本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-11-10 |
3D-generation of high-purity midbrain dopaminergic progenitors and lineage-guided refinement of grafts supports Parkinson's disease cell therapy
2025-Nov-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.001
PMID:41151578
|
研究论文 | 开发了一种三维分化方法SphereDiff,用于生成高纯度中脑多巴胺能祖细胞,并通过谱系引导优化提高帕金森病细胞治疗的安全性和有效性 | 开发了SphereDiff三维分化方法生成高纯度mDA祖细胞;利用单细胞空间转录组学揭示移植后细胞分布模式;采用交叉移植单细胞分裂条形码技术解析供体细胞克隆谱系命运 | 研究主要在PD模型小鼠中进行,尚未进行人体临床试验 | 提高帕金森病细胞治疗中中脑多巴胺能神经元的分化效率和移植后存活率 | 人类多能干细胞、中脑多巴胺能祖细胞、PD模型小鼠 | 再生医学 | 帕金森病 | 三维分化、单细胞空间转录组学、交叉移植单细胞分裂条形码 | NA | 转录组数据、空间分布数据 | PD模型小鼠 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 242 | 2025-11-10 |
Venetoclax plus gilteritinib is effective in preclinical models of FLT3-mutant BCL11B-a lineage-ambiguous leukemia
2025-Nov-06, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025028985
PMID:40811853
|
研究论文 | 本研究评估维奈托克联合吉列替尼在BCL11B-a谱系不明白血病临床前模型中的疗效 | 首次证明BCL-2抑制剂维奈托克与FLT3抑制剂吉列替尼联合治疗对BCL11B-a谱系不明白血病具有协同作用 | 研究仅限于临床前模型,尚未进行临床试验验证 | 探索BCL11B-a谱系不明白血病的靶向治疗策略 | BCL11B-a谱系不明白血病临床前模型 | 血液肿瘤学 | 白血病 | 单细胞RNA测序,BH3分析 | 临床前疾病模型 | 基因表达数据 | 多个临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 243 | 2025-11-10 |
Mapping CMV-related immune signatures in blood, aorta and perivascular mediastinal adipose tissue
2025-Nov-06, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0401
PMID:41194668
|
研究论文 | 本研究通过分析心脏手术患者的血液、主动脉和血管周围纵隔脂肪组织,揭示了巨细胞病毒感染对免疫特征的系统性影响 | 首次在人类主动脉组织中揭示CMV感染导致HLA-C表达下降和干扰素-α信号通路抑制,同时发现表达CD57、GPR56和CX3CR1的CD8 T细胞在血液中增加 | 样本量较小(仅11名参与者),属于初步研究,需要更大规模研究验证 | 探究巨细胞病毒感染如何驱动系统性和组织特异性免疫变化,及其与心血管疾病的潜在关联 | 心脏手术患者的血液、主动脉组织和血管周围纵隔脂肪组织 | 免疫学 | 心血管疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、ELISA、MiloR分析、差异基因表达分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、血清学数据 | 11名心脏手术患者(4名CMV阴性,7名CMV阳性) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2025-11-10 |
Molecular profiling of ex vivo prostate cancer CAF models captures stromal heterogeneity and drug vulnerabilities
2025-Nov-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02792-3
PMID:41198614
|
研究论文 | 通过对前列腺癌相关成纤维细胞进行多组学分析,揭示其转录异质性并识别药物敏感性靶点 | 首次对初治前列腺癌患者来源的原代CAFs进行整合性单细胞多组学分析,发现SOX/FOX/STAT3转录因子网络调控促肿瘤CAF状态,并通过高通量药物筛选鉴定出靶向基质细胞的候选药物 | 仅纳入7例初治患者样本,样本量有限;研究局限于体外模型,未进行体内验证 | 探索前列腺癌相关成纤维细胞的表型异质性和药物敏感性 | 7例初治前列腺癌患者来源的原代癌症相关成纤维细胞 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,高通量药物敏感性检测 | NA | 单细胞转录组数据,药物筛选数据 | 7例初治前列腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 245 | 2025-11-10 |
Integration of Single-cell and bulk RNA sequencing data uncovers lymphatic metastasis-related prognostic genes and a predictive model in bladder cancer
2025-Nov-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22803-8
PMID:41198839
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,揭示了膀胱癌淋巴转移相关的预后基因并建立了预测模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据识别膀胱癌淋巴转移关键基因亚群,并构建了九基因预后模型 | NA | 识别膀胱癌关键预后基因和免疫微环境因子以提升临床评估能力 | 膀胱癌患者的原发肿瘤和淋巴结转移样本 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2025-11-10 |
Suppression of 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase promotes remyelination in multiple sclerosis
2025-Nov-06, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04351-0
PMID:41199250
|
研究论文 | 本研究揭示6-丙酮酰四氢蝶呤合酶(PTS)通过抑制少突胶质前体细胞增殖阻碍多发性硬化症髓鞘再生 | 首次发现PTS是少突胶质前体细胞增殖的负调控因子,并阐明其通过胆固醇生物合成途径影响髓鞘再生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化价值需进一步验证 | 探究PTS在多发性硬化症髓鞘再生障碍中的作用机制 | 少突胶质前体细胞和多发性硬化症小鼠模型 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞测序、条件性基因敲除、转录组分析 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型 | 单细胞测序数据、组织染色图像、转录组数据 | 人类和小鼠少突胶质细胞谱系细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 247 | 2025-11-10 |
Monocyte-derived cells promote transient insult-induced brain injury by enhancing CD8+ T cell response
2025-Nov-06, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116528
PMID:41205172
|
研究论文 | 本研究揭示单核细胞来源的细胞通过增强CD8+ T细胞反应促进短暂损伤诱导的脑损伤 | 首次发现单核来源的cDC2样细胞在脑损伤中通过CD28-CD80/CD86共刺激信号调控CD8+ T细胞反应 | 研究主要基于动物模型和有限的患者样本,需要更大规模临床验证 | 探究短暂性脑损伤中免疫细胞的调控机制 | 辐射诱导脑损伤患者和实验性脑卒中模型 | 免疫学 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 细胞谱系追踪, 单核细胞清除实验 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 辐射诱导脑损伤患者样本和实验动物模型 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 248 | 2025-11-10 |
Inhibition of microglial Slc2a5 attenuates ischemic brain injury
2025-Nov-06, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2025.156429
PMID:41205649
|
研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞Slc2a5介导的果糖代谢通路在急性缺血性脑卒中中的关键作用 | 首次发现小胶质细胞Slc2a5通过调控果糖代谢加重脑缺血损伤,并阐明其通过PKM2介导的神经保护机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探讨小胶质细胞果糖代谢在急性缺血性脑卒中中的作用机制 | 小鼠模型和小胶质细胞 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞转录组测序,体外实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2025-11-10 |
Unraveling the therapeutic potential of triptolide in glioma: Orchestrating apoptosis and immune landscape remodeling
2025-Nov-06, Brain research
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.brainres.2025.150039
PMID:41205732
|
研究论文 | 本研究探讨雷公藤甲素通过调控凋亡相关基因和免疫微环境重塑在胶质瘤中的治疗潜力 | 首次整合转录组分析、免疫浸润分析和单细胞RNA测序揭示雷公藤甲素在胶质瘤中的双重作用机制 | 研究机制尚未完全阐明,需要进一步体内实验验证 | 探索雷公藤甲素在胶质瘤治疗中的作用机制 | 胶质瘤细胞和肿瘤免疫微环境 | 生物医学研究 | 胶质瘤 | 转录组分析,单细胞RNA测序,免疫组化,qPCR | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据,蛋白质表达数据 | GSE147352数据集和实验验证样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 250 | 2025-11-10 |
An etiology-stratified single-cell atlas identifies FABP4 as a prognostic marker for MASLD-related HCC
2025-Nov-06, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.10.026
PMID:41205757
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序构建了病因分层的肝细胞癌肿瘤微环境图谱,鉴定FABP4作为MASLD相关HCC的预后标志物 | 首次系统比较不同病因(HBV感染和MASLD)对HCC肿瘤微环境的影响,发现FABP4通过促进血管正常化增强CD8+ T细胞浸润的新机制 | 样本量相对有限(12例单细胞测序样本),需要更大规模研究验证 | 比较不同病因HCC的肿瘤微环境差异,鉴定病因特异性预后生物标志物 | 肝细胞癌患者肿瘤及癌旁组织,TCGA-LIHC数据库,免疫治疗HCC队列 | 单细胞基因组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,免疫组织化学,多重免疫组织化学,体外和体内实验 | NA | 单细胞转录组数据,批量转录组数据,组织切片图像 | 12例HCC患者的配对肿瘤和癌旁组织(单细胞测序),224例样本(免疫组化验证),TCGA-LIHC数据库和两个免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 251 | 2025-11-10 |
Chronic Intermittent Cold Stress-induced lipophagy promotes foamy macrophage susceptibility to ferroptosis and exacerbates atherosclerosis
2025-Nov-06, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示了慢性间歇性冷应激通过诱导泡沫巨噬细胞铁死亡加剧动脉粥样硬化的分子机制 | 首次阐明冷应激通过糖皮质激素受体激活脂噬作用促进ALOX15介导的脂质过氧化,同时破坏P62-KEAP1相互作用抑制NRF2-GPX4通路,协同诱导铁死亡的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,临床转化价值需进一步验证 | 探究冷应激是否通过诱导泡沫巨噬细胞铁死亡促进动脉粥样硬化进展 | 高脂饮食喂养的ApoE缺陷小鼠和体外培养的巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,电子显微镜,分子生物学技术 | 动物疾病模型 | 基因表达数据,组织图像,分子相互作用数据 | ApoE缺陷小鼠模型及体外细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 252 | 2025-11-10 |
Heterogeneous generation and expansion of epidermal-resident memory T cells in individuals allergic to nickel
2025-Nov-06, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf427
PMID:41206452
|
研究论文 | 本研究探讨镍过敏个体反复接触镍后表皮驻留记忆T细胞的异质性生成和扩增机制 | 首次通过重复斑贴试验结合单细胞RNA测序揭示镍过敏个体表皮TRM细胞的克隆扩增和分化特征 | 样本量较小(12名参与者),且无法将特定T细胞亚型与临床反应严重程度相关联 | 研究反复镍暴露对镍过敏个体临床反应及表皮TRM细胞积累分化的影响 | 12名镍过敏参与者 | 免疫学 | 过敏性接触性皮炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 12名镍过敏参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2025-11-10 |
Trypanosoma brucei cattle infections contain cryptic transmission-adapted bloodstream forms at low parasitaemia
2025-Nov-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64750-y
PMID:41193429
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和显微镜技术发现牛感染布氏锥虫时存在具有传播适应性的隐秘血液形式 | 在低寄生虫血症的牛感染中发现具有锥虫传播适应性的隐秘血液形式,挑战了基于啮齿动物模型的现有假设 | 研究主要基于实验室观察,需要进一步验证这些发现在自然传播环境中的重要性 | 研究布氏锥虫在自然宿主(牛)中的发育和传播机制 | 布氏锥虫在牛和鼠类感染中的发育形式 | 寄生虫学 | 非洲动物锥虫病 | 单细胞RNA测序,显微镜观察 | NA | 转录组数据,显微镜图像 | 牛和鼠类感染样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2025-11-10 |
Research on the expression, prognostic value, and regulatory effects on immune microenvironment of NETO2 in oral squamous cell carcinoma
2025-Nov-05, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15164-y
PMID:41193984
|
研究论文 | 本研究探讨NETO2基因在口腔鳞状细胞癌中的表达、预后价值及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 首次系统研究NETO2在OSCC中的表达特征,结合单细胞RNA测序分析其在免疫细胞中的表达模式,并探索其与免疫治疗反应和药物敏感性的关联 | 研究主要基于公共数据库分析,实验验证部分有限,需要更多临床样本验证 | 阐明NETO2在口腔鳞状细胞癌中的生物学功能和临床意义 | 口腔鳞状细胞癌组织和细胞 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, Kaplan-Meier生存分析, 分子对接, 细胞功能实验 | 列线图预测模型 | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GEO队列数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 255 | 2025-11-10 |
MaskGraphene: an advanced framework for interpretable joint representation for multi-slice, multi-condition spatial transcriptomics
2025-Nov-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03850-w
PMID:41194133
|
研究论文 | 提出MaskGraphene框架,通过图神经网络和自监督学习实现多切片空间转录组数据的可解释联合表征 | 结合掩码自监督学习、三元组损失和聚类级局部对齐,通过软链接和硬链接建立跨切片连接,生成具有高几何保真度的联合嵌入 | NA | 开发能够保持空间几何结构并校正批次效应的空间转录组数据整合方法 | 多切片、多条件的空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络(GNN) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 256 | 2025-11-10 |
Ascorbic acid attenuates immunosenescence and cognitive decline via MYH9-Mediated CD8⁺ T cell differentiation
2025-Nov-05, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-025-00538-4
PMID:41194177
|
研究论文 | 本研究揭示抗坏血酸通过MYH9介导的CD8⁺ T细胞分化减轻免疫衰老并改善认知功能 | 首次发现抗坏血酸通过结合MYH9蛋白调节细胞骨架通路,特异性促进CD8⁺ T细胞分化,从而改善年龄相关的免疫衰老和认知衰退 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验验证;MYH9抑制实验使用blebbistatin可能存在脱靶效应 | 探究抗坏血酸在缓解免疫衰老和认知衰退中的作用机制 | 16月龄C57BL/6老年小鼠、造血干细胞、外周血单个核细胞、CD8⁺ T细胞 | 免疫学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外分化实验 | 动物模型 | 基因表达数据、细胞计数数据、行为学数据 | 老年C57BL/6小鼠(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 257 | 2025-11-10 |
Prognostic evaluation and experimental validation of cuproptosis-related hub genes identified through weighted gene co-expression network analysis in uveal melanoma
2025-Nov-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03978-6
PMID:41194198
|
研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析识别铜死亡相关基因,构建了能够准确预测葡萄膜黑色素瘤预后的CRG_score模型 | 首次在葡萄膜黑色素瘤中系统研究铜死亡相关基因,构建了具有高预测准确性的预后模型,并验证了铜死亡诱导剂对肿瘤细胞的抑制作用 | 研究样本量相对有限,需要更多临床样本验证模型的普适性 | 探索铜死亡相关基因在葡萄膜黑色素瘤预后评估和治疗中的作用 | 葡萄膜黑色素瘤患者样本和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 加权基因共表达网络分析,转录组相关性分析,差异分析,LASSO Cox回归,单细胞RNA测序,细胞实验 | CRG_score预后模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 221例葡萄膜黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2025-11-10 |
Integrating multi-omics and machine learning to decipher the role of GSTP1 in endocrine-disrupting chemical-induced prostate cancer pathogenesis
2025-Nov-05, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178335
PMID:41202964
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,揭示了GSTP1在内分泌干扰化学物诱导前列腺癌发病机制中的关键作用 | 首次系统整合多组学数据与机器学习框架识别EDC-PCa关联基因,并通过孟德尔随机化验证GSTP1的因果保护作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证;样本来源和数量有限 | 系统识别连接内分泌干扰化学物暴露与前列腺癌发病的关键基因 | 前列腺癌相关基因和内分泌干扰化学物相互作用 | 机器学习 | 前列腺癌 | 转录组分析, 机器学习, 孟德尔随机化, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序 | 集成机器学习框架, glmBoost, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 四个转录组数据集(GSE32571, GSE71016, GSE46602, GSE200879) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 259 | 2025-11-10 |
Oral Multi-Enzymatic Manganese-Carbon Dots Alleviate Sepsis-Associated Lung Injury via the Gut-Lung Axis
2025-Nov-04, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c10625
PMID:41128412
|
研究论文 | 本研究开发口服锰掺杂碳点通过调节肠道菌群稳态和靶向肠肺轴缓解脓毒症相关肺损伤 | 首次设计具有多酶模拟活性的锰掺杂碳点,通过肠肺轴机制调控巨噬细胞胞葬作用和抗炎极化 | 研究主要基于小鼠模型,人体应用效果尚需验证 | 探索通过肠肺轴干预脓毒症相关肺损伤的新策略 | 脓毒症相关肺损伤小鼠模型和巨噬细胞 | 生物医学工程 | 脓毒症相关肺损伤 | 单细胞测序,宏基因组学,代谢组学,粪便微生物移植 | NA | 基因组数据,代谢组数据,转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞测序,宏基因组学,代谢组学 | NA | NA |
| 260 | 2025-11-10 |
Lactylated histone H4K8 regulation of MFN2/Wnt signaling integrates glycolytic metabolism and Müller cell activation in the pathogenesis of glaucoma
2025-Nov-04, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107178
PMID:41197676
|
研究论文 | 本研究揭示组蛋白H4K8乳酸化通过调控MFN2/Wnt信号通路整合糖酵解代谢与Müller细胞活化在青光眼发病机制中的作用 | 首次发现乳酸化组蛋白H4K8通过表观遗传调控MFN2表达,将线粒体动力学与Wnt/β-catenin信号通路激活相耦合的新机制 | NA | 探索青光眼发病过程中代谢应激与表观遗传调控的分子机制 | 视网膜组织、Müller胶质细胞、视网膜神经节细胞、光感受器细胞 | 表观遗传学 | 青光眼 | CUT&Tag, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |