单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27085 篇文献，本页显示第 26121 - 26140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26121 | 2024-08-09 |
Dissecting LncRNA Roles in Renal Cell Carcinoma Metastasis and Characterizing Genomic Heterogeneity by Single-Cell RNA-seq
2018-12, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-17-0776
PMID:30082482
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肾细胞癌及其转移样本中的长非编码RNA（lncRNA）表达谱，揭示了lncRNA在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）转移中的作用及其功能。 | 首次详细分析了lncRNA在ccRCC转移中的作用，并发现了与ccRCC转移相关的lncRNA（CMAL），这些lncRNA参与细胞粘附、免疫反应和细胞增殖。 | 研究主要集中在lncRNA的表达和功能分析上，尚未进行临床验证和治疗应用的实验。 | 探索lncRNA在肾细胞癌转移中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力。 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及其转移样本中的lncRNA。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了来自原发性肾细胞癌和配对转移性肾细胞癌样本的单细胞RNA测序数据，涉及超过10,000个基因和1,874个lncRNA。 |
| 26122 | 2024-08-09 |
Resident Breast T Cells: The Troops Are Already There
2018-10, Trends in molecular medicine
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.molmed.2018.07.006
PMID:30077643
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research paper | 研究了组织驻留记忆T细胞在乳腺癌进展中的作用，并通过单细胞RNA测序技术在三阴性乳腺癌患者中识别T细胞，展示了其预测生存的预后价值 | 首次通过单细胞RNA测序技术在三阴性乳腺癌患者中识别T细胞，并证明了其在预测生存中的预后价值 | NA | 探讨组织驻留记忆T细胞在乳腺癌进展中的作用及其预后价值 | 组织驻留记忆T细胞在三阴性乳腺癌患者中的作用 | digital pathology | breast cancer | single-cell RNA sequencing | NA | RNA | NA |
| 26123 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: Global characterization of T cells in non-small-cell lung cancer by single-cell sequencing
2018-Oct, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-018-0167-7
PMID:30093729
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correction | 更正文章中关于非小细胞肺癌中单细胞测序的T细胞全球特征分析的错误 | NA | NA | 更正先前发表文章中的统计错误和标签错误 | 非小细胞肺癌中的T细胞 | NA | lung cancer | single-cell sequencing | NA | NA | NA |
| 26124 | 2024-08-09 |
Exploring parasite heterogeneity using single-cell RNA-seq reveals a gene signature among sexual stage Plasmodium falciparum parasites
2018-10-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2018.08.003
PMID:30096287
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对165个受感染的红细胞进行转录组分析，揭示了恶性疟原虫在性阶段特有的基因特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，成功区分了恶性疟原虫的有性和无性阶段，并验证了五个先前未定义的配子体阶段特异性基因 | 研究样本量较小，仅包括165个受感染的红细胞 | 探索疟原虫在不同生命周期阶段的基因表达和调控 | 恶性疟原虫在红细胞内发育周期的单个受感染红细胞 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 165个受感染的红细胞 |
| 26125 | 2024-08-09 |
An Introduction to the Analysis of Single-Cell RNA-Sequencing Data
2018-Sep-21, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2018.07.003
PMID:30094294
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据分析的基本原理和技术 | 单细胞RNA测序技术提供了基于数百到数十万单个细胞基因表达谱的新见解，揭示了先前在大量细胞群体基因表达分析中隐藏的新细胞群 | 单细胞RNA测序实验产生的大量数据分析和利用具有挑战性，需要理解实验和计算路径 | 讨论单细胞RNA测序数据分析的重要概念和技术 | 单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数百到数十万个单个细胞 |
| 26126 | 2024-08-09 |
Tbx6 Induces Nascent Mesoderm from Pluripotent Stem Cells and Temporally Controls Cardiac versus Somite Lineage Diversification
2018-09-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.07.001
PMID:30100166
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研究论文 | 本文通过直接重编程筛选、单细胞RNA测序和小鼠胚胎中的定向心脏分化，展示了Tbx6如何从多能干细胞诱导新生中胚层，并通过其时间表达决定心血管和体节谱系的分化 | 首次揭示了Tbx6在多能干细胞中诱导新生中胚层及其在心血管和体节谱系分化中的关键作用 | NA | 探讨Tbx6在多能干细胞中诱导中胚层及其在心血管和体节谱系分化中的分子机制 | Tbx6在多能干细胞中的功能及其对中胚层和心血管及体节谱系分化的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9技术 | NA | RNA测序数据 | 小鼠和人类的多能干细胞 |
| 26127 | 2024-08-09 |
Detection of single mRNAs in individual cells of the auditory system
2018-09, Hearing research
IF:2.5Q1
DOI:10.1016/j.heares.2018.07.008
PMID:30071403
|
研究论文 | 本文介绍了一种详细的方法，用于研究耳蜗和下丘中单一mRNA的拷贝数和空间定位 | 本文开发了一种详细的smFISH协议，可用于研究外周和中枢听觉系统中特定细胞类型的单一mRNA表达 | NA | 研究基因表达分析在理解细胞功能丰富性中的重要性 | 耳蜗和下丘中的单一mRNA | 分子生物学 | NA | 单分子荧光原位杂交（smFISH） | NA | 图像 | 成人耳蜗组织 |
| 26128 | 2024-08-09 |
High-throughput single-cell DNA sequencing of acute myeloid leukemia tumors with droplet microfluidics
2018-09, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.232272.117
PMID:30087104
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研究论文 | 开发了一种新型微流控方法，通过将数千个单个癌细胞的扩增基因组DNA编码并限制在液滴中，实现肿瘤细胞群体的遗传异质性表征 | 利用微流控技术和下一代测序数据，能够重新组装细胞的遗传特征，从而敏感地识别携带致病突变的细胞并揭示AML肿瘤内的复杂克隆进化 | NA | 旨在表征肿瘤细胞群体的遗传异质性 | 急性髓系白血病（AML）肿瘤细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 下一代测序 | NA | 基因组DNA | 超过16,000个单个细胞 |
| 26129 | 2024-08-09 |
Transcriptional Convergence of Oligodendrocyte Lineage Progenitors during Development
2018-08-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.07.005
PMID:30078729
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研究论文 | 本文通过批量和单细胞转录组学资源，研究了中枢神经系统（CNS）中Pdgfra+少突胶质细胞前体细胞（OPCs）在发育过程中的转录汇聚现象。 | 发现了脑和脊髓中的新生OPCs具有相似的转录特征，并且E13.5 Pdgfra+细胞的后代在电生理和转录特征上与后续特定波次衍生的OPCs相似。 | NA | 探究中枢神经系统中少突胶质细胞前体细胞在发育过程中的转录汇聚现象。 | Pdgfra+少突胶质细胞前体细胞（OPCs）及其在发育过程中的转录特征。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及脑和脊髓中的新生OPCs以及E13.5 Pdgfra+细胞的后代。 |
| 26130 | 2024-08-09 |
Sequencing Diversity One Cell at a Time
2018-08-09, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.07.024
PMID:30096308
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了复杂生物系统中的细胞多样性 | 采用单细胞RNA测序技术，以前所未有的规模揭示了小鼠和果蝇神经系统中细胞的转录模式 | NA | 研究复杂生物系统中的细胞多样性 | 小鼠和果蝇的神经系统细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 26131 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomes Distinguish Stem Cell State Changes and Lineage Specification Programs in Early Mammary Gland Development
2018-08-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.07.025
PMID:30089273
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研究论文 | 本文通过生成包含胚胎、新生和成年小鼠乳腺发育的单细胞转录组图谱，探讨了乳腺细胞发育的动力学和谱系特化机制 | 首次系统地描绘了乳腺发育过程中转录和表观遗传学上不同细胞状态的时间顺序，并区分了胎儿乳腺干细胞（fMaSCs）与其前体和后代 | NA | 解决乳腺发育中谱系特化机制的知识空白 | 小鼠乳腺发育过程中的细胞状态和谱系特化 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 包含胚胎、新生和成年小鼠的乳腺细胞 |
| 26132 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing technologies and bioinformatics pipelines
2018-08-07, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-018-0071-8
PMID:30089861
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术及其生物信息学分析流程 | 单细胞RNA测序技术能够揭示复杂和稀有的细胞群体，发现基因间的调控关系，并追踪发育中不同细胞谱系的路径 | 文章提到在单细胞分离和文库制备以及生物信息学工具方面仍存在技术挑战 | 探讨单细胞RNA测序技术的挑战及其生物信息学分析流程 | 单细胞RNA测序技术及其在生物学和医学中的应用 | 基因组学 | NA | NGS | NA | RNA序列 | NA |
| 26133 | 2024-08-09 |
Endothelial Regeneration of Large Vessels Is a Biphasic Process Driven by Local Cells with Distinct Proliferative Capacities
2018-Aug-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.07.011
PMID:30075129
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研究论文 | 本文通过体内主动脉内皮损伤模型，结合多色谱系追踪、共生和单细胞转录组学，研究了成年大血管内皮再生的细胞和机制基础。 | 发现内皮再生是一个双相过程，由来自分化内皮细胞的不同群体驱动，且需要激活应激反应基因Atf3。 | NA | 探究成年大血管内皮再生的细胞和机制基础。 | 内皮细胞的再生过程及其驱动机制。 | NA | NA | 多色谱系追踪、共生和单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 26134 | 2024-08-09 |
Accelerating a paradigm shift: The Common Fund Single Cell Analysis Program
2018-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aat8573
PMID:30083611
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综述 | 本文回顾了美国国立卫生研究院（NIH）支持的单细胞分析计划（SCAP）的原始目标，并展望了该计划作为探索人体组织细胞水平异质性的催化剂的影响 | 该计划推动了单细胞RNA测序和多重成像技术与计算方法的进步 | NA | 探索人体组织在细胞水平的异质性，并推动单细胞分析技术在健康和疾病研究中的广泛应用 | 人体内近40万亿个细胞的精确分子特征 | NA | NA | 单细胞RNA测序和多重成像 | NA | 细胞数据 | NA |
| 26135 | 2024-08-09 |
scPipe: A flexible R/Bioconductor preprocessing pipeline for single-cell RNA-sequencing data
2018-08, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006361
PMID:30096152
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scPipe的R/Bioconductor包，用于处理单细胞RNA测序数据的预处理 | scPipe能够处理多种不同协议的条形码策略，并提供样本级别的质量评估和结果可视化 | NA | 开发一种灵活的工具，用于处理和分析单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 数千个细胞 |
| 26136 | 2024-08-09 |
New MiniPromoter Ple345 (NEFL) Drives Strong and Specific Expression in Retinal Ganglion Cells of Mouse and Primate Retina
2019-03, Human gene therapy
IF:3.9Q2
DOI:10.1089/hum.2018.118
PMID:30062914
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研究论文 | 本文通过计算生物学方法，挖掘人类基因组，开发了一种新的最小启动子元素（MiniPromoter）Ple345（NEFL），旨在提高视网膜神经节细胞基因治疗的安全性和有效性 | 开发了一种新的基于人类DNA的最小启动子Ple345（NEFL），该启动子在重组腺相关病毒（rAAV）中显示出在非人类灵长类视网膜神经节细胞中的特异性和强表达 | NA | 改进视网膜神经节细胞基因治疗的安全性和有效性 | 视网膜神经节细胞 | 基因治疗 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（Drop-seq） | NA | 基因组数据 | 在老鼠和非人类灵长类视网膜中测试了七个启动子设计 |
| 26137 | 2024-08-09 |
GPseudoRank: a permutation sampler for single cell orderings
2019-02-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty664
PMID:30052778
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GPseudoRank的排列采样器，用于单细胞排序 | GPseudoRank能够从复杂的多模态后验分布中采样，并识别生物过程中低和高伪时间不确定性的阶段 | NA | 开发一种方法来采样复杂的、多模态的排序分布，并估计生物发育过程中排序不确定性的变化 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | Bayesian modelling, MCMC | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 26138 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis identifies markers of resistance to targeted BRAF inhibitors in melanoma cell populations
2018-09, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.234062.117
PMID:30061114
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SAKE的单细胞RNA测序分析方法，用于识别黑色素瘤细胞对BRAF抑制剂的耐药标志物 | SAKE方法在处理大型复杂细胞群体时优于其他单细胞分析方法，并能识别出BRAF抑制剂耐药细胞的新标志物 | 单细胞RNA测序数据存在高转录本丢失率、随机转录事件和复杂群体亚结构等挑战 | 开发和验证一种新的单细胞RNA测序分析方法，以识别黑色素瘤细胞对BRAF抑制剂的耐药标志物 | 黑色素瘤细胞对BRAF抑制剂的耐药性 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用了来自Fluidigm C1和10x Genomics平台的单细胞RNA测序数据 |
| 26139 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq uncovers dynamic processes and critical regulators in mouse spermatogenesis
2018-09, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-018-0074-y
PMID:30061742
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研究论文 | 本文通过结合转基因标记和生精上皮周期的同步化，开发了一种纯化所有类型均一精原细胞的方法，并进行了单细胞RNA测序，揭示了小鼠精子发生中的动态过程和关键调控因子。 | 本文揭示了先前未被描述的广泛的动态基因表达过程和分子特征，以及特定阶段的男性生殖细胞发育中的替代剪接模式和新调控因子。 | NA | 全面理解精子发生的分子机制，并为不孕症治疗和男性避孕开发新策略。 | 小鼠的精原细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 所有类型的均一精原细胞 |
| 26140 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals the diversity of trophoblast subtypes and patterns of differentiation in the human placenta
2018-08, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-018-0066-y
PMID:30042384
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人类胎盘中滋养层细胞亚型的多样性及其分化模式 | 发现了新的细胞亚型，并定义了细胞类型特异性的基因特征，揭示了人类胎盘的许多先前未知的功能 | NA | 深入了解人类胎盘在妊娠早期的形成过程 | 人类胎盘中的滋养层细胞亚型及其分化模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自第一和第二孕期人类胎盘的已分类胎盘细胞 |