单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 28534 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-06-06 |
Shared roles of immune and stromal cells in the pathogenesis of human bronchiolitis obliterans syndrome
2025-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176596
PMID:40232854
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了支气管闭塞综合征（BOS）患者肺组织中的细胞类型、基因和通路，揭示了免疫和基质细胞在疾病发病机制中的共同作用 | 首次发现CD8+组织驻留记忆T细胞（TRM）在两种BOS亚型中的扩增，并识别了与巨噬细胞趋化和增殖相关的基因通路在非免疫细胞群体中的表达 | 样本量较小（4例CLAD-BOS患者，3例cGVHD-BOS患者和3例对照） | 阐明支气管闭塞综合征的发病机制 | 支气管闭塞综合征患者的肺组织 | 生物医学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 10例（4例CLAD-BOS，3例cGVHD-BOS，3例对照） |
| 242 | 2025-06-06 |
Csf1r⁻ macrophages govern the second wave of neutrophils for bone repair
2025-May-22, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6695752/v1
PMID:40470192
|
研究论文 | 本文发现了一类独特的骨导向巨噬细胞（OdMacs），它们在骨损伤后促进骨再生微环境的形成 | 首次鉴定出具有特定表达谱的OdMacs，并揭示了它们通过招募表达激活素A的前中性粒细胞促进骨再生的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探究巨噬细胞在骨再生中的作用机制 | 骨导向巨噬细胞（OdMacs）、前中性粒细胞（preNeu）和骨髓基质细胞（BMSCs） | 再生医学 | 骨损伤 | RNA-seq、scRNA-seq、FACS分析 | 小鼠基因敲除模型（Axin2-Cre; tdTomato, Inhba, Wls条件性敲除小鼠） | 转录组数据、流式细胞数据 | 未明确说明样本数量，但使用了多种基因工程小鼠模型 |
| 243 | 2025-06-06 |
Transcriptomic Signature-Guided Depletion of Intermediate Alveolar Epithelial Cells Ameliorates Pulmonary Fibrosis in Mice
2025-May-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6623390/v1
PMID:40470235
|
研究论文 | 通过转录组特征引导的中间肺泡上皮细胞耗竭改善小鼠肺纤维化 | 开发了一种新型RNA感知依赖的蛋白质翻译技术，用于选择性靶向和功能研究Krt8+ ADI细胞，并发现Sprr1a mRNA作为这些细胞的标记物 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞的应用和效果尚需进一步验证 | 探究中间肺泡上皮细胞在肺纤维化中的具体作用及其潜在治疗靶点 | 小鼠和人类的KRT5-/KRT17+异常基底样细胞及Krt8+ ADI细胞 | 分子生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RNA感知依赖的蛋白质翻译技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 244 | 2025-06-06 |
NPAS4 Depletion in POMC Neurons Protects From Obesity and Alters the Feeding-regulated Transcriptome in Male Mice
2025-May-19, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaf083
PMID:40296822
|
研究论文 | 本文研究了神经元PAS结构域蛋白4（Npas4）在POMC神经元中的作用及其对摄食行为的调控机制 | 首次研究了Npas4在调控摄食行为中的作用，并揭示了其在POMC神经元中的具体作用机制 | 研究仅针对雄性小鼠，未涉及雌性小鼠或其他动物模型 | 探究Npas4在POMC神经元中对摄食行为的调控作用 | 雄性小鼠的POMC神经元 | 神经科学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | 条件性敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 雄性小鼠（具体数量未提及） |
| 245 | 2025-06-04 |
Correction to: "GnRH-Gonadotropes Interactions Revealed by Pituitary Single-cell Transcriptomics in Zebrafish"
2025-May-19, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaf098
PMID:40457745
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2025-06-06 |
Din Oversees Mesenchymal Stem Cell Homeostasis in Mouse Incisors
2025-May-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6568233/v1
PMID:40470223
|
research paper | 该研究揭示了预测基因Din在小鼠门牙间充质干细胞（MSCs）稳态中的关键作用 | 通过新开发的敲除小鼠模型，首次揭示了Din基因在MSCs稳态中的核心调控作用，并发现其通过Rho GTPases通路影响MSCs的干性、运动性、衰老及分化潜能 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他物种中验证Din基因的功能 | 探究Din基因在小鼠门牙间充质干细胞稳态维持中的作用机制 | 小鼠门牙中的间充质干细胞（MSCs） | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组学、蛋白质组学、GLISA检测 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 未明确说明具体样本数量，使用基因改造小鼠模型 |
| 247 | 2025-06-06 |
Development of a machine learning-based predictive risk model combining fatty acid metabolism and ferroptosis for immunotherapy response and prognosis in prostate cancer
2025-May-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02484-5
PMID:40355680
|
research paper | 本研究整合了多种RNA测序技术，构建了一个基于铁死亡和脂肪酸代谢基因的前列腺癌预后模型，用于预测免疫治疗反应和预后 | 结合铁死亡和脂肪酸代谢基因，利用机器学习算法构建高精度预后模型，并通过空间转录组学和单细胞RNA测序验证模型的有效性 | 模型仅在TCGA-PRAD和DFKZ队列中进行了验证，需要更多独立队列验证其普适性 | 开发前列腺癌的预后模型和个性化治疗策略 | 前列腺癌患者 | machine learning | prostate cancer | bulk RNA sequencing, scRNA-seq, spatial transcriptomics | Lasso + Random Survival Forest (RSF) | RNA sequencing data | TCGA-PRAD数据集和DFKZ队列 |
| 248 | 2025-06-06 |
IFN-γ and donor leukocyte infusions for relapsed myeloblastic malignancies after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2025-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190655
PMID:40131369
|
research paper | 该研究探讨了IFN-γ联合供体白细胞输注(DLI)在异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤中的安全性和初步疗效 | 首次在临床试验中评估IFN-γ联合DLI治疗异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤，并采用单细胞RNA测序技术分析IFN-γ对恶性髓系细胞的体内作用 | 样本量较小(n=7)，需要更大规模的研究来验证疗效 | 评估IFN-γ联合DLI治疗异基因造血干细胞移植后复发髓系恶性肿瘤的安全性和初步疗效 | 异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病或骨髓增生异常综合征患者 | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病,骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 临床数据,基因表达数据 | 7名患者 |
| 249 | 2025-06-06 |
Microglia-driven inflammation induces progressive tauopathies and synucleinopathies
2025-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01450-z
PMID:40307569
|
研究论文 | 研究探讨了小胶质细胞驱动的炎症如何引发和传播神经退行性疾病中的蛋白质病变 | 首次证明小胶质细胞驱动的炎症可独立触发神经退行性疾病的多种病理特征，并揭示炎症诱导的局部神经病理可扩散至更广泛脑区 | 研究仅在小鼠模型中进行，人类相关性的验证尚需进一步研究 | 探究小胶质细胞驱动的炎症在神经退行性疾病中的作用机制 | 小胶质细胞、tau蛋白和α-突触核蛋白 | 神经科学 | 阿尔茨海默病、帕金森病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明小鼠数量 |
| 250 | 2025-06-06 |
Progressive accumulation of circulating CD27-CD28- effector/memory CD8+ T cells in patients with lung cancer blunts responses to immune checkpoint inhibitor therapy
2025-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01448-7
PMID:40307573
|
research paper | 该研究揭示了肺癌患者外周血CD8+ T细胞亚群的改变及其对免疫检查点抑制剂治疗反应的影响 | 首次系统性地描述了肺癌如何通过诱导CD8+ T细胞稳态失调来对抗潜在的肿瘤反应性T细胞 | 研究样本量相对有限（224例患者），且机制研究有待深入 | 探究肺癌对全身CD8+ T细胞区室的影响及其临床意义 | 肺癌患者的外周血CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 224例肺癌患者（来自四个独立队列） |
| 251 | 2025-06-06 |
Cancer-associated fibroblast-derived fibulin-5 promotes epithelial-mesenchymal transition in diffuse-type gastric cancer via cAMP response element-binding protein pathway, showing poor prognosis
2025-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01447-8
PMID:40369121
|
研究论文 | 本研究通过构建大规模信号网络和实验验证，揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）分泌的fibulin-5通过CREB通路促进弥漫型胃癌（DGC）的上皮-间质转化（EMT），并与患者不良预后相关 | 首次发现CAFs分泌的fibulin-5通过CREB通路促进DGC的EMT，并证实其作为预后标志物的潜力 | 研究主要基于体外实验和回顾性数据分析，需要进一步的前瞻性临床研究验证 | 探索弥漫型胃癌（DGC）的特异性生物标志物及其分子机制 | 弥漫型胃癌（DGC）患者样本、癌症相关成纤维细胞（CAFs）和癌细胞系 | 肿瘤生物学 | 胃癌 | RNA测序、免疫组织化学染色、单细胞RNA测序、原代培养、类器官培养和共培养系统 | 数学模型 | RNA测序数据、组织微阵列数据、单细胞RNA测序数据和临床数据 | 三个基因组数据库（TCGA、GSE62254和GSE26253）的数据、组织微阵列块、患者血液样本 |
| 252 | 2025-06-06 |
Clofarabine Enhances the Transduction Efficiency of Recombinant AAV2 in the Retina
2025-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.5.42
PMID:40434346
|
研究论文 | 研究氯法拉滨如何提高重组AAV2在视网膜中的转导效率及其机制 | 发现氯法拉滨能通过同步细胞周期和重编程转录景观，显著提高rAAV2在视网膜中的转导效率 | 研究仅限于小鼠模型和ARPE-19细胞，尚未在人类中进行验证 | 探索核糖核苷酸还原酶抑制剂增强rAAV2在视网膜中转导效率的机制 | 小鼠视网膜和ARPE-19细胞 | 基因治疗 | 眼科疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 小鼠和ARPE-19细胞 |
| 253 | 2025-06-06 |
Recent Advances in Stem Cells of Corneal Epithelia
2025-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.5.45
PMID:40440164
|
综述 | 本文综述了角膜上皮干细胞（CESCs）的最新研究进展，包括其位置、群体维持机制和异质性 | 通过角膜上皮谱系追踪、活体成像和单细胞RNA测序等新技术，揭示了CESCs的意外特性 | 讨论了当前研究的局限性，并指出CESCs领域亟待解决的关键问题 | 深入理解CESCs的特性以推动角膜疾病的再生医学治疗 | 角膜上皮干细胞（CESCs） | 再生医学 | 角膜疾病 | 谱系追踪、活体成像、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 254 | 2025-06-06 |
Microglial colonization routes and their impacts on cellular diversity
2025-Apr-25, Neuroscience research
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.neures.2025.04.004
PMID:40288616
|
review | 本文探讨了小胶质细胞在脑部发育过程中的不同定植路线及其对细胞多样性的影响 | 聚焦于小胶质细胞多样性的形成机制，特别是通过不同定植路线的影响 | 小胶质细胞多样性机制仍不完全清楚，且主要关注第一种假设 | 研究小胶质细胞多样性的形成机制及其在脑发育中的作用 | 小胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 255 | 2025-06-06 |
Multi-Omic Insight Into the Molecular Networks in the Pathogenesis of Coronary Artery Disease
2025-Apr, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.037203
PMID:40135555
|
研究论文 | 通过整合多组学数据，研究冠状动脉疾病（CAD）的分子网络机制 | 利用基于摘要数据的孟德尔随机化和共定位分析整合多组学数据，揭示了TAGLN2、APOB、GIP等基因与CAD风险的关联 | 未提及具体样本量，且部分潜在因果/风险基因仍未被识别 | 探索冠状动脉疾病的分子机制和潜在因果基因 | 冠状动脉疾病（CAD）患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 基因甲基化、表达和蛋白质水平的整合分析，单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化和共定位分析 | 多组学数据（基因甲基化、表达、蛋白质水平） | NA |
| 256 | 2025-06-06 |
BubR1 Controls Heart Development by Promoting Expression of Cardiogenesis Regulators
2025-Mar-18, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.038286
PMID:40055864
|
研究论文 | 该研究揭示了BubR1在心脏发育中的关键作用，通过促进心脏生成调节因子的表达来确保心脏形态发生的正确时机 | 首次揭示了BubR1通过调控关键心脏生成基因的表达和Wnt信号通路来影响心脏发育的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类心脏发育的差异可能影响结果的普适性 | 探究BubR1基因突变导致先天性心脏缺陷的分子机制 | 小鼠胚胎心脏发育过程 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序、轨迹分析、CellChat分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，使用条件性Bub1b敲除小鼠胚胎 |
| 257 | 2025-06-06 |
Pharmacological activation of STAT1-GSDME pyroptotic circuitry reinforces epigenetic immunotherapy for hepatocellular carcinoma
2025-Mar-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332281
PMID:39486886
|
研究论文 | 本研究通过药理学激活STAT1-GSDME焦亡回路，增强表观遗传免疫疗法对肝细胞癌的治疗效果 | 揭示了选择性HDAC抑制剂CXD101与ICB联合治疗通过STAT1-GSDME焦亡回路增强抗肿瘤免疫的新机制 | 研究主要基于临床前模型，临床转化效果需进一步验证 | 开发针对肝细胞癌免疫检查点阻断(ICB)耐药的新型联合治疗策略 | 肝细胞癌(HCC)患者和ICB耐药模型 | 肿瘤免疫治疗 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、单细胞多组学分析、染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq) | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 来自pembrolizumab临床试验(NCT03419481)的HCC患者样本和4种ICB耐药模型 |
| 258 | 2025-06-06 |
Deep learning in single-cell and spatial transcriptomics data analysis: advances and challenges from a data science perspective
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf136
PMID:40185158
|
review | 本文综述了深度学习在单细胞和空间转录组数据分析中的进展与挑战，从数据科学的角度进行了系统分析 | 系统地评估了58种计算方法在21个数据集上的性能，揭示了模型性能在不同基准数据集和评估指标间的显著差异，并提出了未来发展的三个关键方向 | 高质量标注数据集仍然有限，且生物组织的复杂相关性使得准确重建细胞状态和空间环境具有挑战性 | 探讨深度学习在单细胞和空间转录组数据分析中的应用及其面临的挑战 | 单细胞和空间转录组数据 | machine learning | NA | 单细胞测序、空间转录组 | 深度学习 | 基因表达、表观遗传修饰、代谢物水平、空间位置等多模态数据 | 21个数据集来自9个基准测试 |
| 259 | 2025-06-06 |
When is prostate cancer really cancer?
2025-Mar-01, Journal of the National Cancer Institute
DOI:10.1093/jnci/djae200
PMID:39350309
|
research paper | 探讨前列腺癌（尤其是Grade Group 1）是否应被标记为'癌症'，基于其惰性特征及现代诊断路径的调整 | 提出重新定义GG1前列腺癌的标签，基于其无转移能力及在现代诊断中的'偶然发现'性质，并探讨了空间转录组学对癌症定义的挑战 | 未明确说明研究样本量及具体研究方法，更多是基于讨论和现有研究的总结 | 减少前列腺癌死亡率，同时最小化过度诊断和过度治疗带来的危害 | Grade Group 1前列腺癌及其诊断标签 | NA | prostate cancer | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 260 | 2025-06-06 |
Adverse effects of progestin-primed ovarian stimulation: combination of clinical study and single-cell analysis
2025-Jan-20, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2025.104833
PMID:40467355
|
研究论文 | 本研究探讨了孕激素促排卵方案(PPOS)与GnRH拮抗剂方案在生殖结局上的差异，并结合临床研究和单细胞分析进行了评估 | 首次结合临床数据和单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)评估PPOS方案对生殖结局的影响，并发现mtDNA基因表达升高可能与卵母细胞质量下降相关 | 研究为回顾性队列设计，样本量相对有限(临床907例，单细胞分析16例)，且仅针对卵巢储备正常的年轻患者(<40岁) | 比较PPOS与GnRH拮抗剂方案在体外受精(IVF)周期中的效果差异 | 接受首次IVF周期的不孕症患者(907例临床研究，16例单细胞分析) | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，逆概率治疗加权(IPTW) | NA | 临床数据和单细胞基因表达数据 | 临床研究907例(PPOS组299例，GnRH拮抗剂组608例)，单细胞分析16例(每组8例) |