单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 27353 篇文献,本页显示第 241 - 260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
241 2025-04-26
Emerging clinical applications of single-cell RNA sequencing in oncology
2025-May, Nature reviews. Clinical oncology
review 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在肿瘤学中的新兴临床应用 总结了scRNA-seq在癌症患者样本研究中的潜在临床相关发现,并突出了四个主要研究方向 讨论了scRNA-seq的局限性以及未来可能提升临床适用性的方法 探讨scRNA-seq在肿瘤学中的临床应用潜力 癌症患者样本 digital pathology cancer scRNA-seq NA RNA sequencing data 数百项研究中的癌症患者样本
242 2025-04-26
Chemokine (C-C Motif) Ligand 2 Expressing Adventitial Fibroblast Expansion During Loeys-Dietz Syndrome Aortic Aneurysm Formation
2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
research paper 该研究通过单细胞转录组学分析,探讨了Loeys-Dietz综合征(LDS)主动脉瘤形成中外膜成纤维细胞的作用及其促炎状态 揭示了LDS主动脉瘤形成中外膜成纤维细胞的促炎状态及其在巨噬细胞招募中的关键作用,与马凡综合征的机制不同 样本量较小,人类LDS手术标本仅5例,对照组仅2例 阐明LDS主动脉瘤发病机制中的细胞状态转变和转录组学变化 小鼠LDS模型(Tgfbr2G357W/+)和人类LDS手术标本的主动脉根/升主动脉 分子病理学 主动脉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RNA原位杂交、免疫荧光、免疫组织化学 NA 转录组数据、图像数据 小鼠模型(未明确数量)和人类样本(5例LDS,2例对照),共分析超过30,000个细胞
243 2025-04-26
Decoding the role of lipid metabolism in NSCLC: From macrophage subtype identification to prognostic model development
2025-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序分析,识别了与非小细胞肺癌(NSCLC)发生和进展相关的脂质相关巨噬细胞(LAM)标记基因,并开发了一个预后风险评分模型 识别了与脂质代谢密切相关的巨噬细胞亚型及其关键标记基因(S100A10、HLA-DMB和CTSL),并构建了一个高精度的预后风险评分模型 研究主要依赖于TCGA和GEO数据库的RNA测序数据,可能受到数据来源的限制 探索脂质代谢途径在NSCLC进展中的作用,并开发预后模型 非小细胞肺癌(NSCLC)患者和肿瘤微环境中的巨噬细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq) 预后风险评分模型 RNA测序数据 来自TCGA和GEO数据库的NSCLC患者数据
244 2025-04-26
Local DIO2 Elevation Is an Adaption in Malformed Cerebrovasculature
2025-Apr-25, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究探讨了甲状腺激素信号在脑血管畸形中的作用,发现DIO2介导的适应机制可能成为脑血管疾病的潜在治疗靶点 首次揭示了DIO2在脑血管畸形中的上调是一种适应性反应,并阐明了FOXK1-PI3K-Akt-mTOR信号通路调控DIO2表达的分子机制 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化需要进一步验证 探究甲状腺激素信号在脑血管畸形病理过程中的作用机制 人类脑血管畸形样本(海绵状血管瘤和动静脉畸形)及两种小鼠模型(Pdcd10内皮特异性敲除和KrasG12D突变小鼠) 脑血管疾病研究 脑血管畸形 单细胞转录组分析、腺相关病毒介导的基因操作、免疫组织化学 基因敲除小鼠模型(Pdcd10 KO)和基因突变小鼠模型(KrasG12D) 单细胞RNA测序数据、组织学图像、分子生物学数据 人类脑血管畸形样本(数量未明确)和多种基因工程小鼠
245 2025-04-26
Srsf3-Dependent APA Drives Macrophage Maturation and Limits Atherosclerosis
2025-Apr-25, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究揭示了Srsf3依赖性APA在驱动巨噬细胞成熟和限制动脉粥样硬化中的关键作用 首次揭示了Srsf3通过调控线粒体相关基因的3'UTR长度影响巨噬细胞成熟和动脉粥样硬化进程的机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 探究单核细胞向巨噬细胞转变的调控机制及其在动脉粥样硬化中的作用 Apoe-/-小鼠动脉斑块中的单核/巨噬细胞亚型 分子生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序、3'端测序、流式细胞术、组织病理学分析 NA RNA测序数据、流式细胞数据、代谢组数据 Apoe-/-小鼠动脉斑块样本及部分人类斑块样本
246 2025-04-26
Genetics- and age-driven neuroimmune and disc changes underscore herniation susceptibility and pain-associated behaviors in SM/J mice
2025-Apr-25, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过SM/J小鼠模型探讨了遗传背景和年龄对自发性椎间盘突出易感性及疼痛相关行为的影响 首次在野生型小鼠中建立了研究自发性椎间盘突出病理生理学的模型,并揭示了神经免疫和椎间盘变化的分子机制 研究仅使用SM/J小鼠这一特定品系,结果可能不适用于其他遗传背景的小鼠或人类 探究遗传和年龄因素如何影响椎间盘突出的易感性及相关疼痛行为 SM/J小鼠的腰椎间盘、背根神经节、脊髓和外周血单个核细胞 神经科学 椎间盘疾病 转录组学分析、流式细胞术、单细胞RNA测序 SM/J小鼠模型 基因表达数据、细胞组成数据 未明确说明具体数量,但涉及多个年龄段的SM/J小鼠组织样本
247 2025-04-26
Distinct adipose progenitor cells emerging with age drive active adipogenesis
2025-Apr-25, Science (New York, N.Y.)
研究论文 研究揭示了中年时期脂肪祖细胞(APCs)在促进内脏脂肪形成中的关键作用及其与年龄相关代谢疾病的关联 发现了中年时期特有的脂肪祖细胞亚群CP-A,揭示了其在脂肪形成和内脏脂肪扩张中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类相关性的验证需要进一步研究 探究年龄依赖性脂肪重塑的机制及其与代谢疾病的关系 小鼠脂肪祖细胞(APCs) 细胞生物学 代谢疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 小鼠模型
248 2025-04-26
The release of NETs during SFTSV infection downregulates the specific inflammatory factors that lead to liver and spleen damage
2025-Apr-25, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本文研究了严重发热伴血小板减少综合征(SFTS)病毒感染过程中中性粒细胞外诱捕网(NETs)的释放如何下调特定炎症因子,从而导致肝脏和脾脏损伤 首次揭示了SFTSV感染触发NETosis的机制,并发现NETs通过下调特定炎症因子影响免疫反应和器官修复过程 研究结果基于细胞和动物模型,尚需在人体中进一步验证 探究SFTSV感染过程中NETs释放对炎症因子和器官损伤的影响机制 SFTS患者、细胞模型(Thp-1细胞)和动物模型 传染病学 严重发热伴血小板减少综合征 单细胞测序、转录组测序 NA 测序数据、组织样本 NA
249 2025-04-26
M2 Macrophage-Derived Extracellular Vesicles Reprogram Immature Neutrophils into Anxa1hi Neutrophils to Enhance Inflamed Bone Regeneration
2025-Apr-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了M2巨噬细胞来源的细胞外囊泡(M2-EVs)在减轻牙周炎引起的骨丢失中的关键作用,并发现了一种具有促修复特性的Anxa1中性粒细胞亚群 发现了M2-EVs通过破坏中性粒细胞成熟轨迹,促进Anxa1修复亚群的分化,从而增强炎症骨再生的新机制 未明确M2-EVs对其他免疫细胞的影响及长期治疗效果 探究M2巨噬细胞与中性粒细胞的相互作用对炎症骨再生的影响 牙周炎模型中的M2巨噬细胞、中性粒细胞及其亚群 免疫学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA
250 2025-04-26
Mechanism of mitochondrial dysfunction on placental trophoblastic cells in intrahepatic cholestasis of pregnancy
2025-Apr-25, Journal of molecular histology IF:2.9Q3
研究论文 本研究探讨了妊娠期肝内胆汁淤积症(ICP)中胆汁酸诱导的胎盘滋养层细胞线粒体功能障碍的机制 揭示了NRF1/PGC-1α通路在ICP孕妇血清胆汁酸升高导致胎盘滋养层细胞线粒体损伤中的作用机制 研究主要基于细胞模型,需要进一步在动物模型或临床样本中验证 探究ICP中胆汁酸诱导线粒体功能障碍的机制,为ICP治疗提供精准靶点 人类胎盘组织和ICP细胞模型 生殖医学 妊娠期肝内胆汁淤积症 单细胞测序、荧光共聚焦显微镜、电子显微镜 ICP细胞模型 单细胞测序数据、显微镜图像数据 人类胎盘组织样本和建立的ICP细胞模型
251 2025-04-26
Association Between T2DM, TyG Index, Multiple Sclerosis, and Rheumatoid Arthritis: Insights into Potential Mechanisms
2025-Apr-25, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了2型糖尿病(T2DM)和胰岛素抵抗(IR)指标TyG指数与自身免疫相关疾病(ARDs)之间的因果关系,并评估了免疫细胞的影响 首次通过综合Mendelian随机化分析和单细胞RNA测序技术,揭示了T2DM和TyG指数与多发性硬化症(MS)和类风湿性关节炎(RA)的因果关联,并发现特定免疫细胞和基因位点在其中的作用 研究依赖于GWAS汇总数据,可能受到混杂因素的影响,且需要进一步实验验证发现的分子机制 探索T2DM和IR指标与自身免疫疾病之间的因果关系及其潜在机制 2型糖尿病(T2DM)、TyG指数、多发性硬化症(MS)、类风湿性关节炎(RA)和免疫细胞 遗传流行病学 多发性硬化症, 类风湿性关节炎, 2型糖尿病 Mendelian随机化分析, 贝叶斯共定位分析, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因组关联研究(GWAS)数据, 单细胞RNA测序数据 NA
252 2025-04-26
m2ST: Dual Multi-Scale Graph Clustering for Spatially Resolved Transcriptomics
2025-Apr-24, Bioinformatics (Oxford, England)
research paper 提出了一种名为m2ST的双重多尺度图聚类方法,用于空间转录组数据的空间聚类分析 引入多尺度掩码图自编码器提取不同尺度的表示,采用随机掩码机制和缩放余弦误差作为损失函数,并提出定制化的多尺度聚类框架 未明确提及具体局限性,但暗示传统单尺度分析方法可能限制特征判别力 提高空间转录组数据空间域注释的准确性 空间转录组数据 生物信息学 NA 空间转录组测序 图神经网络(GNN)、自编码器 空间转录组数据 多个空间转录组数据集(未明确数量)
253 2025-04-26
Effects of Bacterial Infections under Heatwaves on Chinese Soft-Shelled Turtles and Their Single-Cell Transcriptomic Landscapes
2025-Apr-24, Environmental science & technology IF:10.8Q1
研究论文 本研究探讨了细菌感染和热浪双重胁迫对中华鳖的影响,通过单细胞转录组、行为和生理指标的综合分析 首次整合单细胞转录组、行为和生理指标,研究中华鳖在细菌感染和热浪双重胁迫下的免疫反应 研究仅针对中华鳖,结果可能不适用于其他物种 探究细菌感染和热浪双重胁迫对中华鳖的影响 中华鳖 生态学与免疫学 细菌感染 单细胞转录组测序 NA 转录组数据、行为数据、生理指标数据 四组中华鳖(基于恒温28°C和热浪暴露,以及是否感染细菌)
254 2025-04-26
Comprehensive analysis of breast cancer oxidative stress related gene signature: a combination of bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2025-Apr-24, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2
研究论文 本研究通过结合大量和单细胞RNA测序分析,开发了一个基于氧化应激相关基因的预后基因特征,用于评估乳腺癌患者的预后和免疫状态 结合大量和单细胞RNA测序分析,开发了氧化应激相关评分模型,并识别了转录因子TFAP2B作为高OSRS细胞的关键调控因子 研究依赖于公开数据库的数据,可能受到数据质量和样本选择的限制 开发一个基于氧化应激相关基因的预后基因特征,评估乳腺癌患者的预后和免疫状态 乳腺癌患者 生物信息学 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 Lasso回归, 多变量Cox回归 RNA-seq数据, 临床信息 NA
255 2025-04-26
Nuclear IL-1α Triggers Pyroptosis in Porcine Intramuscular Preadipocytes
2025-Apr-24, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序发现猪肌内脂肪中的脂肪祖细胞在成脂分化过程中高表达炎症基因IL-1α,并揭示了核IL-1α通过IRF2-NOCT-ROS途径促进猪肌内脂肪细胞焦亡的新机制 首次揭示了核IL-1α在焦亡调控中的新功能及其通过IRF2-NOCT-ROS信号通路的作用机制 研究仅针对猪肌内脂肪细胞,未在其他物种或组织类型中验证该机制 探究核IL-1α在猪肌内脂肪细胞中的功能及其调控机制 猪肌内脂肪前体细胞 分子生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 未明确说明样本数量(猪肌内脂肪组织)
256 2025-04-26
Single-cell RNA sequencing revealed the immunophenotypic features of macrophages in cardiac transplants and uncovered Lgals9 promoted their polarization toward the M2b subtype
2025-Apr-23, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了心脏移植中巨噬细胞的免疫表型特征,并发现Lgals9促进其向M2b亚型极化 发现了一种新的巨噬细胞亚群'Myoz2+ MAC',并揭示了Lgals9在巨噬细胞极化中的作用 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 探索心脏移植中巨噬细胞的基因组特征及其在移植排斥反应中的作用 小鼠心脏移植模型中的巨噬细胞 生物医学 心血管疾病 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blotting, 流式细胞术, ELISA 小鼠心脏移植模型 RNA测序数据, 蛋白质表达数据 未明确说明样本数量,使用小鼠心脏移植模型
257 2025-04-26
Histone HIST1 genes and tumor-infiltrating lymphocytes in a child with γδ T cell acute lymphoblastic leukemia by single-cell sequencing
2025-Apr-23, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 通过单细胞测序技术研究了一名儿童γδ T细胞急性淋巴细胞白血病(γδ T-ALL)患者中组蛋白HIST1基因与肿瘤浸润淋巴细胞的关系 首次揭示了组蛋白HIST1基因与γδ T-ALL之间的联系,并识别了γδ T细胞在对抗这种白血病中的潜在效应功能 研究仅基于单个病例,样本量有限 探索γδ T-ALL的生物学特征及潜在治疗策略 一名接受诱导化疗、强化治疗及单倍体相合造血干细胞移植的γδ T-ALL儿童患者 单细胞测序 急性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 1名患者
258 2025-04-26
Protocol for preparing fresh frozen soybean tissues for spatial transcriptomics
2025-Apr-23, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文提出了一种制备新鲜冷冻大豆组织用于空间转录组学的协议 解决了植物组织在空间转录组学应用中因组织制备问题而面临的挑战 NA 开发适用于植物组织的空间转录组学样本制备方法 大豆组织 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 转录组数据 NA
259 2025-04-26
Resolving the spatial organization of fetal liver hematopoiesis by SeekSpace
2025-Apr-22, Cell regeneration (London, England)
研究论文 本研究利用SeekSpace高分辨率单核空间转录组平台,绘制了胚胎13.5天胎儿肝脏中造血干细胞和多能祖细胞(HSC/MPPs)及其下游受限祖细胞(RPs)的空间分布图 首次构建了胎儿肝脏造血的单细胞空间转录组图谱,揭示了HSC/MPPs和RPs在胎儿肝脏中的活跃扩张过程及其与成人骨髓中的行为差异 研究仅针对胚胎13.5天的胎儿肝脏,未涵盖其他发育阶段 解析胎儿肝脏造血过程中不同造血祖细胞群体的空间组织 胎儿肝脏中的造血干细胞、多能祖细胞及其下游受限祖细胞 空间转录组学 NA SeekSpace高分辨率单核空间转录组平台 NA 空间转录组数据 胚胎13.5天的胎儿肝脏样本
260 2025-04-26
Mutual Regulation of Cardiovascular and Hematopoietic Development
2025-Apr-22, Current cardiology reports IF:3.1Q2
综述 探讨心血管和造血系统在发育过程中的相互调控关系,特别是心内膜造血作用的进化保守性及其在心脏发育和巨噬细胞形成中的重要性 通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)揭示心内膜细胞具有独立于已知造血器官的内在造血程序,并阐明这些心源性巨噬细胞对心脏形态发生的独特贡献 NA 阐明心内膜造血作用的进化保守性及其在心脏发育和稳态中的关键作用 心血管系统和造血系统的发育调控机制 发育生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
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