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当前共找到 40164 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-06-06 |
Single-cell RNA sequencing unraveled immune-related expression heterogeneity and lymphoid cell development dysregulation in childhood asthma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1606650
PMID:41550933
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序分析儿童哮喘患者外周血单核细胞，揭示免疫相关的表达异质性和淋巴细胞发育失调 | 首次通过单细胞RNA测序揭示儿童哮喘中造血干细胞和祖细胞早期表达免疫相关基因的倾向，以及淋巴细胞谱系发育的泛发性失调，并提出可能的新型治疗靶点 | 未在标题和摘要中明确说明，故输出NA | 阐明免疫失调在儿童哮喘发病机制中的作用 | 3例儿童哮喘患者和4例年龄匹配健康对照的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 儿童哮喘 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 7个样本（3例儿童哮喘患者和4例健康对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 242 | 2026-06-06 |
Emerging technologies and current challenges in intratumoral microbiota research
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1685862
PMID:41552720
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综述 | 系统总结瘤内微生物研究中的新兴技术与当前挑战，涵盖检测方法、功能解析及临床转化 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学、类器官共培养及人工智能等多技术手段，提出从描述性分析向机制研究和临床转化跨越的路径 | 瘤内微生物低生物量导致检测易受环境污染，分析流程标准化不足，跨研究比较困难 | 阐述瘤内微生物研究的技术进展和挑战，推动精准肿瘤学中微生物导向策略的发展 | 肿瘤微环境中的瘤内微生物 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 优化厌氧培养, 基因组解析分析, 酶水平分析, 类器官共培养 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 243 | 2026-06-06 |
Integration of single cell and bulk transcriptomic analyses identifies FAM189A2 as a key prognostic gene in lung cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1701806
PMID:41567189
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析，识别出FAM189A2作为肺癌关键预后基因 | 首次将单细胞RNA测序与TCGA批量转录组数据整合，构建八基因LASSO-Cox风险模型，并发现FAM189A2作为推定肿瘤抑制因子和潜在生物标志物 | 研究基于回顾性公共数据集，FAM189A2的功能仅在体外细胞系中验证，缺乏体内模型和前瞻性临床验证 | 阐明恶性细胞状态与患者预后和治疗脆弱性的关联，开发可行的预后风险分层模型 | 13例原发性肺肿瘤及配对正常肺组织的单细胞RNA测序数据，以及TCGA-LUAD和两个外部验证队列 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CNN, LSTM, GAN | 图像, 文本, 视频 | 13例肺肿瘤和配对正常组织（48149个细胞）以及三个批量转录组队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 244 | 2026-06-06 |
A review of omics studies in sarcopenia: from molecular mechanisms to hepatic-gut-muscle interactions in chronic liver disease comorbidity
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1710582
PMID:41568005
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综述 | 综述了肌少症的多组学研究，从分子机制到慢性肝病共病中的肝-肠-肌肉相互作用 | 提出“共性-特异性”双层框架，在共性层面识别出蛋白质稳态失衡、线粒体功能障碍、慢性炎症和肠-肌轴失调四大核心病理支柱，在特异性层面提出“弱信号协同积累”假说解释慢性肝病中的肌少症机制 | 目前组学研究大多停留在相关性层面，向临床转化面临挑战 | 系统解析肌少症及其与慢性肝病共病的分子机制，为精准诊疗提供理论基础和发展路线图 | 肌少症及慢性肝病相关肌少症的多组学研究 | 机器学习 | 肌少症，慢性肝病 | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 245 | 2026-06-06 |
Elucidating the role of SHROOM4 in non-small cell lung cancer: expression patterns, clinical correlations, and potential functions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1723844
PMID:41573567
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研究论文 | 通过生物信息学分析探索SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达模式、临床相关性及潜在功能 | 首次系统研究SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达特征及其与肿瘤微环境的关系，发现其与Wnt/Beta-Catenin通路和ANGPTL7/SFTPC的关联 | 基于公共数据库分析，需进一步实验验证SHROOM4在肺癌进展中的具体机制及临床实用性 | 阐明SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达模式、临床意义及潜在功能 | SHROOM4基因在非小细胞肺癌（尤其是肺鳞癌）中的表达及其相关机制 | 生物信息学 | 肺癌 | 生物信息学分析、RNA-seq、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 肺鳞癌组织及对应正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2026-06-06 |
Cuproptosis-driven reprogramming of fibroblast communication by GK is associated with the immune microenvironment in diabetic foot ulcers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1687806
PMID:41583446
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示铜死亡相关基因GK在糖尿病足溃疡中通过成纤维细胞重编程免疫微环境的作用 | 首次将铜死亡机制与糖尿病足溃疡的成纤维细胞-免疫细胞通讯联系起来，并鉴定GK为诊断生物标志物 | 功能验证仅基于动物实验和计算预测，缺乏直接的细胞功能实验和人类样本验证 | 探究铜死亡在糖尿病足溃疡成纤维细胞与免疫细胞相互作用中的角色及潜在生物标志物 | 糖尿病足溃疡患者和健康皮肤组织的单细胞RNA测序数据，以及大鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | scRNA-seq | 机器学习（LASSO, SVM-RFE, 随机森林） | 基因表达数据 | 33,095个细胞（质控后25,198个），9只SD大鼠（每组3只） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 247 | 2026-06-06 |
PANoptosis in urological diseases: molecular mechanisms, pathological roles, and emerging therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1729348
PMID:41583472
|
综述 | 本文综述了PANoptosis在泌尿系统疾病中的分子机制、病理作用及新兴治疗策略 | 首次系统阐述了PANoptosis在泌尿系统疾病中的双重作用，既促进组织损伤又驱动抗肿瘤免疫，并提出了多组学生物标志物筛选、纳米材料递送系统和联合疗法等创新治疗方向 | 未提及具体局限性 | 梳理PANoptosis在泌尿系统疾病中的分子机制和调控网络，探讨其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 泌尿系统疾病，包括急性/慢性肾损伤、前列腺癌、肾癌和睾丸病变 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium FFPE空间转录组学 |
| 248 | 2026-06-06 |
Single-cell transcriptomics reveals a novel mechanism of RDH16 regulating immune infiltration in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689987
PMID:41601632
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示RDH16在肝细胞癌中调控免疫浸润的新机制 | 整合单细胞RNA测序与批量转录组数据集，全面表征HCC的肿瘤细胞异质性和免疫微环境特征，并首次揭示了RDH16作为免疫调节生物标志物，通过调控CD163⁺ M2巨噬细胞浸润影响肿瘤免疫微环境 | NA | 探索肝细胞癌中免疫调节的可操作生物标志物及机制，以改善患者预后 | 肝细胞癌肿瘤细胞和免疫浸润细胞 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 249 | 2026-06-06 |
Integrated multi-omic profiling reveals macrophage-driven prognostic signatures in clear cell renal cell carcinoma through machine learning optimization
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1612262
PMID:41601657
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序与机器学习方法，揭示了肾透明细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其驱动的预后特征 | 首次通过机器学习优化整合多组学数据，鉴定出五种转录上不同的巨噬细胞亚群，并构建了基于巨噬细胞的预后签名，特别是识别出PRDX1+LA-Mac作为主要病理亚型 | 未提及具体限制，但基于摘要可推测可能包括样本量有限（仅10个肿瘤）及验证队列数量不足 | 描绘肾透明细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，识别预后巨噬细胞特征，并表征驱动疾病进展的免疫-代谢程序 | 肾透明细胞癌肿瘤组织中的巨噬细胞亚群及其相关免疫和代谢特征 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据 | 10个肾透明细胞癌肿瘤样本（scRNA-seq）及TCGA和CPTAC独立队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2026-06-06 |
TIMP1 as a context-dependent biomarker linking cancer progression and cardiovascular disorders: a multi-level and bioinformatics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1699962
PMID:41613136
|
研究论文 | 通过多层次生物信息学分析，揭示TIMP1作为连接癌症进展与心血管疾病的上下文依赖性生物标志物 | 首次系统揭示TIMP1在多种癌症和心血管疾病中的上下文依赖性功能，提出其作为跨疾病调节因子的潜在作用，并整合了表观遗传调控、免疫浸润和药物敏感性分析 | 主要依赖公开数据库进行大规模分析，细胞系实验仅用于靶向验证，缺乏体内实验和前瞻性临床验证 | 阐明TIMP1在癌症和心血管疾病中的系统性表达模式及其作为跨疾病生物标志物的潜力 | 结直肠癌和胃癌组织、荷瘤小鼠心脏、动脉粥样硬化和心力衰竭队列 | 计算生物学, 数字病理学 | 结直肠癌, 胃癌, 动脉粥样硬化, 心力衰竭 | 微阵列分析, 全癌基因组分析, 单细胞RNA测序, 免疫组化, 蛋白质印迹法, Transwell实验 | NA | 基因表达数据, 基因组变异数据, 单细胞转录组数据, 组织样本 | 公开数据集包括GSE63032、TCGA/GTEx、GSE100927、GSE5406；细胞系实验涉及结直肠癌和胃癌模型 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 251 | 2026-06-06 |
Interleukin-36 upregulates type-I interferon responses in systemic lupus erythematosus by promoting the accumulation of self-nucleic acids
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1727524
PMID:41607774
|
研究论文 | 研究揭示白介素-36通过促进自我核酸积累上调系统性红斑狼疮中的I型干扰素反应 | 首次阐明IL-36通过下调RNA酶基因和诱导单核细胞凋亡，促进自我核酸积累，从而激活I型IFN通路的新机制 | 样本量较小（scRNA-seq 5个供体，qPCR 9个供体，流式6个供体），可能限制统计效力 | 探索IL-36在系统性红斑狼疮中过度激活I型IFN反应的分子机制 | 健康人和SLE患者的外周血单核细胞 | 机器学习和单细胞转录组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、实时定量PCR、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据、流式数据 | scRNA-seq: 5个健康供体；qPCR: 9个供体；流式: 6个供体；SLE scRNA-seq数据集: 33例患者和11例对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 252 | 2026-06-05 |
ANXA2, DBN1, ZNF385D, and IL6ST: Endothelial cell biomarkers linking atherosclerosis progression to immune microenvironment dysregulation
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
DOI:10.1080/10641963.2026.2627352
PMID:41655191
|
研究论文 | 通过多组学整合和机器学习方法，鉴定与动脉粥样硬化进展和免疫微环境失调相关的内皮细胞生物标志物ANXA2、DBN1、ZNF385D和IL6ST | 首次利用单细胞转录组数据构建动脉粥样硬化图谱，结合高维WGCNA和机器学习筛选出四个内皮细胞特异性诊断基因，并通过分子对接预测其与沙利度胺和白藜芦醇的结合能力 | NA | 识别与动脉粥样硬化进展和免疫微环境失调相关的内皮细胞生物标志物 | 内皮细胞生物标志物ANXA2、DBN1、ZNF385D和IL6ST | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、高维WGCNA、LASSO回归、SVM-RFE、ssGSEA、CIBERSORT、分子对接 | NA | 基因表达数据 | 来自单细胞RNA测序数据集的动脉粥样硬化单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2026-06-05 |
Immune-related biomarkers for major depressive disorder identified via integrated bioinformatics and machine learning
2026-Dec, European journal of psychotraumatology
IF:4.2Q1
DOI:10.1080/20008066.2026.2619389
PMID:41665627
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法，识别出与重度抑郁症相关的免疫相关生物标志物 | 首次整合多个基因表达数据集并结合两种机器学习算法（LASSO和SVM-RFE）筛选MDD诊断标志物，并通过单细胞RNA测序和动物模型进行验证 | 未说明具体限制 | 识别重度抑郁症的免疫相关生物标志物以改善早期和客观诊断 | 重度抑郁症患者和慢性不可预测轻度应激大鼠模型 | 机器学习 | 重度抑郁症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, SVM-RFE | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集及CUMS大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2026-06-05 |
Single-cell transcriptome revealed the aberrant keratinocytes activation in antigen presentation in atopic dermatitis
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2627742
PMID:41666125
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示特应性皮炎中角质形成细胞在抗原呈递中的异常激活 | 首次发现角质形成细胞中抗原加工和呈递通路的持续激活是特应性皮炎慢性炎症的关键驱动因素，并质疑卵清蛋白诱导小鼠模型在模拟人类慢性特应性皮炎中的有效性 | 研究主要基于公共单细胞转录组数据的整合分析，缺乏直接实验验证；小鼠模型与人类疾病在角质形成细胞基因激活模式上存在差异 | 探究特应性皮炎中角质形成细胞的基因表达、细胞动态及其与免疫细胞的相互作用 | 健康对照、慢性活动性特应性皮炎患者、自愈性特应性皮炎患者和卵清蛋白诱导的特应性皮炎小鼠模型的皮肤组织 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个皮肤组织样本，包括健康对照、慢性活动性特应性皮炎患者、自愈性特应性皮炎患者和小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 255 | 2026-06-05 |
Bone targeted microenvironment actuated engineered exosomes for precision therapy of IBD associated bone loss
2026-Oct, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2026.04.034
PMID:42238026
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研究论文 | 开发了一种骨靶向微环境响应型工程化外泌体系统ExoBIP，用于精准治疗炎症性肠病相关的骨丢失 | 首次发现IL-18连接肠道炎症与骨丢失，并设计骨靶向微环境激活工程化外泌体，实现位点特异性IL-18中和，同时保留其在肠道的生理功能 | 需进一步验证在人类中的安全性及有效性，且慢性炎症性疾病的长期治疗效果尚未明确 | 阐明IBD相关骨丢失的机制并开发靶向治疗策略 | 炎症性肠病相关骨丢失小鼠模型及骨髓间充质干细胞来源的外泌体 | 数字病理学 | 炎症性肠病相关骨丢失 | 单细胞RNA测序 | 工程化外泌体系统 | 单细胞转录组数据 | 慢性IBD相关骨丢失小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 256 | 2026-06-05 |
Genome-resolved metagenomics of the tumour microbiome: From strain diversity to functional cancer ecology
2026-Sep, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2026.156543
PMID:42166940
|
综述 | 本文从基因组解析宏基因组学角度综述肿瘤微生物组的菌株多样性及功能生态在癌症中的作用 | 提出一个整合基因组解析、空间和功能视角的“肿瘤宏基因组框架”，将肿瘤微生物生态与癌症演化、免疫调节及转化干预联系起来 | 未提及具体局限性 | 综述肿瘤微生物组在菌株水平多样性、功能性生态及其在癌症进展和治疗中的影响 | 肿瘤相关微生物及其基因组、功能基因和代谢模块 | 机器学习和多组学分析 | 多癌种 | 宏基因组学、空间转录组学、单细胞测序、宏转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据、空间数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞测序 | NA | NA |
| 257 | 2026-06-05 |
Spatial multi-omics defines cancer-associated fibroblasts subtype gradients driving metabolic support and immune remodeling in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Aug-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218585
PMID:42144098
|
研究论文 | 整合空间转录组学和空间代谢组学数据，通过SpatialGlue多模态聚类和最优传输模型，定义胰腺导管腺癌中三种癌症相关成纤维细胞亚型，揭示其代谢支持和免疫重塑功能 | 首次将空间多组学整合与最优传输建模结合，系统刻画CAF亚型的代谢异质性及其与肿瘤细胞的代谢通讯机制，并揭示亚型特异性临床预后关联 | 未明确提及研究局限性，但潜在局限包括空间分辨率限制、独立验证队列规模较小 | 阐明胰腺导管腺癌中癌症相关成纤维细胞的代谢与空间异质性，及其在肿瘤微环境中的功能角色 | 胰腺导管腺癌组织样本中的癌症相关成纤维细胞亚型及其与肿瘤细胞的代谢互作 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学， 空间代谢组学， 多重免疫荧光， TCGA-PAAD反卷积 | SpatialGlue多模态聚类模型， 最优传输模型 | 空间基因表达数据， 空间代谢物数据， 多重免疫荧光图像， TCGA转录组数据 | 独立空间代谢组学队列和多重重免疫荧光染色队列的样本 | NA | 空间转录组学， 空间代谢组学 | NA | NA |
| 258 | 2026-06-05 |
Inferring gene regulatory networks via adversarially regularized directed graph autoencoder
2026-Aug, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2026.108762
PMID:41775092
|
研究论文 | 通过对抗正则化有向图自编码器推断基因调控网络 | 提出一种新的对抗正则化有向图自编码器（ARDGA），利用一阶和二阶邻近度捕捉基因调控网络的复杂拓扑，并通过对抗训练策略将目标向量正则化为原始数据的先验分布，从而保持基因表达数据的生物统计特性 | 未在论文中明确提及局限性，但可能依赖于数据质量且计算复杂度较高 | 开发一种新的基因调控网络推断方法，以应对复杂拓扑和非一致分布特性带来的挑战 | 基因调控网络及其推断方法 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图自编码器（GAN） | 基因表达数据 | DREAM5数据集和七个单细胞RNA测序数据集，包含四种类型的金标准网络 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 259 | 2026-06-05 |
Signal regulatory protein γ is associated with an exhaustion-prone immune microenvironment in metastatic melanoma
2026-Jul-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2026.115069
PMID:42167713
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研究论文 | 通过数据库挖掘、单细胞转录组学和免疫组化验证，研究了信号调节蛋白γ（SIRPG）在皮肤黑色素瘤中的表达及其与免疫微环境的关系 | 首次揭示SIRPG在转移性黑色素瘤中与耗竭倾向的免疫微环境密切相关，并发现其在CD8耗竭T细胞中高表达且与PD-1共表达 | 未在更大样本或独立队列中验证结果，且机制研究较为初步 | 探讨SIRPG在转移性黑色素瘤免疫微环境重塑中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 皮肤黑色素瘤患者组织样本及公共数据库数据 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、免疫组化 | NA | 文本、图像 | 基于公共数据库和少量组织样本，具体数量未详述 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2026-06-05 |
Sensory Nerves Regulate Odontoblast Differentiation via the SPP1/ITGA4 Axis During Tooth Root Development
2026-Jul, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70129
PMID:41796694
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研究论文 | 本研究以牙根发育为模型，探讨感觉神经如何通过SPP1/ITGA4轴调节成牙本质细胞分化 | 首次揭示感觉神经通过SPP1/ITGA4轴调控祖细胞命运，从而协调牙根发育的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类；未涉及其他神经类型或信号通路的潜在作用 | 探究感觉神经在牙根发育过程中调节成牙本质细胞分化的作用及分子机制 | 小鼠牙乳头细胞、三叉神经节、牙根发育组织 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, Co-IP, PLA, siRNA敲低 | NA | 单细胞转录组数据 | 出生后第3.5天和第30天的小鼠三叉神经节和磨牙样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |