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当前共找到 40345 篇文献,本页显示第 241 - 260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
241 2026-06-09
Spatiotemporal role of GLI2 in driving SHH-medulloblastoma tumorigenesis
2026-Jun-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 探究GLI2在驱动SHH型髓母细胞瘤发生中的时空作用 首次揭示GLI2过表达单独即可驱动胚胎Math1+前体细胞形成SHH型髓母细胞瘤,并阐明了MAPK通路在其中的关键作用 NA 阐明GLI2扩增在SHH型髓母细胞瘤发生中的作用机制及其时空窗口 GLI2扩增的SHH型髓母细胞瘤小鼠模型及人类肿瘤样本 机器学习 髓母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 新型小鼠模型及人类肿瘤样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
242 2026-06-09
Toward a multiomics framework for understanding symbiotic nitrogen fixation
2026-Jun, Trends in plant science IF:17.3Q1
综述 本文综述了通过多组学框架(如端粒到端粒基因组、单细胞和空间转录组学、表观基因组学等)理解共生固氮作用的最新进展,并提出人工智能引导的路线图以推动非豆科作物的工程改造 提出人工智能引导的整合序列、染色质可及性和表达数据的路线图,用于优先调控元件、设计紧凑编辑集并指导非豆科作物的细胞类型特异性部署 该框架主要基于描述性数据,缺乏实验验证,且从模型到实际非豆科作物的转化仍存在挑战 减少对合成氮肥的依赖,通过生物固氮的工程化部署实现可持续农业 共生固氮相关植物(包括豆科和非豆科作物),以及放线菌共生系统 机器学习 NA 端粒到端粒基因组组装、泛基因组分析、单细胞转录组学、空间转录组学、表观基因组学、3D基因组图谱、人工智能 AI模型(未指定具体类型) 序列、染色质可及性、基因表达、细胞状态、三维基因组数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
243 2026-06-09
Platelet hyperactivation drives oxidized mitochondrial DNA-induced neutrophil extracellular traps formation in biliary atresia
2026-Jun, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1
研究论文 研究了胆道闭锁中血小板过度激活驱动氧化线粒体DNA诱导的中性粒细胞胞外陷阱形成及潜在的治疗靶点 首次揭示血小板过度激活通过释放氧化线粒体DNA促进NET形成,并发现S100A8/A9作为治疗靶点用paquinimod抑制可改善小鼠生存率 研究主要基于回顾性临床数据和动物模型,尚需进一步验证在人体的治疗效果和长期安全性 探究血小板过度激活在胆道闭锁中驱动NET介导炎症的机制及S100A8/A9靶向治疗潜力 胆道闭锁患者血小板和中性粒细胞,以及RRV注射诱导的胆道闭锁小鼠模型 机器学习 新生儿胆道疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 435例胆道闭锁患者(其中236例血小板计数升高)及小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
244 2026-06-09
Elevation of liver elasticity following radiofrequency ablation reflects neutrophil-mediated abscopal effect in liver cancer
2026-Jun, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1
研究论文 本文研究射频消融后肝脏弹性升高与中性粒细胞介导的远隔效应在肝癌中的关联 首次将射频消融后肝脏弹性变化与中性粒细胞免疫反应联系起来,并发现CD40激动剂可作为增强抗肿瘤免疫的辅助策略 未提及具体局限性 探究射频消融后肝脏弹性动态变化与中性粒细胞反应的相关性,并探索潜在的辅助治疗策略 肝细胞癌患者和肝癌小鼠模型 机器学习 肝癌 单细胞RNA测序、多组学分析、多重免疫荧光染色、流式细胞术 NA 基因表达数据、影像数据 102例患者和每组4-6只小鼠 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
245 2026-06-09
anndataR improves interoperability between R and Python in single-cell transcriptomics
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 anndataR 提升了单细胞转录组学中 R 和 Python 之间的互操作性 允许 R 用户原生读写 H5AD 文件,并将其转换为 SingleCellExperiment 或 Seurat 对象,确保 Python 和 R 之间长期互操作性 未明确指出 促进单细胞转录组学数据在 R 和 Python 之间的互操作 H5AD 文件格式的单细胞转录组数据集 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
246 2026-06-09
Single-Cell RNA-Seq Combined With Bulk RNA-Seq Revealed the Involvement of Pancreatic Cancer Tissue-Resident Macrophages in Tumour Progression and the Immunotherapy Response
2026-Jun, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序揭示胰腺癌组织驻留巨噬细胞在肿瘤进展和免疫治疗反应中的作用 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据,识别并表征了胰腺癌中特定的组织驻留巨噬细胞亚群,并建立了TAM评分系统,发现TRM_C4评分可预测免疫治疗反应,为靶向特定巨噬细胞亚群增强免疫治疗效果提供了新策略 未在独立临床队列中进行验证,且研究主要基于公开数据库数据,缺乏前瞻性实验验证 表征胰腺癌肿瘤相关巨噬细胞的异质性,探究组织驻留巨噬细胞在肿瘤进展和免疫治疗反应中的功能作用 胰腺癌组织驻留巨噬细胞亚群 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA 测序数据 来自GEO和TCGA数据库的胰腺癌样本 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
247 2026-06-09
Supervised deep learning with gene functional annotation for cell classification
2026-Jun, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 提出了一种整合基因功能注释与单细胞RNA测序数据的深度监督学习方法用于细胞分类 提出了SDAN方法,首次将基因功能注释信息(如蛋白质-蛋白质相互作用)通过图神经网络整合到基因表达谱中,以识别具有功能一致性的基因集 未提及 开发一种能同时实现准确结果分类和明确基因功能关系分配的方法 单细胞RNA测序数据集的细胞分类及与严重COVID-19、痴呆症和癌症免疫疗法反应相关的基因集 机器学习 COVID-19, 痴呆症, 癌症 单细胞RNA测序, 图神经网络 图神经网络 基因表达数据 三个真实数据集,涉及严重COVID-19、痴呆症和癌症免疫疗法反应 NA 单细胞RNA测序 NA NA
248 2026-06-09
CeSpGRN: inferring cell-specific gene regulatory networks from single-cell multi-omics and spatial data
2026-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出CeSpGRN方法,从单细胞多组学和空间数据推断细胞特异性基因调控网络 现有方法推断群体或细胞类型水平的基因调控网络,而CeSpGRN利用核加权高斯copula图形模型,在目标函数中整合单细胞分辨率区域信息或多个组学或空间位置信息,以推断细胞特异性网络 NA 从单细胞RNA-seq、配对的scRNA-seq和scATAC-seq或空间转录组学数据推断细胞特异性基因调控网络 模拟数据集和真实数据集中的细胞 机器学习 NA 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 核加权高斯copula图形模型 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 模拟数据集和真实数据集 NA 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 NA NA
249 2026-06-09
Synergistic Interaction Between MALAT1/miR-30b-5p/BAFF Axis and Inflammatory Cytokines Underlies Rituximab-Refractory NMOSD
2026-Jun, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 探讨MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在单核细胞中的激活对NMOSD疾病发作和利妥昔单抗耐药复发的影响 首次发现MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在 monocytes 中被激活,并与利妥昔单抗难治性NMOSD的炎症因子释放相关 样本量较小,尤其是单细胞测序只有2例患者,可能影响结果普适性 阐明利妥昔单抗治疗后仍有复发突破的NMOSD患者中MALAT1/miR-30b-5p/BAFF轴在单核细胞中的调控机制 NMOSD患者外周血单个核细胞(PBMCs)和血清 数字病理学 视神经脊髓炎谱系疾病(NMOSD) qPCR, ELISA, Western Blot, 双荧光素酶报告实验, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 NMOSD onset病例: PBMCs n=10, 血清 n=23; 利妥昔单抗治疗病例: 缓解 n=26, 难治复发 n=13; 健康对照 n=15; 单细胞测序: 2例难治复发, 2例缓解, 2例健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA 单细胞RNA测序使用具体平台未在摘要中说明
250 2026-06-09
Single‑cell Transcriptomic Profiling of Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells Reveals Lineage Heterogeneity and Dysregulated Osteoblast Genes in Osteoporosis Versus Osteoarthritis
2026-Jun-01, Current gene therapy IF:3.8Q2
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示骨质疏松症与骨关节炎患者骨髓间充质干细胞的谱系异质性和成骨细胞基因失调 首次在单细胞水平上系统比较骨质疏松症与骨关节炎患者骨髓间充质干细胞的细胞亚型组成差异,并鉴定出与疾病进展相关的软骨细胞和成骨细胞动态发育及转录调控机制 仅基于公共数据库数据集GSE147287,且大鼠模型验证中样本量有限,结果需进一步在更大规模临床样本中验证 揭示骨质疏松症和骨关节炎中骨髓间充质干细胞的细胞谱系异质性及其分子机制差异 骨质疏松症和骨关节炎患者的骨髓间充质干细胞 单细胞转录组学 骨质疏松症,骨关节炎 单细胞RNA测序 Seurat, Monocle 2, GENIE3 单细胞转录组数据 骨质疏松症和骨关节炎患者的骨髓间充质干细胞样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
251 2026-06-09
Comprehensive Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Unveil the Dynamic Landscape of Betel Nut-Associated Oral Mucosal Carcinogenesis and Its Tumor Microenvironment
2026-Jun, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学,全面解析了槟榔相关口腔黏膜癌变过程中的肿瘤微环境动态和细胞异质性 首次利用单细胞和空间转录组学技术系统描绘槟榔相关口腔黏膜癌变的动态图谱,鉴定了关键恶性上皮亚群LAMC2 EpiC6及其与CAFs的互作机制 样本量有限(6例患者),且缺乏功能验证实验 阐明槟榔咀嚼导致口腔鳞状细胞癌的肿瘤微环境动态和细胞异质性机制 6例口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本 数字病理学 口腔癌(口腔鳞状细胞癌) 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 6例口腔鳞状细胞癌患者 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序平台,10x Visium空间转录组平台
252 2026-06-09
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Uncover Immune Dynamics and Cellular Heterogeneity in Benign Prostatic Hyperplasia and Prostate Cancer Transition
2026-Jun, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示良性前列腺增生与前列腺癌转化过程中的免疫动态和细胞异质性 首次利用单细胞和空间转录组学联合分析,描绘了从良性增生到恶性肿瘤的管腔上皮细胞连续转化图谱,并揭示了伴随的免疫抑制微环境动态变化 未提及明显的局限性 探索良性前列腺增生与前列腺癌在免疫状态和恶性进展中的关联,为早期诊断和免疫治疗提供依据 正常、良性前列腺增生和前列腺癌组织样本 数字病理学 前列腺癌, 良性前列腺增生 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 未明确提及具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
253 2026-06-09
Hydroxytyrosol confers resilience against the depressive, anxiogenic and cognition-disruptive effects of chronic stress
2026-Jun, Neurobiology of stress IF:4.3Q1
研究论文 该研究通过慢性不可预测束缚应激大鼠模型,探讨羟基酪醇对慢性应激引起的抑郁、焦虑和认知障碍的保护作用及其神经保护机制 首次在雌雄大鼠模型中系统评估生物技术生产的羟基酪醇对慢性应激的多维度保护作用,并结合单细胞RNA测序揭示其通过维持神经元转录稳态来抵抗应激的分子机制 未明确提及局限性 研究羟基酪醇对慢性应激诱导的抑郁、焦虑和认知障碍的保护作用及其潜在机制 雌性和雄性大鼠 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 雌性和雄性大鼠,具体样本量未明确说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
254 2026-06-09
Landscape of Immune Remodeling and NAP1L1-Driven Epithelial Reprogramming in Gastric Cancer Metastasis
2026-Jun, Chronic diseases and translational medicine
研究论文 通过单细胞RNA测序数据分析胃癌转移过程中免疫微环境重塑和NAP1L1驱动的上皮细胞重编程 首次系统描绘胃癌从原发灶到转移灶的免疫和上皮细胞动态图谱,并鉴定NAP1L1作为调控上皮细胞重编程和转移进展的新因子 仅基于公共单细胞数据进行分析,缺乏体内外实验验证;样本中淋巴结转移样本量较少 解析胃癌转移过程中肿瘤细胞和免疫微环境的细胞及分子机制 胃癌患者的正常组织、原发肿瘤和转移病灶的细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 131个样本(27例正常胃组织、48例原发肿瘤、56例转移病灶) NA 单细胞RNA测序 NA NA
255 2026-06-09
HBV-driven expansion of CXCR6+-exhausted T cells and CXCL16+ macrophage interaction: Implications for immunotherapy in HCC
2026-Jun-01, Innovation (Cambridge (Mass.))
研究论文 该研究揭示了HBV阳性肝细胞癌患者对免疫治疗反应更佳的原因,主要与新型PD-1+CXCR6+CD8+T细胞亚群的富集及其与CXCL16+巨噬细胞的相互作用有关 首次发现并鉴定了一种新型耗竭CD8+T细胞亚群PD-1+CXCR6+CD8+T细胞,并阐明其与CXCL16+巨噬细胞的相互作用是HBV-HCC患者免疫治疗反应增强的关键机制 NA 探究乙型肝炎病毒如何影响HBV阳性肝细胞癌患者的免疫治疗反应,并揭示其潜在的免疫机制 528名接受免疫治疗的肝细胞癌患者、HCC小鼠模型 NA 肝细胞癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、组织微阵列、过继T细胞转移、抗PD-1治疗 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、组织微阵列数据 528名肝细胞癌患者,包含不同肝炎感染类型 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
256 2026-06-09
Multi-omics analysis identifies a major histocompatibility complex class II-associated antigen-presenting cancer-associated fibroblast-like state linked to the nuclear factor erythroid 2-related factor 2-karyopherin subunit beta 1 axis in nonsmall cell lung cancer
2026-Jun, Journal of cell communication and signaling IF:3.6Q3
研究论文 通过多组学分析鉴定非小细胞肺癌中与NRF2-KPNB1轴相关的MHC-II类抗原呈递癌症相关成纤维细胞状态及其免疫特性 首次发现非小细胞肺癌中存在一种与NRF2-KPNB1轴相关的MHC-II类抗原呈递癌症相关成纤维细胞状态,并阐明其对抗PD-1治疗反应的影响 未明确说明局限性 定义非小细胞肺癌中抗原呈递癌症相关成纤维细胞状态的转录特征、空间分布和免疫相关特性,并评估其与NRF2-KPNB1轴的关系 非小细胞肺癌患者样本中的癌症相关成纤维细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量转录组学 NA 转录组数据, 空间转录组数据 从非小细胞肺癌患者获取的原代癌症相关成纤维细胞 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
257 2026-06-09
Species-specific roles of cellular communication network proteins in cartilage development: A comparative study using in vitro chondrogenic models
2026-Jun, Journal of cell communication and signaling IF:3.6Q3
研究论文 通过比较鸡、小鼠和人软骨发育模型,构建以CCN蛋白为中心的调控网络,揭示其物种特异性作用 首次系统比较不同物种软骨发育中CCN蛋白的调控网络,发现CCN1/2为核心保守枢纽,并揭示物种特异性环境感知机制 未说明 阐明CCN蛋白在软骨发育中的物种特异性作用及其调控网络 鸡和小鼠胚胎肢芽微团培养、人间充质干细胞软骨分化模型 计算生物学 NA RNA-seq, 单细胞RNA测序 共表达网络, 蛋白质-蛋白质相互作用网络 转录组数据 鸡和小鼠胚胎肢芽微团培养样本、人间充质干细胞软骨分化样本、人iPSC软骨分化单细胞数据集 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq NA
258 2026-06-09
Identification of diagnostic biomarkers for neonatal necrotizing enterocolitis via machine learning screening and single-cell virtual gene knockout validation
2026-Jun, Journal of cell communication and signaling IF:3.6Q3
research paper 通过机器学习筛选和单细胞虚拟基因敲除验证,识别新生儿坏死性小肠结肠炎的诊断生物标志物 整合113种机器学习算法组合筛选诊断基因,并首次使用单细胞虚拟基因敲除(scTenifoldKnk)和Geneformer组合扰动分析验证生物标志物,揭示铁死亡作为潜在病理汇聚点 研究主要基于公开数据集和动物模型,缺乏大规模前瞻性临床队列验证 识别新生儿坏死性小肠结肠炎的早期诊断生物标志物并探索其分子机制 新生儿坏死性小肠结肠炎患者和对照组的肠道样本、小鼠NEC模型及肠上皮细胞系 machine learning neonatal necrotizing enterocolitis RNA-seq,单细胞RNA测序,qRT-PCR RF + XGBoost 基因表达数据,单细胞转录组数据 36例NEC患者和34例对照(公共数据集),11,308个肠道细胞(单细胞测序),以及小鼠模型和细胞系 NA bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
259 2026-06-09
A first-in-class bifunctional antibody targeting CD20 and CD37 remodels the immune microenvironment in relapsed or refractory B-cell malignancies
2026-May-29, Journal of hematology & oncology IF:29.5Q1
研究论文 描述了一种靶向CD20和CD37的首创双功能抗体PSB202在复发或难治性B细胞恶性肿瘤中的I期临床试验,该抗体通过重塑免疫微环境发挥抗肿瘤作用 首次开发靶向CD20和CD37的双功能抗体,无需T细胞参与即可耗竭恶性B细胞,可能减轻CD3相关毒性同时促进细胞毒性免疫激活 该研究为I期试验,样本量较小(15例患者),且未达到最大耐受剂量 评估双特异性抗体PSB202在复发或难治性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的安全性和疗效 复发或难治性CD20阳性B细胞非霍奇金淋巴瘤患者 数字病理学 B细胞非霍奇金淋巴瘤 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 15例经过大量预治疗的患者,中位年龄67.7岁(范围54-78岁) NA 单细胞RNA测序 NA NA
260 2026-06-09
Single-cell transcriptomics reveals glycolytic heterogeneity and identifies STC2 as a key regulator of metabolic reprogramming in osteosarcoma
2026-May-21, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 通过单细胞转录组学揭示骨肉瘤中糖酵解异质性并确定STC2为代谢重编程的关键调控因子 通过整合单细胞RNA测序与hdWGCNA,首次在单细胞水平描绘骨肉瘤的代谢图谱,并发现STC2作为糖酵解相关肿瘤进展的关键调控因子,其靶向治疗可有效逆转代谢重编程 文中未明确提及研究局限性 解析骨肉瘤中糖酵解相关的细胞亚群和调控网络,探索治疗新靶点 骨肉瘤细胞(包括MG-63和U2OS细胞系)以及12个骨肉瘤样本的单细胞转录组数据 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、大容量转录组学、高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)、Seahorse细胞外通量分析 NA 单细胞转录组数据、批量转录组数据 12个骨肉瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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