单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27901 篇文献，本页显示第 26081 - 26100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26081 | 2024-08-09 |
Chronic Stress Induces Activity, Synaptic, and Transcriptional Remodeling of the Lateral Habenula Associated with Deficits in Motivated Behaviors
2019-12-04, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.09.005
PMID:31672263
|
研究论文 | 本文研究了慢性压力（CS）对侧缰核（LHb）神经元的活动、突触和转录重塑，以及这些变化与动机行为缺陷的关联 | 首次揭示了CS诱导的LHb神经元超活动与被动应对（PC）增加的关联，并利用单细胞转录组学识别了一组可作为PC增加小鼠生物标志物的基因 | NA | 探讨慢性压力对侧缰核神经元的活动、突触和转录重塑及其与动机行为缺陷的关系 | 侧缰核（LHb）神经元及其与腹侧被盖区（VTA）和背缝核（DR）的神经连接 | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠 |
| 26082 | 2024-08-09 |
Improving single-cell transcriptome sequencing efficiency with a microfluidic phase-switch device
2019-Dec-02, The Analyst
DOI:10.1039/c9an00823c
PMID:31688860
|
research paper | 本文介绍了一种新型微流控相变装置，用于提高单细胞转录组测序的效率，特别适用于细胞数量有限的珍贵样本。 | 设计了一种集成多个单细胞隔离室的微流控装置，实现了近100%的单细胞捕获率和极低的细胞损失，并采用了一种新的相变方法将单细胞封装到皮升大小的水凝胶液滴中。 | NA | 提高单细胞转录组测序的效率和可及性。 | 单细胞转录组测序，特别是细胞数量有限的珍贵样本。 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | text | 数十个hESCs（H9） |
| 26083 | 2024-08-09 |
Unravelling fibrosis using single-cell transcriptomics
2019-12, Current opinion in pharmacology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.coph.2019.09.004
PMID:31670054
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在揭示纤维化疾病发病机制中的应用 | 单细胞转录组学技术使得在纤维化背景下对个体致病细胞群体的研究达到了前所未有的分辨率 | NA | 探讨单细胞转录组学如何推动对纤维化疾病发病机制的理解 | 纤维化疾病及其治疗靶点的精确识别 | 单细胞转录组学 | 纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 26084 | 2024-08-09 |
Preclinical development of T-cell receptor-engineered T-cell therapy targeting the 5T4 tumor antigen on renal cell carcinoma
2019-Dec, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-019-02419-4
PMID:31686124
|
研究论文 | 本研究开发了一种针对肾细胞癌中5T4肿瘤抗原的T细胞受体工程化T细胞疗法，并通过单细胞RNA测序和功能测试验证了其有效性 | 首次探索了5T4作为T细胞受体工程化T细胞疗法的目标，并成功开发了针对该抗原的T细胞疗法 | NA | 开发和验证针对5T4肿瘤抗原的T细胞受体工程化T细胞疗法 | 5T4肿瘤抗原特异性的T细胞克隆及其功能 | 免疫疗法 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | T细胞受体工程化T细胞 | RNA | 七对独特的TRA-TRB配对 |
| 26085 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing and its applications in head and neck cancer
2019-12, Oral oncology
IF:4.0Q2
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在头颈癌研究中的应用及其在基因组、转录组和表观基因组层面的技术和计算进展 | 单细胞测序技术为理解肿瘤生物学中的细微差异提供了新途径，通过识别不同的细胞亚群、解析肿瘤微环境中的信号传导以及描述细胞基因组突变和拷贝数异常 | NA | 探讨单细胞测序技术在头颈癌研究和临床实践中的应用 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞亚群及其基因组、转录组和表观基因组特征 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组数据 | NA |
| 26086 | 2024-08-09 |
Bayesian Inference of Allelic Inclusion Rates in the Human T Cell Receptor Repertoire
2019-11-27, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.09.006
PMID:31677971
|
研究论文 | 本文开发并实验验证了一种完全贝叶斯推理模型，用于可靠地估计α和β TCR等位基因包含率 | 提出了一个完全贝叶斯推理模型来估计α和β TCR等位基因包含率，并提供了超过51,000个先前未发表的等位基因包含TCR序列集的数据库 | 单细胞测序技术的局限性阻碍了对这些双受体T细胞的全面计数 | 研究人类T细胞受体库中的等位基因包含率 | αβ T细胞的等位基因包含现象 | NA | NA | 单细胞测序 | 贝叶斯推理模型 | 序列数据 | 超过51,000个TCR序列集，来自8名健康个体 |
| 26087 | 2024-08-09 |
Self-renewing endometrial epithelial organoids of the human uterus
2019-11-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1915389116
PMID:31666317
|
研究论文 | 本研究使用已建立的器官培养协议，从人类子宫内膜活检中生成并全面分析了三维子宫内膜上皮器官（EEO）培养物 | 本研究首次详细描述了人类子宫内膜上皮器官的生成及其在激素处理下的基因表达变化 | NA | 研究子宫内膜在妊娠早期的作用及其生理和病理机制 | 人类子宫内膜上皮器官（EEO）及其在激素处理下的反应 | NA | 不孕症 | 实时定量PCR，批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自2个不同供体的子宫内膜样本 |
| 26088 | 2024-08-09 |
Modular transcriptional programs separately define axon and dendrite connectivity
2019-11-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.50822
PMID:31687928
|
研究论文 | 本文研究了T4/T5神经元的转录调控程序，揭示了不同树突和轴突连接模式的转录程序 | 本文首次揭示了模块化转录程序在定义神经元连接模式中的独立控制作用 | NA | 探索神经元连接模式的转录调控机制 | T4/T5神经元的树突和轴突连接模式 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八种T4/T5神经元亚型 |
| 26089 | 2024-08-09 |
DoubletDecon: Deconvoluting Doublets from Single-Cell RNA-Sequencing Data
2019-11-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.09.082
PMID:31693907
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DoubletDecon的方法，用于从单细胞RNA测序数据中去除双细胞捕获的技术伪影 | DoubletDecon结合了去卷积分析和独特细胞状态基因表达的识别，能够高灵敏度地识别不同类型的双细胞，并避免将有效的混合谱系和过渡细胞状态误判为双细胞 | NA | 开发一种方法来检测和去除单细胞RNA测序数据中的双细胞 | 单细胞RNA测序数据中的双细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同细胞复杂度的单细胞RNA测序数据集 |
| 26090 | 2024-08-09 |
Single-cell proteomics reveals changes in expression during hair-cell development
2019-11-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.50777
PMID:31682227
|
研究论文 | 本文利用单细胞纳米级 shotgun 质谱技术研究了鸡胚胎第15天椭圆囊中分化中的毛细胞的蛋白质表达动态变化 | 首次使用单细胞质谱技术揭示了毛细胞分化过程中蛋白质表达的变化，并与单细胞转录组数据相结合，提供了细胞发育特征的新见解 | NA | 探索内耳中感觉毛细胞分化过程中的蛋白质表达动态变化 | 鸡胚胎第15天椭圆囊中的毛细胞及其前体细胞 | 蛋白质组学 | NA | 单细胞 shotgun 质谱技术 | NA | 蛋白质组和转录组数据 | 多个单细胞样本 |
| 26091 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiling Reveals Sex, Lineage, and Regional Diversity in the Mouse Kidney
2019-11-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2019.10.005
PMID:31689386
|
研究论文 | 本研究通过解剖引导的单细胞RNA测序结合原位表达研究和细胞系追踪，揭示了成年雄性和雌性小鼠肾脏的细胞多样性、显著的性别差异以及肾单位的组织和细胞组成 | 研究首次综合了单细胞RNA测序、原位表达研究和细胞系追踪，揭示了小鼠肾脏中的细胞多样性和性别差异，并创建了一个可搜索的数据库Kidney Cell Explorer | NA | 增强对哺乳动物肾脏的理解，特别是在细胞多样性和性别差异方面 | 成年雄性和雌性小鼠的肾脏 | 数字病理学 | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 成年雄性和雌性小鼠的肾脏样本 |
| 26092 | 2024-08-09 |
Stress-Induced Metabolic Disorder in Peripheral CD4+ T Cells Leads to Anxiety-like Behavior
2019-10-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.10.001
PMID:31675497
|
研究论文 | 本研究探讨了外周CD4+ T细胞在应激诱导的焦虑样行为中的病理作用及其调控机制 | 首次揭示了CD4 T细胞中由应激诱导的白三烯B4触发线粒体裂变，进而导致焦虑、抑郁和社会行为异常的机制 | NA | 阐明外周CD4+ T细胞在情绪障碍中的病理作用及调控机制 | 外周CD4+ T细胞在应激诱导的焦虑样行为中的作用 | NA | 焦虑症 | 代谢组学分析，单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 26093 | 2024-08-09 |
Single-cell proteomics in complex tissues using microprobe capillary electrophoresis mass spectrometry
2019, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2019.07.001
PMID:31668233
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于微探针毛细管电泳高分辨率质谱（CE-HRMS）的单细胞蛋白质组学分析方法，能够在不分离或解剖整个细胞的情况下，直接对嵌入复杂组织中的单个细胞进行蛋白质组学分析 | 该技术利用微尺度样品收集和处理、分离及离子化技术的最新进展，将高分辨率质谱技术扩展到单细胞水平，揭示了胚胎细胞和神经元之间先前未知的蛋白质组学差异 | NA | 旨在扩展我们对单个细胞产生的蛋白质差异（异质性）及其对正常和受损发育贡献的理解 | 研究对象包括非洲爪蟾和斑马鱼的早期发育胚胎中的单个细胞，以及小鼠黑质中电生理学识别的单个神经元 | 蛋白质组学 | NA | 微探针毛细管电泳高分辨率质谱（CE-HRMS） | NA | 蛋白质组学数据 | 涉及非洲爪蟾、斑马鱼的早期发育胚胎中的单个细胞，以及小鼠黑质中电生理学识别的单个神经元 |
| 26094 | 2024-08-09 |
Recent advances in understanding neocortical development
2019, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.20332.1
PMID:31681469
|
综述 | 本文综述了最近在理解新皮质发育方面的突出进展，特别关注背侧前体细胞和兴奋性神经元 | 强调了神经干细胞在不同类别中的分化及其增殖和神经元产生的过程，以及最近关于神经元迁移的发现 | NA | 总结新皮质发育的最新进展，并探讨其进化和疾病机制 | 新皮质发育，特别是背侧前体细胞和兴奋性神经元 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26095 | 2024-08-09 |
Subregion-specific rules govern the distribution of neuronal immediate-early gene induction
2020-09-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1913658116
PMID:31636216
|
研究论文 | 本文研究了即时早期基因（IEG）在神经元集合中的分布规律，特别是在背侧纹状体中的刺状投射神经元（SPN）中，通过急性可卡因暴露后的表达情况。 | 发现了IEG表达的区域特异性规则，并观察到IEG表达的神经元集合形成空间定义的集群，这些集群与多个IEG的协同和强表达相关。 | 研究主要集中在背侧纹状体的SPN中，未涵盖所有脑结构和刺激类型。 | 探讨IEG在神经元集合中的分布规律及其与记忆形成的关系。 | 背侧纹状体中的刺状投射神经元（SPN）和皮质神经元的IEG表达。 | 神经科学 | NA | 单分子荧光原位杂交（smFISH） | NA | RNA序列 | 小鼠背侧纹状体中的SPN和皮质神经元 |
| 26096 | 2024-08-09 |
deepMc: Deep Matrix Completion for Imputation of Single-Cell RNA-seq Data
2020-07, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2019.0278
PMID:31657645
|
研究论文 | 本文提出了一种基于深度矩阵分解的方法deepMc，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 利用深度学习技术解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达数据 | 机器学习 | NA | 深度矩阵分解 | 深度学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 26097 | 2024-08-09 |
Migraine-associated gene expression in cell types of the central and peripheral nervous system
2020-04, Cephalalgia : an international journal of headache
IF:5.0Q1
DOI:10.1177/0333102419877834
PMID:31660761
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，分析了中枢和周围神经系统中与偏头痛相关的基因表达情况 | 首次通过单细胞RNA测序技术，确定了与偏头痛相关的基因在中枢和周围神经系统中的具体细胞类型表达 | NA | 确定与偏头痛相关的基因在神经系统中的细胞类型特异性表达 | 中枢和周围神经系统中的细胞类型 | NA | 偏头痛 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 26098 | 2024-08-09 |
SINC: a scale-invariant deep-neural-network classifier for bulk and single-cell RNA-seq data
2020-03-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz801
PMID:31647523
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SINC的尺度不变深度神经网络分类器，用于批量和单细胞RNA-seq数据分析 | SINC分类器能够在不进行序列深度缩放的情况下直接使用原始计数数据，且在不同序列深度估计下给出相同结果 | NA | 开发一种尺度不变的深度神经网络分类器，用于样本分类，如正常与癌变样本的区分 | 批量和单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度神经网络 | RNA-seq数据 | 九个批量和单细胞数据集 |
| 26099 | 2024-08-09 |
PlanExp: intuitive integration of complex RNA-seq datasets with planarian omics resources
2020-03-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz802
PMID:31647529
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为PlanExp的网络应用程序，用于探索和可视化不同RNA-seq实验（传统和单细胞RNA-seq）中的基因表达数据，特别是针对地中海扁虫Schmidtea mediterranea | PlanExp提供了多种交互式绘图工具，如热图、散点图等，并整合了PlanNET网络应用程序，实现了基因组和转录水平的序列注释链接，以及基因/蛋白质网络编辑器和单细胞RNA-seq数据的遗传相互作用预测 | NA | 旨在帮助研究人员理解和分析扁虫再生和发育过程中的大量转录组和基因组数据 | 地中海扁虫Schmidtea mediterranea的基因表达数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26100 | 2024-08-09 |
Macrophage-Derived CXCL9 and CXCL10 Are Required for Antitumor Immune Responses Following Immune Checkpoint Blockade
2020-01-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-1868
PMID:31636098
|
研究论文 | 研究免疫检查点阻断治疗后，巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10在抗肿瘤免疫反应中的作用 | 首次揭示了巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10在免疫检查点阻断治疗中对T细胞招募和治疗效果的关键作用 | NA | 探讨免疫检查点阻断治疗中，巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10对T细胞招募和治疗效果的影响 | 巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10在免疫检查点阻断治疗中的作用 | 免疫学 | NA | NanoString-based分析、流式细胞术、细胞珠阵列、单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | 包括小鼠模型和接受免疫检查点抑制剂治疗的患者 |