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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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26001 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Developmental Origins and Ontogenetic Stability of Neurexin Alternative Splicing Profiles
2019-06-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.05.090
PMID:31242409
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,探讨了小鼠成熟和胚胎细胞中neurexin多样性的起源及其在发育过程中的稳定性 | 发现了发育相关细胞中共享的neurexin表达模式,并展示了neurexin表达模式在早期发育阶段确定并在神经元成熟过程中保持不变 | NA | 揭示neurexin替代剪接模式的发育起源和个体发生稳定性 | neurexin的替代剪接模式及其在不同细胞类型中的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多组小鼠成熟和胚胎细胞 |
26002 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq: Introduction to Bioinformatics Analysis
2019-06, Current protocols in molecular biology
DOI:10.1002/cpmb.92
PMID:31237421
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研究论文 | 本文介绍了单细胞RNA测序(RNA-seq)数据的生物信息学分析流程 | 提供了当前公开可用的计算工具来分析单细胞RNA-seq数据,并专注于单细胞转录组异质性的解释以及细胞簇和簇间差异表达基因的识别 | NA | 探索细胞群体的异质性并理解不同细胞中的分子机制 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(RNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
26003 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing for the study of lupus nephritis
2019, Lupus science & medicine
IF:3.7Q1
DOI:10.1136/lupus-2019-000329
PMID:31245017
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术的发展及其在理解狼疮和狼疮性肾炎分子发病机制中的应用 | scRNA-seq技术的高通量特性加速了生物系统和疾病中的发现 | NA | 探讨scRNA-seq技术在狼疮和狼疮性肾炎研究中的应用 | scRNA-seq技术及其在狼疮和狼疮性肾炎中的应用 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | NA |
26004 | 2024-08-09 |
CHETAH: a selective, hierarchical cell type identification method for single-cell RNA sequencing
2019-09-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz543
PMID:31226206
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CHETAH的单细胞RNA测序细胞类型识别方法,该方法通过层次分类技术,能够快速且准确地识别细胞类型,并提供中间或未分类的选项 | CHETAH算法在处理未知类型的细胞时具有更高的特异性,如在肿瘤样本中能够准确识别出恶性细胞,并将其标记为中间或未分类 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序细胞类型识别方法,以提高细胞类型识别的准确性和特异性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 层次分类 | 基因表达数据 | NA |
26005 | 2024-08-09 |
Cellular crosstalk in the development and regeneration of the respiratory system
2019-09, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-019-0141-3
PMID:31217577
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综述 | 本文综述了呼吸系统在发育和再生过程中细胞间相互作用的研究进展 | 利用单细胞测序技术、细胞和组织成像以及细胞谱系追踪等新技术的进展,揭示了呼吸系统细胞和功能异质性比预期更高且高度适应 | NA | 探讨协调呼吸系统发育和再生的细胞间相互作用 | 呼吸系统的细胞相互作用及其在发育、环境交互和损伤响应中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA |
26006 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Chemotaxis-Mediated Intraorgan Crosstalk During Cardiogenesis
2019-08-02, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.315243
PMID:31221018
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了心脏发育过程中不同心脏前体细胞(CP)分化层次的全景图,并探讨了化学趋化介导的器官内对话在心脏形成中的作用 | 首次展示了心脏前体细胞在不同胚胎发育阶段的单细胞转录组全景图,并揭示了化学趋化因子在心脏发育中的关键作用 | NA | 探讨心脏发育过程中器官内通信如何控制心脏不同解剖区域的顺序构建 | 心脏前体细胞(CP)的分化过程及其在心脏发育中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 胚胎发育不同阶段的Nkx2-5和Isl1谱系细胞 |
26007 | 2024-08-09 |
Characteristics of Waldenström Macroglobulinemia in Korean Patients According to Mutational Status of MYD88 and CXCR4: Analysis Using Ultra-Deep Sequencing
2019-08, Clinical lymphoma, myeloma & leukemia
DOI:10.1016/j.clml.2019.03.009
PMID:31221512
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研究论文 | 本研究探讨了韩国Waldenström巨球蛋白血症(WM)患者中MYD88和CXCR4突变状态的特征,并使用超深度测序技术进行了分析。 | 本研究首次在亚洲WM患者中详细分析了MYD88和CXCR4的突变频率及其临床特征,并使用超深度测序技术检测了Sanger测序无法检测到的CXCR4突变。 | 研究样本量较小,仅包括31名患者,可能影响结果的普遍性。 | 研究韩国WM患者中MYD88和CXCR4突变状态的特征,并探讨这些突变对疾病的影响。 | 研究对象为韩国WM患者,重点关注MYD88和CXCR4的突变状态及其对疾病特征的影响。 | 数字病理学 | Waldenström巨球蛋白血症 | 超深度测序 | NA | DNA序列 | 31名患者 |
26008 | 2024-08-09 |
Enhancement of LIN28B-induced hematopoietic reprogramming by IGF2BP3
2019-08-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.325100.119
PMID:31221665
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,研究了Lin28b和Igf2bp3在诱导成人造血干细胞和祖细胞(HSPCs)向胎儿模式重编程中的相互作用和机制 | 发现Lin28b和Igf2bp3共同表达能更有效地在体内重新激活胎儿样B细胞发育,形成一个自调节环,稳定数千个mRNA | NA | 探索Lin28b和Igf2bp3在重编程成人HSPCs向胎儿模式中的作用,以及这种重编程方法在基础研究和临床应用中的潜力 | 成人造血干细胞和祖细胞(HSPCs) | 生物学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | RNA | NA |
26009 | 2024-08-09 |
Prolactin receptor expression in mouse dorsal root ganglia neuronal subtypes is sex-dependent
2019-08, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.12759
PMID:31231869
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研究论文 | 研究探讨了催乳素受体(Prlr)在雌性和雄性小鼠背根神经节(DRG)感觉神经元中的表达及其性别依赖性 | 提出了感觉神经元类型依赖的Prlr表达可能是解释痛觉感受器对催乳素反应性别二态性的新机制 | NA | 旨在确定感觉神经元中性别依赖的催乳素敏感性的机制 | 雌性和雄性小鼠背根神经节中的感觉神经元 | NA | NA | 定量逆转录聚合酶链反应,免疫组织化学和电生理学 | NA | 单细胞测序数据 | 雌性和雄性小鼠的背根神经节样本 |
26010 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of the T Helper Cell Response to House Dust Mites Defines a Distinct Gene Expression Signature in Airway Th2 Cells
2019-07-16, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.05.014
PMID:31231035
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了在屋尘螨过敏性气道疾病模型中,T辅助细胞的转录组特征,特别是在气道Th2细胞中的基因表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了屋尘螨模型中气道Th2细胞的转录组特征,并揭示了与脂质代谢相关的新途径 | NA | 探讨屋尘螨过敏性气道疾病中T辅助细胞的转录组特征,特别是Th2细胞的基因表达模式 | T辅助细胞,特别是Th2细胞在屋尘螨过敏性气道疾病中的转录组特征 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 来自淋巴结、肺和气道的T辅助细胞样本 |
26011 | 2024-08-09 |
Defective Tmprss3-Associated Hair Cell Degeneration in Inner Ear Organoids
2019-07-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2019.05.014
PMID:31204303
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research paper | 本研究利用干细胞衍生的内耳类器官结合单细胞RNA测序技术,探讨TMPRSS3在人类听力损失中的作用 | 首次通过体外模型重现与遗传相关的内耳异常特征,为研究内耳疾病提供了有力工具 | NA | 揭示TMPRSS3相关听力损失的潜在机制 | TMPRSS3在内耳类器官中的功能及其缺陷对毛细胞的影响 | NA | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
26012 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of oocytes from ovarian endometriosis patients reveals a differential transcriptomic profile associated with lower quality
2019-07-08, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/dez053
PMID:31211846
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,比较了卵巢子宫内膜异位症患者与健康女性的卵母细胞转录组差异 | 首次揭示了卵巢子宫内膜异位症对卵母细胞全局转录组行为的影响,并发现了大量差异表达基因 | 研究仅限于卵巢子宫内膜异位症,未考虑其他类型的子宫内膜异位症,且样本量有限 | 探究卵巢子宫内膜异位症患者的卵母细胞是否具有与健康女性不同的转录组特征 | 卵巢子宫内膜异位症患者的卵母细胞与健康女性的卵母细胞 | NA | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 16个卵巢子宫内膜异位症患者的卵母细胞和16个健康卵子捐赠者的卵母细胞 |
26013 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Analyses of Cell Fate Transitions during Human Cardiac Reprogramming
2019-07-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.05.020
PMID:31230860
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,探讨了人类心脏细胞重编程过程中的细胞命运转变 | 开发了一种包含数据标准化方法、多种轨迹预测算法和细胞命运指数计算的分析流程,用于测量重编程进展 | NA | 研究细胞可塑性和细胞命运决定的机制 | 人类心脏细胞的重编程过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
26014 | 2024-08-09 |
α2-Chimaerin is essential for neural stem cell homeostasis in mouse adult neurogenesis
2019-07-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1903891116
PMID:31209021
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研究论文 | 本文研究了α2-chimaerin在成年小鼠海马神经发生中对神经干细胞(NSC)稳态的必要性 | 首次报道了α2-chimaerin在成年海马神经发生中对NSC稳态的关键作用 | NA | 探讨α2-chimaerin在成年海马神经发生中对NSC稳态的作用 | α2-chimaerin在成年小鼠海马神经发生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序和伪时间分析 | NA | RNA | α2-chimaerin条件性敲除(α2-CKO)小鼠 |
26015 | 2024-08-09 |
Myc and Dnmt1 impede the pluripotent to totipotent state transition in embryonic stem cells
2019-07, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-019-0343-0
PMID:31209294
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研究论文 | 本研究探讨了胚胎干细胞从多能状态向全能状态转变的机制 | 首次揭示了Myc和Dnmt1在阻止胚胎干细胞从多能状态向全能状态转变中的作用 | NA | 理解胚胎干细胞从多能状态向全能状态转变的过程 | 胚胎干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9 | NA | RNA | 小部分细胞 |
26016 | 2024-08-09 |
A cellular census of human lungs identifies novel cell states in health and in asthma
2019-07, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0468-5
PMID:31209336
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学技术,对健康和哮喘患者的人类肺部进行了细胞图谱绘制,识别了新的细胞状态 | 报道了位置依赖性的气道上皮细胞状态和一种新的组织驻留记忆T细胞亚群,以及哮喘患者下呼吸道中的粘液细胞增生和杯状细胞增生 | NA | 通过单细胞转录组学技术,揭示健康和哮喘肺部细胞的差异 | 人类肺部的上、下呼吸道和肺实质细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 健康肺部和哮喘肺部的多个样本 |
26017 | 2024-08-09 |
Sensory lesioning induces microglial synapse elimination via ADAM10 and fractalkine signaling
2019-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-019-0419-y
PMID:31209379
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研究论文 | 本文研究了胡须损伤通过ADAM10和fractalkine信号通路诱导小胶质细胞介导的突触消除 | 首次揭示了神经元到小胶质细胞的信号传导在皮质突触重塑中的必要性,并展示了上下文依赖的免疫机制在哺乳动物大脑中重塑突触的利用 | NA | 探究小胶质细胞如何响应神经活动和炎症变化来调节突触连接 | 小胶质细胞介导的突触消除及其分子机制 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 |
26018 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals TOX as a key regulator of CD8+ T cell persistence in chronic infection
2019-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0403-4
PMID:31209400
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研究论文 | 本研究通过比较急性与慢性病毒感染下CD8 T细胞的单细胞转录组和表观遗传学特征,揭示了TOX作为关键调节因子在慢性感染中维持CD8+ T细胞持久性的作用 | 发现TOX在祖细胞样CD8 T细胞中表现出更高的转录活性,并与更多的活跃组蛋白标记相关,促进了抗病毒CD8 T细胞的持久性 | NA | 探究TOX在慢性病毒感染中对CD8+ T细胞持久性的调控作用 | CD8 T细胞在急性与慢性病毒感染中的单细胞转录组和表观遗传学特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
26019 | 2024-08-09 |
The immune cell landscape in kidneys of patients with lupus nephritis
2019-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0398-x
PMID:31209404
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了狼疮性肾炎患者和健康对照者的肾脏样本,揭示了21种在疾病中活跃的白细胞亚群 | 首次详细描述了狼疮性肾炎患者肾脏中多种免疫细胞亚群的活性和反应,包括促炎和抗炎反应 | NA | 开发狼疮性肾炎的疾病机制假设 | 狼疮性肾炎患者和健康对照者的肾脏样本 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个狼疮性肾炎患者和健康对照者的肾脏样本 |
26020 | 2024-08-09 |
Navigating the Depths and Avoiding the Shallows of Pancreatic Islet Cell Transcriptomes
2019-07, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi18-0019
PMID:31221802
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观点 | 本文评估了单细胞RNA测序(scRNA-Seq)在提高我们对β细胞异质性理解方面的能力,并探讨了单细胞分辨率下基因表达检测的局限性及其对单胰岛细胞转录组数据质量的影响 | 采用单细胞RNA测序技术,揭示了人类和鼠类β细胞的显著异质性 | 单细胞分辨率下基因表达检测的局限性可能影响单胰岛细胞转录组数据的质量 | 评估单细胞RNA测序在理解β细胞异质性方面的应用及其局限性 | 人类β细胞的转录组数据 | 基因组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 转录组数据 | 多个单人类β细胞转录组数据集 |