单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
241	2025-05-15	Immune-Vascular Synergy: A Photodynamic Hydrogel Activating ALDH2 to Combat Inflammation and Enhance Angiogenesis in Diabetic Wound Healing 2025-May-13, Small methods IF:10.7Q1 DOI:10.1002/smtd.202500391 PMID:40364604	research paper	该研究开发了一种光动力水凝胶，通过激活ALDH2来对抗炎症并促进糖尿病伤口愈合中的血管生成	提出了一种双功能策略的光动力水凝胶，首次将ALDH2激活与免疫-血管调节相结合，针对糖尿病伤口的多重挑战	未提及临床前或临床试验的具体样本量及长期效果评估	解决糖尿病伤口因持续感染、免疫反应受损和血管化不足带来的治疗难题	糖尿病伤口组织中的中性粒细胞外陷阱（NETs）和ALDH2酶	生物医学工程	糖尿病	单细胞测序分析、光动力水凝胶技术	NA	临床标本的单细胞测序数据	NA
242	2025-05-15	AI-Driven Analysis Unveils Functional Dynamics of Müller Cells in Retinal Autoimmune Inflammation 2025-May-12, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.02.28.640907 PMID:40093069	研究论文	利用AI驱动的单细胞RNA-seq分析揭示Müller细胞在视网膜自身免疫炎症中的功能动态	首次通过AI辅助的单细胞分析识别出视网膜炎症中Müller细胞的九个亚群及T细胞的五个亚群，并发现激活的Müller细胞呈现巨噬细胞样表型	研究仅基于Aire-/-小鼠模型，未在人类样本中验证	探索视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能动态及其与T细胞的相互作用	Aire-/-小鼠视网膜中的Müller细胞和T细胞	数字病理学	视网膜自身免疫炎症	scRNA-seq	SCassist（AI辅助单细胞分析工作流）	单细胞转录组数据	Aire-/-小鼠视网膜scRNA-seq数据集（未明确样本量）
243	2025-05-15	Identification of maize genes that condition early systemic infection of sugarcane mosaic virus through single-cell transcriptomics 2025-May-12, Plant communications IF:9.4Q1 DOI:10.1016/j.xplc.2025.101297 PMID:40045576	研究论文	通过单细胞转录组学识别玉米中影响甘蔗花叶病毒早期系统性感染的基因	首次利用单细胞RNA测序技术研究甘蔗花叶病毒在玉米早期系统性感染中的基因表达变化	研究仅关注早期感染阶段，未涉及症状表现后的过程	探究植物病毒早期系统性感染过程中宿主基因表达与病毒积累的关系	甘蔗花叶病毒(SCMV)感染的玉米叶片	植物病理学	植物病毒感染	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量，但涉及五种细胞类型
244	2025-05-15	Fitness and transcriptional plasticity of human breast cancer single-cell-derived clones 2025-May-12, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115699 PMID:40359107	研究论文	通过单细胞RNA测序和细胞条形码技术，研究人类乳腺癌单细胞克隆的适应性和转录可塑性	结合表达型慢病毒细胞条形码与单细胞RNA测序，首次在体内将单细胞转录组与克隆生长直接关联	仅针对5种乳腺癌模型进行了单细胞转录组分析，样本代表性可能有限	探究乳腺癌克隆适应性和转录可塑性对肿瘤异质性的影响	26例患者来源的乳腺癌异种移植模型中的单细胞衍生克隆	癌症生物学	乳腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 慢病毒细胞条形码技术	NA	单细胞转录组数据	26个患者来源模型中的110个异种移植体，超过20,000个单细胞衍生克隆，167,375个单细胞RNA图谱
245	2025-05-15	Phillyrin for sepsis-related acute lung injury: A potential strategy suppressing GSK-3β 2025-May-12, Molecular immunology IF:3.2Q3 DOI:10.1016/j.molimm.2025.04.017 PMID:40359720	研究论文	研究连翘苷（PHN）通过抑制GSK-3β信号通路缓解脓毒症相关急性肺损伤（ALI/ARDS）的机制	首次发现PHN作为GSK-3β抑制剂，通过促进M2巨噬细胞极化和减少中性粒细胞募集来缓解ALI/ARDS	PHN的具体作用机制仍需进一步研究，且临床疗效尚未验证	探究PHN在脓毒症相关ALI/ARDS中的治疗作用及其分子机制	连翘苷（PHN）、GSK-3β信号通路、巨噬细胞极化、中性粒细胞募集	药理学	急性肺损伤/急性呼吸窘迫综合征（ALI/ARDS）	分子对接、分子动力学模拟、孟德尔随机化分析、单细胞测序分析	NA	基因表达数据、蛋白质活性数据	8331个ALI/ARDS相关靶基因，体外和体内实验（斑马鱼和小鼠）
246	2025-05-15	The upregulation of TNKS1 drives the phenotypic switching of vascular smooth muscle cells in aortic dissection through the activation of ferroptosis 2025-May-12, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114722 PMID:40359887	研究论文	本研究探讨了TNKS1在主动脉夹层中对人类主动脉平滑肌细胞表型转换的影响及其通过激活铁死亡的作用机制	首次揭示了TNKS1通过激活铁死亡途径驱动主动脉平滑肌细胞表型转换的新机制	研究主要基于体外实验和动物模型，临床样本验证有限	探究TNKS1在主动脉夹层发病机制中的作用	人类主动脉平滑肌细胞(HASMCs)	心血管疾病研究	主动脉夹层	单细胞RNA测序、Western blot、免疫荧光、RT-q-PCR、划痕实验、Co-IP	NA	基因表达数据、蛋白质相互作用数据	NA
247	2025-05-15	Spatial transcriptomics highlights B cells as key contributors to a complete and durable response to chemo-immunotherapy in a patient with resectable NSCLC 2025-May-11, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011563 PMID:40350207	研究论文	通过空间转录组学、单细胞RNA测序和血清蛋白质组学分析，研究一名可切除NSCLC患者对化疗免疫疗法的完全病理反应和持久无事件生存	揭示了B淋巴细胞在不同成熟状态下的关键作用，并观察到治疗后原发肿瘤中三级淋巴结构的形成	仅基于单个病例的研究，结果可能需要更大样本量验证	探索化疗免疫疗法在可切除NSCLC患者中的治疗效果及其机制	一名可切除NSCLC伴同步脑转移的患者	数字病理学	肺癌	空间转录组学、单细胞RNA测序、血清蛋白质组学	NA	分子表达数据、蛋白质组数据	1名患者（包括治疗前脑转移组织和治疗后原发肺肿瘤组织）
248	2025-05-15	Integrated bioinformatic analysis identifies GADD45B as an immune-related prognostic biomarker in skin cutaneous melanoma 2025-May-11, Hereditas IF:2.1Q3 DOI:10.1186/s41065-025-00437-0 PMID:40350499	研究论文	该研究通过整合多个数据库和实验方法，全面探讨了GADD45B在皮肤黑色素瘤(SKCM)中的功能及其作为免疫相关预后生物标志物的潜力	首次系统研究GADD45B在SKCM中的作用机制，发现其可作为新型免疫检查点并促进M1型巨噬细胞极化	研究主要基于生物信息学分析和体外实验，临床样本验证有待进一步加强	探究GADD45B在皮肤黑色素瘤中的功能及其临床意义	皮肤黑色素瘤细胞系和患者样本	生物信息学	皮肤黑色素瘤	转录组测序、单细胞分析、免疫浸润分析	NA	基因表达数据	26个SKCM相关数据集、30个人类SKCM细胞系转录组数据、29个SKCM细胞系表型特征分析
249	2025-05-15	Mapping the molecular signature of ABA-regulated gene expression in germinating barley embryos 2025-May-10, BMC plant biology IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12870-025-06654-z PMID:40348990	研究论文	本研究通过整合转录组学、代谢组学和空间转录组学技术，揭示了ABA在发芽大麦胚胎中调控基因表达的分子特征	首次在植物组织中成功应用空间转录组学技术，实现了对胚胎不同区域基因表达的精确定位	空间转录组学技术在植物组织中的应用仍存在技术挑战	探究ABA调控大麦种子发芽的分子机制	ABA处理的大麦(Hordeum vulgare)胚胎	植物分子生物学	NA	Visium Spatial Transcriptomics (10× Genomics), RNA-seq	NA	转录组数据, 代谢组数据	六个胚胎区域
250	2025-05-15	Thioredoxin: a key factor in cold tumor formation and a promising biomarker for immunotherapy resistance in NSCLC 2025-May-10, Respiratory research IF:4.7Q1 DOI:10.1186/s12931-025-03259-w PMID:40349025	研究论文	该研究探讨了硫氧还蛋白（TXN）在非小细胞肺癌（NSCLC）中作为免疫治疗耐药性生物标志物的作用及其在冷肿瘤形成中的关键影响	发现TXN在NSCLC患者中高表达并与冷肿瘤特征相关，揭示了TXN通过调节CD40促进肿瘤免疫逃逸的新机制	研究主要基于体外细胞实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内动物模型的验证	探究TXN在NSCLC免疫治疗耐药性中的作用及其分子机制	非小细胞肺癌（NSCLC）患者组织样本及A549和SK-MES-1细胞系	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NSCLC患者组织样本及两种肺癌细胞系（A549和SK-MES-1）
251	2025-05-15	Piezo1 regulates fibrocartilage stem cell in cartilage growth and osteoarthritis 2025-May-08, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1 DOI:10.1016/j.joca.2025.04.013 PMID:40345612	research paper	该研究探讨了机械敏感离子通道Piezo1在颞下颌关节（TMJ）软骨生长和骨关节炎中的作用	首次揭示了Piezo1在颞下颌关节纤维软骨干细胞（FCSC）分化和软骨内骨化中的关键调控作用，并发现其在骨关节炎病理条件下的保护性作用	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究机械敏感离子通道Piezo1在颞下颌关节发育和骨关节炎中的作用机制	人类颞下颌关节样本和小鼠模型	骨关节疾病研究	颞下颌关节骨关节炎（TMJOA）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、条件性基因敲除（CKO）、组织学和免疫组化分析	Gli1-CreERT2; Piezo1fl/fl条件敲除小鼠	基因表达数据、组织学图像数据	人类TMJ样本（数量未明确）和小鼠模型
252	2025-05-15	Abundance of a metabolically active subpopulation in dedifferentiated adipocytes inversely correlates with body mass index 2025-May-08, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2025.102161 PMID:40348015	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，识别出人类脂肪细胞中一个具有独特基因表达和功能特征的亚群，该亚群与代谢活性增加相关，并与BMI呈负相关	发现了一个新的脂肪细胞亚群（C7∗），该亚群具有肌肉细胞基因特征和更高的代谢活性，且其丰度与BMI呈负相关	研究样本量较小（11名捐赠者），且机制研究仍需进一步深入	探究脂肪组织中不同亚群的细胞组成和功能特性，及其与代谢疾病（如肥胖）的关联	人类去分化脂肪细胞（DFAT）及其亚群	代谢研究	肥胖	单细胞RNA测序（10x Genomics）、FACS、批量RNA测序	NA	RNA测序数据、临床参数数据	11名人类捐赠者的脂肪细胞样本，以及1759名捐赠者的皮下脂肪组织基因表达数据
253	2025-05-15	Blocking LIF and PD-L1 enhances the antitumor efficacy of SBRT in murine PDAC models 2025-May-07, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-010820 PMID:40341024	研究论文	研究探讨了在鼠胰腺导管腺癌模型中，通过阻断LIF和PD-L1增强立体定向体部放疗（SBRT）的抗肿瘤效果	首次展示了LIF和PD-L1同时抑制与SBRT联合治疗的显著协同效应，并深入分析了其免疫调节机制	研究仅在鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验	探索胰腺导管腺癌的新型联合治疗方案	鼠胰腺导管腺癌模型	肿瘤免疫治疗	胰腺癌	流式细胞术、Luminex检测、bulk RNA测序、单细胞RNA测序	鼠原位胰腺肿瘤模型	基因表达数据、免疫细胞表型数据	多个鼠胰腺肿瘤模型
254	2025-05-15	Transcriptomic Plasticity of Human Alveolar Macrophages Revealed by Single-Cell RNA Sequencing Following Drug Exposure: Implications for Therapeutic Development 2025-May-07, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26094439 PMID:40362676	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究药物暴露后人类肺泡巨噬细胞的转录组可塑性，为治疗开发提供新见解	揭示了肺泡巨噬细胞在不同药物处理下的转录组可塑性，并证实其可通过药物重编程改变表型	研究仅基于体外实验，未验证在体内的实际治疗效果	探究肺泡巨噬细胞的转录组可塑性及其在肺纤维化治疗中的潜在应用	人类肺泡巨噬细胞	单细胞转录组学	肺纤维化	scRNA-seq, qPCR	NA	RNA测序数据	NA
255	2025-05-15	Single-Cell Transcriptomics Reveals Stem Cell-Derived Exosomes Attenuate Inflammatory Gene Expression in Pulmonary Oxygen Toxicity 2025-May-07, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26094462 PMID:40362698	研究论文	本文通过单细胞转录组学技术研究了干细胞来源的外泌体在减轻肺氧毒性炎症基因表达中的作用及其分子机制	首次揭示了外泌体在肺氧毒性中的作用机制，并整合单细胞RNA测序和批量分析技术，阐明了间充质干细胞外泌体在肺氧毒性模型中的保护效应	研究仅基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探究干细胞外泌体保护肺组织的机制及潜在分子调控网络	小鼠肺氧毒性模型中的细胞群体变化	单细胞转录组学	肺氧毒性	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	NA
256	2025-05-15	NEUROD1 efficiently converts peripheral blood cells into neurons with partial reprogramming by pluripotency factors 2025-May-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2401387122 PMID:40299704	研究论文	本研究介绍了一种优化的方法，通过外周血细胞将体细胞转化为神经元，避免了诱导多能干细胞（iPSC）中间步骤	使用NEUROD1和四种Yamanaka重编程因子的独特组合，在3周内生成谷氨酸能神经元，提供了一种非侵入性、高效、快速且便捷的方法	虽然外周血细胞提供了潜在的替代方案，但其在神经元重编程中的广泛应用仍需进一步验证	开发一种非侵入性、高效、快速且便捷的方法，将外周血细胞转化为神经元，用于神经系统疾病建模和药物发现	外周血细胞	细胞重编程	神经系统疾病	单细胞RNA测序、全基因组亚硫酸氢盐测序、Cre-LoxP系统谱系追踪	NA	基因表达数据、甲基化数据	NA
257	2025-05-15	Induced B cell receptor diversity predicts PD-1 blockade immunotherapy response 2025-May-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2501269122 PMID:40314973	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和高清空间转录组学等方法，分析了接受抗PD-1治疗的基底细胞癌患者，发现B细胞受体（BCR）克隆多样性的诱导与PD-1抑制治疗的成功反应相关	揭示了B细胞受体克隆多样性在PD-1阻断免疫治疗反应中的动态作用，并开发了基于基线肿瘤RNA测序的机器学习模型来预测PD-1诱导的BCR克隆多样性	研究样本量有限，且需要进一步验证机器学习模型在其他癌症类型中的普适性	探索PD-1阻断免疫治疗反应的机制，并寻找预测治疗反应的生物标志物	局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者	digital pathology	basal cell carcinoma, glioblastoma, melanoma, head and neck squamous cell carcinoma	单细胞RNA测序, 高清空间转录组学, 空间免疫受体分析	machine learning model	RNA测序数据, 空间转录组数据	一组局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及更大规模的胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者队列
258	2025-05-15	Vagus nerve modulates acute-on-chronic liver failure progression via CXCL9 2025-May-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1 DOI:10.1097/CM9.0000000000003104 PMID:38945689	research paper	该研究揭示了迷走神经通过调控CXCL9表达在急性-慢性肝衰竭（ACLF）发展中的作用机制	首次发现迷走神经-巨噬细胞-CXCL9轴的神经免疫通讯机制在ACLF发展中的关键作用	研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，临床转化需要进一步验证	阐明迷走神经调控ACLF发展的分子机制	急性-慢性肝衰竭（ACLF）小鼠模型和患者样本	神经免疫学	肝病	蛋白质组学分析、scRNA-seq、流式细胞术、免疫组化/免疫荧光染色、CRISPR/Cas9技术	小鼠ACLF模型	蛋白质组数据、单细胞转录组数据、流式细胞数据、组织图像数据	ACLF小鼠模型和患者样本（具体数量未明确说明）
259	2025-05-15	A Transfer Learning Framework for Predicting and Interpreting Drug Responses via Single-Cell RNA-Seq Data 2025-May-04, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26094365 PMID:40362602	研究论文	本研究提出了一种基于迁移学习的框架，利用单细胞RNA测序数据预测和解释药物反应	设计了一个共享编码器将批量测序和单细胞测序数据映射到统一的潜在空间，并通过先验生物知识引导的稀疏解码器增强模型的可解释性	临床样本获取有限，且单细胞RNA测序药物反应数据的系统性收集和利用仍不充分	提高药物反应预测的准确性和可解释性	单细胞RNA测序药物反应数据	机器学习	癌症	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	迁移学习框架	单细胞RNA测序数据	五个精选的单细胞RNA测序数据集
260	2025-05-15	Comprehensive single-cell profiling of T and B cell subsets in mice reveals impacts on memory immune responses in FMDV infection 2025-May, Virology IF:2.8Q3 DOI:10.1016/j.virol.2025.110496 PMID:40090183	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究了FMDV感染对小鼠T和B细胞亚群记忆免疫反应的影响	首次全面分析了FMDV感染对记忆免疫细胞亚群的影响，并揭示了Fos相关基因的关键作用	研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他动物模型中验证	探究FMDV感染对记忆免疫反应的影响机制	小鼠脾脏中的T和B细胞亚群	免疫学	口蹄疫	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	未明确说明的小鼠脾脏细胞样本