单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 25981 - 26000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25981 | 2024-08-09 |
An optimised tissue disaggregation and data processing pipeline for characterising fibroblast phenotypes using single-cell RNA sequencing
2019-07-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-45842-4
PMID:31270426
|
研究论文 | 本文描述了一种优化的人类肺组织成纤维细胞分离方法，并展示了其在使用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）表征基质细胞表型中的潜力 | 提出了一种优化的组织解离和数据处理流程，以改善成纤维细胞在scRNA-Seq数据集中的表征和聚类质量 | NA | 优化成纤维细胞的分离和数据处理，以更好地表征其在多细胞生态系统中的作用 | 成纤维细胞及其在人类肺组织中的表型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 人类肺组织样本 |
| 25982 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq variant analysis for exploration of genetic heterogeneity in cancer
2019-07-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-45934-1
PMID:31267007
|
研究论文 | 本文开发了一种方法，从单细胞RNA测序数据中提取和分析影响细胞生物学的遗传异质性信息 | 该方法能够基于单核苷酸变异的遗传变异对细胞进行比较和聚类，揭示了由基于基因表达的方法证实的细胞亚群 | 同时分析同一细胞中的DNA和RNA仍处于起步阶段 | 探索癌症中的遗传异质性 | 单细胞RNA测序数据中的遗传变异 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及淋巴结转移和胶质母细胞瘤患者的细胞样本 |
| 25983 | 2024-08-09 |
Dissecting the transcriptome landscape of the human fetal neural retina and retinal pigment epithelium by single-cell RNA-seq analysis
2019-07, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3000365
PMID:31269016
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析人类胎儿神经视网膜和视网膜色素上皮细胞的转录组景观 | 揭示了人类神经视网膜和视网膜色素上皮细胞的时空基因表达网络，并识别了关键的转录因子和疾病相关基因 | NA | 阐明人类神经视网膜和视网膜色素上皮细胞的发育分子机制及其相互作用 | 人类胎儿神经视网膜和视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2,421个单细胞 |
| 25984 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals T cell infiltration in old neurogenic niches
2019-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1362-5
PMID:31270459
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析年轻和老年小鼠神经发生微环境中的细胞变化 | 首次揭示了老年神经发生微环境中T细胞的浸润及其对神经干细胞增殖的抑制作用 | NA | 探究衰老过程中神经发生微环境的变化及其机制 | 小鼠的年轻和老年神经发生微环境 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 14,685个单细胞 |
| 25985 | 2024-08-09 |
Somatic mutations and cell identity linked by Genotyping of Transcriptomes
2019-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1367-0
PMID:31270458
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研究论文 | 本文开发了一种名为Genotyping of Transcriptomes (GoT)的方法，结合基因分型与高通量液滴单细胞RNA测序，用于研究体细胞突变如何影响人类造血过程 | GoT方法的创新之处在于能够将基因分型与单细胞RNA测序相结合，从而在缺乏表面标记的情况下定义恶性细胞的转录组身份 | NA | 研究体细胞突变如何影响人类造血过程 | 来自CALR突变骨髓增生性肿瘤患者的38,290个CD34细胞 | 数字病理学 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 38,290个CD34细胞 |
| 25986 | 2024-08-09 |
scSLAM-seq reveals core features of transcription dynamics in single cells
2019-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1369-y
PMID:31292545
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研究论文 | 本文介绍了scSLAM-seq技术，该技术结合代谢RNA标记、生物化学核苷酸转换和单细胞RNA测序，能够区分单个细胞中数千个基因的新旧RNA，从而直接记录转录活性 | scSLAM-seq技术能够区分新旧RNA，揭示单细胞转录动力学的真实时间和随机性特征 | 传统的单细胞RNA测序方法只能提供基因表达的快照，且每个细胞的RNA只能分析一次 | 研究单细胞转录动力学的核心特征，并解释细胞间转录组异质性的原因 | 单细胞转录活性、细胞周期状态、感染剂量以及宿主基因表达的'开-关'切换和转录爆发动力学 | 单细胞RNA测序 | NA | scSLAM-seq | NA | RNA | 单个细胞中数千个基因 |
| 25987 | 2024-08-09 |
Comprehensive single-cell transcriptome lineages of a proto-vertebrate
2019-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1385-y
PMID:31292549
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研究论文 | 本文研究了原脊椎动物Ciona intestinalis的单细胞转录组谱系，涵盖从原肠胚形成到游泳蝌蚪的整个发育过程 | 首次为Ciona intestinalis的90,000多个细胞确定了单细胞转录组，并构建了虚拟细胞谱系图和临时基因网络 | NA | 探索原脊椎动物发育中的细胞谱系及其在进化上的起源 | Ciona intestinalis的单细胞转录组及其发育过程中的细胞谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 90,000多个细胞 |
| 25988 | 2024-08-09 |
Machine learning and statistical methods for clustering single-cell RNA-sequencing data
2020-07-15, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbz063
PMID:31243426
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综述 | 本文综述了近年来用于单细胞RNA测序数据聚类的机器学习和统计方法 | 介绍了如何修改或定制传统聚类技术以应对scRNA-seq数据分析中的独特挑战，如低表达基因的丢失、转录本覆盖率低且不均匀、单细胞总mRNA高度变异以及存在技术偏差和无关生物变异时的细胞标记模糊等问题 | NA | 揭示细胞亚型并基于细胞间关系推断细胞谱系 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 转录组数据 | 大规模单细胞 |
| 25989 | 2024-08-09 |
Mapping human pluripotent stem cell-endothelial cell differentiation using scRNA-seq: a step towards therapeutic angiogenesis
2020-03-01, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehz464
PMID:31263875
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25990 | 2024-08-09 |
Proteomics and single-cell RNA analysis of Akap4-knockout mice model confirm indispensable role of Akap4 in spermatogenesis
2019-10-15, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2019.06.017
PMID:31255637
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9系统生成Akap4敲除小鼠模型，并利用蛋白质组学和单细胞RNA测序分析，证实了Akap4在精子发生中的不可或缺的作用 | 首次通过蛋白质组学和单细胞RNA测序技术，全面分析了Akap4敲除小鼠的精子形态、运动能力和生育能力的变化 | NA | 验证Akap4在精子发生中的作用 | Akap4敲除小鼠的精子形态、运动能力和生育能力 | NA | NA | CRISPR-Cas9系统，蛋白质组学，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据，单细胞RNA测序数据 | Akap4敲除小鼠和野生型小鼠 |
| 25991 | 2024-08-09 |
Matrix-metalloproteinase expression and gelatinase activity in the avian retina and their influence on Müller glia proliferation
2019-10, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2019.112984
PMID:31251936
|
研究论文 | 本研究探讨了兴奋性毒性损伤后鸟类视网膜中明胶酶活性的动态变化及其对Müller胶质细胞前体细胞形成的影响 | 首次揭示了MMP2在Müller胶质细胞向Müller胶质细胞前体细胞重编程中的作用 | NA | 研究明胶酶在视网膜再生中的作用 | 鸟类视网膜中的明胶酶活性和Müller胶质细胞前体细胞的形成 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及鸟类视网膜中的多种细胞类型，包括少突胶质细胞、非星形内视网膜胶质细胞（NIRG）、小胶质细胞、Müller胶质细胞（MG）等 |
| 25992 | 2024-08-09 |
CD166 Engagement Augments Mouse and Human Hematopoietic Progenitor Function via Activation of Stemness and Cell Cycle Pathways
2019-10, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3053
PMID:31260147
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研究论文 | 本文研究了CD166在鼠和人类造血祖细胞功能中的增强作用，通过激活干细胞和细胞周期通路 | 首次展示了CD166同型相互作用在体外增强鼠和人类造血祖细胞生成的能力，并通过单细胞RNA测序分析揭示了CD166参与激活多种信号通路 | NA | 探讨CD166在维持干细胞/祖细胞功能中的作用 | 鼠和人类的造血干细胞和祖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了来自野生型和CD166敲除小鼠的LSK细胞以及人脐带血CD34细胞 |
| 25993 | 2024-08-09 |
Nondestructive Identification and Accurate Isolation of Single Cells through a Chip with Raman Optical Tweezers
2019-08-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.9b01604
PMID:31251569
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研究论文 | 本文设计了一种利用拉曼光学镊子（ROT）的芯片，用于非破坏性地识别和精确隔离特定单个细胞 | 该平台能够进一步结合其他单细胞技术，如单细胞测序，成为一种多角度的单细胞分析方法 | NA | 开发一种新的芯片技术，用于单细胞的识别和隔离 | 胃癌细胞BGC823、红细胞、淋巴细胞等不同类型的细胞 | 生物技术 | 胃癌 | 拉曼光学镊子（ROT） | NA | 细胞 | 四种不同类型的细胞，包括胃癌细胞BGC823、红细胞、淋巴细胞等 |
| 25994 | 2024-08-09 |
De novo prediction of cell-type complexity in single-cell RNA-seq and tumor microenvironments
2019-08, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.201900443
PMID:31266885
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研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞RNA测序数据分析方法，用于无监督预测细胞类型复杂度和肿瘤微环境中的异质性深度 | 本文引入了一种结合非负矩阵分解和贝叶斯模型比较的方法，无需使用经验参数或间接质量指标即可直接评估样本中子群的数量 | NA | 开发一种新的算法，用于准确预测单细胞RNA测序数据中的细胞类型复杂度和肿瘤微环境中的异质性 | 单细胞RNA测序数据和肿瘤微环境中的细胞类型异质性 | 生物信息学 | 肿瘤学 | 非负矩阵分解 | 贝叶斯模型比较 | 单细胞RNA测序数据 | 包括模拟数据、初级血液单核细胞和胰腺细胞数据以及一系列单细胞肿瘤样本 |
| 25995 | 2024-08-09 |
Neutrophils Driving Unconventional T Cells Mediate Resistance against Murine Sarcomas and Selected Human Tumors
2019-07-11, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.05.047
PMID:31257026
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研究论文 | 本文通过遗传学方法和细胞转移技术，发现中性粒细胞在抵抗3-甲基胆蒽诱导的致癌作用中起关键作用，并与非典型αβ T细胞（UTC）的极化和I型免疫反应有关。 | 首次揭示了中性粒细胞在抵抗肿瘤中的关键作用，并通过批量和单细胞RNA测序分析了UTC的先天性特征和多样性。 | NA | 研究中性粒细胞在抵抗肿瘤中的作用及其机制。 | 中性粒细胞、非典型αβ T细胞（UTC）、3-甲基胆蒽诱导的致癌作用及选择性人类肿瘤。 | NA | 肿瘤 | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25996 | 2024-08-09 |
Identification of Genes With Enriched Expression in Early Developing Mouse Cone Photoreceptors
2019-07-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.19-26951
PMID:31260032
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研究论文 | 本文研究了小鼠早期发育的视锥光感受器中富集表达的基因 | 通过单细胞RNA测序技术，识别了在小鼠早期发育的视锥光感受器中富集表达的新基因 | NA | 旨在识别在小鼠胚胎视锥光感受器中差异表达的基因，以了解视锥和视杆光感受器的分化过程 | 小鼠早期发育的视锥光感受器中的基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和鸡的视网膜样本 |
| 25997 | 2024-08-09 |
Polled Digital Cell Sorter (p-DCS): Automatic identification of hematological cell types from single cell RNA-sequencing clusters
2019-Jul-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-019-2951-x
PMID:31262249
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Polled Digital Cell Sorter (p-DCS)的计算工具，用于自动识别单细胞RNA测序簇中的血液细胞类型 | 该工具使用投票算法自动识别细胞类型，无需专家手动解读，并能处理多个scRNA-seq数据集 | NA | 开发一种自动化的方法来识别单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的血液细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 投票算法 | 基因表达数据 | 8个骨髓样本 |
| 25998 | 2024-08-09 |
Recharacterizing Tumor-Infiltrating Lymphocytes by Single-Cell RNA Sequencing
2019-07, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-18-0658
PMID:31262773
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术重新表征肿瘤浸润淋巴细胞（TIL），特别是T细胞的异质性、克隆扩增、迁移和功能状态转换等基本特性 | 利用单细胞测序技术深入分析肿瘤内免疫细胞，特别是T细胞亚群的详细特性，并探讨了新的T细胞标志物在治疗或预后中的潜力 | NA | 深入理解肿瘤浸润淋巴细胞的异质性和功能状态转换 | 肿瘤浸润淋巴细胞，特别是T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 25999 | 2024-08-09 |
Obesity remodels activity and transcriptional state of a lateral hypothalamic brake on feeding
2019-06-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aax1184
PMID:31249056
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研究论文 | 本文通过高吞吐量的单细胞RNA测序和纵向体内双光子钙成像技术，研究了肥胖小鼠模型中侧下丘脑区域（LHA）的功能改变，该区域是调节进食的高度保守脑区。 | 首次揭示了肥胖如何影响侧下丘脑区域（LHA）的谷氨酸能神经元的转录谱和功能，以及这种改变如何促进过度进食和肥胖。 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的研究来验证这些发现是否适用于人类。 | 探讨肥胖如何通过神经适应性改变侧下丘脑区域（LHA）的功能，从而影响进食行为。 | 侧下丘脑区域（LHA）的谷氨酸能神经元及其在肥胖状态下的功能和转录状态。 | 神经科学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序，双光子钙成像 | NA | 转录组数据，钙成像数据 | 小鼠模型 |
| 26000 | 2024-08-09 |
Developmental kinetics and transcriptome dynamics of stem cell specification in the spermatogenic lineage
2019-06-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-10596-0
PMID:31243281
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研究论文 | 本文通过多转基因报告小鼠模型、单细胞RNA测序和移植分析，研究了哺乳动物精子发生系中干细胞特化的发育动力学和转录组动态 | 揭示了从胎儿期前体细胞到新生儿期精原细胞的异质性前体细胞群在晚期胎儿和新生儿发育期间的动态变化，并证明了胎儿期前体细胞中存在预编程的干细胞命运 | NA | 定义从前体细胞到精原干细胞的轨迹 | 哺乳动物精子发生系中的干细胞特化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 多转基因报告小鼠模型 |