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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-05-09 |
TIMP1 and PKM drive immunosuppression and metabolic remodeling to promote colorectal cancer progression through integrated multi-omics analysis
2026-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151944
PMID:41966374
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示TIMP1和PKM驱动结直肠癌免疫抑制和代谢重塑的机制 | 首次通过整合多组学分析发现TIMP1和PKM协同驱动结直肠癌的免疫抑制和代谢重塑,并利用AlphaFold3预测PKM-LDHA复合体结构 | 未在更大样本队列或动物模型中进一步验证所发现的靶点和机制 | 鉴定结直肠癌免疫逃逸的关键靶点及其分子机制 | 结直肠癌患者的肿瘤组织样本及单细胞数据 | 生物信息学、多组学分析 | 结直肠癌 | RNA-seq、单细胞RNA测序、T细胞杀伤实验、Co-IP、AlphaFold3结构预测 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 242 | 2026-05-09 |
Cytokine networks driving eosinophil functional heterogeneity
2026-May-01, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2026.100347
PMID:42070631
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综述 | 综述细胞因子网络如何驱动嗜酸性粒细胞的功能异质性 | 利用单细胞转录组学的最新进展,重新审视嗜酸性粒细胞的传统观点,揭示其在多种免疫环境下的发育和功能异质性 | 未提及具体局限 | 总结嗜酸性粒细胞的发育程序,并研究细胞因子网络如何塑造其在1型、2型和17型免疫中的反应 | 嗜酸性粒细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 243 | 2026-05-09 |
Tenofovir Alafenamide in the Treatment of Chronic Hepatitis B Virus Infection in the High-Replicative Low-Inflammatory Phase: A 48-Week Randomized Controlled Trial
2026-May, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70960
PMID:42095461
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研究论文 | 评估替诺福韦艾拉酚胺治疗慢性乙型肝炎病毒高复制低炎症期患者的疗效和安全性,并进行外周免疫特征分析 | 首次在高复制低炎症期慢性HBV感染患者中进行TAF抗病毒治疗的随机对照试验,并结合单细胞RNA测序分析免疫细胞亚群与治疗反应的关系 | 48周随访期内完全病毒学抑制率仍不理想,样本量较小(尤其scRNA-seq仅6例),可能限制结果的普适性 | 评估TAF在HBV高复制低炎症期患者中的安全性和疗效,并分析外周免疫特征与治疗反应的相关性 | HBeAg阳性、ALT正常且HBV DNA升高的慢性HBV感染患者 | 机器学习 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 59例患者(治疗组30例,对照组29例);其中6例患者进行scRNA-seq(病毒学应答组3例,低水平病毒血症组3例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2026-05-09 |
MXRA5 is identified and validated as a key gene related to epithelial-mesenchymal transition in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes
2026-05, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/dt5mf6
PMID:41105461
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研究论文 | 通过单细胞分析和多种机器学习方法,识别并验证了MXRA5作为类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞中上皮-间质转化相关关键基因 | 首次结合单细胞RNA测序与五种机器学习算法(XGBoost、Boruta、随机森林、LASSO、SVM-RFE)筛选RA中EMT相关关键基因,并通过功能实验验证MXRA5对细胞增殖、迁移和侵袭的调控作用 | 未提及 | 利用单细胞分析和机器学习方法识别类风湿关节炎滑膜细胞中与上皮-间质转化相关的重要基因,并进行功能验证 | 类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞(MH7A细胞系) | 机器学习 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、RNA测序 | XGBoost、随机森林、LASSO、SVM-RFE、Boruta | 基因表达数据 | NA(未明确样本量,使用公开数据集SDY 998和bulk RNA数据) | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 245 | 2026-05-09 |
Comprehensive single-cell transcriptomic profiling of the scalp from patients with moderate-to-severe alopecia areata
2026-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.02.014
PMID:41740930
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序对中重度斑秃患者头皮进行全面的转录组图谱分析 | 首次在单细胞水平系统描绘了中重度斑秃头皮中免疫与非免疫细胞之间的通讯网络,揭示了可能破坏毛囊免疫特权并驱动疾病进展的细胞通路 | 未提及具体局限性 | 表征斑秃头皮相对于健康对照的单细胞转录组景观 | 13名中重度斑秃患者(5名全秃/普秃)的皮损和非皮损头皮活检样本及11名健康对照 | 数字病理学 | 斑秃 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13名斑秃患者和11名健康对照的头皮活检样本,共41,067个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 246 | 2026-05-09 |
TRAP5 Inhibition Targeting Scar-Associated Macrophages Ameliorates Acute Kidney Injury to Chronic Kidney Disease Transition
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202519855
PMID:41773735
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research paper | 通过单细胞RNA测序图谱,研究发现靶向疤痕相关巨噬细胞中的TRAP5可抑制急性肾损伤向慢性肾病的转变 | 首次发现TRAP5阳性疤痕相关巨噬细胞在AKI-CKD转化中的致病作用,并验证药理学抑制TRAP5可保护肾功能和结构 | 该研究主要基于小鼠模型,未在大型动物或人类临床试验中验证,且观察到的主要是短期疗效 | 探究急性肾损伤向慢性肾病转化中巨噬细胞状态的变化及TRAP5的作用机制 | 使用马兜铃酸I诱发的小鼠急性肾损伤模型,以及缺血再灌注损伤和单侧输尿管梗阻模型 | machine learning | kidney disease | single-cell RNA-seq | NA | single-cell RNA-seq data | 39345个细胞,来自对照、急性期和重塑期小鼠肾脏,共18个细胞簇 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 247 | 2026-05-09 |
Spatially resolved multi-omics reveals that paeoniflorin ameliorates IgA nephropathy via Oat, Aco1 and Fh-mediated metabolic reprogramming and tubuloimmune crosstalk
2026-May-01, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158263
PMID:42096999
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研究论文 | 通过空间多组学整合分析揭示芍药苷通过Oat、Aco1和Fh介导的代谢重编程和肾小管免疫串扰改善IgA肾病的分子机制 | 首次采用空间代谢组学与空间转录组学整合方法,在肾脏区域特异性层面解析芍药苷对IgA肾病的治疗机制,发现其通过Oat、Aco1和Fh调控TCA循环及精氨酸/脯氨酸代谢,并减少受损远端小管细胞的免疫共定位 | 未提及具体局限性 | 阐明芍药苷在IgA肾病中基于空间多组学的分子治疗机制 | IgA肾病大鼠模型(Wistar大鼠经Thy-1抗体诱导)的肾脏组织 | 数字病理学 | IgA肾病 | 空间代谢组学、空间转录组学 | NA | 空间组学数据(代谢与转录) | IgA肾病模型大鼠肾脏组织(具体数量未提及) | NA | 空间代谢组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 248 | 2026-05-09 |
Variants in KLHL15, encoding a regulator of protein ubiquitination, linked to focal epilepsy with neurodevelopmental disorders
2026-May-01, Seizure
DOI:10.1016/j.seizure.2026.04.029
PMID:42097059
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研究论文 | 研究KLHL15基因变异与局灶性癫痫及神经发育障碍的关联 | 首次发现KLHL15基因错义变异与局灶性癫痫及神经发育障碍相关,并通过时空表达谱和功能网络分析揭示其致病机制 | 样本量较小,仅涉及四例无关患者,可能限制变异谱的全面性;功能验证主要依赖计算预测和网络分析,缺乏体内实验验证 | 探讨KLHL15基因与癫痫的关联 | 非获得性局灶性癫痫患者 | 机器学习 | 癫痫, 神经发育障碍 | 全外显子组测序, 单细胞分析, 网络扩散分析 | NA | 基因测序数据, 单细胞测序数据 | 4例无关局灶性癫痫伴神经发育障碍病例 | Illumina | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 249 | 2026-05-09 |
LILRB2+ monocytes reshape the immune activation landscape in immunotherapy with non-small cell lung cancer: Evidence from real-world cohorts and single-cell analyses
2026-Apr-30, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152331
PMID:42069195
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研究论文 | 本研究利用真实世界队列和单细胞分析,揭示LILRB2+单核细胞在非小细胞肺癌免疫治疗中重塑免疫激活景观的作用 | 首次在单细胞水平解析LILRB2+单核细胞亚群对PD-1/PD-L1免疫治疗的影响,并建立LILRB2/S100A8单核细胞比值作为新的疗效预测指标 | 未充分探索LILRB2+单核细胞与其他免疫细胞的相互作用机制,且样本量有限,需进一步验证 | 探究LILRB2+单核细胞在非小细胞肺癌免疫治疗中的作用及其预测价值 | 非小细胞肺癌患者的转录组数据和临床数据 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自OAK、POPLAR和ORIENT-11临床试验的NSCLC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2026-05-09 |
LC3B promotes bladder cancer cell proliferation via the Sp1-cyclin D1/p27 axis with pan-cancer clinical associations
2026-Apr-29, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112560
PMID:42066829
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研究论文 | 本研究阐明了LC3B在膀胱癌中的表达模式、生物学功能及分子机制,并评估了其在多种人类癌症中的临床相关性 | 首次揭示LC3B通过Sp1-Cyclin D1/p27轴调控膀胱癌细胞增殖的非经典自噬功能,并进行了泛癌临床关联分析 | 未明确LC3B脂化独立功能的详细机制,且未涉及LC3B在免疫微环境中的作用 | 阐明LC3B在膀胱癌中的表达、功能及分子机制,并评估其泛癌临床意义 | 膀胱癌患者样本及T24T、J82膀胱癌细胞系 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、基因敲除、细胞周期分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 膀胱癌上皮细胞及T24T、J82细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 251 | 2026-05-09 |
Aqueous extract of Solanum nigrum L. restrains colorectal cancer progression by blocking cancer-associated fibroblast-induced STAT3-Annexin A2 signaling
2026-Apr-28, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158257
PMID:42097000
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研究论文 | 该研究通过多组学分析发现龙葵水提物通过阻断癌相关成纤维细胞诱导的STAT3-Annexin A2信号通路抑制结直肠癌进展 | 首次揭示龙葵水提物通过直接结合STAT3调控ANXA2转录、破坏ANXA2-Cortactin复合物形成及抑制细胞骨架重塑的完整抗转移分子机制,并整合单细胞转录组与蛋白质组学数据识别药物靶点 | 研究中未提及龙葵水提物中除茄碱和边茄碱外其他活性成分的潜在贡献,且STAT3直接结合实验基于体外条件,体内药效学验证尚需更多临床前数据支撑 | 系统鉴定龙葵水提物的生物活性成分,阐明其在结直肠癌模型中的抗转移分子机制 | 结直肠癌细胞及皮下异种移植瘤、APCMin/+小鼠、实验性转移模型小鼠 | 自然语言处理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、TMT蛋白质组学、药物-靶标相互作用分析 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | 人类结直肠癌单细胞RNA测序数据(具体样本量未说明)、多种小鼠模型(皮下移植瘤、APCMin/+、转移模型) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于人类结直肠癌单细胞转录组分析 |
| 252 | 2026-05-09 |
Exogenous pyruvate restores mitochondrial bioenergetics by synergizing with the AMPK-mTOR-SIRT3 pathway to alleviate sepsis-associated acute kidney injury
2026-Apr-22, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2026.112089
PMID:42031090
|
研究论文 | 本研究揭示外源性丙酮酸乙酯通过AMPK-mTOR-SIRT3信号通路协同恢复线粒体生物能量学,从而减轻脓毒症相关急性肾损伤 | 首次阐明外源性代谢底物丙酮酸乙酯与AMPK激活剂协同作用,通过AMPK-mTOR-SIRT3通路恢复线粒体功能,为脓毒症相关急性肾损伤的代谢靶向治疗提供新机制 | 实验仅基于小鼠模型和细胞系,缺乏临床验证;SIRT3下游机制有待进一步探索 | 研究外源性丙酮酸乙酯通过调节线粒体生物能量学减轻脓毒症相关急性肾损伤的分子机制 | 盲肠结扎穿刺诱导的SA-AKI小鼠模型和LPS刺激的HK-2细胞 | 数字病理学 | 脓毒症相关急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和HK-2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2026-05-09 |
A high-resolution spatial map of cilia-associated proteins in the human fallopian tube
2026-04-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71692-6
PMID:42010243
|
研究论文 | 利用整合转录组学和蛋白质组学方法,在人输卵管中创建了纤毛相关蛋白的高分辨率空间图谱 | 首次在单细胞分辨率下整合转录组学和蛋白质组学,绘制输卵管中纤毛相关蛋白的空间分布图,并验证了11个此前仅在转录水平研究的蛋白质 | 仅对一名输卵管积水患者进行了分析,样本量有限,且未提供其他疾病或正常组织的充分比较 | 揭示输卵管中纤毛相关蛋白的分子景观,以帮助理解不孕症和纤毛特异性相关疾病的通路 | 人输卵管及其他具有运动纤毛的组织 | 数字病理学 | 不孕症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 质谱分析 | NA | 文本数据(转录组和蛋白质组数据) | 1名输卵管积水患者及其他健康样本(具体数量未说明) | NA | NA | NA | NA |
| 254 | 2026-05-09 |
SpaTRACE: Spatiotemporal recurrent auto-encoder for reconstructing signaling and regulatory networks from spatiotemporal transcriptomics data
2026-Apr-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.20.689569
PMID:42039614
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研究论文 | 提出SpaTRACE框架,从空间转录组数据中联合推断细胞间信号传导和基因调控网络 | 利用时空递归自编码器同时重建转录因子-靶基因调控网络、配体-受体-靶基因信号通路及配体-受体结合关系,无需预定义配体-受体数据库 | 依赖伪时间轨迹采样,可能无法完全捕捉真实时间动态;模型复杂度高,需要较大数据集进行训练 | 从空间转录组数据中联合推断细胞间信号传导和基因调控网络,捕捉发育和再生过程中的动态调控机制 | 小鼠中脑发育和蝾螈脑再生过程中的空间转录组数据 | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 自编码器, 注意力机制 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 255 | 2026-05-09 |
A Mouthful of Genomic Data: Single-Cell Insights into Salivary Gland Biology and Disease
2026-Apr-18, Biology
DOI:10.3390/biology15080641
PMID:42041920
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综述 | 综述单细胞RNA测序在唾液腺生物学与疾病研究中的应用,总结主要发现、局限性及方法学考虑 | 系统整合了唾液腺scRNA-seq研究的最新进展,聚焦于细胞类型发现、分子机制及数据质量问题 | 数据处理不一致和实验方法报告不完整影响可重复性,限制高质量数据集的识别 | 总结scRNA-seq在唾液腺研究中的发现,指导未来研究 | 唾液腺(大唾液腺和小唾液腺) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 256 | 2026-05-09 |
Histotripsy-Initiated Immune Response Synergizes with Chemotherapy in a Neuroblastoma Murine Model
2026-Apr-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18081249
PMID:42073574
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研究论文 | 本研究探讨了组织切除术在神经母细胞瘤小鼠模型中诱导的免疫反应如何与化疗协同作用 | 首次展示了无创聚焦超声组织切除术通过机械性气泡云作用诱导系统性抗肿瘤免疫反应,增强化疗对转移性神经母细胞瘤的疗效 | 未提供具体局限性信息 | 验证组织切除术诱导的肿瘤微环境变化能否改善转移性神经母细胞瘤对化疗的应答 | 雌性A/J小鼠双侧胁部接种Neuro-2a细胞建立神经母细胞瘤模型 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 组织切除术,单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 30只小鼠双侧肿瘤(单侧治疗),每组5-7天后评估 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未提供具体平台配置信息 |
| 257 | 2026-05-09 |
Benchmarking scRNA-seq Copy Number Inference: A Comprehensive Evaluation and Practitioner's Guide
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.12.718050
PMID:42039587
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研究论文 | 对12种从单细胞RNA测序数据推断拷贝数变异的方法在28个真实数据集和多种合成数据集上进行了全面基准测试,提供实践指南 | 首次对12种CNV推断方法进行大规模系统基准测试,覆盖超过10万个细胞,建立了基于恶性细胞分类准确性、CNV推断准确性、可扩展性和鲁棒性的综合评估框架,并提供标准化CNV档案公共资源库 | 基准测试主要依赖现有数据集和合成数据,可能未完全涵盖所有实际应用场景;部分方法的性能高度依赖于原始测序数据可用性和等位基因推断质量 | 系统评估单细胞RNA测序数据的拷贝数变异推断方法,为研究人员提供实践决策指南 | 12种CNV推断方法(包括Numbat、Clonalscope、CopyKAT、inferCNV、SCEVAN等) | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、等位基因数据 | 28个真实数据集(超过10万个细胞)及多种合成数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2026-04-18 |
Sphingosine-1-Phosphate-derived 2-Hexadecenal is a central mediator of ocular neovascularization by inhibiting Sphingosine-1-Phosphate receptor 5
2026-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71792-3
PMID:41980976
|
研究论文 | 本文揭示了S1P代谢产物2-HD通过抑制S1PR5破坏铁稳态并诱导铁死亡,从而在视网膜血管异常中发挥关键作用 | 首次发现S1P衍生的2-HD在血管功能中的作用,并揭示其通过直接与S1PR5相互作用诱导铁死亡的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型和体外分析,人类样本验证有限,且未深入探讨其他S1PRs在过程中的潜在作用 | 探究S1P代谢产物2-HD在血管生成和视网膜血管疾病中的功能及机制 | 斑马鱼视网膜血管、人类新生血管视网膜样本 | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 多组学分析、单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 259 | 2026-05-09 |
Metabolic surgery mitigates early kidney injury in obese youth with diabetes by suppressing mTORC1/JAK/STAT signaling
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198545
PMID:41665972
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序等技术,探讨了代谢手术(袖状胃切除术)如何通过抑制mTORC1/JAK/STAT信号通路减轻肥胖青少年2型糖尿病患者的早期肾损伤 | 首次利用单细胞RNA测序结合循环蛋白质组学揭示代谢手术对青少年肥胖相关肾病的分子机制,特别是mTORC1/JAK/STAT信号通路的抑制作用 | 研究样本量较小(仅5例患者进行配对活检),且缺乏长期随访数据以验证肾损伤缓解的持久性 | 探索垂直袖状胃切除术对肥胖青少年2型糖尿病患者肾脏结构和分子变化的影响及其潜在机制 | 5名患有2型糖尿病和肥胖的青少年(IMPROVE-T2D队列),以及64名接受代谢手术的肥胖青少年(Teen-LABS队列) | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 循环蛋白质组学, 组织学评估 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 临床代谢参数 | 5例配对肾活检样本(术前和术后12个月),64例独立队列的蛋白质组学样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 260 | 2026-05-09 |
Semi-parametric empirical bayes method for multiplet detection in snATAC-seq with probabilistic multi-omic integration
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013653
PMID:42054434
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研究论文 | 提出一种半参数经验贝叶斯方法SEBULA,用于snATAC-seq数据中的多细胞检测,并支持多模态证据整合 | 无需合成双细胞,直接从染色质可及性信号建模单细胞背景,实现假发现率控制;并扩展至多模态数据整合 | 标题与摘要未提及具体限制 | 开发高效的snATAC-seq多细胞检测方法 | snATAC-seq数据中的多细胞(双细胞) | 机器学习 | NA | snATAC-seq | 半参数经验贝叶斯模型 | 序列数据 | 多个多模态数据集与模拟数据 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |