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当前共找到 39915 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-05-30 |
The Current Landscape of Metastatic Breast Cancer: A Pathology Guide on Emerging Biomarkers
2026-May-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18101544
PMID:42192904
|
综述 | 本文综述了转移性乳腺癌生物标志物检测的当前景观，包括常规标志物和新兴标志物，以及液体活检等技术进展 | 本文全面整合了最新临床指南与文献，强调了液体活检（如ctDNA分析）在实时监测和耐药检测中的重要性，并展望了AI和空间转录组学将推动病理学从静态诊断向动态预测模型转变 | 作为综述，未提供原始实验数据；新兴生物标志物如AI和空间转录组学的临床应用仍处于早期阶段 | 全面合成转移性乳腺癌生物标志物检测的当前景观，详细说明哪些生物标志物需要检测及其临床依据 | 转移性乳腺癌（MBC）患者及相关生物标志物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2026-05-30 |
The Role of Next-Generation Sequencing in Cardiovascular Disease: A New Era of Precision Cardiology
2026-May-10, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life16050796
PMID:42195352
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综述 | 本文综述了下一代测序（NGS）如何推动心血管疾病的精准医疗，包括分子诊断、风险预测和新兴治疗应用 | 系统总结了NGS从单基因分析向综合遗传变异评估的转变，并讨论了长读长测序和单细胞测序等新技术的前景 | 未提供具体临床试验数据，主要基于现有文献综述，缺乏实证验证 | 探讨NGS在心血管疾病精准诊疗中的应用现状与未来方向 | 心血管疾病相关遗传变异及临床应用 | 机器学习 | 心血管疾病 | NGS，长读长测序，单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2026-05-30 |
Molecular Target Discovery and Systemic Mechanism Analysis of Teriflunomide for Dry Eye Disease
2026-May-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48050492
PMID:42193097
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research paper | 采用整合计算与转录组学框架，包括ADMET分析、多数据集转录组整合及单细胞RNA测序，鉴定特立氟胺治疗干眼病的多靶点机制 | 首次应用虚拟细胞模型AetherCell模拟靶点扰动与药物诱导反应的吻合度，揭示特立氟胺通过协调多靶点调控发挥治疗作用的新机制 | NA | 探究特立氟胺治疗干眼病的分子靶点及系统机制 | 干眼病相关上皮细胞和免疫细胞 | machine learning | 干眼病 | 单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | AetherCell虚拟细胞模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2026-05-30 |
SIRT1 in Cardiac Diseases: Molecular Mechanisms, Therapeutic Potential, and Future Directions
2026-May-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104216
PMID:42196199
|
综述 | 本文综述了SIRT1在多种心脏疾病中的分子机制、治疗潜力和未来研究方向 | 系统总结了SIRT1在心脏疾病中的多面保护作用及其双重角色，并整合了多组学和单细胞转录组学的前沿方法 | SIRT1的过度表达可能有害，需精确调控；心脏特异性靶向、NAD可用性优化及临床转化仍面临挑战 | 探讨SIRT1在心脏疾病中作为治疗靶点和生物标志物的潜力 | SIRT1及其在心肌缺血/再灌注损伤、心力衰竭、糖尿病心肌病、心脏肥大、衰老相关心功能障碍和昼夜节律紊乱中的作用 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 245 | 2026-05-30 |
Unfolding Immune Dysregulation in COPD: Identification of a Three-Gene Signature and Functional Validation of TCF7 in Human Lung Tissue and T Lymphocytes
2026-May-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104231
PMID:42196213
|
研究论文 | 通过机器学习识别COPD免疫失调的三基因标志物，并在人体肺组织和T淋巴细胞中验证TCF7的功能 | 首次鉴定出TCF7、EGR1和NFKB1三种基因作为COPD免疫失调的标志物，并验证了TCF7在T细胞中的关键调控作用及其对caspase-8的影响 | 未提及具体限制 | 揭示COPD的免疫失调机制并识别潜在生物标志物和治疗靶点 | COPD患者和健康对照的肺组织、T淋巴细胞及巨噬细胞 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | qRT-PCR, ELISA, Western blotting, 免疫荧光 | 机器学习模型 | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | 未明确提及样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2026-05-30 |
BART-spatial unravels biologically significant transcriptional regulators from spatial omics data
2026-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.05.723027
PMID:42146333
|
研究论文 | 开发了一种名为BART-spatial的计算方法，用于从空间组学数据中推断功能性的转录调控因子 | BART-spatial创新性地整合了空间变异性与伪时间信息，结合公开的转录调控因子结合谱数据，能够从空间转录组学和表观组学数据中识别低表达的转录调控因子，弥补了现有工具忽视空间异质性的不足 | 未提及 | 开发一种能够从空间组学数据中推断功能性转录调控因子的计算方法 | 空间组学数据中的转录调控因子 | 机器学习 | NA | 空间转录组学，空间表观组学 | BART-spatial | 空间组学数据 | 多个空间数据集，涵盖10X Visium、Visium HD、Atera和空间RNA-ATAC-seq等平台 | 10x Genomics, Atera | 空间转录组学，空间表观组学 | 10x Visium, Visium HD, Atera, 空间RNA-ATAC-seq | NA |
| 247 | 2026-05-30 |
Hypoxia Impairs CD8+ T Cell Fitness and Is Associated with a Dysfunctional CD8+ T Cell State in Pancreatic Cancer
2026-May-08, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18101508
PMID:42192869
|
研究论文 | 本研究利用体外系统结合胰腺癌细胞与癌症相关成纤维细胞，揭示缺氧抑制CD8+ T细胞积累，并联合肿瘤细胞与CAFs衍生因子通过增加细胞死亡和减少增殖损害T细胞适应性，最终导致终末分化、功能失调的T细胞状态 | 首次将缺氧信号与肿瘤微环境中的细胞外因子结合，系统解析其对CD8+ T细胞功能性适应的协同抑制作用，并利用单细胞RNA测序数据验证人胰腺癌中相关转录特征 | 体外模型可能无法完全复现体内复杂微环境；仅基于转录组分析，缺乏蛋白质组或代谢组验证；样本量有限，需进一步扩大临床样本确认 | 阐明缺氧在胰腺癌中如何与肿瘤细胞及成纤维细胞协同损害CD8+ T细胞适应性，并探索其与功能失调状态的关系 | 胰腺导管腺癌中的CD8+ T细胞、胰腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 人胰腺癌组织样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 248 | 2026-05-30 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling Uncovers a Metastasis-Associated MUCL3+ Signet-Ring Cell Subpopulation in Gastric Cancer
2026-May-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15100857
PMID:42193868
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示胃癌中与转移相关的MUCL3阳性印戒细胞亚群 | 首次鉴定出MUCL3作为胃印戒细胞癌特异性标志物，并发现TFF1与胃癌细胞迁移相关 | 未明确说明局限性 | 比较胃印戒细胞癌与胃腺癌，寻找生物标志物并阐明印戒细胞癌侵袭行为的分子机制 | 胃印戒细胞癌和胃腺癌患者的手术切除原发胃癌组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 手术切除的原发胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 249 | 2026-05-30 |
Integrated Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Identifies Macrophage Heterogeneity and Mitophagy-Related Biomarkers in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-May-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27104201
PMID:42196184
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序，识别特发性肺纤维化中巨噬细胞异质性与线粒体自噬相关生物标志物 | 首次整合单细胞与批量转录组分析，揭示IPF巨噬细胞-线粒体自噬轴中GPNMB和CTSS的关键作用，为理解IPF发病机制提供新框架 | 未明确说明，但基于摘要可能未提及具体局限性，如样本规模或验证不足 | 探究特发性肺纤维化中巨噬细胞与线粒体自噬的关联，识别用于早期诊断和临床管理的生物标志物 | 特发性肺纤维化患者与对照组的巨噬细胞及免疫细胞 | 数字化病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫浸润分析、加权基因共表达网络分析、机器学习 | NA | RNA测序数据 | 未明确样本数量，但涉及IPF和对照组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于单细胞测序 |
| 250 | 2026-05-30 |
Systematic clustering alignment and feature characterization for single-cell omics using ACE-OF-Clust
2026-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710668
PMID:41959377
|
研究论文 | ACE-OF-Clust实现单细胞组学数据的系统性聚类对齐与特征表征 | 引入直接比较聚类解决方案、评估与标注的一致性，并利用特征级聚类剖面优先区分细胞类型的基因，同时评估基因集对聚类模式的贡献 | NA | 解决单细胞聚类中的聚类对齐问题，提高聚类结果的可解释性、灵活性和鲁棒性 | 单细胞转录组数据（scRNA-seq）和空间转录组（ST）数据，包括PBMC scRNA-seq和乳腺癌ST数据，以及多组学单细胞数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学单细胞测序 | 混合成员聚类模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、单细胞多组学 | NA | NA |
| 251 | 2026-05-30 |
spatiAlytica: Viewer-Grounded Multimodal Agentic System for Interactive Spatial Omics Analysis
2026-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.29.721735
PMID:42146494
|
研究论文 | 提出了一种嵌入Napari查看器的多模态交互式代理系统spatiAlytica，使非编程生物学家能通过自然语言进行迭代、假设驱动的空间组学分析 | 首次将查看器状态序列化、代理记忆、生物概念到数据字段映射、代码生成与调试、空间视觉问答及基于查看器的解释机制相结合，实现了无需编程的空间组学交互分析 | 可能受限于基准测试的覆盖范围和实际生物问题的复杂性，未提及对大规模数据或高噪声数据的鲁棒性验证 | 开发一种非程序员友好的交互式空间组学分析系统，支持自然语言驱动的探索性分析和解释性推理 | 空间转录组学和蛋白质组学数据（包括卡波西肉瘤、结直肠癌和卵巢癌组织样本） | 计算机视觉, 数字病理学 | 卡波西肉瘤, 结直肠癌, 卵巢癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 文本, 图像 | 空间分析编码问题222个、多轮序列工作流问题178个、图像推理问题7350个 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 252 | 2026-05-30 |
Cellular Origins and Context-Dependent Prognostic Effects of Lactate Metabolism Genes Reveal Novel Molecular Subtypes in Gastric Cancer
2026-May-04, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48050477
PMID:42193082
|
研究论文 | 通过乳酸代谢相关基因揭示胃癌新型分子亚型及其细胞起源和背景依赖性预后效应 | 首次通过单细胞RNA-seq整合分析，揭示乳酸代谢关键基因HK2和FABP4在不同细胞类型中的起源，并发现FABP4的预后效应具有背景依赖性，颠覆了传统预后模型固定效应的认知 | 跨平台预后模型验证失败，表明单队列来源的特征具有局限性；需要更多外部队列验证FABP4的细胞起源依赖性功能 | 解析胃癌异质性中乳酸代谢重编程的贡献，重点关注关键基因的细胞来源和背景特异性功能 | 胃癌患者肿瘤样本（TCGA队列375例）及单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 共识聚类 | 基因表达数据 | 375例胃癌患者样本（TCGA） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 253 | 2026-05-30 |
Artificial Intelligence for Spatial Immunometabolic Analysis of the Tumor Microenvironment: Current Evidence and Future Directions
2026-May-03, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48050476
PMID:42193081
|
综述 | 综述了人工智能在肿瘤微环境空间免疫代谢分析中的当前证据和未来方向 | 系统梳理了基于AI的空间免疫代谢研究，涵盖数字病理学、空间转录组学和多模态数据融合，并提出了多模态基础模型、联邦学习和空间解析靶点发现等新兴趋势 | 数据异质性、模型可解释性、泛化性和生物学验证等挑战仍需解决 | 全面概述基于AI的肿瘤微环境空间免疫代谢研究，探讨现有证据和未来发展方向 | 肿瘤微环境中的空间免疫代谢特征 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学、代谢组学、多重成像、AI | NA | 图像、空间转录组数据、代谢组数据、多模态数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 254 | 2026-05-30 |
Integrated Evolutionary and Multi-Omic Analysis of STAT Family Activation Across Solid Tumors
2026-May-03, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17050547
PMID:42195004
|
研究论文 | 对STAT家族在实体瘤中的激活进行综合进化与多组学分析 | 首次整合进化分析与多组学数据（转录组、调控子、单细胞及染色质结合）来解析STAT家族在实体瘤中的作用，揭示了STAT1非经典DNA识别模式 | 仅基于公开数据集，染色质结合分析限于干扰素刺激的细胞系，未进行体内验证 | 阐明STAT转录因子家族在实体瘤中的进化保守性及激活机制 | 人类实体瘤样本及正常组织 | 生物信息学 | 实体瘤 | 进化分析、转录组分析、调控子分析、单细胞RNA-seq、ChIP-seq | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、染色质免疫沉淀测序数据 | TCGA实体瘤样本与GTEx正常组织样本；HNSCC单细胞数据集；HeLa和K562细胞系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 255 | 2026-05-30 |
A Synthetic Lethality-Informed Multi-Omic Framework for Identifying a Five-Gene Diagnostic Signature in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026-May-02, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48050475
PMID:42193080
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研究论文 | 利用合成致死信息的多组学框架识别慢性阻塞性肺疾病的五基因诊断标志物 | 首次将合成致死相关基因优先排序与多组学整合及机器学习方法相结合，用于识别COPD的诊断标志物 | 未提及 | 为慢性阻塞性肺疾病早期诊断和风险分层识别可靠的分子生物标志物 | 慢性阻塞性肺疾病患者和健康对照者的转录组数据 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA-seq， 单细胞RNA测序， 免疫浸润分析， 体外实验 | LASSO回归， 随机森林 | 转录组数据 | 训练队列：220例COPD和108例对照；外部验证队列：98例COPD和91例对照 | NA | 单细胞RNA-seq， 批量RNA-seq | NA | NA |
| 256 | 2026-05-30 |
A Head and Neck Cancer Patient-Specific Microphysiological System for Predicting Response to Chemoradiation
2026-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.28.721391
PMID:42094510
|
研究论文 | 开发了一种头颈癌患者特异性微生理系统，用于预测对放化疗的反应 | 构建了包含患者自身恶性细胞、成纤维细胞、免疫细胞和内皮化管腔的三维血管化头颈癌肿瘤微环境模型，并利用单细胞RNA测序验证其保留了12种转录上不同的细胞群体 | 当前模型在捕捉个别头颈癌肿瘤及微环境的全部复杂性或患者间异质性方面仍有不足 | 开发能预测头颈癌患者对放化疗反应的个体化功能工具 | 头颈癌患者手术切除的肿瘤组织中的恶性细胞、成纤维细胞和免疫细胞 | 机器学习 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 来自头颈癌患者的多个样本（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 257 | 2026-05-30 |
Identification of RPA3 as a Potential Functional Effector of Chromosome 7 Gain in Glioblastoma
2026-Apr-30, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14051014
PMID:42193341
|
研究论文 | 本研究鉴定RPA3为胶质母细胞瘤中7号染色体获得性扩增的一个潜在功能效应因子 | 首次识别RPA3作为7号染色体获得性扩增中除经典位点外的剂量敏感候选基因，并证明其在胶质母细胞瘤恶性表型中的功能相关性 | 基于体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证及临床试验数据支持 | 鉴定胶质母细胞瘤中7号染色体获得性扩增相关的额外候选基因及其功能 | 胶质母细胞瘤肿瘤样本及U87、U118胶质瘤细胞系 | 机器学习和生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq，拷贝数分析，单细胞RNA-seq，siRNA敲低 | NA | 转录组数据，拷贝数数据，临床数据，单细胞RNA-seq数据 | TCGA-GBM和TCGA-LGG队列，CGGA-693队列，单细胞分析中chr7获得性和正常拷贝肿瘤亚克隆 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 258 | 2026-05-30 |
Somatic Mutation Trajectories Define Prognostically Distinct Subtypes and Shape the Tumor Microenvironment in Gastric Cancer
2026-Apr-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17050536
PMID:42194993
|
研究论文 | 通过体细胞突变轨迹重建将胃癌分为两种预后不同的亚型，并揭示其肿瘤微环境特征 | 首次应用SuStaIn算法从时间顺序角度分析胃癌体细胞突变积累过程，识别出加速路径和渐进路径两种进化轨迹，并关联了转录组和微环境差异 | 药物敏感性预测和基因表达与临床结局的机制联系仅为假设生成性发现，需前瞻性和功能性验证 | 重建胃癌体细胞突变轨迹以定义预后不同的亚型并分析相关的转录组和微环境特征 | 胃癌患者的体细胞突变数据、转录组数据和微环境特征 | 数字病理学 | 胃癌 | SuStaIn算法、基因表达分析、单细胞RNA测序反卷积、药物敏感性预测 | SuStaIn | 基因组突变数据、转录组数据 | 三个独立的外部转录组队列 | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2026-05-30 |
Putative Self-Organizing Human Corneal Organoids Recapitulate Human Corneal Architecture and Cellular Diversity
2026-Apr-29, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering13050518
PMID:42194275
|
研究论文 | 开发了一种使用人胚胎干细胞通过改良SEAM方案生成三维角膜类器官模型，该模型能重现人类角膜的多层结构和细胞多样性 | 首次通过自发三维球体培养方法生成具有角膜上皮、基质和内皮分层结构的角膜类器官，单细胞RNA测序揭示18个不同细胞簇，包括三种角膜上皮亚群和两种基质亚群 | 仅约20%的类器官形成透明区域，未来需要提高类器官形成效率和功能成熟度 | 建立能重现人类角膜复杂细胞架构和多样性的三维角膜类器官模型，用于角膜发育、疾病建模和再生医学研究 | 人胚胎干细胞来源的角膜类器官 | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | 三维角膜类器官模型 | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 7-8周分化培养的类器官样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3端测序平台用于分析类器官细胞组成和基因表达模式 |
| 260 | 2026-05-30 |
Integrative Multi-Omics and Machine Learning Analysis Identifies Therapeutic Targets and Drug Repurposing Candidates for Alzheimer's Disease
2026-Apr-27, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14050998
PMID:42193325
|
研究论文 | 通过整合多组学数据和机器学习方法，识别阿尔茨海默病的诊断生物标志物和治疗靶点，并筛选药物重利用候选分子 | 首次整合转录组学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接等多层分析方法，构建定量多组学收敛框架，系统识别免疫相关的治疗靶点及药物重利用候选物 | 所有预测均需在生化及细胞模型中进行实验验证后方可得出临床结论 | 开发整合多组学计算流程，识别阿尔茨海默病的诊断生物标志物并优先排序可药物干预的治疗靶点 | 阿尔茨海默病患者与健康对照的转录组数据、单细胞核RNA测序数据及FDA批准药物库 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 加权基因共表达网络分析、机器学习、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、贝叶斯共定位、分子对接、分子动力学模拟 | LASSO, 随机森林, 支持向量机 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 药物分子结构数据 | 1047个转录组样本（547例AD，500例对照）及48,481个单细胞核 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |