单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 29656 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-07-11 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the malignant characteristics of tumour cells and the immunosuppressive landscape in HER2-positive inflammatory breast cancer
2025-Jul-08, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03454-z
PMID:40624675
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研究论文 | 通过单细胞转录组技术分析HER2阳性炎症性乳腺癌的肿瘤微环境，揭示其恶性特征和免疫抑制景观 | 首次使用单细胞转录组技术全面比较HER2阳性炎症性乳腺癌与非炎症性乳腺癌的肿瘤微环境，发现PTN分子在肿瘤细胞中的高表达与其高侵袭性和免疫抑制微环境的强烈相关性 | 样本量较小（仅3例HER2阳性炎症性乳腺癌患者），且部分数据来自公共数据库 | 阐明HER2阳性炎症性乳腺癌肿瘤微环境的细胞组成和分子特征，为诊断和治疗提供新方向 | HER2阳性炎症性乳腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 3例HER2阳性炎症性乳腺癌患者的15,832个细胞 |
| 242 | 2025-07-11 |
Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data to Investigate Tumor Cell Heterogeneity in Uroepithelial Bladder Cancer and Predict Immunotherapy Response
2025-Jul-08, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
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研究论文 | 通过分析膀胱尿路上皮癌的单细胞RNA测序数据，研究肿瘤细胞异质性并预测免疫治疗反应 | 识别了与血管生成和肿瘤转移相关的缺氧肿瘤亚群，并基于Ste.genes构建了预测免疫检查点抑制剂(ICI)反应的机器学习模型 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，未进行实验验证 | 探究膀胱尿路上皮癌中肿瘤干细胞与免疫治疗耐药性的关系 | 膀胱尿路上皮癌(UBC)的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习模型 | RNA测序数据 | NA |
| 243 | 2025-07-11 |
Telomeric repeat-containing RNA increases in aged human cells
2025-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf597
PMID:40637232
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研究论文 | 本研究通过TERRA-capture RNA-seq和Oxford Nanopore直接RNA测序技术，解析了人类T2T-CHM13参考基因组中TERRA的转录区域，并发现TERRA在衰老的人类细胞中增加 | 开发了生物信息学工具TERRA-QUANT用于量化TERRA，并首次将TERRA与人类衰老及阿尔茨海默病早期阶段联系起来 | 未明确说明样本的具体数量及实验设计的详细限制 | 探究TERRA在人类衰老和疾病中的作用 | 人类血液、大脑和成纤维细胞中的TERRA | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | TERRA-capture RNA-seq, Oxford Nanopore直接RNA测序, 逆转录定量聚合酶链反应, 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 未明确说明具体数量，涉及血液、大脑和成纤维细胞等多种样本 |
| 244 | 2025-07-11 |
Pancreatic alpha and beta cell fate choice is directed by apical-basal polarity dynamics
2025-Jul-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.02.008
PMID:40056911
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research paper | 该研究揭示了顶端-基底极性作为调节多潜能胰腺Neurogenin3内分泌祖细胞分化为β或α细胞命运的主要调控因子 | 首次发现顶端-基底极性状态决定内分泌祖细胞向α或β细胞谱系分化的命运选择 | 研究主要基于人类内分泌祖细胞，尚未在完整器官或体内环境中验证 | 探索细胞外信号如何调控动态变化微环境中多潜能祖细胞的分化机制 | 人类胰腺Neurogenin3内分泌祖细胞(EPs) | developmental biology | diabetes | single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data | NA |
| 245 | 2025-07-11 |
Genomic evolution reshapes cell-type diversification in the amniote brain
2025-Jul-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.014
PMID:40367951
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研究论文 | 该研究通过构建爬行动物、鸟类和哺乳动物的单细胞图谱，揭示了羊膜动物大脑细胞类型在进化过程中的保守性和多样性 | 首次在单细胞分辨率下比较了多种羊膜动物大脑细胞类型的基因表达模式，并发现了鸟类特有的Purkinje细胞亚型及其相关基因通路 | 研究仅关注了端脑和小脑的部分区域，未涵盖整个大脑 | 探索羊膜动物大脑复杂性和认知能力进化的遗传机制 | 乌龟、斑胸草雀、鸽子、小鼠和猕猴的端脑与小脑细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据 | 超过130万个细胞，来自5个不同物种 |
| 246 | 2025-07-11 |
Molecular Mechanisms of Perivascular Macrophages in Alzheimer's Disease: Insights from Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization
2025-Jul-07, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-025-01590-w
PMID:40622473
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和孟德尔随机化分析探讨了血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病中的分子机制 | 结合单细胞测序与孟德尔随机化分析，识别出四个与AD风险显著相关的关键基因，并揭示了PVMs在免疫调节和代谢通路中的作用 | 研究主要基于已有数据集分析，需要进一步实验验证 | 探索血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病发病机制中的分子作用 | 血管周围巨噬细胞(PVMs)及其相关基因 | 生物医学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序, 孟德尔随机化(MR)分析 | NA | 单细胞测序数据, eQTL数据 | 基于GSE264648和eQTLGen数据集的分析 |
| 247 | 2025-07-11 |
Single-nucleus rna sequencing identifies universal camk1d upregulation and dysregulated c-ltmr subtypes as key drivers of paclitaxel-induced neuropathy
2025-Jul-07, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10065-z
PMID:40622640
|
研究论文 | 通过单核RNA测序技术研究紫杉醇诱导的神经病变疼痛的分子机制 | 首次使用单核RNA测序技术揭示紫杉醇诱导神经病变疼痛的细胞类型特异性改变，特别是C_LTMR亚型的转录组变化 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证 | 探索紫杉醇诱导神经病变疼痛的分子机制 | 小鼠背根神经节(DRG)细胞 | 神经科学 | 神经病变疼痛 | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 紫杉醇处理的小鼠背根神经节细胞 |
| 248 | 2025-07-11 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies systemic immunosuppressive myeloid cells and local monocytes/macrophages as key regulators in polytrauma-induced immune dysregulation
2025-Jul-07, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00444-x
PMID:40623986
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析，识别了系统性免疫抑制性髓系细胞和局部单核细胞/巨噬细胞作为多发伤诱导免疫失调的关键调节因子 | 首次同时研究系统性及局部免疫细胞，发现TIM细胞群体和Spp1单核细胞/巨噬细胞在免疫失调中的作用 | 研究基于大鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究多发伤诱导的免疫失调及其对骨折愈合的影响 | 大鼠多发伤模型中的血液、骨髓和局部缺损软组织 | 免疫学 | 多发伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 249 | 2025-07-11 |
Single-cell transcriptomic profiling of immune landscape in triple-negative breast cancer during neoadjuvant chemotherapy
2025-Jul-07, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00549-3
PMID:40624003
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序技术研究三阴性乳腺癌在新辅助化疗期间的免疫景观 | 首次发现并计算了S100АMHC单核细胞群体中的髓系来源抑制细胞（MDSC）特征评分，并验证了其在非响应患者中的升高 | 样本量有限，且仅关注了新辅助化疗的初始阶段 | 探究三阴性乳腺癌患者在新辅助化疗期间的免疫系统功能状态及其对化疗效果的影响 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括响应和非响应新辅助化疗的三阴性乳腺癌患者 |
| 250 | 2025-07-11 |
Integrated bioinformatics analysis identifies CHAD association with osteoporosis and in vitro chondrogenic effects of Wogonin
2025-Jul-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05861-w
PMID:40624035
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学方法识别与骨质疏松症相关的基因，并探索中药化合物对软骨生成的体外影响 | 首次将CHAD基因与骨质疏松症关联，并发现汉黄芩素对软骨生成的促进作用 | 仅进行了体外实验，尚未进行动物或临床验证 | 探索骨质疏松症的新型治疗靶点和中药替代疗法 | 骨质疏松症相关基因和中药化合物 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | RNA测序、分子对接、qRT-PCR | ATDC5细胞模型 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 |
| 251 | 2025-07-11 |
Neurogenomic and behavioral principles shape freezing dynamics and synergistic performance in Drosophila melanogaster
2025-Jul-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61313-z
PMID:40624091
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研究论文 | 本研究通过大规模行为实验和GWAS分析，揭示了果蝇在面对威胁时集体行为的神经和遗传基础 | 发现了影响视觉神经元发育和行为的基因位点Ptp99A和kirre，并验证了遗传多样性对集体行为的促进作用 | 研究仅针对果蝇这一模式生物，结果在其他物种中的普适性尚待验证 | 探究集体行为的神经和遗传机制 | 黑腹果蝇(Drosophila melanogaster) | 神经科学 | NA | GWAS、单细胞转录组学、功能实验、基于代理的模拟 | NA | 行为数据、基因表达数据 | 大规模果蝇群体 |
| 252 | 2025-07-11 |
Novel single-cell preservation and RNA sequencing technology unlocks field studies for Plasmodium natural infections
2025-Jul-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-08765-x
PMID:40624152
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研究论文 | 本文介绍了一种新型单细胞保存和RNA测序技术，用于疟原虫自然感染现场研究 | 开发了适用于低资源环境的单细胞RNA保存和测序技术，首次在自然感染疟原虫的现场研究中应用单细胞RNA测序 | 目前仅在P. knowlesi疟原虫中进行了验证，尚未在其他疟原虫物种或更广泛的现场环境中测试 | 开发适用于疟原虫自然感染现场研究的单细胞RNA测序技术 | 疟原虫(P. knowlesi)单细胞 | 基因组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 6个样本中的22,345个P. knowlesi单细胞转录组 |
| 253 | 2025-07-09 |
Author Correction: Spatial transcriptomics reveals regionally altered gene expression that drives retinal degeneration
2025-Jul-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08451-8
PMID:40624286
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 254 | 2025-07-11 |
Integrated analysis of polytranscriptomics reveals TNFSF ligand genes in pancreatic cancer prognosis and immune regulation
2025-Jul-07, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00733-4
PMID:40624624
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研究论文 | 本研究通过整合分析多转录组数据，揭示了TNFSF配体基因在胰腺癌预后和免疫调节中的作用 | 首次基于TNFSF配体表达谱对胰腺癌进行分子分型，并发现TNFSF4在B细胞中的高表达与良好预后及免疫治疗反应相关 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证TNFSF4的具体作用机制 | 探究TNF配体家族成员在胰腺癌中的表达模式及预后意义 | 胰腺癌(PC)患者样本 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq)、qRT-PCR | 非负矩阵分解(NMF) | 基因表达数据 | GSE212966和TCGA-PAAD数据集中的样本 |
| 255 | 2025-07-11 |
Current insight into HIV-1 persistence from single-cell transcriptome profiling in acutely treated cohorts of infection
2025-Jul-07, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000962
PMID:40638066
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学技术研究急性HIV-1感染治疗队列中病毒持久性的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术揭示HIV-1感染急性期治疗队列中的免疫反应变化、新型限制因子和潜伏因子，以及病毒储存细胞的标志物 | NA | 研究HIV-1病毒在宿主中的持久性机制 | HIV-1感染者的单细胞 | 基因组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 数十万个单细胞 |
| 256 | 2025-07-11 |
Microgravity modulates keratinocyte, fibroblast, and endothelial cell communication during wound healing
2025-Jul-06, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123842
PMID:40628314
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综述 | 本文综述了微重力环境下皮肤伤口愈合过程中角质形成细胞、成纤维细胞和内皮细胞之间通讯的调节机制 | 强调了单细胞转录组学等先进技术在微重力环境下皮肤伤口愈合机制研究中的应用 | 微重力环境下伤口愈合的具体分子机制仍需进一步研究 | 探讨微重力对皮肤伤口愈合过程中细胞通讯的影响 | 角质形成细胞、成纤维细胞和内皮细胞 | 生物医学 | 皮肤损伤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 257 | 2025-07-11 |
The reprogramming impact of SMAC-mimetic on glioblastoma stem cells and the immune tumor microenvironment evolution
2025-Jul-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03452-1
PMID:40616096
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研究论文 | 本研究评估了SMAC模拟物Xevinapant对胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）和肿瘤免疫微环境（TME）的重编程影响 | 首次在单细胞水平上评估Xevinapant对GBM的抗肿瘤和免疫调节作用，并发现其能激活抗肿瘤效应免疫反应 | 研究主要基于体外和小鼠模型，临床转化效果尚需进一步验证 | 开发针对胶质母细胞瘤干细胞同时重编程肿瘤微环境的新型治疗策略 | 胶质母细胞瘤干细胞和肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、体外存活实验、原位移植模型 | NA | 基因表达数据、生存数据 | 人类和小鼠的胶质母细胞瘤干细胞模型 |
| 258 | 2025-07-11 |
SpotSweeper: spatially aware quality control for spatial transcriptomics
2025-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02713-3
PMID:40481362
|
research paper | 介绍了一种名为SpotSweeper的空间感知质量控制方法，用于空间转录组学数据 | SpotSweeper利用局部邻域校正空间混杂效应，能够识别局部异常值和区域伪影，填补了现有方法在识别SRT特有组织伪影方面的空白 | NA | 开发一种针对空间转录组学数据的质量控制方法，确保数据可靠性 | 空间转录组学数据 | digital pathology | NA | spatially resolved transcriptomics (SRT) | NA | spatial transcriptomics data | 公开可用的Visium条形码点数据 |
| 259 | 2025-07-11 |
Spotiflow: accurate and efficient spot detection for fluorescence microscopy with deep stereographic flow regression
2025-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02662-x
PMID:40481364
|
研究论文 | 提出了一种名为Spotiflow的深度学习方法，用于荧光显微镜图像中亚像素级精确的斑点检测 | 将斑点检测问题重新定义为多尺度热图和立体流回归问题，支持2D和3D图像，具有更高的时间和内存效率 | 未明确提及具体局限性 | 开发一种高效准确的斑点检测方法，用于荧光显微镜图像分析 | 荧光显微镜图像中的斑点状结构 | 计算机视觉 | NA | 深度学习 | 立体流回归模型 | 图像 | 多种数据集（未明确数量） |
| 260 | 2025-07-11 |
HECLIP: histology-enhanced contrastive learning for imputation of transcriptomics profiles
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf363
PMID:40569046
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research paper | 提出了一种名为HECLIP的深度学习框架，用于从H&E染色组织学图像推断空间基因表达谱 | 采用以图像为中心的对比学习策略，减少对空间转录组数据的依赖，实现准确且有生物学意义的基因表达预测 | 未提及具体样本量或数据集的局限性 | 开发可扩展的计算方法，弥合成像与转录组学之间的差距 | H&E染色组织学图像 | digital pathology | NA | spatial transcriptomics (ST) | contrastive learning | image | NA |