单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-05-04 |
Integrated single-cell RNA sequencing reveals the tumor heterogeneity and microenvironment landscape during liver metastasis in adenocarcinoma of esophagogastric junction
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1484234
PMID:39850884
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research paper | 利用单细胞RNA测序技术揭示食管胃结合部腺癌肝转移过程中的肿瘤异质性和微环境景观 | 首次在AEGJ肝转移中鉴定出一种特定的成纤维细胞类型，并发现SFRP2基因在周细胞中的高表达可能通过Wnt通路影响血管稳定性和血管生成 | 样本量较小，未进行功能验证实验 | 探究食管胃结合部腺癌肝转移的细胞和分子机制 | 食管胃结合部腺癌肝转移患者的肿瘤组织和微环境 | digital pathology | esophagogastric junction adenocarcinoma | single-cell RNA sequencing, immunofluorescence staining | NA | RNA-seq data, immunofluorescence images | AEGJ肝转移患者样本（具体数量未明确说明） |
| 242 | 2025-05-04 |
Combining single-cell analysis and molecular docking techniques to construct a prognostic model for colon adenocarcinoma and uncovering inhibin subunit βb as a novel therapeutic target
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1524560
PMID:39850875
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研究论文 | 结合单细胞分析和分子对接技术构建结肠腺癌预后模型，并揭示抑制素亚基βb作为新型治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序数据和分子对接技术，构建基于失巢凋亡相关基因的结肠腺癌预后模型，并发现INHBB作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于体外细胞实验 | 探索失巢凋亡与结肠腺癌的生物学联系及其在肿瘤进展中的机制，寻找新的治疗靶点 | 结肠腺癌患者和细胞系 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、分子对接、基因敲除 | Cox比例风险模型、Lasso回归 | 转录组数据、临床信息 | TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌患者数据 |
| 243 | 2025-05-04 |
Integrated single-cell and bulk transcriptome analysis of R-loop score-based signature with regard to immune microenvironment, lipid metabolism and prognosis in HCC
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1487372
PMID:39850878
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research paper | 该研究通过整合单细胞和批量转录组分析，构建了一个基于R-loop评分的特征模型，以探索其在HCC免疫微环境、脂质代谢和预后中的作用 | 首次构建了基于R-loop评分的特征模型，揭示了R-loop调节基因（RLRGs）与HBV感染、脂质代谢及HCC进展的关系，并发现CLTC作为潜在的治疗靶点 | 研究主要基于转录组数据，缺乏对R-loop形成和功能机制的深入实验验证 | 探索R-loop在HCC进展中的作用，并构建预后风险模型以识别潜在治疗靶点 | HCC患者的单细胞和批量转录组数据，以及体外和体内实验验证 | digital pathology | hepatocellular carcinoma | scRNA-seq, WGCNA分析 | 预后风险模型 | 转录组数据 | 来自GSE149614和CRA002308的HCC患者数据，以及TCGA数据库的数据 |
| 244 | 2025-05-04 |
Macrophage heterogeneity and oncogenic mechanisms in lung adenocarcinoma: insights from scRNA-seq analysis and predictive modeling
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1491872
PMID:39850883
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析探索了肺腺癌中巨噬细胞的异质性及其潜在的致癌机制，并基于巨噬细胞相关基因构建了一个预后模型 | 揭示了巨噬细胞亚群的复杂性及其在肺腺癌中的潜在致癌作用，构建了一个基于巨噬细胞标记基因的预后模型，并验证了其在预测预后和免疫治疗效果方面的有效性 | 研究主要依赖于TCGA数据，可能受到样本量和数据质量的限制，且细胞实验仅验证了COL5A1的致癌机制 | 探索肺腺癌中巨噬细胞的特性及其对预后的影响，并构建一个有效的预后模型 | 肺腺癌患者及其肿瘤微环境中的巨噬细胞 | digital pathology | lung cancer | scRNA-seq, RT-PCR | Lasso regression, multivariate Cox regression | scRNA-seq data, clinical data | TCGA数据集及多个外部验证数据集 |
| 245 | 2025-05-04 |
The emergence of DNAM-1 as the facilitator of NK cell-mediated killing in ovarian cancer
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1477781
PMID:39835114
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研究论文 | 本研究探讨了DNAM-1在卵巢癌中促进NK细胞介导的杀伤作用 | 揭示了DNAM-1在卵巢癌中作为NK细胞杀伤促进因子的新作用，并发现PVR/DNAM-1轴在肿瘤免疫逃逸中的关键作用 | 样本量相对有限(80例)，且主要为观察性研究，缺乏机制层面的深入探索 | 探索卵巢癌中NK细胞的表型和功能特征及其与临床预后的关系 | 80名卵巢癌患者的血液、原发肿瘤和转移组织中的NK细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 流式细胞术、scRNA-seq | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 80名卵巢癌患者样本 |
| 246 | 2025-05-04 |
Integrating single cell analysis and machine learning methods reveals stem cell-related gene S100A10 as an important target for prediction of liver cancer diagnosis and immunotherapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1534723
PMID:39840058
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研究论文 | 结合单细胞分析和机器学习方法，揭示干细胞相关基因S100A10作为肝癌诊断和免疫治疗预测的重要靶点 | 首次将单细胞RNA测序与机器学习技术结合，识别出与肝癌干细胞相关的关键基因S100A10，并验证其作为预后标志物的潜力 | 研究仅针对肝癌，未在其他癌症类型中验证S100A10的普适性 | 提高肝癌的诊断精度和免疫治疗效果 | 肝癌干细胞相关基因 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | XGBoost | 基因表达数据 | 多个数据集（具体数量未提及） |
| 247 | 2025-05-03 |
Prognostic significance of neutrophil extracellular trap-related genes in childhood acute lymphoblastic leukemia: insights from multi-omics and in vitro experiment
2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2025.2452701
PMID:39829399
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研究论文 | 本研究基于中性粒细胞胞外诱捕网相关基因(NETRGs)构建了一个儿童急性淋巴细胞白血病(cALL)的预后模型 | 首次将多组学数据与体外实验相结合，鉴定出7个预后相关基因并构建风险模型，揭示了TLR2等6个潜在治疗靶点 | 研究样本来自公共数据库，缺乏独立队列验证实验结果的临床适用性 | 开发儿童急性淋巴细胞白血病的预后预测模型并探索潜在治疗靶点 | 儿童急性淋巴细胞白血病患者 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 转录组测序、单细胞转录组测序、RT-qPCR | LASSO回归、Cox回归风险模型 | 基因表达数据 | 来自TARGET-ALL-P2/P3队列和GSE26713/GSE130116数据集的样本 |
| 248 | 2025-05-03 |
Interferon Regulatory Factor 1 Promotes Diabetic Vasculopathy by Mediating Endothelial Cell Pyroptosis
2025-Jun, Annals of vascular surgery
IF:1.4Q3
DOI:10.1016/j.avsg.2025.02.018
PMID:40086624
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research paper | 该研究探讨了干扰素调节因子1（IRF-1）通过介导内皮细胞焦亡促进糖尿病血管病变的机制 | 首次揭示了IRF-1在糖尿病血管病变中通过调节内皮细胞焦亡的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证不足 | 探究糖尿病血管病变的分子机制 | 糖尿病模型小鼠BKS-db/db和内皮细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、免疫组化、HE染色、Masson染色 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 两组样本（非糖尿病动脉粥样硬化和糖尿病动脉粥样硬化） |
| 249 | 2025-05-03 |
Single-cell sequencing reveals a regulatory role of WT1 in mast cell proliferation in endometrial polyps
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500116R
PMID:40304994
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术研究子宫内膜息肉中WT1在肥大细胞增殖中的调控作用 | 首次在单细胞水平上揭示了WT1作为关键转录调节因子在子宫内膜息肉肥大细胞增殖中的作用 | 研究样本量有限，需要更大规模的验证 | 探究子宫内膜息肉的细胞异质性和分子机制 | 子宫内膜息肉(EPs)及邻近正常子宫内膜组织(EUs) | 单细胞测序 | 子宫内膜息肉 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 子宫内膜息肉和邻近正常子宫内膜组织样本 |
| 250 | 2025-05-03 |
Induced B cell receptor diversity predicts PD-1 blockade immunotherapy response
2025-May-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2501269122
PMID:40314973
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、高分辨率空间转录组学和空间免疫受体分析，探讨了B细胞受体多样性在预测PD-1阻断免疫疗法反应中的作用 | 发现PD-1抑制成功反应的特征是治疗后B细胞受体克隆多样性的诱导，并验证了这种多样性作为多种癌症治疗反应的通用预测因子 | 研究样本量有限，且需要进一步验证机器学习模型的预测准确性 | 探索PD-1阻断免疫疗法反应的机制，并寻找预测治疗反应的生物标志物 | 局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者 | 免疫治疗 | 基底细胞癌、胶质母细胞瘤、黑色素瘤、头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、高分辨率空间转录组学、空间免疫受体分析 | 机器学习模型 | RNA测序数据、空间转录组数据 | 一组局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及更大的胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者队列 |
| 251 | 2025-05-03 |
CCN5 suppresses injury-induced vascular restenosis by inhibiting smooth muscle cell proliferation and facilitating endothelial repair via thymosin β4 and Cd9 pathway
2025-May-02, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae911
PMID:39873228
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研究论文 | 本研究探讨了CCN5在抑制血管损伤后再狭窄中的作用及其机制 | 揭示了CCN5通过胸腺素β4和Cd9通路抑制平滑肌细胞增殖并促进内皮修复的双重保护作用 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究CCN5在预防支架内再狭窄(ISR)中的作用机制 | 猪冠状动脉和小鼠股动脉的血管细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 酶联免疫吸附试验, 质谱分析, 免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | 支架植入猪冠状动脉和小鼠损伤诱导的股动脉新生内膜样本 |
| 252 | 2025-05-03 |
Kindlin-2-Mediated Hematopoiesis Remodeling Regulates Triple-Negative Breast Cancer Immune Evasion
2025-May-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0698
PMID:39918417
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研究论文 | 研究探讨了kindlin-2在三阴性乳腺癌（TNBC）免疫逃逸中的作用及其通过造血重塑调节免疫反应的机制 | 揭示了kindlin-2通过调节造血过程和PD-L1表达促进TNBC免疫逃逸的新机制，并提出了kindlin-2作为联合免疫检查点阻断治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探索kindlin-2在TNBC免疫逃逸中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌（TNBC）及其免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组织化学（IHC） | 基因敲除（KO）小鼠模型 | 基因表达数据、免疫组织化学数据 | 未明确说明样本数量，但使用了TNBC肿瘤小鼠模型 |
| 253 | 2025-05-03 |
Denosumab Enhances Antitumor Immunity by Suppressing SPP1 and Boosting Cytotoxic T Cells
2025-May-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-1094
PMID:40009710
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研究论文 | 本研究探讨了denosumab通过抑制SPP1基因表达和增强细胞毒性T细胞活性来增强抗肿瘤免疫的新作用 | 揭示了denosumab在抗肿瘤免疫中的新机制，即通过抑制SPP1表达和增加细胞毒性T细胞数量来增强免疫反应 | 研究样本量较小，仅包括9例GCTB患者，且pan-cancer分析为相关性研究，未进行机制验证 | 探索denosumab在抗肿瘤免疫中的作用及其机制 | 人类巨细胞瘤(GCTB)患者样本和34种不同类型的癌症数据 | 肿瘤免疫学 | 巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9例GCTB患者样本(6例未治疗，3例仅接受denosumab治疗)和34种癌症的pan-cancer数据 |
| 254 | 2025-05-03 |
Charting the Single-Cell and Spatial Landscape of IDH-Wildtype Glioblastoma with GBmap
2025-May-02, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf113
PMID:40312969
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research paper | 该研究通过整合单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据，构建了GBmap，一个全面的单细胞和空间图谱，以揭示IDH野生型胶质母细胞瘤的细胞异质性和空间结构 | 构建了GBmap，一个统一的单细胞图谱，并开发了肿瘤结构评分（TSS）来量化肿瘤组织，揭示了缺氧依赖性肿瘤微环境与不良预后的关联 | 研究依赖于已有数据集，可能受限于数据质量和样本多样性 | 揭示IDH野生型胶质母细胞瘤的细胞异质性、空间结构及其临床相关性 | IDH野生型胶质母细胞瘤的肿瘤微环境和空间组织 | digital pathology | glioblastoma | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 240名患者的110万个细胞 |
| 255 | 2025-05-03 |
Calbindin 2 as a Novel Biomarker and Therapeutic Target for Abdominal Aortic Aneurysm: Integrative Analysis of Human Proteomes and Genetics
2025-May-02, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.039195
PMID:40314374
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研究论文 | 本研究通过整合人类蛋白质组和遗传学数据，发现CALB2作为腹主动脉瘤的新型生物标志物和治疗靶点 | 首次将CALB2确定为腹主动脉瘤的潜在因果蛋白，并发现其通过调节脂质代谢影响疾病进展 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步人类临床试验验证 | 寻找腹主动脉瘤的新型生物标志物和治疗靶点 | 腹主动脉瘤患者和小鼠模型 | 生物医学研究 | 腹主动脉瘤 | 蛋白质组范围孟德尔随机化、遗传相关性分析、共定位分析、RNA测序、单细胞/单核RNA测序、空间转录组学 | 载脂蛋白E缺陷小鼠模型 | 蛋白质组数据、遗传数据、转录组数据 | 未明确说明人类样本量，使用载脂蛋白E缺陷小鼠模型 |
| 256 | 2025-05-03 |
T-type calcium channels regulate medulloblastoma and can be targeted for therapy
2025-May, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-025-04967-5
PMID:39961940
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研究论文 | 本研究探讨了T型钙通道在髓母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次对T型钙通道在髓母细胞瘤中的多组学特征进行了全面表征，并提供了将米贝地尔重新用作治疗策略的临床前数据 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 研究T型钙通道在髓母细胞瘤中的作用及其治疗靶点潜力 | 髓母细胞瘤肿瘤细胞和动物模型 | 肿瘤生物学 | 髓母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RPPA, hdWGCNA | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 公开可用的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集，以及动物模型 |
| 257 | 2025-05-03 |
Harnessing omics data for drug discovery and development in ovarian aging
2025-May-01, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmaf002
PMID:39977580
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综述 | 本文综述了多组学数据在卵巢衰老药物发现和开发中的应用 | 整合了基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和微生物组等多组学数据，从组织和单细胞层面探索卵巢衰老的分子机制和药物靶点 | 仅限于截至2024年9月的英文文献，可能遗漏其他语言的重要研究 | 探索多组学数据在卵巢衰老药物发现和开发中的应用 | 卵巢衰老相关的多组学数据 | 生物信息学 | 卵巢衰老 | 基因组学、转录组学、表观基因组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学、微生物组学、单细胞技术、空间转录组学 | 机器学习、人工智能、深度学习 | 多组学数据 | NA |
| 258 | 2025-05-03 |
Differential cellular origins of the extracellular matrix of tumor and normal tissues according to colorectal cancer subtypes
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02964-z
PMID:40032993
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research paper | 该研究通过整合定量蛋白质组学和单细胞RNA测序数据，分析了结直肠癌肿瘤微环境中细胞外基质（ECM）的蛋白异质性 | 鉴定了正常组织和肿瘤组织中ECM蛋白的差异细胞来源，并建立了细胞-基质组数据库，定义了与特定成纤维细胞亚型相关的间充质亚型特异性分子 | 样本量较小（24个组织样本来自21名患者），可能影响结果的普遍性 | 理解结直肠癌肿瘤微环境中ECM的蛋白异质性及其与疾病进展的关系 | 结直肠癌患者的肿瘤组织和相邻正常组织 | digital pathology | colorectal cancer | TMT质谱分析、scRNA-Seq、bulk RNA-Seq | NA | 蛋白质组数据、RNA测序数据 | 24个组织样本（来自21名CRC患者） |
| 259 | 2025-05-03 |
Macrophage-mediated IL-6 signaling drives ryanodine receptor-2 calcium leak in postoperative atrial fibrillation
2025-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI187711
PMID:40048254
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研究论文 | 本研究探讨了术后心房颤动(poAF)的细胞和分子机制，特别是巨噬细胞介导的IL-6信号在RyR2钙泄漏中的作用 | 首次揭示了巨噬细胞通过IL-6-STAT3-CaMKII信号通路驱动RyR2-S2814磷酸化，从而导致poAF的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明术后心房颤动的发病机制 | 小鼠和人类心脏手术后的心房组织 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、假时间轨迹分析、共聚焦成像 | 条件性基因敲除小鼠模型(cKO) | 单细胞转录组数据、生化数据、功能数据 | 小鼠模型和人类心包液样本(具体数量未明确说明) |
| 260 | 2025-05-03 |
Claudin18.2-positive gastric cancer-specific changes in neoadjuvant chemotherapy-driven immunosuppressive tumor microenvironment
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02981-y
PMID:40128286
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光技术，分析了37例胃癌样本，探讨了新辅助化疗驱动的CLDN18.2阳性胃癌肿瘤微环境的免疫抑制变化 | 揭示了化疗在CLDN18.2阳性胃癌中驱动免疫抑制性肿瘤微环境变化的特异性机制 | 样本量较小（37例GC样本，其中11例CLDN18.2阳性） | 探究CLDN18.2阳性胃癌中新辅助化疗驱动的肿瘤微环境变化 | 胃癌样本（特别是CLDN18.2阳性病例） | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 37例胃癌样本（11例CLDN18.2阳性） |