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当前共找到 41493 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-07-13 |
Identification of a Potential Biomarker PDGFRA for Endometriosis Based on Comprehensive Analysis of Multiple Omics Data
2026-02, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-025-02049-5
PMID:41721175
|
研究论文 | 基于多组学数据综合分析，识别PDGFRA作为子宫内膜异位症的潜在生物标志物 | 整合了bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组数据，结合WGCNA和机器学习方法识别PDGFRA作为核心基因 | 未提及明显局限性 | 寻找子宫内膜异位症的潜在生物标志物和治疗靶点 | 子宫内膜异位症组织样本及基质细胞 | 机器学习 | 子宫内膜异位症 | RNA-seq、单细胞RNA测序、空间转录组学 | WGCNA、机器学习 | 基因表达数据 | 利用GEO数据库中的公共数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 242 | 2026-07-13 |
SCSEQ: A web tool for analyzing single-cell RNA-seq data
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag029
PMID:42084898
|
研究论文 | 开发了一个基于网络交互式生物信息学分析平台SCSEQ，用于分析单细胞RNA-seq数据 | 提供了一个无需编程技能即可使用的综合性单细胞数据分析平台，涵盖从预处理到下游分析的完整流程，并支持多种输入格式和动态交互 | 未明确说明限制，但可能依赖于平台在线服务的稳定性和计算资源 | 解决单细胞RNA测序数据处理的挑战，为研究人员提供便捷的分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 243 | 2026-07-13 |
4D single-cell spatial transcriptomics reveals dynamic morphogenetic gradients and regenerative domains in planarians
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag064
PMID:42172041
|
研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学构建包含超过350万细胞、涵盖8个再生时间点的四维图谱，揭示涡虫再生的形态发生梯度和再生区域 | 首次生成覆盖涡虫全身再生的四维单细胞空间转录组图谱，识别出由Mediator 8调控的前再生区这一全新的损伤诱导空间域 | 未提及具体局限性 | 研究涡虫全身再生过程中基因表达与细胞反应的时空动态规律 | 涡虫（planarians） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 超过350万个细胞，来自8个不同再生时间点的完整涡虫样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 244 | 2026-07-13 |
Integrative single-cell transcriptomics and proteomics reveal an immunometabolic framework for MSC-exosome-mediated remodeling of expanded NK cells
2026-01-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag049
PMID:42008150
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和蛋白质组学整合分析，揭示间充质干细胞外泌体对扩增NK细胞功能重塑的免疫代谢调控机制 | 首次将单细胞转录组学与蛋白质组学结合，系统解析MSC-Exos对NK细胞代谢与免疫功能的多维度调控，并提出基于FcγR/CD16信号的外泌体作用假说 | 因果关系验证尚不充分，需进一步机制研究确认 | 评估MSC-Exos对人NK细胞体外扩增过程中功能状态的影响及其分子机制 | 人自然杀伤细胞（NK细胞）及间充质干细胞来源的外泌体 | 单细胞组学 | 肿瘤免疫、衰老免疫监视 | 单细胞转录组测序、蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 体外扩增的人NK细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 245 | 2026-07-13 |
Inhibiting Nampt signaling promotes M2 macrophage polarization to enhance bone regeneration in periodontitis
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1768560
PMID:41969528
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研究论文 | 研究通过抑制Nampt信号促进M2型巨噬细胞极化，增强牙周炎骨再生 | 首次揭示NAMPT信号在牙周炎巨噬细胞极化中的作用，并证实局部注射FK866通过诱导M2极化促进骨再生 | NA | 阐明NAMPT信号在巨噬细胞极化中的功能及其对牙周骨再生的影响 | 牙周炎组织中的巨噬细胞、小鼠RAW264.7巨噬细胞、MC3T3-E1成骨细胞、结扎诱导的大鼠牙周炎模型 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、共培养、显微CT、组织学染色 | NA | 基因表达数据、图像 | 牙周炎组织样本、小鼠细胞系、大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2026-07-13 |
Malignant triton tumor with thoracic region as the initial presentation: a case report
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1764543
PMID:41971419
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病例报告 | 报道一例以胸痛为首发表现的罕见恶性Triton肿瘤，并综述其临床特征和治疗策略 | 首次将单细胞RNA测序应用于恶性Triton肿瘤，结合CopyKAT算法区分恶性与非恶性细胞，揭示肿瘤微环境的异质性 | 病例报告的代表性有限，单细胞测序的应用仍处于初步探索阶段，结论需要更大规模研究验证 | 总结恶性Triton肿瘤的临床表现和治疗策略，并探索单细胞RNA测序在揭示肿瘤分子特征中的作用 | 一名23岁女性恶性Triton肿瘤患者，伴有神经纤维瘤病1型病史 | 机器学 | 神经纤维瘤病1型相关恶性Triton肿瘤 | 单细胞RNA测序 | CopyKAT算法 | 单细胞转录组数据 | 1例患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 247 | 2026-07-13 |
Ovarian tissue quality assessment and fertility preservation strategies enabled by multi-omics and artificial intelligence: current applications and clinical perspectives
2026, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2026.1789252
PMID:41971663
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综述 | 本文综述多组学和人工智能在卵巢组织质量评估和生育力保存策略中的应用及其临床前景 | 首次系统整合多组学（如转录组学、单细胞测序、蛋白质组学和空间转录组学）与人工智能技术，提出基于分子图谱和智能预测的个性化卵巢组织评估与移植决策框架 | 当前多组学和AI技术仍处于研究阶段，缺乏大规模临床验证，且整合多模态数据的标准化流程尚未建立 | 探讨多组学和人工智能在卵巢组织质量评估和生育力保存中的应用潜力 | 卵巢组织冷冻保存相关的组织质量评估、生育力保存策略及临床决策 | 数字病理学, 机器学习 | 卵巢早衰, 癌症 | 转录组学、单细胞测序、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 图像、文本、多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2026-07-13 |
Immune Cell-Mediated Retinoblastoma Development: Genetic and Molecular Mechanisms
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6303747
PMID:41971766
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序探究免疫细胞介导的视网膜母细胞瘤发生机制 | 首次利用双样本孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序数据，系统揭示了28种免疫细胞与RB1基因的关联，并发现EZH2、UBLCP1和HKDC1基因在免疫细胞参与RB过程中的潜在分子机制 | 基于GWAS汇总统计数据的分析可能受限于数据来源和样本大小，单细胞RNA测序数据的细胞类型覆盖及因果关系推断需进一步验证 | 阐明免疫细胞通过RB1基因影响视网膜母细胞瘤发生的遗传和分子机制 | 视网膜母细胞瘤组织中的免疫细胞及RB1基因相关变异 | 机器学习 | 视网膜母细胞瘤 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 基于已发表的GWAS汇总统计数据，具体样本量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 249 | 2026-07-13 |
Integrative multi-omics dissection identifies ACO2, KLF5, and IMP4 as central regulators of the mitochondrial-immune axis in ulcerative colitis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1746810
PMID:41972123
|
研究论文 | 通过整合多组学分析，识别ACO2、KLF5和IMP4为溃疡性结肠炎中线粒体-免疫轴的核心调控因子 | 首次系统鉴定ACO2、KLF5和IMP4作为连接线粒体代谢与免疫调控的关键基因，并从遗传、转录组和单细胞水平进行多重验证 | 未对AGPS在不同UC数据集中的转录差异进行功能验证，且部分发现仅基于公共数据库和动物模型，需进一步在临床样本中验证 | 探索溃疡性结肠炎中代谢-免疫调控的关键基因及其作用机制 | 溃疡性结肠炎患者及DSS诱导的小鼠结肠炎模型 | 机器学习和生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | GWAS、eQTL、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因型数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | UC病例对照共计394,626人（GWAS），215例病例和134例对照（转录组），18例病例和12例对照（单细胞RNA测序） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2026-07-13 |
The construction of CD8+ T cell-associated molecular subtypes in esophageal squamous cell carcinoma reveals tumor heterogeneity, tumor microenvironment, and immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1775837
PMID:41972154
|
研究论文 | 基于CD8+ T细胞分化基因表达谱构建食管鳞状细胞癌分子亚型，揭示肿瘤异质性、肿瘤微环境及免疫治疗反应 | 首次通过单细胞测序分析CD8+ T细胞分化动态，结合非负矩阵分解构建三种新型分子亚型，并利用孟德尔随机化分析发现RHOB基因作为食管鳞癌新生物标志物 | 未提及具体局限性 | 构建CD8+ T细胞相关分子亚型以预测食管鳞癌患者预后和治疗效果 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤样本及CD8+ T细胞 | 机器学习和生物信息学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | GSE53625队列及多个批量RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | Seurat包进行细胞聚类可视化，Harmony包去除批次效应，Monocle2包进行伪时间分析 |
| 251 | 2026-07-13 |
Correction: Mast cell marker gene signature: prognosis and immunotherapy response prediction in lung adenocarcinoma through integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1827500
PMID:41972190
|
更正 | 对一篇关于肥大细胞标记基因特征在肺腺癌预后和免疫治疗反应预测中作用的研究进行更正 | NA | NA | 更正已发表文章的错误 | NA | NA | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 252 | 2026-07-13 |
IL21 is predominantly produced by a CXCL13 associated CD4+ T cell subset and shapes the immune microenvironment in colorectal cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1865519
PMID:42433376
|
研究论文 | 本研究揭示IL21在结直肠癌中主要由CXCL13相关CD4+ T细胞亚群产生，并塑造免疫微环境 | 首次明确结直肠癌中IL21的主要细胞来源为CXCL13+CD4+ T细胞，并鉴定候选关键转录因子（STAT1、IRF9等），揭示外源IL21诱导的转录重塑特征 | 直接机制验证仍有待开展 | 阐明IL21在结直肠癌中的细胞来源、调控程序及功能意义 | 结直肠癌肿瘤浸润T细胞、结直肠癌组织微阵列、AOM/DSS诱导的小鼠结直肠癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色, SCENIC分析, 批量RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 全转录组测序数据, 免疫荧光图像 | 公开单细胞RNA测序数据集（具体数量未说明）、抗PD-1新辅助治疗单细胞队列（具体数量未说明）、结直肠癌组织微阵列（具体数量未说明）、AOM/DSS诱导小鼠模型（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2026-07-13 |
From islet to blood: macrophage remodeling signatures for diagnosis and risk stratification in type 1 diabetes
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1832672
PMID:42433374
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 254 | 2026-07-13 |
Completing spatial transcriptomics data for gene expression prediction benchmarking
2025-12, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2025.103754
PMID:40885036
|
研究论文 | 提出SpaRED数据库和SpaCKLE模型，用于评估和改善基于组织学图像的基因表达预测 | 首次建立系统化的空间转录组公共数据集SpaRED，并开发基于Transformer的基因表达补全模型SpaCKLE，大幅降低预测均方误差 | 未提及具体局限性 | 解决空间转录组数据成本高、基因捕获效率低及模型评估不一致的问题 | 空间转录组公共数据集和基因表达预测模型 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | Transformer | 图像 | 26个公共数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 255 | 2026-07-13 |
Single-cell analysis of human airway epithelium identifies cell-type-specific responses to Aspergillus and Coccidioides
2025-11-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02121-25
PMID:41081505
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析人原代气道上皮细胞对两种真菌病原体的细胞特异性反应 | 首次报道了曲霉和球孢子菌感染人原代气道上皮细胞的单细胞转录组分析，揭示了不同真菌诱导的细胞类型特异性应激和信号通路差异 | 未提供具体局限性信息 | 研究气道上皮细胞对曲霉和球孢子菌感染的早期致病机制及细胞特异性反应 | 人原代气道上皮细胞感染曲霉或球孢子菌后的单细胞转录组 | 单细胞转录组学 | 呼吸道真菌感染 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 单细胞转录组数据 | 使用人原代气道上皮细胞（具体数量未提及） | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 256 | 2026-07-13 |
Early developmental neuronal activity inhibits oligodendrocyte differentiation through AMPA receptor activation
2025-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.683139
PMID:41279286
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研究论文 | 本研究探讨早期神经元活动通过AMPA受体激活抑制少突胶质细胞分化 | 首次发现发育早期神经元活动抑制而非促进少突胶质细胞分化，并揭示AMPAR信号是关键调节因子 | 研究仅限于小鼠模型，且主要关注感觉诱发和化学遗传调控的神经元活动 | 探究发育早期神经元活动如何影响少突胶质细胞成熟 | 小鼠嗅球、体感皮层和胼胝体中的少突胶质细胞及神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠组织样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 257 | 2026-07-13 |
Rethinking large-scale phylogenomics with EukPhylo v.1.0, a flexible toolkit to enable phylogeny-informed data curation and analyses of diverse eukaryotic lineages
2025-10-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01770-25
PMID:40862604
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研究论文 | 介绍EukPhylo v.1.0，一个模块化、用户友好的管道，用于通过系统发育信息进行数据筛选和分析多种真核生物谱系 | EukPhylo v.1.0 提供基于系统发育信息的污染去除、同源基因家族估计和多序列比对及基因树生成的模块化管道，并包含约15000个古代基因家族的Hook数据库，易于替换，提升了系统发育基因组分析的可重复性和灵活性 | 主要依赖单细胞测序数据，对于不可培养微生物谱系，污染问题仍然存在；最终树挑战了某些文献假说（如CRuMs、Obazoa、Diaphoretickes），需要更多数据验证 | 改进微生物真核生物的系统发育基因组分析，特别是不可培养谱系的数据筛选和污染去除 | 1000种多样真核生物、细菌和古菌中的500个保守基因家族 | 机器学习 | NA | 系统发育基因组分析、单细胞测序 | NA | 序列数据 | 1000种物种（包括真核生物、细菌和古菌）的500个保守基因家族 | NA | NA | NA | NA |
| 258 | 2026-07-13 |
ST6GALNAC1-mediated sialylation in uterine endometrial epithelium facilitates the epithelium-embryo attachment
2025-06, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.021
PMID:39111624
|
研究论文 | 探究ST6GALNAC1介导的唾液酸化在子宫子宫内膜上皮中促进胚胎附着的作用 | 首次揭示ST6GALNAC1/sTn-Siglecs轴在胚胎着床中的功能，并鉴定了CD44作为sTn的载体分子 | 未明确说明，但可推测为研究主要基于体外模型和小鼠实验，人类样本分析有限 | 研究ST6GALNAC1和sTn-Siglecs轴在胚胎着床中的作用 | 人类和鼠类子宫内膜细胞及胚胎细胞 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 免疫组化、免疫沉淀、质谱分析、单细胞RNA测序、蛋白质相互作用分析、RNA干扰 | NA | 图像、文本 | 人类子宫内膜组织样本（具体数目未提供）和鼠类模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 已发表的单细胞RNA测序数据集用于分析人类胚胎中的Siglec-6 |
| 259 | 2026-07-13 |
Single-cell transcriptomic profiling of heart reveals ANGPTL4 linking fibroblasts and angiogenesis in heart failure with preserved ejection fraction
2025-02, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.02.006
PMID:38346487
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示保留射血分数心力衰竭中心脏成纤维细胞与血管生成之间的联系及ANGPTL4的作用 | 首次在单细胞分辨率下系统解析了HFpEF心脏中细胞异质性和血管生成障碍的机制，发现成纤维细胞过度分泌ANGPTL4通过调控血管生成与内皮细胞谱系交叉作用 | 基于小鼠模型，需在人体组织中验证；ANGPTL4作为药物靶点的预测基于计算方法，需进一步功能验证 | 揭示保留射血分数心力衰竭的细胞异质性和潜在病理机制 | HFpEF小鼠模型的心脏组织，重点研究成纤维细胞和内皮细胞谱系 | N/A | 心血管疾病 | 单细胞测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 图像 | 小鼠心脏组织样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2026-07-13 |
The role of fibroblast in chronic rhinosinusitis with nasal polyps: a key player in the inflammatory process
2025-02, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2414774
PMID:39378160
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综述 | 综述了成纤维细胞在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中通过产生细胞外基质、引发和加剧炎症反应的关键作用，并利用单细胞RNA测序数据探讨了其异质性和功能机制 | 强调了鼻息肉源性成纤维细胞在触发和加剧炎症反应中的关键角色，并通过单细胞RNA测序数据深入探索了成纤维细胞的异质性和功能机制，指出其作为治疗靶点的潜力 | 尽管单细胞RNA测序为靶向和清除病理成纤维细胞亚群提供了方向，但成纤维细胞靶向疗法在临床开发中仍面临挑战 | 总结鼻息肉源性成纤维细胞在慢性鼻窦炎伴鼻息肉组织重塑和炎症反应中的关键作用，并评估其作为治疗靶点的潜力 | 鼻息肉源性成纤维细胞（NPDFs） | 自然语言处理 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |