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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-05-17 |
Guidelines for evaluating endothelial function in vascular tissue
2026-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00656.2025
PMID:41801061
|
指南 | 提供评估血管组织内皮功能的指南,整合传统功能测定与现代分子方法 | 该指南由领域专家共识制定,首次将传统的功能性测定(如线肌电图、压力肌电图)与现代分子方法(如批量及单细胞转录组学、蛋白质组学和先进成像技术)相结合,建立评估内皮功能的最佳实践,旨在提高方法的严谨性和可重复性 | 未提及具体限制 | 制定评估血管组织内皮功能的标准化指南,以增强内皮生物学研究的严谨性、可重复性和理解 | 血管组织中的内皮细胞及内皮功能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2026-05-17 |
Single-cell analysis of signalling and transcriptional responses to type I interferons
2026-May, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00750-3
PMID:41896367
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研究论文 | 通过质谱流式技术和RNA测序分析I型干扰素在免疫细胞中的信号传导与转录反应 | 首次在多种原代免疫细胞中比较不同I型干扰素亚型的信号和转录反应,并发现细胞类型特异性的STAT磷酸化变化和基因表达模式 | 未发现不同I型干扰素亚型诱导的定性差异,且研究仅限于体外刺激系统 | 探究不同I型干扰素是否诱导不同的细胞反应 | 人外周血单个核细胞(PBMCs) | 细胞生物学, 免疫学 | 抗病毒免疫, 自身炎症, 肿瘤免疫 | 质谱流式细胞术, RNA测序(bulk和单细胞RNA-seq) | NA | 蛋白质磷酸化数据, 基因表达数据 | 人外周血单个核细胞 | NA | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 243 | 2026-05-17 |
Chikungunya virus persists in joint-associated macrophages and promotes chronic disease in mice
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02303-9
PMID:41922840
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序、空间转录组学和流式细胞术,探究甲病毒感染小鼠关节相关组织中巨噬细胞持续携带基孔肯雅病毒RNA并促进慢性疾病的机制 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示慢性期关节相关组织中巨噬细胞持续携带病毒RNA并参与炎症维持,且CD4 T细胞通过MHC II表达调控巨噬细胞炎症反应 | 研究仅基于小鼠模型,未验证人类样本;未明确巨噬细胞中病毒持续复制的具体分子机制 | 阐明甲病毒(如基孔肯雅病毒)在慢性期通过巨噬细胞持续复制引发关节炎症的机制 | 甲病毒感染小鼠的关节相关组织 | 机器学习 | 甲病毒相关慢性关节疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、空间表达数据 | 甲病毒感染小鼠(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 244 | 2026-05-17 |
Therapy-driven clonal dynamics in chronic lymphocytic leukemia
2026-May, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2026.04.001
PMID:42002058
|
综述 | 综述了慢性淋巴细胞白血病中治疗驱动的克隆动态变化及耐药机制 | 聚焦于靶向治疗时代下CLL克隆演变的新机制,如BTK和PLCG2突变,并整合单细胞测序和多组学等新兴技术视角 | 未提供原始实验数据,主要基于已发表文献的总结,缺乏前瞻性临床验证 | 总结CLL中克隆进化与耐药机制的最新认知,并展望未来研究方向 | 慢性淋巴细胞白血病患者的克隆进化与治疗耐药 | 机器学习 | 慢性淋巴细胞白血病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞测序, 整合多组学 | NA | NA |
| 245 | 2026-05-05 |
Blockade of Tumor TAK1 Induces DNA Damage and Immunogenic cGAS-STING Pathway Activation in Pancreatic Cancer
2026-May-01, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.04.017
PMID:42070691
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤TAK1在胰腺癌中维持基因组完整性的关键作用,阻断TAK1可诱导DNA损伤和cGAS-STING通路激活,从而增强免疫检查点阻断疗效 | 首次发现TAK1通过磷酸化EphA2和RAD51维持DNA损伤修复,阻断TAK1能将免疫‘冷’肿瘤微环境转变为‘热’肿瘤微环境 | NA | 探索胰腺导管腺癌中TAK1作为治疗靶点以逆转免疫抑制性肿瘤微环境 | 人类胰腺癌样本、基因工程小鼠模型、肿瘤与T细胞共培养体系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫组化、流式细胞术、蛋白质组学 | NA | 图像、文本 | 人类胰腺癌样本(未提供具体数量)及基因工程小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 246 | 2026-05-17 |
Spatial transcriptomics maps host-gut microbiome biogeography at high resolution
2026-May, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-026-02286-7
PMID:41792309
|
研究论文 | 该研究开发了一种高分辨率空间转录组学方法,用于绘制宿主-肠道微生物组生物地理学图谱 | 通过酶促原位多聚腺苷酸化结合空间RNA测序,提高了细菌RNA回收率,实现了对低丰度和空间受限微生物类群的转录组分析,首次在亚微米分辨率下研究肠道微生物组的空间组织 | 文章中未明确提及局限性 | 开发一种在肠道中以高分辨率广泛空间采样微生物组-宿主相互作用的方法 | 小鼠肠道微生物组及宿主组织 | 数字病理学 | 肠道肿瘤 | 空间RNA测序、酶促原位多聚腺苷酸化 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠肠道肿瘤模型样品 | Illumina | 空间转录组学 | 空间RNA测序平台 | 采用商业空间RNA测序平台进行高分辨率(1 µm)分析 |
| 247 | 2026-05-17 |
RELB Overexpression Induced by DNA Hypomethylation Contributes to Perioperative Immunotherapy Resistance in Resectable Esophageal Squamous Cell Carcinoma by Modulating the mregDC-Treg Axis
2026-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71863
PMID:42130013
|
研究论文 | DNA低甲基化诱导的RELB过表达通过调节mregDC-Treg轴导致可切除食管鳞癌围手术期免疫治疗耐药 | 首次发现RELB通过mregDC-Treg轴介导食管鳞癌围手术期免疫治疗耐药,并揭示DNA低甲基化是其过表达的调控机制 | NA | 识别可切除食管鳞癌围手术期免疫治疗疗效的预测生物标志物,并阐明非应答者治疗耐药的机制 | 可切除食管鳞癌患者组织样本及Eca109和KYSE450细胞系 | 数字病理学 | 食管癌 | 亚硫酸盐测序、甲基化特异性PCR、单细胞RNA测序、批量RNA测序、三重免疫荧光染色 | NA | 组织样本、单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 59例接受围手术期免疫治疗的食管鳞癌患者组织样本,以及组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 248 | 2026-05-17 |
osr1 as a Novel Marker for ICC-Like Cells Development in Zebrafish
2026-May, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.70162
PMID:42132003
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现osr1作为ICC样细胞的新型标志基因,并在斑马鱼中验证其对肠道发育的关键作用 | 首次发现osr1是ICC样细胞的新型标志基因,并揭示其通过调控yap1影响肠道发育的机制 | 未提及具体局限性 | 探究osr1在肠道发育和疾病中的功能 | 人类和斑马鱼的肠道组织及ICC样细胞 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞转录组测序、转基因技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类IBD患者活检组织和斑马鱼样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2026-05-17 |
scHilda: Hierarchical Integration of LLM with KG database for single cell type annotation
2026-May, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014291
PMID:42113882
|
研究论文 | 提出scHilda框架,将大型语言模型与知识图谱分层集成,用于单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | 提出层次化仲裁注释策略,先识别主要细胞谱系再动态检索子图领域信息以精确解析细胞亚型,有效约束LLM决策空间、降低幻觉风险并减轻知识库缺陷导致的误导 | 未提及具体限制,但依赖外部知识库质量且仅验证于基准数据集 | 开发一种集成外部知识图谱与大型语言模型的鲁棒框架,提升单细胞注释的准确性、可解释性和泛化能力 | 单细胞RNA测序中的细胞类型注释任务 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 大型语言模型(LLM) | 基因表达数据 | 多个基准数据集,具体样本量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 250 | 2026-05-17 |
Single-Cell Sequencing Analysis Reveals Dysregulated Energy Metabolism and Altered Synaptic Connectivity in the Mouse Retina Following Dark Rearing
2026-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.5.35
PMID:42138518
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示暗饲养小鼠视网膜中能量代谢失调及突触连接改变 | 首次在单细胞分辨率下揭示暗饲养小鼠视网膜中能量代谢失调及突触重塑,并发现Müller胶质细胞来源的DIO2作为关键的补偿机制 | 未提及 | 解析视觉剥夺下视网膜各细胞类型的转录变化及其对视觉功能和结构的影响 | 暗饲养和正常饲养的C57BL/6J小鼠视网膜 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠视网膜样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 251 | 2026-05-17 |
Stromal NNMT overexpression as an independent prognostic biomarker in lung adenocarcinoma and breast carcinoma
2026-Apr-09, Carcinogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/carcin/bgag020
PMID:41913584
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研究论文 | 研究了烟酰胺N-甲基转移酶在泛癌基质中的表达谱及其预后意义,并在肺腺癌和乳腺癌中进行了验证 | 首次揭示基质NNMT过表达作为肺腺癌和乳腺癌的独立预后生物标志物,并利用单细胞RNA测序和多个数据库进行多层面验证 | 数据主要来自公共数据库,独立临床队列样本量可能有限,未深入探讨NNMT的分子机制 | 探究基质NNMT在多种癌症中的表达模式及其对肺腺癌和乳腺癌患者的预后价值 | 肺腺癌和乳腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌, 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 定量免疫组织化学 | Cox回归模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 组织样本图像 | 多个公共数据库和独立临床队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 252 | 2026-05-17 |
Generation of biologically responsive colon-like intestinal tissue patches from human induced pluripotent stem cells using a rapid co-differentiation platform
2026-Apr-09, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05006-4
PMID:41957847
|
研究论文 | 利用人诱导多能干细胞快速共分化平台,生成具有生物学响应性的结肠样肠道组织补片 | 开发了一种新型早期人诱导多能干细胞共分化平台,能在8天内生成多种肠道细胞谱系(上皮、间质和内皮),该方法无血清、动物产品使用大幅减少,且能形成结肠样肠道组织补片 | 仍处于早期阶段 | 开发一种可移植的肠道黏膜组织移植物,用于促进肠道损伤愈合 | 人诱导多能干细胞 | 数字病理学 | 肠道疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 多个hiPSC细胞系,并在独立中心重复 | NA | 单细胞RNA-seq, 大量RNA-seq | NA | NA |
| 253 | 2026-05-17 |
A zero-inflated hierarchical generalized transformation model to address non-normality in spatially-informed cell-type deconvolution
2026-Apr-09, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujag055
PMID:41994891
|
研究论文 | 提出一种零膨胀分层广义变换模型,用于解决空间转录组学中细胞类型解卷积的非正态性问题,并在口腔鳞状细胞癌数据上验证其优越性能 | 首次将零膨胀分层广义变换模型应用于条件自回归解卷积框架,解决口腔鳞状细胞癌空间转录组数据的高度零膨胀问题,提高细胞类型解卷积的准确性并量化不确定性 | 未提及具体局限性 | 改进空间转录组学中细胞类型解卷积方法,处理数据非正态性和高度零膨胀问题 | 口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的细胞类型解卷积 | 机器学习 | 口腔癌 | 空间转录组学 | 零膨胀分层广义变换模型、条件自回归模型 | 空间转录组数据 | 口腔鳞状细胞癌样本(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 254 | 2026-05-17 |
Benchmarking tools for deciphering cellular crosstalk in spatially-resolved transcriptomics
2026-Apr-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04063-5
PMID:41952215
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研究论文 | 该论文对九种计算细胞间相互作用推断方法在空间转录组学数据上进行了系统评估 | 首次针对空间转录组学应用场景对细胞间相互作用推断工具进行全面基准测试,涵盖多个平台和真实数据集 | 工具性能在不同空间分辨率、组织背景和平台间存在显著差异;应用于真实空间转录组学数据时面临关键挑战 | 评估空间转录组学中用于解析细胞间通讯的计算工具的性能和适用性 | 九种计算细胞间相互作用推断方法 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组数据 | 九组来自三项独立研究的真实空间转录组学数据集 | 10x Genomics, BGI | 空间转录组学 | 10x Visium, MGI Stereo-seq, 10x Xenium | Visium平台、Stereo-seq平台、Xenium平台 |
| 255 | 2026-04-04 |
Global scientific growth and thematic development of spatial transcriptomics in oncology research
2026-Apr-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04937-x
PMID:41931230
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2026-05-17 |
A Tissue Virus Microenvironment with Activated Stress Responses Underlies Durable SIV Persistence
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716177
PMID:41959291
|
研究论文 | 通过对比早期与晚期抗逆转录病毒治疗后的SIV感染恒河猴,结合免疫PET/CT引导采样和空间转录组学,定义了组织病毒微环境(VME)在病毒持久性和反弹中的作用 | 首次利用免疫PET/CT引导的空间转录组学揭示病毒微环境(VME)的结构和功能特征,并发现其与肿瘤微环境的相似性,为HIV治愈策略提供新视角 | 未提及具体局限性 | 探究SIV在抗逆转录病毒治疗下的病毒持久性机制及其对病毒反弹的影响 | 早期与晚期启动抗逆转录病毒治疗的SIV感染恒河猴组织样本 | 数字病理学 | 艾滋病 | 空间转录组学、免疫PET/CT | NA | 影像数据, 空间转录组数据 | SIV感染的恒河猴(早期治疗组与晚期治疗组) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 257 | 2026-05-17 |
PMEPA1 modulates YAP1 nuclear translocation to disrupt EMT subtypes and promote metastasis in Biliary tract cancer
2026-Apr-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08684-3
PMID:41932868
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研究论文 | 通过整合分析胆道癌单细胞RNA测序数据,揭示PMEPA1通过调控YAP1核转位影响EMT亚型并促进转移的分子机制 | 首次鉴定PMEPA1作为胆道癌EMT关键调控因子,阐明其通过抑制LATS1/2激酶活性绕过Hippo抑癌通路、释放YAP1入核启动促EMT基因程序的机制,并发现拓扑异构酶抑制剂SN-38可靶向该通路抑制转移 | 未明确描述研究局限性 | 探究胆道癌中EMT的关键调控因子及其分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 47例胆道癌样本的单细胞RNA测序数据及多组学分析 | 数字病理学 | 胆道癌 | 单细胞RNA测序、多组学分析 | NA | 基因表达数据 | 47例胆道癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2026-05-17 |
Depletion of Fibrinogen Suppresses Growth of Primary Tumors and Metastasis of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2026-Apr, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.09.024
PMID:41432649
|
研究论文 | 消耗纤维蛋白原抑制胰腺导管腺癌原发性肿瘤生长和转移 | 首次使用临床上正在测试的反义寡核苷酸或含小干扰RNA的脂质纳米颗粒来消耗纤维蛋白原,并揭示了纤维蛋白原在胰腺癌早期(而非晚期)转移步骤中的差异作用以及通过空间转录组学鉴定了基质成分的变化 | 纤维蛋白原敲低在脾内注射模型中不影响肝定植,提示该研究主要针对早期转移而非晚期转移步骤,且机制研究依赖于体内模型和蛋白组学、空间转录组学方法 | 探究消耗纤维蛋白原对胰腺导管腺癌肿瘤生长和转移的影响及其潜在机制 | 胰腺导管腺癌患者异种移植模型小鼠 | 机器学习 | 胰腺癌 | 反义寡核苷酸、脂质纳米颗粒、蛋白组学、空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | 3个患者来源的异种移植模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 259 | 2026-05-17 |
RNF128 aggravates metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease progression via stabilization of SCD1
2026-Mar-30, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001757
PMID:41911552
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研究论文 | 本研究揭示了RNF128通过稳定SCD1加重代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 | 首次发现E3泛素连接酶RNF128通过催化SCD1的K63连接泛素化并阻断其自噬溶酶体降解,促进脂质积累,并验证了靶向RNF128的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类MASLD的异质性和复杂性可能限制其直接临床转化 | 阐明RNF128在MASLD进展中的功能及其分子机制,并评估其治疗靶点潜力 | 人类MASLD肝脏组织、饮食诱导的MASLD小鼠模型、肝细胞特异性RNF128敲除和过表达模型 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 泛素组学分析 | NA | RNA序列数据, 蛋白质组学数据, 泛素组学数据 | 未明确说明具体样本量,涉及人类肝脏样本和小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2026-05-17 |
NT-I7, a long-acting interleukin-7, increases lymphocyte counts and induces CD8+ T cell clonotype expansion in patients with newly diagnosed high-grade gliomas
2026-Mar-25, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2953
PMID:41880597
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研究论文 | 评估长效白细胞介素-7(NT-I7)对新诊断高级别胶质瘤患者淋巴细胞计数和CD8+ T细胞克隆型扩增的影响 | 首次在人体临床试验中证明NT-I7能安全有效地逆转高级别胶质瘤患者因标准治疗引起的淋巴细胞减少,并选择性诱导CD8+ T细胞克隆型扩增 | 该研究为I期试验,样本量有限且为单臂设计,无法充分评估疗效;仅对外周血免疫细胞进行分析,未涉及肿瘤内免疫微环境 | 探究NT-I7在高级别胶质瘤患者中的安全性、最大耐受剂量及其对免疫细胞的影响 | 新诊断高级别胶质瘤患者 | 机器学习和数字病理学 | 高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | I期临床试验中纳入的新诊断高级别胶质瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |