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当前共找到 33948 篇文献,本页显示第 241 - 260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
241 2025-12-11
Integrative epidemiological and spatial multi-omics analyses reveal SPP1⁺ macrophages with senescence-like features as key mediators linking NO₂ exposure to coronary heart disease
2025-Dec-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 本研究通过整合流行病学数据、因果推断方法和多组学分析,揭示了环境污染物二氧化氮(NO₂)通过加速生物衰老(特别是PhenoAge)增加冠心病风险的机制,并识别出SPP1⁺巨噬细胞作为关键介导细胞 首次将大规模流行病学数据、因果推断方法(倾向评分匹配和孟德尔随机化)与多组学分析(包括单细胞和空间转录组学)相结合,系统阐明了NO₂暴露通过生物衰老途径影响冠心病风险的完整证据链,并识别出具有衰老样特征的SPP1⁺巨噬细胞作为关键介导细胞 研究主要基于中国人群数据,结论在其他种族/人群中的普适性有待验证;多组学分析样本量相对较小;环境暴露评估可能存在测量误差 探究环境污染物NO₂暴露通过生物衰老途径影响冠心病风险的因果机制 冠心病患者及对照人群(来自天津队列和CHARLS队列)、人类动脉粥样硬化斑块组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 批量转录组测序, 孟德尔随机化, 倾向评分匹配 NA 流行病学数据, 基因组数据, 转录组数据, 空间数据 流行病学队列:17,412人(13,886例患者,3,526例对照);多组学分析:人类动脉粥样硬化斑块样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
242 2025-12-11
Expression of ACTR3 in cervical cancer and impact on immune cell infiltration and prognosis: A comprehensive analysis based on bulk RNA-Seq and single-cell RNA-Seq
2025-Dec-05, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过整合bulk RNA-Seq和单细胞RNA-Seq数据,分析了ACTR3在宫颈癌中的表达及其对免疫细胞浸润和患者预后的影响 首次将PI3K/Akt/mTOR通路关键基因ACTR3的表达与宫颈癌免疫微环境及预后联系起来,并利用单细胞RNA测序技术解析了表达ACTR3的特定免疫细胞亚群 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来确认ACTR3在肿瘤免疫中的具体功能机制 探究ACTR3过表达是否影响宫颈癌生存率及其对肿瘤免疫微环境的影响 宫颈鳞状细胞癌和宫颈内膜腺癌(CESC)患者 数字病理学 宫颈癌 RNA-seq,单细胞RNA-seq,免疫组织化学 LASSO Cox回归模型,列线图(Nomogram) RNA测序数据,单细胞测序数据,临床数据 NA NA bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
243 2025-12-11
Identification of Neurotrophic Factor Related Biomarkers and Mechanistic Insights into Neuropathic Pain via Integrated Bioinformatics Analysis
2025-Dec-02, ACS omega IF:3.7Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学方法,识别了与神经病理性疼痛相关的五个关键生物标志物,并探讨了其潜在机制 结合单细胞RNA测序、差异表达分析、孟德尔随机化及细胞通讯分析,首次系统性地识别了神经病理性疼痛中与神经营养因子相关的生物标志物及其在细胞相互作用和分化轨迹中的作用 研究主要基于公共数据库和小鼠背根神经节数据,人类样本验证不足,且机制探索仍处于初步阶段 识别神经病理性疼痛的关键生物标志物并探索其潜在机制 小鼠背根神经节细胞及公共数据库中的神经病理性疼痛数据集 生物信息学 神经病理性疼痛 单细胞RNA测序, 差异表达分析, 孟德尔随机化, 细胞通讯分析, 伪时间分析 NA RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
244 2025-12-11
Transforming histologic assessment: artificial intelligence in cancer diagnosis and personalized treatment
2025-Dec, British journal of cancer IF:6.4Q1
综述 本文综述了人工智能在组织学评估中的变革性作用,特别是在癌症诊断和个性化治疗中的应用 AI正从诊断辅助工具演变为临床决策的组成部分,能够预测癌症预后、基因改变和治疗反应,并引入了组织形态学表型聚类和空间转录组学等创新方法 AI预测的验证仍面临挑战,特别是在预后应用方面,以及在资源有限环境中的可及性问题 探讨人工智能如何变革组织学评估,以改善癌症诊断和个性化治疗 组织学评估、癌症诊断、个性化治疗 数字病理学 癌症 深度学习 深度学习模型 全切片图像、临床数据、分子数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
245 2025-12-11
Lipid-laden macrophages in atherosclerosis and cancer
2025-Dec, Seminars in cancer biology IF:12.1Q1
综述 本文综述了脂质负载巨噬细胞在炎症、动脉粥样硬化和癌症中的双重作用,比较了其在生理和病理条件下的异同 系统比较了脂质负载巨噬细胞在动脉粥样硬化和癌症这两种不同疾病背景下的共同和独特功能,并探讨了基于脂质代谢调节的治疗策略在癌症治疗中的潜力 作为综述文章,主要基于现有文献进行总结,未提出新的实验数据或验证 探讨脂质负载巨噬细胞在不同疾病(动脉粥样硬化和癌症)中的作用机制及治疗靶点 脂质负载巨噬细胞 自然语言处理 动脉粥样硬化,癌症 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
246 2025-12-11
Androgen receptor interacts with c-Myc to regulate macrophage-osteoclast axis and drive bone metastasis in triple negative breast cancer
2025-Dec, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本文探讨了雄激素受体(AR)与c-Myc相互作用调控巨噬细胞-破骨细胞轴,驱动三阴性乳腺癌(TNBC)骨转移的机制 揭示了AR与c-Myc相互作用通过MMP13促进巨噬细胞向破骨细胞分化,从而驱动TNBC骨转移的新机制 研究主要基于小鼠模型和回顾性数据库分析,临床样本验证有限 阐明TNBC亚型骨转移的调控机制 三阴性乳腺癌(TNBC)及其骨转移过程 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序、免疫共沉淀(CoIP)、CUT&TAG测序、破骨细胞分化实验 小鼠模型 测序数据、实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
247 2025-12-11
Lactylated histone H4K8 regulation of MFN2/Wnt signaling integrates glycolytic metabolism and Müller cell activation in the pathogenesis of glaucoma
2025-Dec, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究揭示了在青光眼发病过程中,组蛋白H4K8乳酰化通过调控MFN2/Wnt信号通路,将糖酵解代谢与Müller细胞激活联系起来,并最终导致视网膜神经节细胞凋亡的分子机制 首次发现组蛋白H4K8乳酰化在青光眼视网膜中显著增加,并作为乳酸响应的表观遗传检查点,通过调控MFN2基因表达,将线粒体动力学与Wnt/β-catenin信号通路激活相耦合 研究主要基于动物模型和体外实验,在人类青光眼患者中的直接验证尚不充分;MFN2作为治疗靶点的具体干预策略和潜在副作用有待进一步探索 阐明青光眼发病过程中代谢应激、表观遗传调控与神经胶质细胞-神经元相互作用之间的分子机制 青光眼模型中的视网膜组织、Müller胶质细胞、视网膜神经节细胞、光感受器细胞 分子生物学与表观遗传学 青光眼 CUT&Tag(靶向切割与标签化)、单细胞RNA测序、基因组学分析、体内实验 NA 基因组学数据、表观遗传学数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
248 2025-12-11
QuiCAT: a scalable and flexible framework for mapping synthetic sequences
2025-Dec-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一个名为QuiCAT的Python包,用于从测序数据中高效提取、聚类和分析合成标签,以支持细胞命运和谱系追踪研究 QuiCAT是一个端到端的、可扩展的软件框架,在速度和准确性上优于现有方法,并提供参考无和参考两种工作流程,适用于大规模单细胞和空间转录组学应用 未在摘要中明确提及 开发一个可扩展且灵活的软件框架,用于分析合成细胞标记技术的数据,以支持细胞命运和谱系追踪研究 合成序列标签,包括来自群体水平数据、单细胞和空间分辨转录组学的数据集 生物信息学 NA 合成细胞标记技术,单细胞和空间转录组学测序 NA 测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
249 2025-12-11
Destruction of VISTA by TRIM25 ablation in T cells potentiates cancer immunotherapy
2025-Dec, Cell research IF:28.1Q1
研究论文 本研究揭示了TRIM25通过拮抗降解信号正向调控T细胞中VISTA的机制,并证明靶向TRIM25-VISTA可增强肿瘤免疫治疗效果 首次发现TRIM25是VISTA的正向调节因子,阐明了ERK介导的VISTA Thr284磷酸化增强其与TRIM25互作从而稳定的分子机制,并开发了可破坏该互作的磷酸肽抑制剂 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证;磷酸肽抑制剂的实际应用潜力需进一步评估 探索VISTA在T细胞中的调控机制,并开发增强癌症免疫治疗的新策略 T细胞中的VISTA蛋白及其调节因子TRIM25 癌症免疫学 癌症 CRISPR敲除筛选、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白质互作数据 多种小鼠肿瘤模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
250 2025-12-11
FastSCODE: an accelerated SCODE algorithm for inferring gene regulatory networks on manycore processors
2025-Dec-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了FastSCODE,一种针对多核处理器优化的加速版SCODE算法,用于从单细胞RNA测序数据推断基因调控网络 开发了FastSCODE,通过批处理计算和GPU加速,显著提升了SCODE算法的计算性能,处理大型数据集时速度提升高达6000倍 未在摘要中明确提及具体限制,但可能依赖于GPU硬件和大型数据集的有效性 优化基因调控网络推断算法的计算性能,以处理大规模单细胞RNA测序数据 单细胞RNA测序数据,包括小鼠、人类和植物细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 线性ODE模型 基因表达谱数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
251 2025-12-11
Microplastic exposure elicits sex-specific atherosclerosis development in lean low-density lipoprotein receptor-deficient mice
2025-Dec, Environment international IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了环境相关剂量微塑料暴露对低密度脂蛋白受体缺陷小鼠动脉粥样硬化发展的性别特异性影响 揭示了微塑料暴露在非肥胖小鼠模型中导致动脉粥样硬化发展的性别差异,并通过单细胞RNA测序提供了细胞机制见解 研究仅使用小鼠模型,结果向人类外推需谨慎;暴露剂量和持续时间可能无法完全模拟人类长期低剂量暴露 评估微塑料暴露对心血管系统的影响,特别是动脉粥样硬化的发展 低密度脂蛋白受体缺陷小鼠(LDLR小鼠)的动脉组织及原代内皮细胞 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞RNA测序,体外细胞培养 动物模型(小鼠),细胞模型 基因表达数据,组织病理学数据 未明确具体数量,但涉及雄性和雌性LDLR小鼠分组 NA 单细胞RNA测序 NA NA
252 2025-12-11
Association of Neuronal Autoantibodies with Overall Survival in Patients with Gastric Cancer
2025-Dec-01, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了胃癌患者中神经元自身抗体与总体生存期的关联 首次在无副肿瘤性神经系统综合征的胃癌患者中检测神经元自身抗体,并揭示其与生存期缩短和肿瘤微环境免疫抑制特征的关联 单中心队列研究,样本量有限,单细胞测序仅基于有限肿瘤样本,需要进一步机制研究验证 评估胃癌患者中神经元自身抗体的临床预后意义 胃癌患者血清样本和肿瘤组织 数字病理学 胃癌 免疫荧光、细胞基础检测、单细胞测序 NA 血清样本、肿瘤组织图像、单细胞测序数据 323例胃癌患者(TBA阳性144例,TBA阴性179例) NA 单细胞RNA-seq NA NA
253 2025-12-11
Phenotypic Changes in a Monocyte Cluster with High Interleukin-1 Beta Expression during Long-Term Anti-CD20 Therapy
2025-Dec, Annals of neurology IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学分析,揭示了多发性硬化症患者在接受长期抗CD20治疗期间,一个高表达白细胞介素-1β的单核细胞亚群的表型变化 首次在单细胞分辨率下鉴定出一个具有独特促炎特征和中枢神经系统浸润潜能的IL1Bhigh单核细胞亚群,并阐明了其在抗CD20治疗前后的动态变化 样本量相对有限,且主要关注外周血单核细胞,未直接分析中枢神经系统内的细胞变化 探究多发性硬化症患者在接受抗CD20治疗期间,外周血单核细胞的疾病相关和治疗相关变化 多发性硬化症患者和健康对照者的外周血单核细胞 单细胞多组学 多发性硬化症 靶向单细胞转录组和表位测序、多色光谱流式细胞术 细胞聚类分析、基因本体富集分析、细胞间通讯网络分析 单细胞转录组数据、表位数据、流式细胞术数据 64份血液样本(来自多发性硬化症患者基线及治疗后3个时间点,以及健康对照) NA 单细胞RNA测序、单细胞表位分析 NA NA
254 2025-12-11
Pangenomics and single-cell transcriptomics uncover the genetic basis of continuous bearing trait in grapevine
2025-Dec, Horticulture research IF:7.6Q1
研究论文 本研究通过整合泛基因组学、比较基因组学、单细胞转录组学和批量转录组学,揭示了葡萄连续开花和结实性状(CFB)的遗传基础 首次结合泛基因组学和单细胞转录组学分析葡萄连续开花性状,并基于新生成的单倍型分辨近端粒到端粒(T2T)基因组进行深入研究 NA 阐明葡萄连续开花和结实性状的遗传机制 葡萄品种'Julian'(连续开花和结实)和'Muscat Hamburg'(季节性开花和结实) 植物基因组学 NA 泛基因组学, 比较基因组学, 单细胞转录组学, 批量转录组学 NA 基因组数据, 转录组数据 16个葡萄基因组(包括新生成的'Julian' T2T基因组和15个已发表基因组),以及两个品种的花芽单细胞转录组数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
255 2025-12-11
Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals NK Cell Subpopulations Associated With Immunotherapy for Melanoma
2025-Dec, Smart medicine
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学,揭示了与黑色素瘤免疫治疗相关的NK细胞亚群及其功能 首次在黑色素瘤中系统鉴定出四个NK细胞亚群,并利用空间转录组学揭示了关键亚群NK cluster 01与肿瘤细胞的空间邻近关系及潜在的IFN-II信号通路调控网络 研究机制尚未通过体内外实验完全验证,分子对接的靶向治疗策略仍需后续实验确认 探究黑色素瘤患者对免疫检查点抑制剂产生耐药性的机制,并寻找新的治疗靶点 黑色素瘤患者样本中的NK细胞 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 转录组数据,空间位置数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
256 2025-12-11
Removal of unwanted variation in pseudobulk analysis of single-cell RNA sequencing data and the leveraging of pseudoreplicates
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 本文评估了在单细胞RNA测序数据的伪批量分析中去除不必要变异的策略,并提出了一种新方法RUVIII PBPS以解决技术重复不足或阴性对照基因缺失的问题 引入了RUVIII PBPS新策略,可在技术重复不足或阴性对照基因缺失时有效控制伪发现率,扩展了RUV方法在单细胞RNA测序伪批量分析中的应用范围 研究主要基于模拟和真实生物信号进行评估,可能未覆盖所有实际应用场景;方法在极端模型错误指定条件下的性能需进一步验证 评估和优化单细胞RNA测序伪批量数据中去除不必要变异的方法,以提高差异表达分析的准确性和统计效力 单细胞RNA测序数据的伪批量分析,重点关注技术噪声和混杂因素的影响 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 RUV2, RUVIII, RUV4, RUVIII PBPS 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
257 2025-12-11
Integration of genetic, proteomic, and transcriptomic data identifies therapeutic targets and prognostic biomarkers in bladder cancer
2025-Nov-30, Translational andrology and urology IF:1.9Q3
研究论文 本研究通过整合遗传、蛋白质组和转录组数据,识别了膀胱癌的潜在治疗靶点和预后生物标志物 整合了跨组学数量性状位点、OLINK蛋白质组学和转录组学数据,结合前瞻性队列研究和多组学分析,系统识别了膀胱癌的分子靶点和候选药物 研究依赖于现有数据库(如UK Biobank)的数据,可能存在样本选择偏倚,且部分发现需进一步实验验证 识别膀胱癌的分子靶点和候选药物,以改善早期诊断和精准治疗 膀胱癌患者及相关组学数据 生物信息学 膀胱癌 xQTLs, OLINK蛋白质组学, 转录组学, GWAS, 单细胞RNA测序, 甲基化分析 Cox回归, 随机生存森林模型 遗传数据, 蛋白质数据, 转录组数据, 甲基化数据 来自UK Biobank Pharma Proteomics Project, deCODE Genetics和Atherosclerosis Risk in Communities study的队列数据 OLINK 高通量血浆蛋白质测量 OLINK平台 用于血浆蛋白质测量的高通量平台
258 2025-12-11
Migrasome-related long non-coding RNAs orchestrate immune microenvironment and serve as a novel prognostic model in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-30, Translational andrology and urology IF:1.9Q3
研究论文 本研究通过整合转录组数据和临床参数,识别了与透明细胞肾细胞癌预后相关的迁移体相关长链非编码RNA,并构建了一个包含五个MRLs的预后模型,用于风险分层和指导治疗策略 首次系统性地识别了迁移体相关长链非编码RNA在透明细胞肾细胞癌中的预后价值,并构建了一个基于五个MRLs的稳健预后模型,同时结合单细胞RNA测序揭示了VEGF信号通路在调节迁移体相关分子程序中的作用 研究主要基于TCGA数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床验证;单细胞RNA测序数据的样本量可能有限,且实验验证仅通过RT-qPCR进行,功能机制研究尚不深入 系统识别与透明细胞肾细胞癌预后相关的迁移体相关长链非编码RNA,并构建一个稳健的预后模型以改善风险分层和指导潜在治疗策略 透明细胞肾细胞癌患者及其转录组数据和临床参数 自然语言处理 肾癌 转录组分析、LASSO回归、单细胞RNA测序、RT-qPCR LASSO回归模型 转录组数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 来自TCGA数据库的透明细胞肾细胞癌患者样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
259 2025-12-11
MSI2 exerts antitumor effects by regulating T-cell function in kidney renal clear cell carcinoma
2025-Nov-30, Translational andrology and urology IF:1.9Q3
研究论文 本研究探讨了MSI2在肾透明细胞癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系,揭示了MSI2通过调节T细胞功能发挥抗肿瘤作用 首次在肾透明细胞癌中发现MSI2表达下调,并揭示其通过调节T细胞功能发挥抗肿瘤作用,同时提出MSI2可能作为肾小管上皮细胞分化成熟的标志物 研究主要基于数据库分析和体外细胞实验,缺乏体内实验验证;单细胞RNA测序样本来源和数量未明确说明 探索MSI2在肾透明细胞癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系 肾透明细胞癌患者数据、肾细胞系、T细胞 生物信息学 肾透明细胞癌 单细胞RNA测序、生物信息学分析、细胞实验 NA mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 未明确说明具体样本数量,涉及数据库中的KIRC患者数据及细胞实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
260 2025-12-11
Multi-omics characterization of metabolic and immune interactions in prostate cancer
2025-Nov-30, Translational andrology and urology IF:1.9Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞多组学数据,揭示了前列腺癌中代谢重编程与免疫微环境之间的相互作用,并识别出关键代谢生物标志物ENO1和CKB 首次通过整合scRNA-seq和scATAC-seq数据,系统性地描绘了前列腺癌中代谢与免疫的相互作用网络,并将分子发现与临床预后(淋巴结转移状态)直接关联 研究主要基于公开数据集进行二次分析,缺乏独立的实验验证队列;使用的样本量相对有限;未在功能上验证ENO1和CKB的调控机制 阐明前列腺癌中代谢重编程与免疫微环境之间的相互作用机制,并识别具有预后意义的代谢生物标志物 前列腺癌(PCa)组织样本 生物信息学,计算生物学 前列腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单细胞ATAC测序(scATAC-seq),生物信息学分析 多组学整合分析框架,预后列线图(nomogram),Cox回归模型 单细胞转录组数据,单细胞表观基因组数据,临床数据 来自公共数据集(包括TCGA-PRAD队列)的前列腺癌样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
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