析、Mfuzz聚类、单细胞RNA测序 | LASSO回归、SVM-RFE、随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2617 | 2025-10-06 |
GPX4 expression changes in proximal tubule cells highlight the role of ferroptosis in IgAN
2025-01-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-87228-9
PMID:39890853
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和微阵列数据分析,探讨了氧化应激在IgA肾病中的作用机制,重点关注近端肾小管细胞中铁死亡的调控 | 首次在IgA肾病中发现近端肾小管细胞中铁死亡活动的显著改变,并确定GPX4作为关键调控因子 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证 | 探究氧化应激在IgA肾病中的作用机制及细胞组织损伤保护机制 | IgA肾病患者的肾脏组织样本 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 免疫组织化学 | 基因集变异分析(GSVA), 富集分析 | 基因表达数据, 组织图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列分析 | NA | NA |
2618 | 2025-10-06 |
TRα1 mutant suppresses KLF9 to cause endometrial metaplasia with ectopic IL-33 expression leading to uterine fibrosis and infertility
2025-01-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86848-5
PMID:39890871
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了TRα1突变通过抑制KLF9导致子宫内膜化生和异位IL-33表达,进而引发子宫纤维化和不孕的分子机制 | 首次发现TRα1突变通过抑制KLF9导致子宫内膜鳞状化生,并鉴定IL-33是驱动子宫纤维化和不孕的关键因子 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 阐明甲状腺激素受体突变导致女性不孕的分子机制 | 表达突变TRα1的Thra1转基因小鼠 | 生殖医学 | 不孕症 | RNA-seq, 激光捕获显微切割, 空间转录组学 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学图像 | 未明确说明 | NA | 空间转录组学, RNA测序 | NA | NA |
2619 | 2025-10-06 |
A cell atlas of the human fallopian tube throughout the menstrual cycle and menopause
2025-01-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55440-2
PMID:39753552
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研究论文 | 通过单细胞RNA和ATAC测序构建了人类健康输卵管在月经周期和绝经期间的全面细胞图谱 | 首次系统揭示了输卵管在月经周期和绝经期间细胞类型频率、基因表达、转录因子活性和细胞间通讯的重大变化 | 仅关注健康输卵管组织,未涉及病理状态下的变化 | 构建人类输卵管在生殖周期不同阶段的细胞图谱 | 人类输卵管组织 | 单细胞组学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 85,107个绝经前细胞和46,111个绝经后细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
2620 | 2025-10-06 |
Deeper response predicts better outcomes in high-risk-smoldering-myeloma: results of the I-PRISM phase II clinical trial
2025-01-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55308-5
PMID:39753553
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研究论文 | 评估伊沙佐米、来那度胺和地塞米松联合治疗高危冒烟型骨髓瘤的II期临床试验结果 | 首次证明深度治疗反应与高危冒烟型骨髓瘤患者长期预后显著相关 | 单臂研究设计,样本量较小(55例患者) | 评估早期治疗干预对高危冒烟型骨髓瘤患者长期预后的影响 | 55例高危冒烟型骨髓瘤患者 | 临床医学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据,基因表达数据 | 55例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |