单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32324 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-11-06 |
Single-cell resolution spatial transcriptomic signature of the retrosplenial cortex during memory consolidation
2025-Nov-04, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03331-3
PMID:41188622
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了压后皮层在空间记忆巩固过程中的分子特征 | 首次在单细胞分辨率下解析了压后皮层在记忆巩固期间的转录组特征，并发现了阿尔茨海默病模型中神经元激活的减少 | 研究主要聚焦于小鼠模型，结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 探索压后皮层在空间记忆巩固过程中的分子机制 | 小鼠压后皮层的兴奋性神经元 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病及相关痴呆 | 空间转录组学，深度学习计算工具，化学遗传学方法 | 深度学习 | 空间转录组数据 | 成年小鼠压后皮层组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组分析 |
| 242 | 2025-11-06 |
Single Cell Sequencing Identifies Distinct Cellular Alterations in Impaired Aged and Diabetic Wounds
2025-Nov-04, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70217
PMID:41189300
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较老年和糖尿病小鼠伤口愈合的细胞差异 | 首次在单细胞水平直接比较老年和糖尿病伤口愈合过程，揭示不同的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本验证 | 探究老年和糖尿病伤口愈合障碍的细胞机制差异 | 老年和糖尿病小鼠的伤口组织 | 单细胞组学 | 糖尿病、老年性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，伪时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年和糖尿病小鼠伤口组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 243 | 2025-11-06 |
Single-cell characterization of trophoblast-epithelial interactions at the human maternal-fetal interface during early implantation
2025-Nov-04, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf246
PMID:41189328
|
研究论文 | 本研究利用输卵管异位妊娠模型通过单细胞RNA测序技术探索人早期胚胎植入过程中母胎界面滋养细胞与上皮细胞的相互作用机制 | 首次利用输卵管异位妊娠模型作为研究工具，通过单细胞转录组分析揭示母胎界面细胞间通讯网络 | 研究基于异位妊娠模型，与正常宫内妊娠存在生理环境差异 | 阐明人类早期胚胎植入过程中母胎界面的分子机制 | 输卵管异位妊娠和正常宫内妊娠的母胎界面组织 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | CellPhoneDB，CellChat | 单细胞转录组数据 | 输卵管异位妊娠患者植入部位样本及公共数据库正常宫内妊娠数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2025-11-06 |
Epigenetic repression of hepatocyte FoxO1 disrupts local immune homeostasis and promotes liver inflammation
2025-Nov-04, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001590
PMID:41190981
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研究论文 | 本研究揭示了肝细胞FoxO1通过JMJD1C维持的表观遗传调控在肝脏免疫稳态中的关键作用 | 首次发现JMJD1C通过调控Foxo1启动子区H3K9二甲基化水平控制FoxO1转录，从而维持肝脏局部免疫稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 阐明肝细胞FoxO1在肝脏免疫稳态和炎症中的作用机制 | 人类肝脏样本、肝细胞特异性Foxo1敲除小鼠、酒精性肝炎和血吸虫病肝病小鼠模型 | 表观遗传学 | 肝脏炎症性疾病 | 单细胞RNA测序、CUT&Tag分析、转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 多种肝脏疾病患者样本和基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 245 | 2025-11-06 |
Mouse cortical cellular diversification through lineage progression of radial glia
2025-Nov-03, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352826.125
PMID:40774817
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研究论文 | 通过时间序列单细胞测序技术研究小鼠皮层放射状胶质细胞的谱系进展与细胞多样化机制 | 首次构建了皮层细胞谱系进展的全面分子图谱，揭示染色质可及性通过限制转录因子表达时序驱动细胞多样化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，人类皮层发育可能存在物种特异性差异 | 探索皮层细胞多样化的细胞内在程序机制 | 小鼠皮层放射状胶质细胞及其衍生细胞类型 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据 | 胚胎期和出生后多个发育阶段的小鼠皮层祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 246 | 2025-11-06 |
Neoadjuvant Immunotherapy Promotes the Formation of Mature Tertiary Lymphoid Structures in a Remodeled Pancreatic Tumor Microenvironment
2025-Nov-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0387
PMID:40815230
|
研究论文 | 本研究通过构建胰腺导管腺癌的空间多组学图谱，揭示了新辅助免疫治疗促进成熟三级淋巴结构形成及其在肿瘤微环境重塑中的作用 | 首次报道了新辅助免疫治疗在胰腺癌中促进成熟三级淋巴结构形成的空间特征，并发现了与患者生存改善相关的TLS特异性空间基因表达特征 | 研究样本量有限，且主要关注特定免疫治疗方案下的反应机制 | 探究三级淋巴结构在胰腺导管腺癌免疫治疗中的作用及其空间分布特征 | 接受新辅助免疫治疗联合治疗的胰腺导管腺癌患者肿瘤组织及肿瘤邻近淋巴结 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 成像质谱流式技术,空间转录组学,无监督基因表达矩阵分解 | 机器学习分类模型,无监督学习 | 图像,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,成像质谱流式 | NA | NA |
| 247 | 2025-11-06 |
Highly accurate reference and method selection for universal cross-data set cell type annotation with CAMUS
2025-Nov-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280821.125
PMID:41034048
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研究论文 | 提出一种通用参考数据和方法选择策略CAMUS，用于跨数据集细胞类型注释 | 开发了首个通用参考数据和方法选择策略，显著提升细胞类型注释准确性 | NA | 提高单细胞数据中细胞类型注释的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据 | 672对跨物种scRNA-seq数据集，80个scST数据集，5个scATAC-seq数据集 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 248 | 2025-11-06 |
Evaluation of Proton Minibeam Radiotherapy on Antitumor Immune Responses in a Rat Model of Glioblastoma
2025-Nov-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0902
PMID:40833465
|
研究论文 | 评估质子微束放疗在胶质母细胞瘤大鼠模型中对抗肿瘤免疫反应的影响 | 首次在临床前胶质母细胞瘤模型中系统研究质子微束放疗的免疫调节作用，发现其优于传统质子疗法的免疫激活特性 | 研究仅限于大鼠模型，尚未在人体验证；单细胞转录组学分析可能未完全捕捉所有免疫细胞亚群 | 探索质子微束放疗对胶质母细胞瘤免疫反应的调节机制 | 胶质母细胞瘤原位大鼠模型 | 放射肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学，质子微束放疗 | NA | 基因表达数据，免疫细胞密度数据 | 胶质母细胞瘤大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 249 | 2025-11-06 |
Protocol for decoding immune predictors of response to immunotherapy through pan-cancer multiomics analysis
2025-Nov-03, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104183
PMID:41187056
|
研究论文 | 提出一种通过单细胞多组学分析解码免疫检查点阻断治疗反应预测因子的实验方案 | 整合单细胞RNA测序、免疫分型和质谱流式技术，结合基因调控网络和细胞互作分析，建立跨癌种的免疫预测模型 | NA | 开发识别免疫治疗反应相关T细胞亚群和预测生物标志物的分析方法 | 多种癌症类型中的T细胞动态 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫分型, 质谱流式技术 | 基因调控网络分析, 细胞互作分析 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞免疫分析, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 250 | 2025-11-06 |
Monohaloacetamide disinfection by-products are potential risk factors for the quality of mouse oocytes
2025-Nov-03, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119343
PMID:41187544
|
研究论文 | 本研究系统评估了单卤乙酰胺消毒副产物对雌性小鼠生殖系统的毒性作用及分子机制 | 首次系统比较不同单卤乙酰胺的生殖毒性等级，并通过单细胞RNA测序揭示其分子作用机制 | 研究仅使用小鼠模型，未涉及人类样本；暴露浓度和时长可能无法完全反映真实环境暴露情况 | 评估单卤乙酰胺消毒副产物的生殖毒性及其分子机制 | 雌性小鼠卵母细胞 | 生殖毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,氧化应激生物标志物检测,线粒体功能测定,卵巢组织病理学分析 | 小鼠动物模型 | 基因表达数据,组织病理图像,生化指标数据 | 雌性小鼠群体（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞RNA测序技术 |
| 251 | 2025-11-06 |
A phenotypic brain organoid atlas and biobank for neurodevelopmental disorders
2025-Nov-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.006
PMID:41187745
|
研究论文 | 本研究建立了神经发育障碍的表型脑类器官图谱和生物样本库 | 创建了首个包含352个遗传多样性患者来源iPSCs的NDD生物样本库，并系统分析了6000多个脑类器官的组织学和单细胞转录组特征 | 仅从35名代表性患者中深入分析，样本规模相对有限 | 建立神经发育障碍的疾病模型并探索其细胞机制 | 神经发育障碍患者来源的诱导多能干细胞和脑类器官 | 发育神经生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组测序，组织学分析 | 脑类器官模型 | 单细胞RNA-seq数据，影像数据，基因组数据 | 352个iPSC系，35名代表性患者，6000多个脑类器官，10名神经典型对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 252 | 2025-11-06 |
Insights into the relevance of targeting fibroblasts to control cancer
2025-Nov-03, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102395
PMID:41187743
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综述 | 本文总结了以癌症相关成纤维细胞为靶点控制癌症的最新研究进展 | 探讨了通过单细胞RNA测序和蛋白质组学等高通量技术揭示CAF亚群复杂性，并提出利用AI平台解析大数据以开发靶向CAF的新疗法 | 未提及具体研究样本量和数据来源的局限性 | 探索靶向癌症相关成纤维细胞控制癌症的策略 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, AI平台分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 253 | 2025-11-06 |
Atlas-Guided Discovery of Transcription Factors for T Cell Programming
2025-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.03.522354
PMID:36711632
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研究论文 | 本研究通过构建CD8+ T细胞状态图谱，系统鉴定调控T细胞分化的转录因子 | 整合转录组和表观基因组数据构建T细胞状态图谱，结合体内CRISPR筛选发现新型T细胞状态特异性转录因子 | NA | 系统定义驱动CD8+ T细胞不同分化状态的转录因子 | CD8+ T细胞的九种分化状态，特别是终末耗竭T细胞和组织驻留记忆T细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，表观遗传分析，体内CRISPR筛选 | NA | 转录组数据，表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2025-11-06 |
Transcriptomic profiling of individual bacteria by MATQ-seq
2025-Nov, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01157-5
PMID:40204970
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研究论文 | 开发了一种基于MATQ-seq的细菌单细胞转录组测序方法，能够高效分析单个细菌的基因表达谱 | 将真核生物MATQ-seq方法成功应用于细菌单细胞转录组分析，实现了95%的细胞保留率，显著优于现有方法 | NA | 建立高效可靠的细菌单细胞转录组测序方法 | 单个细菌细胞，以鼠伤寒沙门氏菌为模型生物 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选，rRNA去除 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | MATQ-seq | 基于多重退火和dC加尾的定量单细胞RNA测序方法 |
| 255 | 2025-11-06 |
Improving predictive accuracy in multiple myeloma using a plasma cell profile derived from single-cell RNA sequencing
2025-Nov-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.287586
PMID:40438979
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤肿瘤细胞异质性，发现了一个侵袭性细胞亚群并建立了七基因标志物的整合风险分层模型 | 首次在单细胞分辨率下识别出多发性骨髓瘤中具有染色体不稳定性和高耐药性的侵袭性细胞亚群，并开发了基于七基因标志物的新型风险分层模型 | 样本量相对较小（12例新诊断患者），需要在更大队列中进一步验证 | 改善多发性骨髓瘤的风险分层和预后预测准确性 | 多发性骨髓瘤患者的肿瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，数字PCR | Cox比例风险模型，整合风险分层模型 | 单细胞转录组数据 | 12例新诊断多发性骨髓瘤患者，并在5个独立数据集中验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 256 | 2025-11-06 |
Integrative Transcriptomic Analysis Decodes the Interplay Between Aging, Senescence, and Cancer
2025-Nov, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70178
PMID:40899323
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研究论文 | 通过整合基因组学、表观基因组学及单细胞转录组学分析，揭示细胞衰老与肿瘤发生之间的反向转录特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较正常衰老、细胞衰老和癌症的特征，发现648个衰老依赖性衰老相关共调控模块 | 研究主要关注17种组织，可能未覆盖所有组织类型；机制研究仍需进一步实验验证 | 解析衰老、细胞衰老与癌症之间的相互作用机制 | 17种人体组织中的内皮细胞、T细胞、上皮细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 基因组学、表观基因组学、单细胞转录组学 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、转录组数据 | 17种组织类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 257 | 2025-11-06 |
Increased AIF-1-mediated p38 MAPK phosphorylation in the mid-secretory endometrium impairs endometrial receptivity in women with recurrent implantation failure
2025-Nov-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf174
PMID:41003697
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研究论文 | 本研究探讨了同种异体移植炎症因子-1（AIF-1）通过p38 MAPK磷酸化途径损害复发性种植失败患者子宫内膜容受性的机制 | 首次揭示AIF-1在子宫内膜基质细胞中通过p38 MAPK磷酸化途径抑制细胞增殖和蜕膜化，从而降低子宫内膜容受性的新机制 | AIF-1在子宫内膜巨噬细胞在胚胎植入过程中的作用尚不明确 | 研究AIF-1对复发性种植失败患者子宫内膜容受性的影响机制 | 复发性种植失败患者和生育能力正常女性的子宫内膜组织、人子宫内膜基质细胞、子宫内膜基质细胞系、CD-1小鼠 | 生殖医学 | 复发性种植失败 | 单细胞RNA测序、定量PCR、Western blot、免疫组织化学、免疫荧光分析、RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、组织图像数据 | 18例RIF患者、18例对照患者、30例不同月经周期阶段的额外对照患者、CD-1小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2025-11-06 |
Identifying candidate genes for spermatogenic failure and predicting ICSI outcomes using single-cell RNA sequencing and protein-protein interaction networks
2025-Nov-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf186
PMID:41033661
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和蛋白质-蛋白质相互作用网络，通过机器学习框架识别精子发生障碍候选基因并预测ICSI治疗结局 | 首次将单细胞转录组数据与PPI网络结合，利用机器学习算法同时实现基因优先排序和临床结局预测 | 训练数据依赖文献整理和数据库标注，可能存在错误分类或注释偏差；缺乏实验验证；外部队列样本量有限且多样性不足 | 改进精子发生障碍的基因优先排序方法并预测ICSI治疗结局 | 精子发生障碍患者（包括无精子症、弱精子症、畸形精子症） | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 随机森林, Node2Vec | 单细胞转录组数据, 蛋白质相互作用数据, 临床数据 | 34名精子发生障碍亚型患者 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 259 | 2025-11-06 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Novel Prognostic Signatures in HNSCC Immunotherapy Response
2025-Nov, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70171
PMID:40791099
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析头颈鳞状细胞癌免疫治疗反应，开发预后风险分层模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据开发LASSO-Cox风险分层模型，识别治疗前后免疫细胞亚群变化 | 样本量较小（仅3例患者），需更大队列验证 | 分析HNSCC免疫微环境变化并建立免疫治疗预后预测模型 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 单细胞转录组学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 3例HNSCC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 260 | 2025-11-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies a Novel OLR1+ SLC7A7+ Liver-Enriched Metastatic Subset With Immunometabolic Rewiring in Pancreatic Cancer
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71345
PMID:41176774
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别胰腺癌肝转移中新型OLR1+SLC7A7+肝脏富集转移亚群及其免疫代谢重编程特征 | 首次发现并表征了胰腺癌肝转移中具有代谢重编程和免疫抑制通路超活化的终末分化恶性细胞亚群LEMS | 需要扩大临床队列和体内模型以全面阐明LEMS与巨噬细胞之间的具体机制相互作用 | 识别驱动PDAC肝转移的关键细胞亚群，阐明其与转移微环境的相互作用，定义肝脏定植的潜在机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)原发肿瘤和肝转移患者的临床样本 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PDAC原发肿瘤和肝转移患者的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |