单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31256 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-09-19 |
Glycoprotein Ib-CD11b + monocyte-derived macrophages mediate atherosclerosis-exacerbated psoriatic inflammation
2025-Sep-11, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123960
PMID:40945652
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研究论文 | 本研究揭示了CD11b+单核细胞来源的巨噬细胞通过GPIb-CD11b轴在动脉粥样硬化加剧银屑病炎症中的核心作用 | 首次发现血小板来源的GPIb通过GPIb-CD11b轴促进巨噬细胞M1极化，揭示了两种疾病共同的炎症驱动机制 | 样本量有限，且主要基于观察性数据和动物模型验证 | 阐明动脉粥样硬化与银屑病之间的炎症相互作用机制 | 银屑病合并动脉粥样硬化患者及小鼠模型 | 免疫学 | 银屑病和动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、体外功能实验 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 未明确样本数量的患者组织及小鼠模型 |
| 242 | 2025-09-19 |
Autophagy Upregulation in Mutant Isocitrate Dehydrogenase 1 (IDH1) Glioma Uncovers a Novel Therapeutic Target
2025-Sep-11, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7483444/v1
PMID:40964044
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研究论文 | 本研究揭示mIDH1胶质瘤通过上调自噬作为能量来源，并证明抑制自噬可增强放疗敏感性 | 发现自噬在mIDH1胶质瘤中的关键生存作用，并首次使用靶向Atg7的siRNA纳米颗粒实现体内自噬抑制治疗 | NA | 探索mIDH1胶质瘤的代谢适应机制并开发新的治疗策略 | 人类和小鼠的mIDH1胶质瘤细胞及小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胶质瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, 蛋白质纳米颗粒递送siRNA | NA | 基因组学数据，蛋白质表达数据 | 人类和小鼠mIDH1胶质瘤细胞及体内模型（具体数量未明确说明） |
| 243 | 2025-09-19 |
S3R: Spatially Smooth and Sparse Regression Reveals High-Dimensional Regulatory Networks in Spatial Transcriptomics
2025-Sep-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.06.674629
PMID:40964272
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研究论文 | 提出一种名为S3R的空间平滑稀疏回归框架，用于从空间转录组数据中解析高维调控网络 | 结合结构化稀疏性和最小生成树引导的平滑惩罚，实现系数场的空间连贯性与边界锐化 | NA | 开发能够处理空间转录组数据噪声、共线性和细胞混合问题的回归模型 | 空间转录组数据，包括人类前额叶皮层、皮肤感染和胰腺导管腺癌样本 | 空间转录组学 | 多疾病研究（神经科学、感染性疾病、癌症） | 空间转录组学技术 | 回归模型（S3R） | 空间基因表达数据 | 多个数据集（具体数量未明确说明），包括合成数据和真实生物样本 |
| 244 | 2025-09-19 |
Spatiomolecular mapping reveals anatomical organization of heterogeneous cell types in the human nucleus accumbens
2025-Sep-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.10.675374
PMID:40964296
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，构建了人类伏隔核细胞类型和空间域的空间分子图谱 | 首次在人类大脑中发现连续的基因表达空间梯度，揭示了DRD1和DRD2 MSNs更复杂的组织方式，并建立了跨物种保守性 | 研究基于10名神经典型成年捐赠者的死后组织样本，样本量相对有限 | 解析人类伏隔核的细胞类型空间组织及其与神经精神疾病的关联 | 人类伏隔核组织 | 空间转录组学 | 神经精神疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 分层连锁不平衡评分回归 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 10名神经典型成年捐赠者的死后伏隔核组织 |
| 245 | 2025-09-19 |
Dual checkpoint blockade of glioblastoma with Anti-PD-1 and Anti-LAG-3 promotes expansion of tumor-reactive T cell clones along a unique pathway of differentiation
2025-Sep-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.06.674490
PMID:40964361
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析，探索了抗PD-1和抗LAG-3双重检查点阻断对胶质母细胞瘤中T细胞克隆动态和分化的影响 | 首次绘制了双重免疫检查点抑制剂治疗后胶质母细胞瘤T细胞克隆动态和分化的全面图谱，揭示了外周招募肿瘤反应性T细胞的新机制 | 研究样本量有限，且主要关注IDH野生型胶质母细胞瘤，结果可能不适用于其他亚型 | 评估免疫检查点抑制剂对胶质母细胞瘤T细胞转录景观和受体库的影响 | 胶质母细胞瘤患者的肿瘤浸润淋巴细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | scRNA-seq, TCR-seq | NA | 单细胞转录组数据，T细胞受体序列数据 | 未治疗新诊断胶质母细胞瘤患者和接受双重检查点阻断治疗的复发胶质母细胞瘤患者的配对样本 |
| 246 | 2025-09-19 |
Single-cell transcriptomic profiling of C. elegans Q neuroblast lineage during migration and differentiation
2025-Sep-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.09.675151
PMID:40964368
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了秀丽隐杆线虫Q神经母细胞谱系在迁移和分化过程中的分子机制 | 发现了这些细胞中先前未描述的新基因，揭示了母代Q细胞具有上皮样特性并在迁移早期经历上皮-间质转化，以及新的Wnt相关机制 | NA | 研究神经母细胞迁移和分化的分子机制 | 秀丽隐杆线虫Q神经母细胞谱系 | 单细胞生物学 | NA | FACS, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 发育不同阶段的Q谱系细胞 |
| 247 | 2025-09-19 |
[Single-cell sequencing reveals the temporal expression characteristics of key molecules related to tooth agenesis and dental hard tissues in mouse molars]
2025-Sep-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析小鼠磨牙发育过程中与牙齿发育不全和牙硬组织形成相关分子的时间表达特征 | 构建了从E13.5到P7.5完整发育时期的细胞图谱，揭示了Msx1双峰表达等关键分子的动态表达模式 | 研究仅基于公开数据库数据，未进行实验验证 | 解析牙齿发育不全的分子机制，为牙齿发育异常提供理论基础 | 小鼠下颌磨牙牙胚 | 单细胞测序分析 | 牙齿发育不全 | scRNA-seq, Harmony批次效应校正, Monocle伪时间分析 | Seurat分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 5个发育阶段(E13.5, E14.5, E16.5, P3.5, P7.5)的小鼠磨牙样本 |
| 248 | 2025-09-19 |
[Advances in animal models and multi-omics technologies for cleft palate research]
2025-Sep-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
综述 | 本文综述了动物模型和多组学技术在非综合征性腭裂研究中的应用与进展 | 重点探讨动物模型与多组学技术（如单细胞RNA测序、转录组学等）的结合，揭示腭裂形成的多维分子机制 | NA | 研究非综合征性腭裂的致病机制，推动早期诊断和干预策略的开发 | 动物模型及多组学数据 | 生物医学研究 | 先天性颅面畸形 | 单细胞RNA测序、转录组学、蛋白质组学、表观基因组学 | NA | 多组学数据 | NA |
| 249 | 2025-09-19 |
Short Chain Fatty Acid Supplementation After Traumatic Brain Injury Attenuates Neurologic Injury Via the Gut-Brain-Microglia Axis
2025-Sep-09, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002706
PMID:40961414
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研究论文 | 本研究探讨短链脂肪酸（SCFAs）补充剂通过肠-脑-小胶质细胞轴减轻创伤性脑损伤（TBI）后神经损伤的作用 | 首次提出SCFA补充作为TBI后治疗策略，并通过多组学方法验证其对微生物组、神经认知和小胶质细胞转录组的综合保护效应 | 研究仅基于小鼠模型，样本量有限（n=52），且未探索长期效应或人类适用性 | 评估SCFA补充对TBI后神经损伤的缓解作用及潜在机制 | 14周龄雄性C57BL/6小鼠（52只），分为TBI组和假手术组 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 16S rRNA基因扩增子测序、单细胞RNA测序（scRNAseq）、3D对比增强MRI | NA | 基因组数据、影像数据、行为数据 | 52只小鼠 |
| 250 | 2025-09-19 |
DAESC+: High-performance, integrated software for single-cell allele-specific expression data
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.03.674100
PMID:40964337
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研究论文 | 开发了用于单细胞等位基因特异性表达数据处理和分析的高性能集成软件DAESC+ | 提供了首个端到端的单细胞ASE专用计算工具，包含预处理模块DAESC-P和基于GPU加速的分析模块DAESC-GPU | NA | 解决单细胞等位基因特异性表达分析缺乏专用计算工具的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, GPU加速计算 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 可扩展至超过百万个细胞，使用OneK1K队列子集进行验证 |
| 251 | 2025-09-19 |
TNF Receptor 1 regulates colonic mesenchymal cell diversity and the epithelial stem cell niche
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.08.674957
PMID:40964374
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研究论文 | 本研究探讨了TNFR1在调节结肠间充质细胞多样性和上皮干细胞微环境中的关键作用 | 揭示了TNFR1信号通过调控RSPO3和ITGA6表达影响干细胞微环境的新机制，并证明靶向ITGA6可逆转TNFR1缺失的表型 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明TNFR1在结肠间充质细胞分化和干细胞微环境维持中的功能机制 | TNFR1基因敲除小鼠的结肠间充质细胞和上皮干细胞 | 分子生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、基因敲除模型、共培养实验 | NA | 基因表达数据 | 使用TNFR1 -/-、PDGFRα-Cre;TNFR1 fl/fl转基因小鼠模型进行实验 |
| 252 | 2025-09-19 |
Impact of Data Quality on Deep Learning Prediction of Spatial Transcriptomics from Histology Images
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.04.674228
PMID:40964396
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研究论文 | 本研究探讨了分子和图像数据质量对基于深度学习的组织学图像空间转录组预测性能的影响 | 首次系统研究不同空间转录组技术（Xenium成像与Visium测序）产生的数据质量差异对深度学习预测的影响，而非专注于模型架构改进 | 插补实验的改善效果有限且未能推广到测试集之外，技术局限性直接影响数据质量的问题需要谨慎考虑 | 提升从组织学图像预测空间基因表达的深度学习模型性能 | 空间转录组数据和H&E染色组织学图像 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术（Xenium, Visium）, 深度学习 | 深度学习模型 | 图像, 分子表达数据 | NA |
| 253 | 2025-09-19 |
Single-vessel transcriptome map pathological landscapes and reveal NR2F2-mediated smooth muscle cell phenotype acquisition in capillary malformations
2025-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.02.673874
PMID:40950147
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研究论文 | 本研究通过单血管空间转录组分析揭示了毛细血管畸形中NR2F2介导的平滑肌细胞表型获取的病理机制 | 首次在单血管水平构建空间转录组图谱，发现NR2F2作为关键调控因子驱动平滑肌细胞表型获得 | 研究主要基于体外iPSC模型，需要进一步体内验证 | 探究毛细血管畸形的血管病理发生机制 | 毛细血管畸形病变组织及iPSC衍生的血管细胞 | 数字病理学 | 血管畸形 | 空间全转录组分析(GeoMx), 单细胞RNA测序, 磷酸化蛋白质组学, 基因扰动分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞测序数据, 蛋白质组数据 | 毛细血管畸形病变组织样本及iPSC衍生细胞 |
| 254 | 2025-09-19 |
Blood transcriptome analysis reveals CTSB and ATP6V0D1 expression in circulating monocytes as potential biomarkers of sepsis
2025-Sep-05, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002693
PMID:40961380
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研究论文 | 本研究通过血液转录组分析识别出循环单核细胞中CTSB和ATP6V0D1的表达作为脓毒症的潜在生物标志物 | 首次将CTSB和ATP6V0D1确定为与脓毒症患者28天死亡率显著相关的单核细胞特异性生物标志物 | 样本量较小（脓毒症患者n=20，健康对照n=12），需更大规模研究验证 | 识别脓毒症外周血单核细胞(PBMCs)中的转录组变化作为潜在生物标志物 | 脓毒症患者和健康个体的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA-seq, 生物信息学分析, 免疫细胞荧光检测 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 蛋白质-蛋白质相互作用分析 | 转录组数据 | 32个样本（20例脓毒症患者+12例健康对照），外部验证队列479例 |
| 255 | 2025-09-19 |
After the bite: cellular responses to mosquito blood feeding
2025-Sep, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2025.07.018
PMID:40803965
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和代谢组学分析埃及伊蚊中肠和脂肪体组织在吸血后的细胞反应 | 首次在吸血后蚊子组织中鉴定新细胞类型和标记物，并揭示转录组和代谢响应及病毒感染的动态过程 | NA | 探究蚊子吸血后的细胞水平响应机制 | 埃及伊蚊（Aedes aegypti）的中肠和脂肪体组织 | 单细胞组学 | 虫媒病毒感染 | 单细胞转录组学、代谢组学 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | NA |
| 256 | 2025-09-19 |
Heart failure-specific cardiac fibroblasts contribute to cardiac dysfunction via the MYC-CXCL1-CXCR2 axis
2025-Sep, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00698-y
PMID:40931092
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研究论文 | 本文揭示了心力衰竭特异性心脏成纤维细胞通过MYC-CXCL1-CXCR2轴导致心功能不全的机制 | 首次发现心力衰竭特异性心脏成纤维细胞亚群及其通过MYC-CXCL1-CXCR2信号通路影响心肌细胞功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究心脏成纤维细胞在心力衰竭中的作用机制 | 小鼠心脏、新生大鼠心肌细胞、人iPSC来源心肌细胞及人心力衰竭组织样本 | 心血管疾病研究 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 小鼠压力超负荷模型、人类心力衰竭患者与对照组心脏组织 |
| 257 | 2025-09-19 |
IL7R+ T Cell-Macrophage Crosstalk Links Asthma to Alzheimer's Pathogenesis: Integrating Mendelian Randomization and CellChat Analysis
2025-Sep, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.70809
PMID:40951943
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞分析探讨中重度哮喘与阿尔茨海默病之间的潜在因果联系和分子机制 | 首次整合孟德尔随机化与单细胞通讯分析揭示IL7R+ T细胞-巨噬细胞串扰在哮喘与阿尔茨海默病关联中的作用 | 研究主要基于欧洲裔人群数据，遗传相关性分析未发现显著重叠 | 探究中重度哮喘与阿尔茨海默病之间的因果关系和生物学机制 | 欧洲裔人群的基因组数据和单细胞测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化(MR), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 连锁不平衡评分回归(LDSC) | NA | 基因组关联数据, 单细胞测序数据 | AD样本455,258例，中重度哮喘样本57,695例 |
| 258 | 2025-09-19 |
A Spinal Circuit for Modular Gating of Organ Somatosensation
2025-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.27.672386
PMID:40949983
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研究论文 | 本研究识别了一组遗传定义的腰骶脊髓中间神经元，它们调控膀胱感觉输入和排尿反射 | 发现了分子特性不同的神经元亚型，这些神经元对协调膀胱-括约肌活动和门控内脏疼痛至关重要 | NA | 探索协调器官功能（如膀胱控制）的特定脊髓回路 | 腰骶脊髓中间神经元 | 神经科学 | 泌尿系统疾病 | 单细胞转录组学、原位生理学、回路追踪 | NA | 分子数据、生理数据 | NA |
| 259 | 2025-09-19 |
shinyUMAP: an online tool for promoting understanding of single cell omics data visualization
2025-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.27.672621
PMID:40949989
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研究论文 | 开发了一个名为shinyUMAP的在线工具，用于帮助用户交互式探索单细胞组学数据的UMAP可视化效果 | 提供了一个交互式在线平台，允许用户上传单细胞数据并实时调整UMAP超参数，直观观察细胞簇分布变化 | NA | 促进对单细胞组学数据可视化中UMAP方法的正确理解和使用 | 单细胞组学数据，特别是scRNA-seq表达数据 | 生物信息学 | NA | UMAP（均匀流形近似与投影） | NA | 单细胞组学数据 | NA |
| 260 | 2025-09-19 |
Single-Cell RNA Analysis Reveals Reduced Frequency and Activity of CXCR5+ Atypical Memory B Cells in Islet Xenotransplantation Treated With Clinically Applicable Immunosuppressants Including Belimumab
2025 Sep-Oct, Xenotransplantation
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/xen.70076
PMID:40964768
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了Belimumab在猪到非人灵长类胰岛异种移植中抑制B细胞活性的机制 | 首次在异种移植模型中揭示Belimumab不仅减少CXCR5+非典型记忆B细胞比例，还引起所有B细胞亚群的功能损伤 | 研究基于非人灵长类动物模型，临床适用性需进一步验证 | 评估Belimumab作为免疫抑制剂在胰岛异种移植中的作用机制 | 恒河猴的血液样本及移植的猪胰岛细胞 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 恒河猴治疗前后血液样本 |