单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
241	2025-04-29	A specific microbial consortium enhances Th1 immunity, improves LCMV viral clearance but aggravates LCMV disease pathology in mice 2025-Apr-25, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59073-x PMID:40274773	研究论文	本文探讨了特定微生物群落对Th1免疫力的增强作用及其对LCMV病毒感染清除和疾病病理的影响	揭示了特定低复杂度细菌群落（OMM）在增强抗病毒免疫反应中的作用，及其对LCMV病毒清除和疾病病理的双重影响	研究仅限于小鼠模型，结果可能无法直接推广到人类	研究肠道微生物组对抗病毒免疫反应的影响	小鼠及其肠道微生物组	免疫学	病毒感染	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	特定无病原体（SPF）小鼠和无菌小鼠
242	2025-04-29	T-B cell cooperation in ectopic lymphoid follicles propagates CNS autoimmunity 2025-Apr-25, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adn2784 PMID:40279405	research paper	该研究探讨了脑膜异位淋巴滤泡（eLF）样结构在多发性硬化症中的作用，揭示了T细胞与B细胞在其中的合作机制	首次使用单细胞RNA测序和活体成像技术直接观察T17-B细胞在脑膜eLF中的相互作用，揭示了它们如何促进中枢神经系统自身免疫	研究主要基于实验性自身免疫性脑脊髓炎模型，结果可能不完全适用于人类多发性硬化症	探究脑膜异位淋巴滤泡样结构在中枢神经系统自身免疫中的作用机制	T细胞和B细胞在脑膜异位淋巴滤泡中的相互作用	免疫学	多发性硬化症	单细胞RNA测序，活体成像	T helper 17 (T17) adoptive transfer experimental autoimmune encephalomyelitis model	RNA测序数据，影像数据	NA
243	2025-04-29	The P2X7R/NLRP3 inflammasome axis suppresses enthesis regeneration through inflammatory and metabolic macrophage-stem cell cross-talk 2025-Apr-25, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adr4894 PMID:40279432	研究论文	本研究揭示了P2X7R/NLRP3炎症小体轴通过放大IL-1β介导的炎症交叉作用和抑制DTA代谢交叉作用，从而抑制腱骨结合部再生	首次揭示了P2X7R/NLRP3炎症小体轴在腱骨结合部再生中的关键调控作用，并提出了针对该轴的治疗策略	研究主要基于动物模型，尚未在人体中进行验证	探究腱骨结合部再生不良的关键调控机制	腱骨结合部再生过程中的巨噬细胞和干细胞	再生医学	肌肉骨骼疾病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	基因敲除模型	基因表达数据	NA
244	2025-04-29	Adipose-derived leptin and complement factor D mediate osteoarthritis severity and pain 2025-Apr-25, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adt5915 PMID:40279436	research paper	该研究探讨了脂肪分泌的瘦素和补体因子D在骨关节炎严重程度和疼痛中的作用	揭示了瘦素通过调节补体因子D（adipsin）影响骨关节炎的结构和疼痛表型，首次提供了脂肪-关节交叉对话的确凿证据	研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需进一步验证	阐明肥胖相关脂肪因子在骨关节炎发病机制中的具体作用机制	脂肪分泌因子（特别是瘦素和补体因子D）与骨关节炎的关系	骨关节疾病研究	骨关节炎	空间转录组学、全局无监督多组学分析	小鼠脂肪营养不良模型	分子生物学数据、行为学数据	脂肪营养不良小鼠模型（具体数量未明确说明）
245	2025-04-29	Exosomes derived from ccRCC cells confers fibroblasts activation to foster tumor progression through Warburg effect by downregulating PANK3 2025-Apr-25, Cell death discovery IF:6.1Q1 DOI:10.1038/s41420-025-02434-8 PMID:40280913	research paper	研究揭示了肾癌细胞通过外泌体下调PANK3激活成纤维细胞，促进肿瘤进展的机制	首次发现肾癌细胞外泌体通过下调PANK3激活成纤维细胞，并促进Warburg效应	研究未涉及PANK3下调的具体分子机制	探究肾癌细胞与基质细胞相互作用的机制及其在肿瘤进展中的作用	肾癌细胞、癌相关成纤维细胞(CAFs)和正常成纤维细胞(NFs)	肿瘤生物学	肾细胞癌	单细胞测序、转录组测序、能量代谢测试	NA	测序数据、代谢数据	不同进展阶段的肾细胞癌组织样本
246	2025-04-29	Telomere-related gene risk model predicts prognostic and immune microenvironment alterations in prostate cancer 2025-Apr-25, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-98663-z PMID:40280966	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和批量RNA-seq数据，分析了前列腺癌中与端粒相关基因的风险模型，预测了预后和免疫微环境的改变	识别了15种不同的细胞类型，并发现髓样树突状细胞（mDCs）作为端粒活跃细胞在前列腺癌发展中的重要作用，同时构建了预测患者生存率的风险模型	研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本选择的限制	提高前列腺癌的预测能力，探索端粒相关基因在疾病发展中的作用	前列腺癌患者和细胞系（LNCaP和DU145细胞）	digital pathology	prostate cancer	scRNA-seq, bulk RNA-seq	risk model	RNA-seq data	147,856 cells (31,256 with high telomere-related gene score)
247	2025-04-29	Direct cell interactions potentially regulate transcriptional programmes that control the responses of high grade serous ovarian cancer patients to therapy 2025-Apr-25, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-98463-5 PMID:40280979	研究论文	通过分析单细胞RNA测序数据中的细胞双联体，研究高等级浆液性卵巢癌患者对治疗反应的转录调控机制	利用单细胞RNA测序中的生物双联体推断细胞间物理相互作用网络，揭示了与临床预后相关的转录景观	研究样本量较小（7名患者），且仅针对治疗初期的卵巢癌患者	探索细胞间直接物理相互作用如何调控高等级浆液性卵巢癌患者对治疗的反应	高等级浆液性卵巢癌患者的肿瘤微环境细胞	数字病理学	卵巢癌	scRNA-seq	NA	单细胞转录组数据	约18,000个细胞，来自7名未接受治疗的卵巢癌患者
248	2025-04-29	Single-cell RNA sequencing dissects the immunosuppressive signatures in Helicobacter pylori-infected human gastric ecosystem 2025-Apr-25, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59339-4 PMID:40281037	研究论文	通过单细胞RNA测序和TCR分析，研究幽门螺杆菌感染对人类胃生态系统的影响，揭示其免疫抑制特征	首次在单细胞分辨率下描述了幽门螺杆菌感染重塑的人类胃生态系统，并识别了潜在的免疫逃逸相关T细胞群体	样本量相对有限（23名个体），且未涉及治疗干预后的动态变化	解析幽门螺杆菌感染导致的免疫抑制微环境机制	幽门螺杆菌感染的人类胃部细胞生态系统	单细胞组学	幽门螺杆菌感染	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、TCR分析	NA	单细胞转录组数据	187,192个细胞（来自11名阴性和12名阳性个体）
249	2025-04-29	Advances in single-cell DNA sequencing enable insights into human somatic mosaicism 2025-Apr-25, Nature reviews. Genetics DOI:10.1038/s41576-025-00832-3 PMID:40281095	研究论文	本文探讨了单细胞DNA测序技术在人类体细胞嵌合体研究中的进展	介绍了单细胞DNA测序技术的最新进展，解决了传统方法难以处理的复杂克隆模式、细胞材料稀缺和非循环细胞等问题	NA	理解组织中存在的遗传异质性以及导致体细胞嵌合体的机制	人类体细胞嵌合体	基因组学	癌症与非癌症疾病	单细胞DNA测序	NA	基因组数据	NA
250	2025-04-29	The dynamic immune behavior of primary and metastatic ovarian carcinoma 2025-Apr-25, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-025-00818-8 PMID:40281242	研究论文	本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术，揭示了高级别浆液性卵巢癌（HGSC）中导致免疫抑制的分子机制	结合单细胞测序和空间转录组学技术，首次揭示了HGSC中原发肿瘤和网膜肿瘤在免疫微环境上的差异，并发现了上皮细胞与免疫细胞间的交叉通讯对免疫抑制的重要性	研究样本可能有限，未涉及其他亚型的卵巢癌	探索HGSC中导致免疫抑制的分子机制	高级别浆液性卵巢癌（HGSC）的原发肿瘤和网膜肿瘤	肿瘤免疫学	卵巢癌	单细胞测序, 空间转录组学	NA	基因表达数据	未明确提及具体样本数量
251	2025-04-29	Single-cell epigenetics and multiomics analysis in kidney research 2025-Apr-25, Clinical and experimental nephrology IF:2.2Q2 DOI:10.1007/s10157-025-02679-8 PMID:40281349	综述	本文综述了单细胞测序技术在肾脏研究中的应用，特别是新兴的表观基因组学和多组学方法	整合表观基因组和转录组的单细胞多组学分析，揭示了驱动细胞异质性的细胞特异性基因调控机制	NA	推动肾脏研究中新生物标志物和潜在治疗靶点的发现，促进临床转化	健康与患病肾脏中的细胞异质性	数字病理学	肾脏疾病	单细胞测序技术，多组学分析	NA	单细胞转录组数据，表观基因组数据	NA
252	2025-04-29	ScAGCN: Graph Convolutional Network with Adaptive Aggregation Mechanism for scRNA-seq Data Dimensionality Reduction 2025-Apr-25, Interdisciplinary sciences, computational life sciences DOI:10.1007/s12539-025-00702-w PMID:40281370	研究论文	本文提出了一种名为scAGCN的自适应聚合机制的图卷积网络，用于单细胞RNA测序数据的降维	设计了一种基于自适应聚合机制的图卷积网络，通过节点分布和相似性箱线图的邻域选择策略优化了聚合函数	未提及具体局限性	解决单细胞RNA测序数据因规模大、维度高、噪声多和稀疏性强带来的分析挑战	单细胞RNA测序数据	机器学习	NA	scRNA-seq	图卷积网络（GCN）	基因表达数据	15个真实的scRNA-seq数据集，其中10个为大规模数据集
253	2025-04-29	scRNA-seq reveals that VEGF signaling mediates the response to neoadjuvant anlotinib combined with PD-1 blockade therapy in non-small cell lung cancer 2025-Apr-25, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06485-4 PMID:40281576	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究VEGF信号在非小细胞肺癌患者对新辅助安罗替尼联合PD-1阻断疗法反应中的作用	首次揭示了VEGF信号在介导非小细胞肺癌患者对新辅助安罗替尼联合PD-1阻断疗法反应中的关键作用，并发现PLA2G4A作为VEGF通路的关键酶与不良预后相关	样本量较小（9例患者进行scRNA-seq，135例进行免疫组化验证），且研究结果需要在更大规模的临床试验中进一步验证	探索非小细胞肺癌患者对新辅助安罗替尼联合PD-1阻断疗法的耐药机制并预测疗效	非小细胞肺癌患者	数字病理	肺癌	scRNA-seq, 免疫组化, 多重免疫荧光	NA	单细胞转录组数据, 图像数据	9例NSCLC患者进行scRNA-seq（3例治疗前，3例MPR患者，3例Non-MPR患者），135例NSCLC患者进行免疫组化验证
254	2025-04-29	Bioinformatic analysis and experimental verification reveal expansion of monocyte subsets with an interferon signature in systemic lupus erythematosus patients 2025-Apr-25, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s13075-025-03560-5 PMID:40281593	研究论文	本研究通过生物信息学分析和实验验证，揭示了系统性红斑狼疮(SLE)患者中具有干扰素特征的单个核细胞亚群的扩增	首次在健康人外周血中发现了SIGLEC1+IRF7+单核细胞亚群，并证实其在SLE患者中的扩增与疾病严重程度相关	研究主要基于转录组数据，需要更多功能实验验证这些单核细胞亚群的具体作用机制	探究SLE患者中单核细胞亚群的变化及其在疾病发病机制中的作用	系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血单个核细胞和单核细胞	生物信息学	系统性红斑狼疮	scRNA-seq, 流式细胞术	DESeq2, limma, Seurat	转录组数据	SLE患者和健康对照者的PBMCs样本(具体数量未明确说明)
255	2025-04-29	The Janus Face of Astrocytes in Multiple Sclerosis: Balancing Protection and Pathology 2025-Apr-25, Brain research bulletin IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.brainresbull.2025.111356 PMID:40288545	综述	本文综述了星形胶质细胞在多发性硬化症（MS）中的双重作用及其治疗潜力	揭示了人类星形胶质细胞状态的连续性，超越了传统的A1/A2二分法，并探讨了星形胶质细胞-小胶质细胞串扰和代谢重编程在MS病理中的关键作用	将小鼠A1/A2概念转化为人类MS研究存在挑战，人类星形胶质细胞表现出异质性和环境依赖性反应	探讨星形胶质细胞在MS中的双重作用及其作为治疗靶点的潜力	多发性硬化症（MS）中的星形胶质细胞	神经科学	多发性硬化症	单细胞转录组学、空间转录组学、空间多组学	NA	转录组数据	NA
256	2025-04-29	Microglial Colonization Routes and Their Impacts on Cellular Diversity 2025-Apr-25, Neuroscience research IF:2.4Q3 DOI:10.1016/j.neures.2025.04.004 PMID:40288616	review	本文探讨了小胶质细胞的定植路线及其对细胞多样性的影响	重点关注小胶质细胞通过不同定植路线形成多样性的假说，结合最新研究发现	小胶质细胞多样性形成的具体机制仍不明确	研究小胶质细胞多样性的形成机制及其在脑发育中的作用	小胶质细胞	神经科学	NA	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	NA
257	2025-04-29	Integrative analysis of taurine metabolism-related genes prognostic signature with immunotherapy and identification of ABCB1 and GORASP1 as key genes in nasopharyngeal carcinoma 2025-Apr-24, Amino acids IF:3.0Q3 DOI:10.1007/s00726-025-03452-7 PMID:40272558	研究论文	该研究通过整合多数据库数据，构建了与牛磺酸代谢相关的鼻咽癌预后特征，并验证了ABCB1和GORASP1作为关键基因的作用	首次报道了牛磺酸代谢相关基因在鼻咽癌中的预后作用，并通过多维分析和实验验证了三个关键基因的功能和预后意义	研究结果需要更大样本量的进一步验证	探索牛磺酸代谢相关基因在鼻咽癌中的预后价值和治疗潜力	鼻咽癌患者	生物信息学	鼻咽癌	基因表达分析、免疫组化、分子对接、单细胞测序	Cox回归、LASSO回归	基因表达数据、临床样本	未明确说明样本数量
258	2025-04-29	DOCK9 as a predictive biomarker linked to angiogenesis and immune response in esophageal squamous cell carcinoma 2025-Apr-24, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s10238-025-01653-8 PMID:40272582	研究论文	本研究探讨了DOCK9基因在食管鳞状细胞癌（ESCC）中的预后标志物作用及其对血管生成和免疫反应的影响	首次将DOCK9基因与ESCC的血管生成和免疫反应联系起来，并开发了一个21基因预后风险模型	研究主要基于RNA微阵列和单细胞RNA测序数据，需要进一步实验验证DOCK9的功能机制	识别ESCC的预后生物标志物并探索其治疗策略	食管鳞状细胞癌（ESCC）组织和人脐静脉内皮细胞	肿瘤生物学	食管鳞状细胞癌	RNA微阵列分析、单细胞RNA测序、蛋白表达分析	21基因预后风险模型	RNA测序数据、蛋白表达数据	未明确提及具体样本数量，但涉及ESCC组织和人脐静脉内皮细胞
259	2025-04-29	Integration of single-cell sequencing and mendelian randomization reveals novel causal pathways between monocytes and hepatocellular carcinoma 2025-Apr-24, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02357-x PMID:40272662	研究论文	本研究通过整合单细胞测序和孟德尔随机化方法，揭示了单核细胞与肝细胞癌之间的新因果通路	首次将单细胞测序技术与孟德尔随机化分析相结合，研究单核细胞与肝细胞癌的关系	NA	探讨单核细胞中差异表达基因与肝细胞癌发展的关联	人类肝脏先天性淋巴细胞（ILCs）中的单核细胞亚群及其细胞标记物	生物信息学	肝细胞癌	单细胞转录组分析，孟德尔随机化（MR）分析	NA	转录组数据	NA
260	2025-04-29	Neutrophil single-cell analysis identifies a type II interferon-related subset for predicting relapse of autoimmune small vessel vasculitis 2025-Apr-24, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-58550-7 PMID:40274824	研究论文	通过单细胞转录组和表面蛋白质组分析，识别自身免疫性小血管炎复发预测的中性粒细胞亚群	首次在单细胞水平上识别出与II型干扰素相关的中性粒细胞亚群（Neu_T2ISG），并发现其与疾病复发相关	研究样本量有限，且仅针对新发显微镜下多血管炎（MPA）患者	探索中性粒细胞在自身免疫性小血管炎中的动态变化及其与疾病复发的关联	新发显微镜下多血管炎（MPA）患者的外周血白细胞	单细胞分析	自身免疫性小血管炎	单细胞转录组分析、表面蛋白质组分析	NA	单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据	新发MPA患者的外周血白细胞样本