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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-05-30 |
A Head and Neck Cancer Patient-Specific Microphysiological System for Predicting Response to Chemoradiation
2026-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.28.721391
PMID:42094510
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研究论文 | 开发了一种头颈癌患者特异性微生理系统,用于预测对放化疗的反应 | 构建了包含患者自身恶性细胞、成纤维细胞、免疫细胞和内皮化管腔的三维血管化头颈癌肿瘤微环境模型,并利用单细胞RNA测序验证其保留了12种转录上不同的细胞群体 | 当前模型在捕捉个别头颈癌肿瘤及微环境的全部复杂性或患者间异质性方面仍有不足 | 开发能预测头颈癌患者对放化疗反应的个体化功能工具 | 头颈癌患者手术切除的肿瘤组织中的恶性细胞、成纤维细胞和免疫细胞 | 机器学习 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 来自头颈癌患者的多个样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 242 | 2026-05-30 |
Identification of RPA3 as a Potential Functional Effector of Chromosome 7 Gain in Glioblastoma
2026-Apr-30, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14051014
PMID:42193341
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研究论文 | 本研究鉴定RPA3为胶质母细胞瘤中7号染色体获得性扩增的一个潜在功能效应因子 | 首次识别RPA3作为7号染色体获得性扩增中除经典位点外的剂量敏感候选基因,并证明其在胶质母细胞瘤恶性表型中的功能相关性 | 基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证及临床试验数据支持 | 鉴定胶质母细胞瘤中7号染色体获得性扩增相关的额外候选基因及其功能 | 胶质母细胞瘤肿瘤样本及U87、U118胶质瘤细胞系 | 机器学习和生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq,拷贝数分析,单细胞RNA-seq,siRNA敲低 | NA | 转录组数据,拷贝数数据,临床数据,单细胞RNA-seq数据 | TCGA-GBM和TCGA-LGG队列,CGGA-693队列,单细胞分析中chr7获得性和正常拷贝肿瘤亚克隆 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 243 | 2026-05-30 |
Somatic Mutation Trajectories Define Prognostically Distinct Subtypes and Shape the Tumor Microenvironment in Gastric Cancer
2026-Apr-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17050536
PMID:42194993
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研究论文 | 通过体细胞突变轨迹重建将胃癌分为两种预后不同的亚型,并揭示其肿瘤微环境特征 | 首次应用SuStaIn算法从时间顺序角度分析胃癌体细胞突变积累过程,识别出加速路径和渐进路径两种进化轨迹,并关联了转录组和微环境差异 | 药物敏感性预测和基因表达与临床结局的机制联系仅为假设生成性发现,需前瞻性和功能性验证 | 重建胃癌体细胞突变轨迹以定义预后不同的亚型并分析相关的转录组和微环境特征 | 胃癌患者的体细胞突变数据、转录组数据和微环境特征 | 数字病理学 | 胃癌 | SuStaIn算法、基因表达分析、单细胞RNA测序反卷积、药物敏感性预测 | SuStaIn | 基因组突变数据、转录组数据 | 三个独立的外部转录组队列 | NA | NA | NA | NA |
| 244 | 2026-05-30 |
Putative Self-Organizing Human Corneal Organoids Recapitulate Human Corneal Architecture and Cellular Diversity
2026-Apr-29, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering13050518
PMID:42194275
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研究论文 | 开发了一种使用人胚胎干细胞通过改良SEAM方案生成三维角膜类器官模型,该模型能重现人类角膜的多层结构和细胞多样性 | 首次通过自发三维球体培养方法生成具有角膜上皮、基质和内皮分层结构的角膜类器官,单细胞RNA测序揭示18个不同细胞簇,包括三种角膜上皮亚群和两种基质亚群 | 仅约20%的类器官形成透明区域,未来需要提高类器官形成效率和功能成熟度 | 建立能重现人类角膜复杂细胞架构和多样性的三维角膜类器官模型,用于角膜发育、疾病建模和再生医学研究 | 人胚胎干细胞来源的角膜类器官 | 数字病理学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | 三维角膜类器官模型 | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | 7-8周分化培养的类器官样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3端测序平台用于分析类器官细胞组成和基因表达模式 |
| 245 | 2026-05-30 |
Integrative Multi-Omics and Machine Learning Analysis Identifies Therapeutic Targets and Drug Repurposing Candidates for Alzheimer's Disease
2026-Apr-27, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14050998
PMID:42193325
|
研究论文 | 通过整合多组学数据和机器学习方法,识别阿尔茨海默病的诊断生物标志物和治疗靶点,并筛选药物重利用候选分子 | 首次整合转录组学、单细胞RNA测序、孟德尔随机化和分子对接等多层分析方法,构建定量多组学收敛框架,系统识别免疫相关的治疗靶点及药物重利用候选物 | 所有预测均需在生化及细胞模型中进行实验验证后方可得出临床结论 | 开发整合多组学计算流程,识别阿尔茨海默病的诊断生物标志物并优先排序可药物干预的治疗靶点 | 阿尔茨海默病患者与健康对照的转录组数据、单细胞核RNA测序数据及FDA批准药物库 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 加权基因共表达网络分析、机器学习、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、贝叶斯共定位、分子对接、分子动力学模拟 | LASSO, 随机森林, 支持向量机 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 药物分子结构数据 | 1047个转录组样本(547例AD,500例对照)及48,481个单细胞核 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2026-05-30 |
Mechanism of Xiao-ai-fei Honey Ointment, a Traditional Uyghur Multi-Ingredient Medicinal Preparation, Against Cervical Cancer Based on Network Pharmacology and In Vitro Evaluation of Anti-Cancer Activity
2026-Apr-27, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19050686
PMID:42198359
|
研究论文 | 通过网络药理学、单细胞RNA测序及体外实验,揭示了传统维吾尔药复方制剂消炎蜂蜜软膏(XAFHO)对抗宫颈癌的分子机制 | 首次结合网络药理学、单细胞RNA测序和体外实验,系统阐明了XAFHO通过多靶点、多细胞途径抗宫颈癌的作用机制,并鉴定出11个基因的预后模型 | 研究主要依赖数据库分析和体外实验,尚缺乏体内动物实验及临床样本验证 | 探究消炎蜂蜜软膏(XAFHO)抗宫颈癌的潜在分子机制 | 宫颈癌细胞系(HeLa和SiHa)、TCGA及GEO数据库中的宫颈癌转录组数据 | 计算机视觉 | 宫颈癌 | NA | LASSO回归、Cox回归 | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据 | TCGA数据库中的宫颈癌样本(未明确具体数量)及单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 247 | 2026-05-30 |
Age-associated B cells (ABCs) develop from a CNS-localized progenitor pool into a pro-inflammatory phenotype after stroke
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.02.709112
PMID:41847014
|
研究论文 | 该研究鉴定出年龄相关B细胞在卒中后从中枢神经系统局部前体细胞库分化为促炎表型 | 首次发现中枢神经系统内存在独特的B1b前体细胞库,并揭示其向年龄相关B细胞(ABC)转化的轨迹,同时证实小鼠与人类组织中的保守性 | 未明确阐述研究局限性 | 阐明中枢神经系统中B细胞亚群的特征及其在衰老和卒中后的变化 | 老年雄性和雌性小鼠(未损伤和卒中后)的脑部B细胞,以及老年人类脑供体的脑实质组织 | 数字病理学 | 缺血性卒中 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、B细胞受体测序 | NA | NA | 老年小鼠(未损伤和卒中后)及老年人类脑供体组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 248 | 2026-05-30 |
Computational Approaches to Cancer Cell Dormancy: From Detection to Dynamic Modelling
2026-Apr-24, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16050633
PMID:42193984
|
综述 | 综述计算方法在癌症细胞休眠研究中的应用,涵盖从检测到动态建模的各个环节 | 将癌症细胞休眠视为动态、多尺度的系统问题,而非静态细胞类型分类任务,并系统梳理了计算方法在推断休眠细胞身份、异质性、微环境调控、状态转换和再激活动力学方面的应用 | 操作定义碎片化、罕见状态检测困难、跨研究不兼容以及使用快照数据研究时间动态过程 | 探讨计算方法如何应用于癌症细胞休眠的检测、特征描述和动态建模,以推动该领域进展 | 癌症细胞休眠现象及其相关计算方法 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学、谱系追踪、空间分析、多组学整合分析 | NA | 单细胞数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 249 | 2026-05-30 |
TAF1 Suppresses MHC-I Expression and Correlates with Poor Immunotherapy Response in Small Cell Lung Cancer
2026-Apr-23, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14050973
PMID:42193300
|
研究论文 | 通过系统筛选表观遗传调控因子,发现TAF1通过抑制MHC-I表达导致小细胞肺癌免疫治疗效果差 | 首次系统筛选796个表观遗传调控因子,鉴定TAF1为小细胞肺癌免疫治疗抵抗的关键调控因子,揭示了TAF1通过抑制MHC-I表达降低CD8 T细胞浸润的新机制 | 未提及具体限制 | 探究小细胞肺癌对免疫治疗内在抵抗的表观遗传调控机制 | 小细胞肺癌患者肿瘤样本及相关细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 测序数据 | 20例小细胞肺癌肿瘤的scRNA-seq数据,IMpower133队列的bulk RNA-seq数据,TU-SCLC队列的蛋白质组数据,以及一个独立的39例小细胞肺癌肿瘤的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 250 | 2026-05-30 |
Glo1 promotes glioma progression by modulating Sox2 transcriptional networks in glioma stem-like cells
2026-Apr-20, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag090
PMID:42011505
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组分析发现Glo1在胶质瘤干细胞中富集,并揭示其通过调控Sox2转录网络促进胶质瘤进展的分子机制 | 首次鉴定Glo1作为胶质瘤干细胞的功能性标志物,并通过单细胞转录组学、体内外模型及药理学抑制系统验证其治疗靶点潜力 | 文章未明确说明实验样本量及临床队列验证的局限性 | 阐明Glo1在胶质瘤干细胞中的功能及其作为治疗靶点的可行性 | 胶质瘤干细胞、患者来源异种移植模型及宫内电转模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学、功能基因组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类及小鼠胶质母细胞瘤模型样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 251 | 2026-04-18 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies a Pivotal Role of SPHK1+ Macrophage-Driven Inflammation in Mechanism of Aortic Dissection and Highlights SPHK1 as a Therapeutic Target
2026-Apr-16, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-026-02505-7
PMID:41991732
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2026-04-18 |
Exploring and experimental validation of SLC7A11 and ferroptosis related prognostic genes in non-small cell lung cancer using bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing
2026-Apr-16, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00786-4
PMID:41992345
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2026-05-30 |
Hexokinase 3 promoted cytokine production of monocytes by targeting metabolic reprogramming and histone lactylation in sepsis
2026-Apr-10, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-026-02129-6
PMID:41964014
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研究论文 | 该文章研究了己糖激酶3(HK3)通过代谢重编程和组蛋白乳酸化促进脓毒症中单核细胞的细胞因子产生 | 首次发现HK3作为代谢检查点在脓毒症中通过H3K18乳酸化依赖性激活IL-6和TNF-α基因,驱动单核细胞过度炎症反应,并确定HK3为潜在的诊断标志物和治疗靶点 | 未提供具体局限性信息 | 阐明脓毒症中糖酵解相关调控基因在单核细胞免疫反应中的作用机制 | 脓毒症患者的外周血单核细胞及LPS诱导的单核细胞脓毒症模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序、ROC曲线分析、免疫细胞浸润分析 | NA | 基因表达数据 | 使用GEO数据库数据集,具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2026-04-11 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to reveal the spatiotemporal dynamics of retinal cells during ischemia-reperfusion injury progression in rats
2026-Apr-09, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-026-01571-6
PMID:41957682
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2026-05-30 |
Current understanding and future directions in severe asthma through artificial intelligence-integrated multi-omic approaches
2026-Apr, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society
IF:9.0Q1
DOI:10.1183/16000617.0040-2025
PMID:42203233
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综述 | 探讨人工智能整合多组学方法在重症哮喘研究中的现状与未来方向 | 首次系统综述AI与多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)结合在重症哮喘中的应用,揭示传统方法无法识别的数据模式 | 研究多停留在概念验证阶段,临床转化面临数据整合标准化、算法解释性等挑战 | 阐明AI整合多组学如何提升重症哮喘诊断精度、预测治疗效果并指导个性化治疗策略 | 重症哮喘患者的多组学数据(基因组、转录组、蛋白质组、代谢组)及单细胞RNA测序数据 | machine learning | 重症哮喘 | 多组学技术(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据(基因组、转录组、蛋白质组、代谢组)、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 256 | 2026-05-30 |
Splicing variants in MYRF cause partial loss of function in the retinal pigment epithelium leading to nanophthalmos
2026-Mar-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.194681
PMID:41746734
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研究论文 | 研究揭示了MYRF基因的剪接变异体导致视网膜色素上皮细胞部分功能丧失,从而引发纳米眼 | 首次证明MYRF基因的C末端剪接变异体(如dG-MYRF)是功能减退等位基因,并解释了为何此类变异导致孤立性纳米眼而非综合征性疾病 | 未提及 | 探究MYRF基因C末端变异导致孤立性纳米眼与完全功能丧失变异导致综合征疾病的差异机制 | MYRF基因C末端剪接变异体(dG-MYRF, p.Gly1126fs30*, c.3376-1G>A)及两个产生非功能性亚型的MYRF剪接变异体 | 分子生物学 | 纳米眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人源化MYRF C末端小鼠模型(MyrfhumdG/humdG胚胎致死,MyrfhumWT/humWT存活)及KO RxCre;Myrffl/fl小鼠(E15.5和P0) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 257 | 2026-05-30 |
A single-nucleus and spatial transcriptomic atlas of poplar leaves reveals the regulation of leaf polarity and cuticle deposition
2026-Mar-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.03.015
PMID:41866110
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研究论文 | 通过单核和空间转录组学构建杨树叶片的细胞图谱,揭示叶面极性及角质层沉积的调控机制 | 首次整合单核和空间转录组学解析杨树叶片近轴-远轴极性,发现MYC2作为角质层生物合成的关键调控因子,结合脂质合成和转运基因启动子并促进角质层增厚 | 研究主要基于杨树叶片,需验证MYC2在其他植物中的保守性及其在非生物胁迫中的具体功能 | 探究叶片近轴-远轴极性建立过程中转录组和代谢组的空间调控网络 | 杨树叶片细胞类群(叶肉细胞、表皮细胞、维管相关细胞)及其近轴-远轴亚型 | 数字病理学 | 不适用 | 单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学 | 不适用 | 基因表达数据、空间位置数据 | 杨树叶片样本 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序平台, 10x Visium空间转录组平台 |
| 258 | 2026-05-30 |
Optimal transport fate mapping resolves T cell differentiation dynamics across tissues
2026-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.24.707057
PMID:42124734
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研究论文 | 利用最优输运命运映射方法重建跨组织CD8 T细胞分化动态 | 首次将最优输运框架应用于时间序列单细胞RNA-seq数据,重建连续细胞轨迹并解析效应与记忆T细胞分化路径,实验验证了小肠中时间上不同的迁移波导致不同的组织驻留记忆T细胞命运 | 未明确说明研究局限性 | 重建免疫细胞在不同命运间转化的连续轨迹,特别是在抗病毒CD8 T细胞分化过程中的动态变化 | 急性病毒感染小鼠的CD8 T细胞 | 机器学习 | 病毒感染(急性) | 单细胞RNA-seq | 最优输运 | 基因表达数据 | 小鼠样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 纵向单细胞RNA-seq数据 |
| 259 | 2026-05-30 |
RORγt+ dendritic cells are a distinct lymphoid-derived lineage
2026-Feb-20, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aed7439
PMID:41591258
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研究论文 | 该研究发现了小鼠中RORγt树突状细胞作为一个独立的淋巴来源谱系,其发育由特定增强子和转录因子调控,对于维持肠道免疫耐受至关重要 | 首次鉴定RORγt DC为淋巴源性的独立谱系,并揭示了其骨髓中的前体细胞(包括RILP和pre-RORγt DC前体)以及REV-ERBα/β、PRDM16和PU.1等关键调控因子 | 研究主要基于小鼠模型,结论向人类转化的可行性尚待验证 | 阐明耐受性树突状细胞谱系如何建立以防止对共生菌和食物抗原的不适当免疫反应 | 小鼠RORγt树突状细胞及其前体细胞 | 机器学习 | NA | 谱系追踪、单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠骨髓细胞和肠道样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 260 | 2026-05-30 |
Modeling cell-cell interactions to advance drug discovery in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.29.702646
PMID:41676623
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研究论文 | 利用支架共培养类器官模型研究特发性肺纤维化中细胞间相互作用,并评估抗纤维化药物疗效 | 开发了一种基于支架的人源共培养肺泡类器官模型,结合IPF患者原代成纤维细胞和携带SFTPC 173T突变的多能干细胞衍生肺泡2型细胞,模拟疾病进展中的上皮-间质细胞通讯 | 模型可能无法完全复制体内复杂微环境,体外结果向临床转化存在局限 | 建立更贴近患者病情的模型以研究IPF发病机制和抗纤维化药物 | 人类原代肺成纤维细胞(健康与IPF)、多能干细胞来源的肺泡2型细胞(iAT2);包含SFTPC 173T突变及其同基因校正对照 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型、共培养系统 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本量,涉及多能干细胞系和原代成纤维细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | NA |