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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2581 | 2025-10-06 |
The extracellular-matrix-remodeling capability exposes therapeutic vulnerability in a subset of renal cell carcinomas with tumor thrombi
2025-Aug-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.010
PMID:40774251
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肾细胞癌伴癌栓中细胞外基质重塑能力与治疗脆弱性的关系 | 首次识别出两种临床相关的RCC-TT亚型,发现预后不良亚型(TT1)具有由上皮LOX表达驱动的增强ECM重塑特征 | 样本量相对有限(164例),需要进一步验证LOX抑制治疗的临床效果 | 探索肾细胞癌伴癌栓的治疗抵抗机制并寻找新的治疗靶点 | 164例肾细胞癌伴癌栓患者样本 | 数字病理 | 肾细胞癌 | 空间转录组学, 多重免疫荧光染色, 多组学分析 | NA | 多组学数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 164例RCC-TT患者 | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
2582 | 2025-10-06 |
RNA m6A Methylation Regulates CDH6 to Promote Epithelial-to-Mesenchymal Transition in Cholangiocytes of Biliary Atresia
2025-Aug-05, Journal of pediatric surgery
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.jpedsurg.2025.162492
PMID:40774478
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研究论文 | 本研究探讨了m6A甲基化通过调控CDH6表达促进胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化的机制 | 首次揭示METTL3介导的m6A低甲基化通过YTHDF2稳定CDH6转录本促进胆管细胞EMT的新机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探索m6A修饰在胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化中的作用机制 | 胆道闭锁患者的胆管细胞 | 单细胞测序分析 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序, RNA测序, RNA免疫沉淀, 免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据, 图像数据 | 公开单细胞数据集HRA003163及体外培养的胆管细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
2583 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome sequencing (scRNA-seq) reveals dynamic gene expression trajectories regulating vascular cell senescence in Hylocereus undatus
2025-Aug-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149718
PMID:40774524
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了火龙果采后维管细胞衰老过程中的基因表达动态变化 | 首次在火龙果中构建单细胞图谱,识别维管细胞衰老的关键调控因子HuCEP和HuSCPL48,并发现物质运输和能量代谢相关基因的显著上调 | 研究仅聚焦于火龙果果皮组织,未涉及其他水果或植物器官的验证 | 探索火龙果采后维管细胞衰老的分子机制 | 火龙果(Hylocereus undatus)果皮组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | SCODE | 单细胞RNA测序数据 | 13个细胞簇,其中维管细胞主要位于簇10 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2584 | 2025-10-06 |
Spatial Analysis of Hereditary Diffuse Gastric Cancer Reveals Indolent Phenotype of Signet Ring Cell Precursors
2025-Aug-04, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-1039
PMID:40192595
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序分析遗传性弥漫性胃癌中印戒细胞前体病变的分子表型特征 | 首次揭示遗传性弥漫性胃癌中印戒细胞前体病变具有惰性表型特征,缺乏已知胃癌驱动基因突变 | 样本量较小(20例),仅针对CDH1变异携带者 | 阐明早期印戒细胞病变与晚期弥漫性胃癌的分子差异 | CDH1胚系变异携带者的全胃切除标本 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 基因表达数据 | 20例人全胃切除标本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2585 | 2025-10-06 |
Local inflammation at the salmon louse (Lepeophtheirus salmonis) attachment site contributes to copepodid rejection in coho salmon (Oncorhynchus kisutch)
2025-Aug, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-025-03976-0
PMID:40464919
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研究论文 | 本研究比较了四种鲑鱼对鲑鱼虱的易感性,并分析了银鲑和大西洋鲑在寄生虫附着部位的细胞反应差异 | 首次结合组织学、蛋白质组学和空间转录组学分析鲑鱼对寄生虫的局部炎症反应机制 | 仅在前两次试验中未能成功感染所有物种,可能影响结果的一致性 | 探究不同鲑鱼物种对鲑鱼虱的易感性及宿主防御机制 | 大西洋鲑和太平洋鲑物种(粉鲑、银鲑和奇努克鲑) | 寄生虫学 | 寄生虫感染 | 组织学分析、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 组织样本、蛋白质数据、基因表达数据 | 四种鲑鱼物种在感染后12、24、36、48、60和168小时采集的皮肤和鳍样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2586 | 2025-10-06 |
Inflammatory monocyte-derived amphiregulin mediates intestinal fibrosis in Crohn's disease by activating PI3K/AKT
2025-Aug, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.05.008
PMID:40480418
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研究论文 | 本研究揭示了炎症性单核细胞来源的双调蛋白通过激活PI3K/AKT通路促进克罗恩病肠道纤维化的机制 | 首次阐明炎症性单核细胞来源的AREG通过PI3K/AKT通路驱动肠道纤维化的具体分子机制 | 动物模型与人类疾病存在差异,需要进一步临床验证 | 阐明双调蛋白介导肠道纤维化的分子机制 | 克罗恩病患者组织标本、小鼠结肠炎模型、人肠道成纤维细胞 | 分子病理学 | 克罗恩病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 动物模型 | NA | 基因表达数据, 组织样本 | CD患者狭窄与非狭窄病变组织,肠憩室正常组织,野生型和Areg基因敲除小鼠 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2587 | 2025-10-06 |
Prediction and validation based on scRNA-seq: ETS2 targets CEBPB to mediate osteoclast differentiation in osteoarthritis progression
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145639
PMID:40602581
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现ETS2通过靶向CEBPB调控破骨细胞分化,从而影响骨关节炎进展 | 首次揭示ETS2作为关键转录因子通过靶向CEBPB调控破骨细胞分化在骨关节炎进展中的作用机制 | 研究主要基于小鼠DMM模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 识别驱动破骨细胞介导的骨关节炎进展的关键分子靶点并探索其潜在机制 | 破骨细胞、骨关节炎小鼠模型 | 单细胞基因组学 | 骨关节炎 | scRNA-seq, ATAC-seq, Cut&Tag, 体外扰动实验, 体内实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表观基因组数据 | DMM模型小鼠 | NA | single-cell RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
2588 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and PANDORA-seq reveal the pivotal role of piRNA in heat stress-induced testicular injury
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145674
PMID:40609925
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和PANDORA-seq技术揭示了piRNA在热应激诱导睾丸损伤中的关键作用 | 首次发现piRNA是热应激反应最敏感的小RNA,并鉴定出piR_021767作为精子发生障碍的关键调控因子 | 研究主要基于小鼠模型,在猪等哺乳动物中的验证仍需进一步研究 | 探究piRNA在热应激诱导睾丸损伤中的分子机制 | 猪精液质量数据和小鼠睾丸热应激模型 | 单细胞组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,PANDORA-seq,双荧光素酶报告实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,小RNA测序数据 | 23,385个猪数据点和小鼠睾丸热应激模型 | NA | 单细胞RNA测序,小RNA测序 | NA | NA |
2589 | 2025-10-06 |
Hypoxia-induced cellular responses in the gills of juvenile Eleutheronema tetradactylum: Insights from single-cell RNA sequencing
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145749
PMID:40617425
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术首次揭示了四指马鲅鳃组织在缺氧应激下的细胞异质性和分子响应机制 | 首次结合单细胞RNA测序、批量RNA测序和形态学评估,系统解析四指马鲅鳃组织在缺氧条件下的细胞异质性和分子响应机制 | 研究仅针对幼鱼鳃组织,未涉及其他组织或发育阶段;候选生物标志物的功能验证仍需进一步研究 | 阐明四指马鲅对缺氧应激的细胞和分子响应机制 | 四指马鲅幼鱼鳃组织 | 单细胞生物学 | 缺氧应激 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 苏木精-伊红染色, 透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据, 组织形态图像 | 幼鱼鳃组织样本(缺氧与常氧条件对比) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
2590 | 2025-10-06 |
Causal Association Between Immune Cell Traits and Risk of Multiple Malignant and Nonmalignant CNS Diseases: A Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptomic Analysis
2025-Aug, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.70632
PMID:40760788
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞转录组分析,揭示免疫细胞特征与多种中枢神经系统疾病的因果关系 | 首次大规模整合731种免疫细胞特征与13种脑部疾病,结合eQTL和单细胞RNA测序数据建立胶质母细胞瘤风险标志 | 研究结果可能受到人群特异性和数据来源的限制 | 阐明免疫细胞特征与中枢神经系统疾病的因果关系 | 731种免疫细胞特征与13种脑部疾病(包括胶质母细胞瘤、阿尔茨海默病、肌萎缩侧索硬化等) | 生物信息学 | 中枢神经系统疾病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 表达数量性状位点分析, 非负矩阵分解 | 孟德尔随机化模型, NMF | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2591 | 2025-10-06 |
New insights into interstitial cystitis/bladder pain syndrome at single-cell resolution
2025-Aug, BJUI compass
IF:1.6Q3
DOI:10.1002/bco2.70051
PMID:40765664
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综述 | 通过单细胞RNA测序技术对间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征的细胞异质性进行系统性综述 | 首次在单细胞分辨率水平系统揭示IC/BPS中膀胱细胞亚型的改变特征,发现TLR3-NR2F6信号通路异常、特定成纤维细胞亚型及HPV感染可能病因 | 基于已发表研究的二次分析,缺乏原始实验数据验证;物种间差异(人类与小鼠模型)尚未完全阐明 | 总结单细胞RNA测序在间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征研究中的最新发现 | 健康与IC/BPS患者的膀胱组织细胞,包括尿路上皮细胞、间质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2592 | 2025-10-06 |
CXCR4-Mediated Chemokine Signaling Orchestrates the Progression of Conjunctival Melanocytic Lesions
2025-Aug-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.11.23
PMID:40778698
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了CXCR4介导的趋化因子信号通路在结膜黑色素瘤恶性进展中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统描绘结膜黑色素病变微环境异质性,并证实CXCR4拮抗剂AMD3100通过抑制PI3K/Akt和MEK/ERK通路发挥抗肿瘤作用 | 样本量有限,需要更大规模研究验证临床转化潜力 | 阐明结膜良恶性黑色素病变的微环境差异及趋化因子信号在病变进展中的作用机制 | 结膜黑色素病变组织标本、PIG1黑色素细胞、结膜黑色素瘤细胞系(CRMM1, CRMM2, CM2005.1) | 数字病理学 | 结膜黑色素瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 蛋白质印迹法, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 组织图像数据 | 多个细胞系和未明确数量的组织标本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
2593 | 2025-10-06 |
Innate Immune Remodeling Drives Therapy Resistance via Macrophage-NK Cell Crosstalk
2025-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.22.666055
PMID:40777338
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了靶向治疗过程中肿瘤免疫微环境的动态演变,发现巨噬细胞-NK细胞相互作用是治疗耐药的关键机制 | 首次识别了治疗过程中的免疫转折点,发现独特的巨噬细胞亚群通过CCR2/5信号调控NK细胞招募,并证实Ptpn22抑制可恢复NK细胞浸润 | 主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限,需要更大规模临床研究确认 | 探究靶向治疗过程中肿瘤免疫微环境的动态变化及其对治疗耐药的影响 | 小鼠黑色素瘤模型、人类黑色素瘤和肺癌患者样本 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤, 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2594 | 2025-10-06 |
Programmable microparticles rewire CAR signaling to enable super-physiological expansion of human T cells in vitro
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.17.665438
PMID:40777491
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研究论文 | 利用可编程PLGA微粒重编程CAR信号通路,实现人类T细胞的超生理扩增 | 首次使用可编程微粒通过外部控制CAR信号通路,实现人类CAR-T细胞持续100天以上的超生理扩增 | 研究仅限于体外实验,尚未进行体内验证 | 探索如何通过外部编程最大化人类CAR-T细胞的增殖能力 | 人类CD8 CAR-T细胞 | 细胞工程 | NA | 单细胞测序,转录组分析 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
2595 | 2025-10-06 |
Disruption of E-cadherin in the airway led to dysplastic stressed cells and asthma-like phenotypes
2025-Jul-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.030
PMID:40683251
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研究论文 | 本研究通过破坏小鼠气道上皮细胞中的E-钙黏蛋白,揭示了其缺失导致细胞应激、增殖增加和哮喘样表型的机制 | 首次证明E-钙黏蛋白缺失可通过上皮细胞内在机制和上皮-免疫互导引发气道重塑,无需过敏原暴露 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究E-钙黏蛋白在气道上皮细胞命运决定和哮喘样表型形成中的作用机制 | 小鼠气道上皮祖细胞(club细胞)和终末分化纤毛细胞 | 单细胞生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量的小鼠气道组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2596 | 2025-10-06 |
Pan-cancer human brain metastases atlas at single-cell resolution
2025-Jul-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.025
PMID:40215980
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析构建泛癌种人类脑转移图谱,揭示脑转移的细胞特征和肿瘤微环境 | 首次在单细胞分辨率下构建跨癌种的脑转移综合图谱,识别出脑转移相关的恶性细胞元程序和五种不同的脑转移生态型 | 样本量相对有限,可能无法完全代表所有脑转移亚型 | 研究不同癌种脑转移的细胞状态特征和肿瘤微环境重塑 | 108例脑转移样本和111例原发肿瘤样本 | 单细胞基因组学 | 脑转移癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 219个样本(108个脑转移,111个原发肿瘤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2597 | 2025-10-06 |
Gland- and cell-level heterogeneity in the prostate: A narrative review of related diseases
2025-Jul, Current urology
IF:0.9Q4
DOI:10.1097/CU9.0000000000000269
PMID:40765528
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综述 | 本文综述了前列腺腺体和细胞水平异质性与相关疾病的关系 | 系统阐述了前列腺不同区域细胞类型分布异质性及其对疾病分布的影响,提出了club/hillock细胞的干细胞特性和免疫细胞诱导的炎症环境对疾病机制的新解释 | 当前研究尚无法精确回答前列腺异质性的具体机制问题 | 探讨前列腺腺体和细胞水平异质性及其与疾病分布的关系 | 前列腺组织、良性前列腺增生(BPH)、前列腺癌(PCa) | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序技术、分子组学研究 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
2598 | 2025-10-06 |
Mosaic loss of chromosome Y in blood is associated with male susceptibility for idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Jun-28, Communications medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1038/s43856-025-00966-9
PMID:40581694
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研究论文 | 本研究探讨血液中Y染色体嵌合缺失与男性特发性肺纤维化易感性之间的关联 | 首次在人类中证实Y染色体嵌合缺失通过上调促纤维化基因和增强TGF-β信号通路加剧IPF的疾病机制 | 研究主要基于观察性数据和回顾性分析,需要进一步实验验证机制 | 研究Y染色体嵌合缺失是否导致人类纤维化疾病过程 | 男性特发性肺纤维化患者 | 生物医学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、临床数据、测序数据 | UK Biobank数据库和两个队列研究中的男性参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2599 | 2025-10-06 |
Lineage-resolved analysis of embryonic gene expression evolution in C. elegans and C. briggsae
2025-Jun-19, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adu8249
PMID:40536976
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较秀丽隐杆线虫和布里格斯线虫胚胎发育过程中基因表达模式的进化约束 | 首次在具有保守不变胚胎谱系的模式生物中系统比较细胞类型特异性基因表达的进化分歧 | 仅研究两种线虫物种,未涵盖更广泛的进化谱系 | 探究发育过程中基因表达模式进化的约束机制 | 秀丽隐杆线虫和布里格斯线虫的胚胎发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种线虫物种的胚胎细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2600 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals new epithelial-stromal associated mesenchymal-like subsets in recurrent gliomas
2025-06-07, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02036-6
PMID:40483536
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序发现复发性胶质瘤中新的上皮-基质相关间充质样亚群 | 首次在复发性胶质母细胞瘤中发现富含EGR1和SERPINE1等EMT相关基因的新型间充质样亚群 | 样本量相对有限(52例),需要更大规模研究验证 | 探索驱动胶质瘤复发的转录和调控机制 | 52例IDH野生型胶质母细胞瘤标本(26例原发,26例复发) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单核RNA测序,空间转录组学 | 基因调控网络分析,非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 52例IDH野生型GBM标本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |