单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32106 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-31 |
Pan-cancer neural regulation pattern with implications for patient stratification and immunotherapy
2025-Dec-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102732
PMID:41147013
|
研究论文 | 通过整合多组学数据系统描绘了泛癌神经调控模式及其对患者分层和免疫治疗的临床意义 | 首次系统性描绘泛癌神经-肿瘤相互作用全景图，发现神经信号与临床特征的相关性并构建神经癌症亚型分类 | 基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证神经调控机制 | 探究神经系统与癌症相互作用的调控模式及其在免疫治疗中的临床应用价值 | 10,000+ TCGA批量转录组、239个泛癌空间转录组、115个批量检查点抑制剂治疗转录组和120,000+单细胞转录组 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 批量转录组测序, 空间转录组学, 单细胞转录组测序 | 配体-受体相互作用网络分析 | 转录组数据, 空间转录组数据 | >10,000 TCGA样本 + 239空间样本 + 115治疗样本 + >120,000单细胞 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 242 | 2025-10-31 |
Single-Cell RNA-Seq Revealed the Immune Microenvironment Reprogramming by Dexmedetomidine Treatment in Ischemic Stroke
2025-Dec, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05237-1
PMID:40751033
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了右美托咪定通过HK2介导的小胶质细胞代谢重编程维持免疫微环境稳态，从而在缺血性脑卒中发挥神经保护作用的机制 | 首次采用多组学方法系统阐明右美托咪定通过HK2调控小胶质细胞代谢重编程维持免疫微环境稳态的神经保护机制 | 研究主要基于小鼠MCAO模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究右美托咪定在缺血性脑卒中中的神经保护作用机制 | 大脑中动脉闭塞模型小鼠和小胶质细胞 | 单细胞组学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA-seq, RNA-seq, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | MCAO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 243 | 2025-10-31 |
Beyond gut and neural mechanisms: A multi-organ system perspective on insecticide resistance
2025-Dec, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2025.106701
PMID:41162084
|
综述 | 本文从多器官系统视角探讨杀虫剂抗性的形成机制，突破传统孤立研究的局限 | 提出将杀虫剂抗性视为多器官协同作用的系统现象，强调器官间信号传导和补偿机制的重要性 | 在解析器官间通讯、识别组织特异性抗性标记物及开发现场诊断方法方面仍存在挑战 | 探索多器官系统在塑造杀虫剂抗性中的作用机制 | 昆虫的脂肪体代谢、循环运输、跨代效应、呼吸调节、马氏管排泄和内分泌调节等生理系统 | 系统生物学 | NA | 多组学技术、单细胞RNA测序、先进成像技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2025-10-31 |
Caloric Restriction Substantially Improves Glucose Regulation in Mice With Hnf1a-Deficient Beta-Cells
2025-Dec, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.70121
PMID:41165340
|
研究论文 | 本研究探讨饮食对HNF1A突变胰岛β细胞的影响，发现热量限制显著改善Hnf1a缺陷β细胞的血糖调节 | 首次系统研究饮食因素对HNF1A-MODY疾病发生发展的影响，揭示了Hnf1a缺陷β细胞对饮食线索的高度敏感性 | 研究主要基于小鼠模型，人类验证仅使用体外干细胞胰岛，样本规模有限 | 探索环境因素（特别是饮食）对HNF1A-MODY发病和进展的影响机制 | 转基因小鼠（Hnf1a突变β细胞）和人类干细胞胰岛（HNF1AP291fsinsC杂合突变） | 代谢疾病研究 | 单基因糖尿病（HNF1A-MODY） | 免疫荧光、蛋白质组学、bulk转录组学、单细胞转录组学 | 转基因小鼠模型、干细胞胰岛模型 | 生理测试数据、蛋白质组数据、转录组数据 | 转基因小鼠暴露于四种不同饮食方案，人类干细胞胰岛及其同基因对照 | NA | 单细胞转录组学, bulk转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 245 | 2025-10-31 |
Eupatilin ameliorates spinal cord injury by inhibiting damage-associated microglia and optimizing the regenerative microenvironment
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113687
PMID:41146716
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现损伤相关小胶质细胞在急性脊髓损伤中的关键作用，并证实黄岑素能促进其向稳态小胶质细胞转化 | 首次通过整合单细胞RNA测序和微阵列数据识别急性脊髓损伤特异性损伤相关小胶质细胞亚群，并发现黄岑素促进其向有益表型转化的新功能 | 研究仅使用C57BL/6小鼠模型，尚未在更大型动物或临床样本中验证 | 探索脊髓损伤中小胶质细胞的动态变化及黄岑素的治疗机制 | C57BL/6小鼠脊髓挫伤模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 246 | 2025-10-31 |
Decoding Dendritic Cell Subtypes via Integrated Radiogenomics: A Stacked Ensemble Model for Predicting Immunotherapy Response in NSCLC
2025-Nov-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501990R
PMID:41160086
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、影像组学和深度学习技术，开发了一个多模态框架来预测非小细胞肺癌患者对免疫治疗的应答 | 首次将单细胞转录组学、影像组学和深度学习相结合，通过堆叠集成学习方法识别树突状细胞亚型与免疫治疗应答的关联 | 样本量相对有限，需要在更大规模队列中验证模型的泛化能力 | 预测非小细胞肺癌患者对PD-1抑制剂免疫治疗的应答 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本和影像数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 影像组学, 深度学习 | LSTM, ResNet50, 堆叠集成学习 | 转录组数据, 临床数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 247 | 2025-10-31 |
Single-cell RNA sequencing reveals the ameliorative effects of Kai-Xin-San on depression via regulating neuroplasticity and inflammation in the hypothalamus of rats
2025-Nov-10, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示开心散通过调节下丘脑神经可塑性和炎症改善大鼠抑郁的分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统阐明开心散通过抑制前驱活性、恢复星形胶质细胞线粒体代谢和重塑神经-星形胶质细胞相互作用网络来增强突触可塑性的抗抑郁机制 | 研究仅针对大鼠下丘脑区域，未涉及其他脑区；样本数量相对有限 | 探究开心散改善抑郁症状的分子机制 | 慢性不可预见轻度应激诱导的抑郁模型大鼠 | 单细胞转录组学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序,行为学实验,分子生物学实验 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,行为学数据 | 45,482个下丘脑细胞，来自对照组、CUMS模型组、开心散治疗组和氟西汀治疗组大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 248 | 2025-10-31 |
CRISPLD2, a novel insulin-sensitizing adipokine that alters adipocyte size
2025-Nov, Obesity (Silver Spring, Md.)
DOI:10.1002/oby.24342
PMID:40855979
|
研究论文 | 本研究探讨新型脂肪因子CRISPLD2在调节脂肪组织纤维化和改善胰岛素敏感性方面的功能 | 首次发现CRISPLD2能够改变脂肪细胞大小并改善胰岛素敏感性，同时揭示其通过调节胶原转录和纤维化发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床意义尚需进一步验证 | 探索CRISPLD2脂肪因子在脂肪组织结构和功能调节中的作用机制 | 脂肪特异性过表达CRISPLD2的小鼠模型和3T3-L1脂肪细胞 | 分子生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序, 质谱分析, transwell实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质互作数据 | 脂肪特异性CRISPLD2过表达小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 249 | 2025-10-31 |
Targeting MAT2A synergistically induces DNA damage in osteosarcoma cells through EZH2-mediated H3K27me3 modification
2025-Nov, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.09.007
PMID:41146859
|
研究论文 | 本研究通过靶向MAT2A与EZH2抑制联合治疗，协同诱导骨肉瘤细胞DNA损伤并抑制肿瘤生长 | 首次发现MAT2A抑制与EZH2抑制在骨肉瘤治疗中的协同作用机制，通过代谢与表观遗传双重干预策略 | NA | 探索代谢与表观遗传联合干预在骨肉瘤治疗中的潜在价值 | 骨肉瘤细胞 | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序，高通量化合物筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 250 | 2025-10-31 |
Single-cell RNA profiling of blood CD4+ T cells identifies distinct helper and dysfunctional regulatory clusters in children with SLE
2025-Nov, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02297-2
PMID:41120754
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童系统性红斑狼疮患者血液CD4⁺ T细胞的异质性 | 首次在儿童SLE患者中通过单细胞RNA测序识别出独特的辅助性T细胞和功能失调调节性T细胞亚群，并发现TLR5和FCRL3在SLE初始T细胞中的上调 | 研究样本仅限于儿童患者，未包含成人队列；样本量相对有限 | 表征系统性红斑狼疮患者CD4⁺ T细胞区室的复杂性 | 儿童系统性红斑狼疮患者和健康供体的血液CD4⁺ T细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 儿童SLE患者和健康供体的血液CD4⁺ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 251 | 2025-10-31 |
Rationale, design and baseline characteristics of REMODEL, a mechanism-of-action trial with semaglutide in people with type 2 diabetes and chronic kidney disease
2025-Oct-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfaf114
PMID:40608494
|
研究论文 | REMODEL试验是一项为期52周的随机对照试验，旨在研究索马鲁肽对2型糖尿病和慢性肾病患者肾脏保护作用的机制 | 首次结合MRI影像学评估、肾脏活检组织学分析和单核/空间转录组学等多维度方法探究GLP-1受体激动剂的肾脏保护机制 | 样本量相对较小（总106人，活检亚组33人），观察周期为52周 | 探究索马鲁肽在2型糖尿病合并慢性肾病患者中的肾脏保护作用机制 | 2型糖尿病合并慢性肾病的成年患者 | 数字病理学 | 2型糖尿病, 慢性肾病 | 磁共振成像, 单核转录组学, 空间转录组学, 组织病理学分析 | NA | 医学影像, 组织样本, 临床数据 | 总样本106人（其中活检亚组33人） | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 252 | 2025-10-31 |
Spatial Transcriptomics of Adipose Tissue: Technologies, Applications, and Challenges
2025-Oct-30, Journal of obesity & metabolic syndrome
IF:4.7Q1
DOI:10.7570/jomes25078
PMID:41094746
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术在脂肪组织研究中的技术进展、应用场景和面临挑战 | 系统整合了空间转录组学技术在解析脂肪组织空间结构方面的最新进展，强调了该技术在揭示脂肪生成微环境、区域特异性重塑和免疫细胞相互作用方面的独特优势 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于已有文献进行归纳总结 | 探讨空间转录组学技术在脂肪组织生物学研究中的应用前景 | 脂肪组织及其细胞组成 | 空间转录组学 | 代谢疾病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq，单核RNA-seq | NA | NA |
| 253 | 2025-10-31 |
Andrias Davidianus Peptide Hydrogel Enables Sustained SR9011 Release to Promote Efferocytosis and Alleviate Colitis
2025-Oct-30, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202509049
PMID:41163542
|
研究论文 | 本研究开发了一种大鲵肽水凝胶用于持续释放SR9011，通过激活NR1D1促进胞葬作用并缓解结肠炎 | 首次发现NR1D1在溃疡性结肠炎中的表达降低及其对CD47的转录抑制功能，并创新性地开发了大鲵肽水凝胶递送系统 | 药代动力学分析仅限于结肠组织，未进行全身性评估 | 探索NR1D1在溃疡性结肠炎发病机制中的作用并开发新型治疗策略 | 人类UC活检组织、小鼠结肠炎模型、肠上皮细胞特异性Nr1d1缺陷小鼠 | 生物医学工程 | 溃疡性结肠炎 | CUT&Tag, ChIP-qPCR, 荧光素酶报告实验, 单细胞RNA测序 | DSS诱导结肠炎小鼠模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据, 单细胞转录组数据 | 人类UC活检组织和小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2025-10-31 |
FXYD3 Promotes Tumor Progression by Binding With IRF7 to Regulate JAK2/STAT5 Signaling in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510782
PMID:41164952
|
研究论文 | 本研究揭示了FXYD3通过结合IRF7调控JAK2/STAT5信号通路促进肝内胆管癌恶性进展的机制 | 首次发现FXYD3通过其60-87aa结构域直接与IRF7相互作用，通过cGAS/STING通路形成正反馈环路持续激活JAK2/STAT5信号 | 未明确说明样本量的具体数值和研究局限性 | 探究FXYD3在肝内胆管癌进展中的作用机制 | 肝内胆管癌细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝内胆管癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组分析, 生物信息学分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 255 | 2025-10-31 |
CHB-Induced Immune Zonation Chaos Elicited LXRα-mediated Lipid Metabolism Disorders in Kupffer Cells to Induce Cancer Stem Cell Formation
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510275
PMID:41164971
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示了慢性乙型肝炎中Kupffer细胞区室化紊乱通过LXRα介导的脂代谢异常诱导癌症干细胞形成的机制 | 首次揭示了Kupffer细胞区室化在疾病进展中的作用，发现了LXRα在Kupffer细胞中的关键调控功能 | 研究主要基于AAV-HBV小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究慢性乙型肝炎向肝癌转变过程中肝脏微环境的动态分子机制 | AAV-HBV小鼠模型和HBV患者的肝脏组织 | 空间转录组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | AAV-HBV小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | AAV-HBV小鼠模型和HBV患者肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 256 | 2025-10-31 |
YAP-Induced Glycolysis Drives Fibroinflammation and Disrupts Fibroblast Fidelity
2025-Oct-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326480
PMID:41165345
|
研究论文 | 本研究揭示了YAP通过诱导糖酵解驱动心脏纤维炎症并破坏成纤维细胞谱系保真度的机制 | 首次发现右心房心脏成纤维细胞具有更高的糖酵解活性和YAP活性，揭示了YAP通过糖酵解促进纤维炎症、诱导成纤维细胞向骨软骨祖细胞状态分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；机制研究集中在Hippo/YAP通路，其他可能参与的通路未充分探索 | 探究Hippo/YAP通路在心脏成纤维细胞代谢微环境调控和纤维炎症中的作用机制 | 心脏成纤维细胞、心脏四个腔室、巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 单核ATAC测序, 代谢研究, 同位素标记葡萄糖摄取测定 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据, 代谢数据 | 人类和小鼠心脏组织样本 | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 257 | 2025-10-31 |
Endothelial Protective Effects of Ferulic Acid in Pre-eclampsia Treatment
2025-Oct-30, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00495.2025
PMID:41165539
|
研究论文 | 本研究探讨阿魏酸通过STAT3/VEGF信号轴改善子痫前期症状的内皮保护作用 | 首次揭示阿魏酸通过抑制STAT3磷酸化增强内皮屏障功能并改善子痫前期血管功能障碍 | 研究基于L-NAME诱导的小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 评估阿魏酸对子痫前期的治疗潜力及其作用机制 | L-NAME诱导的子痫前期小鼠模型 | 生物医学研究 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序, 分子检测 | 动物模型 | 基因表达数据, 生理指标数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2025-10-31 |
The cell as a token: high-dimensional geometry in language models and cell embeddings
2025-Oct-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf595
PMID:41165609
|
综述 | 探讨自然语言嵌入结构理解如何为单细胞数据集分析提供启示 | 将语言模型中的token概念与细胞嵌入进行类比，提出细胞作为token的新视角 | NA | 探索语言模型与细胞嵌入在高维几何结构上的相似性 | 单细胞数据集和自然语言数据 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型, 语言模型 | 单细胞数据, 文本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 259 | 2025-10-31 |
Spatially resolved airway niches: mapping epithelial-immune microenvironments in asthma
2025-Oct-29, Expert review of respiratory medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/17476348.2025.2582244
PMID:41146609
|
综述 | 本文综述了空间组学技术在哮喘研究中揭示气道上皮-免疫微环境空间异质性的应用 | 整合多种空间组学技术揭示哮喘中先前被忽视的疾病定义性微环境生态位 | 检测成本较高、RNA扩散问题、FFPE工作流程标准化不足、需要全球队列的多组学整合 | 通过空间组学技术解析哮喘气道上皮-免疫微环境的分子环路和异质性 | 人气道活检组织、离体肺切片、小鼠哮喘模型 | 空间转录组学 | 哮喘 | 空间转录组学、多重成像蛋白质组学、空间代谢组学 | 基于图的人工智能 | 空间分子数据 | NA | 10x Genomics,Nanostring,Akoya Biosciences,Vizgen,Ionpath,Standard BioTools | 空间转录组学,多重成像蛋白质组学,空间代谢组学 | Visium-HD,Xenium,CosMx SMI,MERFISH,Imaging Mass Cytometry,MIBI,MALDI-MSI | 10x Visium HD,10x Xenium,Nanostring CosMx SMI,Vizgen MERFISH,Standard BioTools Imaging Mass Cytometry,Ionpath MIBI,高分辨率MALDI-MSI |
| 260 | 2025-10-31 |
scCT-DB, an omnibus for cancer patient-derived paired pre- and post-treatment single-cell transcriptomes to reveal drug perturbation and drug resistance mechanisms
2025-Oct-29, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1065
PMID:41160885
|
研究论文 | 开发了一个癌症治疗相关单细胞转录组数据库scCT-DB，用于揭示药物扰动和耐药机制 | 首个全面收集患者治疗前后配对单细胞转录组数据的数据库，采用统一流程处理并提供结构化元数据 | NA | 揭示药物扰动和耐药机制，发现预测治疗反应的生物标志物 | 癌症患者治疗前后的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 619万个细胞，来自1142个原始患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |