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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2581 | 2026-04-30 |
Dynamic and cell-type specific transcriptional reprogramming underlies the floral transition in the maize shoot apical meristem
2026-Mar-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04033-x
PMID:41851888
|
研究论文 | 通过整合时间序列批量RNA-seq、单细胞转录组学、染色质可及性和转录因子结合谱,构建玉米茎尖分生组织花转变的时空分子框架,揭示动态和细胞类型特异性转录重编程机制 | 首次构建了玉米花转变的完整时空调控框架,发现花转变并非由统一的转录开关驱动,而是源自空间上不同的茎尖分生组织区域的协同作用,并鉴定出ZmMADS69-ZmRap2.7-ZMM4调控模块以及UNBRANCHED2和UNBRANCHED3在促进花转变中的新角色 | 未明确提及局限性 | 研究玉米茎尖分生组织在花转变过程中的转录重编程和细胞身份变化的分子机制 | 玉米茎尖分生组织 | 机器学习 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞转录组学, 染色质可及性分析, 转录因子结合谱分析 | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据 | 时间序列样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2582 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA sequencing uncovers neutrophil clusters associated with autoimmune neuroinflammation
2026-Mar-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03772-9
PMID:41851894
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2583 | 2026-03-19 |
A differential single-cell transcriptome atlas of left-sided and right-sided colorectal cancer
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04789-5
PMID:41844817
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2584 | 2026-03-19 |
Identification of TRPM4 related genes in LUAD by RNA seq and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04797-5
PMID:41845138
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2585 | 2026-04-28 |
Artificial intelligence-assisted spatial omics-based biomimetic nanoplatform for intelligent and precise intervention in the immunosuppressive core region of ovarian cancer
2026-Mar-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01345-w
PMID:41814059
|
综述 | 综述了人工智能辅助的空间组学基于仿生纳米平台用于卵巢癌免疫抑制核心区域的智能精准干预 | 提出人工智能辅助的闭环治疗框架,整合识别、递送和反馈,实现个性化精准免疫治疗,并系统梳理了空间组学鉴定免疫抑制核心区域的方法 | 空间图谱标准化、递送系统稳定性和跨平台兼容性仍需进一步技术突破 | 实现卵巢癌免疫抑制核心区域的智能精准干预 | 卵巢癌免疫抑制肿瘤微环境中的核心区域,包括调节性T细胞、肿瘤相关巨噬细胞和髓源性抑制细胞构成的“排斥结构” | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞组学, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2586 | 2026-04-30 |
Inhibiting KDM6A Phosphorylation Suppresses Glycolysis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2026-Mar, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70142
PMID:41251278
|
研究论文 | 揭示KDM6A磷酸化在口腔鳞状细胞癌中调控糖酵解的机制 | 首次发现KDM6A Ser829位点磷酸化可作为E3泛素连接酶FBXW7的底物,并利用条件性敲入小鼠模型结合单细胞RNA测序阐明其对糖酵解的调控作用 | 未提及,但一般可能包括:机制验证仅在小鼠模型中进行,未在人类样本中确认;4NQO诱导的OSCC模型可能不能完全模拟人类疾病 | 探究KDM6A翻译后修饰在口腔鳞状细胞癌糖酵解调控中的作用 | KDM6A蛋白、FBXW7泛素连接酶、小鼠舌组织及口腔鳞状细胞癌细胞 | 分子生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | Co-IP(免疫共沉淀)、免疫印迹、条件性基因敲入、单细胞RNA测序、4NQO诱导OSCC模型、免疫荧光成像 | NA | 测序数据(scRNA-Seq)、免疫荧光图像 | Kdm6a S829A条件性敲入小鼠(多个)及野生型对照小鼠;具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2587 | 2026-03-31 |
Single-cell RNA sequencing-guided drug discovery to alleviate radiotherapy-induced esophageal toxicity
2026-Mar, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.12.038
PMID:41909731
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2588 | 2026-04-30 |
Benchmarking cell-type-specific spatially variable gene detection methods
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag190
PMID:42041225
|
研究论文 | 系统评估了六种最新的细胞类型特异性空间可变基因检测方法的性能,包括一致性、预测性能、旋转鲁棒性、可扩展性和生物学可解释性 | 首次全面比较多种ctSVG检测方法,涵盖46个真实数据集和大量模拟数据集,揭示了方法间的互补性和性能差异 | 旋转不变性问题仍需进一步研究,Celina方法易受非目标细胞类型影响产生假信号 | 评估和比较细胞类型特异性空间可变基因检测方法,为工具选择和算法开发提供指导 | 六种ctSVG检测方法(STANCE、Celina、C-SIDE、spVC、ctSVG、CTSV) | 数字病理学 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组数据 | 46个真实数据集及多种模拟数据集 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 2589 | 2026-04-30 |
Longitudinal in vivo human wound healing model defines key role for smooth muscle cells in ECM remodeling
2026-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.24.707845
PMID:42051305
|
研究论文 | 通过纵向体内人体伤口愈合模型,定义平滑肌细胞在细胞外基质重塑中的关键作用 | 首次利用纵向体内人体数据,结合单细胞和空间转录组学,揭示血管平滑肌细胞在伤口愈合重塑阶段的主导作用,并鉴定TIMP1作为关键调控因子 | 未提及具体局限性 | 明确血管平滑肌细胞在人体伤口愈合中的调控机制,特别是与细胞外基质重塑相关的信号活动 | 健康志愿者的皮肤伤口组织以及糖尿病足溃疡患者的非愈合伤口组织 | 数字病理学, 机器学习 | 伤口愈合, 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | 健康志愿者(具体数量未提及),糖尿病足溃疡患者(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 2590 | 2026-04-30 |
ADT-030, a novel PDE10 inhibitor, demonstrates potent antitumor activity in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.11.705411
PMID:41726934
|
研究论文 | 研究了新型PDE10抑制剂ADT-030在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤活性及其机制 | 首次发现PDE10抑制剂ADT-030能有效抑制KRAS突变PDAC细胞增殖并通过诱导G2/M期阻滞和凋亡发挥抗肿瘤作用,且对KRAS抑制剂耐药细胞也有活性 | 未提及具体局限性 | 评估新型PDE10抑制剂ADT-030在胰腺导管腺癌中的治疗潜力 | KRAS突变胰腺导管腺癌细胞系及动物模型 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含同源移植和患者来源异种移植模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序分析肿瘤微环境重编程 |
| 2591 | 2026-04-30 |
The glia-immune network: Astrocytes and oligodendrocytes as microglial co-ordinators in health and disease
2026-02, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287015
PMID:40492604
|
综述 | 探讨星形胶质细胞和少突胶质细胞作为小胶质细胞协调者在健康和疾病中构成的胶质细胞免疫网络 | 提出大胶质细胞(星形胶质细胞、少突胶质细胞)应被视为中枢神经系统免疫系统的主动组分,形成胶质细胞特异性的免疫样网络,并协调多种中枢神经系统效应 | 基于现有文献综述,缺乏直接实验验证,且主要聚焦于阿尔茨海默病,对其他神经病理学适用性尚未充分探讨 | 综述大胶质细胞来源的免疫信号及其在健康和疾病中的相关性,特别是在阿尔茨海默病病理中的分子对话 | 大胶质细胞(星形胶质细胞和少突胶质细胞)以及小胶质细胞 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 用于分析健康和疾病状态下细胞谱系的单细胞转录组学技术 |
| 2592 | 2026-02-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals disease associated changes in brain endothelial cells in the 5XFAD mouse
2026-Jan-30, Fluids and barriers of the CNS
IF:5.9Q1
DOI:10.1186/s12987-026-00766-w
PMID:41618410
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2593 | 2026-04-30 |
Differential Hes1 activation defines neural stem cell lineage commitment and niche maintenance in embryonic and adult mouse cortex
2026-Jan-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2511800123
PMID:41557790
|
research paper | 利用单细胞转录组学和条件敲除小鼠模型,研究Hes1差异激活在胚胎和成年小鼠皮层神经干细胞谱系特化及生态位维持中的作用 | 首次区分了Notch非依赖性表达Hes1的神经干细胞与Notch依赖性表达的放射状胶质细胞,并证明了NIHes1神经干细胞是产生其他神经前体细胞的祖先前体细胞 | 未明确提及具体限制 | 阐明Hes1差异激活在神经干细胞谱系特化和生态位维持中的功能和机制 | 小鼠胚胎和成年皮层神经干细胞/祖细胞 | machine learning | NA | 单细胞转录组学, 条件敲除小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 胚胎和成年小鼠皮层样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2594 | 2026-04-30 |
EGFR-mutant transformed small cell lung cancer harbors intratumoral heterogeneity targetable with MEK inhibitor combination therapy
2026-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197008
PMID:41574603
|
研究论文 | 通过对EGFR突变小细胞肺癌转化患者的恶性胸腔积液进行单细胞RNA测序,发现肿瘤内存在可被MEK抑制剂联合疗法靶向的异质性 | 首次揭示EGFR突变小细胞肺癌由不同细胞状态混合组成,并发现非NE细胞对MEK抑制剂具有选择性敏感性,为靶向肿瘤异质性提供了新治疗策略 | 仅基于少量患者的胸水样本,需要更大样本量和更多模型验证;EZH2调控EGFR表达的机制及临床转化潜力需进一步研究 | 探究EGFR突变小细胞肺癌转化中的肿瘤异质性及其治疗靶点 | EGFR突变小细胞肺癌转化患者的恶性胸腔积液及患者来源细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 多例EGFR突变小细胞肺癌转化患者的恶性胸腔积液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 2595 | 2026-04-30 |
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191990
PMID:41480746
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析甲状腺癌进展,识别出预后相关的成纤维细胞亚群 | 首次整合单细胞与空间转录组学,在儿童与成人混合样本中揭示甲状腺癌进展的空间图谱,并鉴定出与预后不良相关的POSTN+肌成纤维细胞癌相关成纤维细胞亚群 | 未明确提及,可能包括样本量限制或功能验证不足 | 解析甲状腺癌在儿童与成人中的演化机制,并识别具有预后价值的细胞亚群 | 甲状腺癌样本(包括分化型甲状腺癌、间变性甲状腺癌及儿童弥漫硬化型甲状腺癌)中的细胞群体 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | 81个样本中的423,733个细胞的单细胞转录组,28个肿瘤的空间转录组,5个大型批量RNA测序队列 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium(推断), 10x Visium(推断) | NA |
| 2596 | 2026-04-30 |
Identification of a distinctive gene signature associated with disease activity in granulomatous myositis
2026-01-08, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf543
PMID:41132132
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研究论文 | 通过全转录组分析确定肉芽肿性肌炎疾病活动相关的特征基因标志 | 首次系统鉴定出肉芽肿性肌炎的特异性转录组特征(1293个上调基因和256个下调基因),并发现CHIT1基因表达与疾病严重程度强相关 | NA | 阐明肉芽肿性肌炎的病理生理机制,通过定义其特异性转录组特征 | 肉芽肿性肌炎患者及其它肌病患者和健康对照者的肌肉活检样本 | 转录组学 | 肉芽肿性肌炎 | RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组化 | 支持向量机 | 转录组数据 | 722例肌肉活检样本(包括38例GM患者) | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2597 | 2026-04-30 |
Indomethacin exerts both cyclooxygenase inhibition-dependent and independent mechanisms to enhance chemo-immunotherapy in mice
2026-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698231
PMID:41542639
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研究论文 | 该论文研究了吲哚美辛通过COX抑制依赖和非依赖两种机制增强化疗联合免疫治疗在小鼠模型中的抗肿瘤效果 | 首次揭示吲哚美辛不仅通过抑制COX/PGE2通路增强化疗效果,还能通过抑制肿瘤内在的RAS信号通路发挥COX非依赖的联合增强作用 | 研究仅在小鼠肿瘤模型中进行,缺乏临床试验验证;且对不同肿瘤类型间的效果差异机制尚未完全阐明 | 探究吲哚美辛联合环磷酰胺化疗在多种小鼠肿瘤模型中的抗肿瘤效应及其免疫机制 | CT26、MC38、4T1、A20等多种小鼠肿瘤模型 | 免疫肿瘤学 | 多种癌症(结直肠癌、乳腺癌等) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠肿瘤模型(CT26、MC38、4T1、A20) | 10x Genomics | 单细胞转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 2598 | 2026-04-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptional profiles of endometrial epithelial remodeling and identifies candidate genes regulating glandular cell development in Chinese Meishan pigs
2026-Jan-08, Journal of animal science
IF:2.7Q1
DOI:10.1093/jas/skag041
PMID:41808446
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析梅山猪子宫内膜上皮细胞在发情周期中的转录组图谱及腺体细胞发育调控基因 | 首次构建梅山猪子宫内膜上皮在卵泡期和黄体期的单细胞转录组图谱,鉴定出ALDH1A3+LGR5+干细胞和ALDH1A1+祖细胞亚群,并揭示从干细胞经祖细胞向腺上皮的连续分化轨迹及关键转录因子 | 仅基于梅山猪品种,且未涉及功能验证实验来确认候选转录因子对腺体发育的直接调控作用 | 揭示猪子宫内膜上皮细胞在发情周期中的异质性和分化轨迹,并鉴定调控腺体细胞发育的关键基因 | 梅山猪子宫内膜上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3 |
| 2599 | 2026-04-30 |
The single-cell landscape of the human vein after arteriovenous fistula creation and implications for maturation failure
2026-Jan, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.024
PMID:40992573
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术绘制动静脉瘘形成前后人静脉的单细胞图谱,揭示瘘管成熟失败的细胞和分子机制 | 首次在单细胞水平系统描绘人静脉在动静脉瘘形成后的细胞动态变化,发现巨噬细胞源性骨桥蛋白是驱动瘘管失败的关键旁分泌信号,并揭示Myddosome信号复合物、促炎性血管滋养管内皮细胞及过度活化的成纤维细胞在瘘管失败中的新作用 | 样本量相对有限(23例组织活检和20例单细胞样本),且未对不同种族或合并症患者进行分层分析 | 阐明动静脉瘘成熟过程的生物学机制,找出导致瘘管成熟失败的潜在治疗靶点 | 接受血液透析患者的动静脉瘘组织样本(包括术前静脉、早期切除标本、成熟及失败的瘘管) | 单细胞组学 | 肾病相关血管病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 23例组织活检标本和20例患者的70281个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2600 | 2026-04-30 |
Mechanisms of immune escape and extramedullary tropism in leukemia cutis
2026-Jan-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029121
PMID:41026928
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研究论文 | 对10例皮肤和皮下组织孤立性髓外病变患者的23份白血病皮肤活检样本进行bulk和单细胞转录组分析,揭示急性髓系白血病髓外浸润的免疫逃逸机制和趋向性 | 首次对白血病皮肤进行bulk和单细胞转录组测序,揭示了髓外AML中T细胞耗竭、HLA II类分子下调及8个归巢受体分子的表达差异,为治疗靶点提供新线索 | 样本量较小(10例患者,23份活检),且缺乏功能验证实验 | 探究急性髓系白血病髓外浸润(特别是皮肤)的免疫微环境和白血病表型机制 | 10例伴发孤立性皮肤和皮下组织髓外病变的急性髓系白血病患者的白血病皮肤活检样本 | 转录组学 | 急性髓系白血病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 10例患者,23份白血病皮肤活检样本,7份骨髓复发样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |