单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
25981 2024-08-09
Single-Cell Transcriptomic Analyses of Cell Fate Transitions during Human Cardiac Reprogramming
2019-07-03, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,探讨了人类心脏细胞重编程过程中的细胞命运转变 开发了一种包含数据标准化方法、多种轨迹预测算法和细胞命运指数计算的分析流程,用于测量重编程进展 NA 研究细胞可塑性和细胞命运决定的机制 人类心脏细胞的重编程过程 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA
25982 2024-08-09
α2-Chimaerin is essential for neural stem cell homeostasis in mouse adult neurogenesis
2019-07-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文研究了α2-chimaerin在成年小鼠海马神经发生中对神经干细胞(NSC)稳态的必要性 首次报道了α2-chimaerin在成年海马神经发生中对NSC稳态的关键作用 NA 探讨α2-chimaerin在成年海马神经发生中对NSC稳态的作用 α2-chimaerin在成年小鼠海马神经发生中的作用 NA NA 单细胞RNA测序和伪时间分析 NA RNA α2-chimaerin条件性敲除(α2-CKO)小鼠
25983 2024-08-09
Myc and Dnmt1 impede the pluripotent to totipotent state transition in embryonic stem cells
2019-07, Nature cell biology IF:17.3Q1
研究论文 本研究探讨了胚胎干细胞从多能状态向全能状态转变的机制 首次揭示了Myc和Dnmt1在阻止胚胎干细胞从多能状态向全能状态转变中的作用 NA 理解胚胎干细胞从多能状态向全能状态转变的过程 胚胎干细胞 NA NA 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9 NA RNA 小部分细胞
25984 2024-08-09
A cellular census of human lungs identifies novel cell states in health and in asthma
2019-07, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本文利用单细胞转录组学技术,对健康和哮喘患者的人类肺部进行了细胞图谱绘制,识别了新的细胞状态 报道了位置依赖性的气道上皮细胞状态和一种新的组织驻留记忆T细胞亚群,以及哮喘患者下呼吸道中的粘液细胞增生和杯状细胞增生 NA 通过单细胞转录组学技术,揭示健康和哮喘肺部细胞的差异 人类肺部的上、下呼吸道和肺实质细胞 数字病理学 哮喘 单细胞转录组学 NA 转录组 健康肺部和哮喘肺部的多个样本
25985 2024-08-09
Sensory lesioning induces microglial synapse elimination via ADAM10 and fractalkine signaling
2019-07, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本文研究了胡须损伤通过ADAM10和fractalkine信号通路诱导小胶质细胞介导的突触消除 首次揭示了神经元到小胶质细胞的信号传导在皮质突触重塑中的必要性,并展示了上下文依赖的免疫机制在哺乳动物大脑中重塑突触的利用 NA 探究小胶质细胞如何响应神经活动和炎症变化来调节突触连接 小胶质细胞介导的突触消除及其分子机制 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠
25986 2024-08-09
Single-cell RNA-seq reveals TOX as a key regulator of CD8+ T cell persistence in chronic infection
2019-07, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过比较急性与慢性病毒感染下CD8 T细胞的单细胞转录组和表观遗传学特征,揭示了TOX作为关键调节因子在慢性感染中维持CD8+ T细胞持久性的作用 发现TOX在祖细胞样CD8 T细胞中表现出更高的转录活性,并与更多的活跃组蛋白标记相关,促进了抗病毒CD8 T细胞的持久性 NA 探究TOX在慢性病毒感染中对CD8+ T细胞持久性的调控作用 CD8 T细胞在急性与慢性病毒感染中的单细胞转录组和表观遗传学特征 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
25987 2024-08-09
The immune cell landscape in kidneys of patients with lupus nephritis
2019-07, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析了狼疮性肾炎患者和健康对照者的肾脏样本,揭示了21种在疾病中活跃的白细胞亚群 首次详细描述了狼疮性肾炎患者肾脏中多种免疫细胞亚群的活性和反应,包括促炎和抗炎反应 NA 开发狼疮性肾炎的疾病机制假设 狼疮性肾炎患者和健康对照者的肾脏样本 数字病理学 自身免疫疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 多个狼疮性肾炎患者和健康对照者的肾脏样本
25988 2024-08-09
Navigating the Depths and Avoiding the Shallows of Pancreatic Islet Cell Transcriptomes
2019-07, Diabetes IF:6.2Q1
观点 本文评估了单细胞RNA测序(scRNA-Seq)在提高我们对β细胞异质性理解方面的能力,并探讨了单细胞分辨率下基因表达检测的局限性及其对单胰岛细胞转录组数据质量的影响 采用单细胞RNA测序技术,揭示了人类和鼠类β细胞的显著异质性 单细胞分辨率下基因表达检测的局限性可能影响单胰岛细胞转录组数据的质量 评估单细胞RNA测序在理解β细胞异质性方面的应用及其局限性 人类β细胞的转录组数据 基因组学 糖尿病 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 转录组数据 多个单人类β细胞转录组数据集
25989 2024-08-09
Single-cell sequencing of neonatal uterus reveals an Misr2+ endometrial progenitor indispensable for fertility
2019-06-24, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了Misr2+细胞在新生小鼠子宫中的持久性及其对生育能力的影响 首次揭示了新生小鼠子宫中Misr2+细胞的持久性及其在生育中的关键作用 研究主要集中在小鼠模型上,对人类的具体影响尚需进一步研究 探究Misr2+细胞在新生子宫发育中的作用及其对生育能力的影响 新生小鼠和人类的子宫中的Misr2+细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 具体样本数量未在摘要中提及
25990 2024-08-09
Integrative inference of subclonal tumour evolution from single-cell and bulk sequencing data
2019-06-21, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了B-SCITE方法,该方法首次从单细胞和批量测序数据中推断肿瘤的亚克隆进化 B-SCITE是首个结合单细胞和批量测序数据来推断肿瘤谱系的方法,其在树重建精度和亚克隆识别方面优于现有方法 NA 理解肿瘤的克隆结构和进化历史,以克服由于耐药细胞群导致的治疗失败 肿瘤的亚克隆进化 数字病理学 NA 单细胞测序和批量测序 NA 单细胞和批量测序数据 数量适中的单细胞样本和受拷贝数变化影响的批量等位基因频率数据
25991 2024-08-09
Fcmr regulates mononuclear phagocyte control of anti-tumor immunity
2019-06-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文研究了Fcmr(Toso)在调节髓系细胞对肿瘤免疫控制中的作用 首次展示了Fcmr在调节髓系细胞对肿瘤免疫反应中的作用,并发现Fcmr缺陷增强了抗肿瘤免疫 NA 探究Fcmr在肿瘤微环境中对髓系细胞功能的调节作用 Fcmr在髓系细胞中的作用及其对肿瘤免疫的影响 NA 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA RNA NA
25992 2024-08-09
Single-Cell Transcriptomics Identifies the Adaptation of Scart1+ Vγ6+ T Cells to Skin Residency as Activated Effector Cells
2019-06-18, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组测序技术,揭示了IL-17产生型Vγ6 T细胞在皮肤中的组织特异性适应及其作为效应细胞的持久性 首次通过单细胞RNA测序技术,识别出IL-17产生型Vγ6 T细胞在皮肤中的高度同质性Scart1群体,并揭示了其在皮肤中的组织特异性基因表达特征 NA 探讨IL-17产生型γδ T细胞在不同组织间的交换及其组织特异性适应机制 IL-17产生型Vγ6 T细胞及其在皮肤中的适应性 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 具体样本数量未在摘要中提及
25993 2024-08-09
Multiplex RNA single molecule FISH of inducible mRNAs in single yeast cells
2019-06-17, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 研究使用RNA单分子荧光原位杂交(smFISH)技术,在单个酵母细胞中定量分析STL1和CTT1 mRNA在盐胁迫下的动力学表达。 smFISH技术相比单细胞测序提供了更准确的RNA水平量化,并能直接观察转录本的亚细胞定位。 NA 探索smFISH分析如何生成改进的基因表达模型,并研究转录调控的基本过程。 STL1和CTT1 mRNA在单个酿酒酵母细胞中的动力学表达。 分子生物学 NA RNA单分子荧光原位杂交(smFISH) NA 图像 单个酿酒酵母细胞
25994 2024-08-09
Single-Cell Sequencing in Precision Medicine
2019, Cancer treatment and research
研究论文 本文探讨了单细胞测序技术在精准医学中的应用及其对癌症研究和治疗的影响 单细胞基因组学是一个新兴领域,它增强了我们对癌症复杂生物系统中细胞遗传多样性的理解 NA 探索单细胞测序技术在精准癌症治疗中的应用潜力 癌症细胞的基因表达、DNA变异、表观遗传状态和核结构 数字病理学 癌症 下一代测序 NA 基因组数据 单个细胞
25995 2024-08-09
DECENT: differential expression with capture efficiency adjustmeNT for single-cell RNA-seq data
2019-12-15, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一种名为DECENT的方法,用于单细胞RNA-seq数据的差异表达分析,该方法明确且准确地模拟了单细胞RNA-seq实验中的分子捕获过程 DECENT方法在差异表达分析中明确地模拟了dropout事件,相较于不明确模拟dropout的现有方法,显示出改进的性能 NA 开发一种新的方法来提高单细胞RNA-seq数据差异表达分析的准确性 单细胞RNA-seq数据的差异表达分析 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq NA RNA-seq数据 多个公共单细胞RNA-seq数据集
25996 2024-08-09
Large scale control and programming of gene expression using CRISPR
2019-12, Seminars in cell & developmental biology IF:6.2Q1
综述 本文综述了CRISPR-Cas9技术在大规模基因扰动研究中的应用,包括单基因和多基因敲除、敲低、敲高库及其相关筛选方法,并特别强调了这些方法与单细胞转录组学方法的结合,以及在构建合成回路控制细胞状态中的应用。 CRISPR-Cas9技术因其高特异性、兼容多种生物以及设计灵活性而超越了其他基因调控系统。 NA 探讨CRISPR-Cas9技术在大规模基因表达控制和生物响应重编程中的应用。 CRISPR-Cas9技术及其在基因扰动研究和细胞状态控制中的应用。 基因工程 NA CRISPR-Cas9 NA 基因表达数据 NA
25997 2024-08-09
RNA-based diagnostic and therapeutic strategies for cardiovascular disease
2019-11, Nature reviews. Cardiology
综述 本文综述了基于RNA的诊断和治疗策略在心血管疾病中的应用 介绍了下一代测序技术、功能性高通量RNA筛选和单细胞测序技术在筛选心血管疾病诊断和治疗RNA候选物中的应用 许多非编码RNA尚未被功能性注释,限制了潜在RNA诊断和治疗目标的数量 总结和探讨基于RNA的诊断和治疗策略在心血管疾病中的应用和潜力 非编码RNA如microRNAs、长非编码RNA和环状RNA在心血管疾病中的诊断和治疗潜力 NA 心血管疾病 下一代测序技术 NA RNA NA
25998 2024-08-09
Single-cell transcriptomics reveals the landscape of intra-tumoral heterogeneity and stemness-related subpopulations in liver cancer
2019-09-10, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了肝癌内部异质性和与干细胞特性相关的亚群 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了肝癌内部的异质性,并识别出可能与干细胞特性相关的新亚克隆 研究主要集中在体外和裸鼠模型中,需要进一步的临床验证 探索肝癌内部的异质性及其与干细胞特性相关亚群的关系 肝癌细胞及其亚群 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 具体样本数量未在摘要中明确
25999 2024-08-09
Detachable Acoustophoretic System for Fluorescence-Activated Sorting at the Single-Droplet Level
2019-08-06, Analytical chemistry IF:6.7Q1
研究论文 本文介绍了一种新型荧光激活液滴分选系统,利用高聚焦表面声波实现单细胞液滴的高精度、高产量分离 该系统采用可拆卸的声波分选技术,通过微柱波导结构将声波局部耦合到微流控通道中,实现了单细胞液滴的快速准确分离,并避免了交叉污染 NA 开发一种能够高效、高精度分离单细胞液滴的新技术,以满足高通量分析的需求 单细胞液滴的分选 微流控技术 NA 表面声波(HFSAW) NA 液滴 三种不同封装内容的单细胞液滴,分选速率约为1 kHz,纯度高于90%
26000 2024-08-09
Cross-Species Single-Cell Analysis of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Reveals Antigen-Presenting Cancer-Associated Fibroblasts
2019-08, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本文通过跨物种的单细胞RNA测序分析,深入研究了人鼠胰腺导管腺癌中的肿瘤相关成纤维细胞(CAF)及其在肿瘤微环境中的作用 本文发现并定义了一类新的表达MHC II类分子和CD74的CAF亚型,即抗原呈递CAF,这些细胞能够在模型系统中以抗原特异性的方式激活CD4 T细胞 NA 研究胰腺导管腺癌中肿瘤相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤免疫和进展中的作用 人鼠胰腺导管腺癌中的肿瘤相关成纤维细胞及其亚型 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及人和鼠的胰腺导管腺癌肿瘤样本
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