单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32278 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-11-05 |
The joint impact of elevated homocysteine and type 2 diabetes on non-healing wounds and all-cause mortality: integrated clinical and multi-omics analyses
2025-Nov-04, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003715
PMID:41186525
|
研究论文 | 本研究探讨高同型半胱氨酸血症与2型糖尿病对难愈合伤口和全因死亡率的联合影响及其机制 | 首次揭示HHcy和T2D对难愈合伤口的协同作用，发现Hcy通过MIF-CD74/CXCR4轴驱动免疫代谢重编程 | 观察性研究设计无法确定因果关系，样本代表性可能受限 | 探究HHcy和T2D对难愈合伤口和死亡风险的联合影响及分子机制 | 8406名NHANES参与者（1999-2004）及糖尿病足溃疡患者 | 多组学分析 | 糖尿病足溃疡 | 批量转录组测序,单细胞测序,限制性立方样条,中介分析 | 加权逻辑回归,Cox比例风险模型 | 临床数据,转录组数据,单细胞数据 | 8406名NHANES参与者 | NA | 批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 242 | 2025-11-05 |
Unveiling gastric stem cell dynamics in gastric atrophy and carcinogenesis: revisiting mechanisms and advancing experimental models - a narrative review
2025-Nov-04, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003733
PMID:41186567
|
综述 | 全面评估胃干细胞在萎缩性胃炎和癌前病变中的动态作用，重新审视胃干细胞耗竭与扩张的竞争范式 | 提出胃干细胞在慢性炎症中持续存在并发生克隆扩张的新观点，建立区域癌化效应的概念框架 | 依赖多化学致癌物模型的转化相关性有限，他莫昔芬依赖性谱系追踪系统存在混杂效应 | 阐明胃干细胞在胃萎缩和癌变过程中的动态机制 | 胃干细胞 | 病理学 | 胃癌 | 谱系追踪，空间转录组学，类器官系统 | NA | 实验数据，文献资料 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 243 | 2025-11-05 |
Immune cell quantification of in situ inflammation partitions human lupus nephritis into mechanistic subtypes
2025-Nov-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI192669
PMID:40906524
|
研究论文 | 通过免疫细胞定量分析将人类狼疮性肾炎划分为机制亚型 | 使用高维共聚焦显微镜、空间转录组学和计算机视觉技术量化免疫细胞群体，首次发现狼疮性肾炎和肾移植排斥反应中免疫细胞亚群形成相同的独特生态位 | 样本量相对有限（54例活检组织），研究结果需要更大规模验证 | 解析人类狼疮性肾炎的炎症机制和异质性 | 狼疮性肾炎和肾移植排斥反应的肾脏活检组织 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 高维共聚焦显微镜, 空间转录组学, 计算机视觉 | 计算机视觉技术 | 图像, 空间转录组数据 | 54例去标识化肾脏活检组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 244 | 2025-11-05 |
Protoplast technology in woody plants: Current advances and potential applications in genetic improvement
2025-Nov-03, Tree physiology
IF:3.5Q1
DOI:10.1093/treephys/tpaf138
PMID:41182256
|
综述 | 本文综述了木本植物原生质体技术的当前进展及其在遗传改良中的潜在应用 | 系统总结了木本植物原生质体分离方法和应用前景，突出了其在基因编辑和单细胞测序等新兴领域的潜力 | NA | 探讨木本植物原生质体技术在生物技术和遗传改良中的应用价值 | 木本植物原生质体 | 植物生物技术 | NA | 原生质体分离、瞬时表达、基因编辑、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 245 | 2025-11-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals multiple pathways involving pulmonary immune and epithelial cells through which aryl hydrocarbon receptor activation attenuates acute respiratory distress syndrome
2025-Nov-03, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf295
PMID:41182312
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了芳香烃受体激活通过调节肺免疫和上皮细胞的多条通路来减轻急性呼吸窘迫综合征 | 首次在单细胞水平系统揭示AhR激活通过调节多种细胞类型和信号通路来缓解ARDS的机制 | 研究基于小鼠模型，结果需在人类中验证；仅使用LPS诱导的ARDS模型 | 探究芳香烃受体激活对急性呼吸窘迫综合征的保护作用机制 | LPS诱导的ARDS小鼠模型中的肺组织细胞 | 单细胞生物学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2025-11-05 |
Branch-specific gene discovery in cell differentiation using multi-omics graph attention
2025-Nov-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013664
PMID:41183107
|
研究论文 | 提出基于异构图注意力机制的BranchKGN框架，用于识别细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 | 开发了整合多组学单细胞数据的异构图变换器框架，能够识别细胞分化分支点及其后代谱系中持续提供信息的关键基因 | NA | 解析细胞分化过程中的基因调控机制 | 细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, 图注意力网络 | 异构图变换器, 图注意力网络 | 单细胞多组学数据 | 三个独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 247 | 2025-11-05 |
Toward a ToxAtlas of Carbon-Based Nanomaterials: Single-Cell RNA Sequencing Reveals Initiating Cell Circuits in Pulmonary Inflammation
2025-Nov-03, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c12054
PMID:41183169
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示碳基纳米材料引发肺部炎症的起始细胞回路 | 首次在单细胞分辨率下系统比较不同碳基纳米材料引发的特异性分子起始事件，并开发了ToxAtlas网络工具 | 仅观察12小时后的急性炎症反应，未评估长期慢性炎症效应 | 研究碳基纳米材料如何驱动急性肺部炎症反应 | 小鼠肺部细胞 | 单细胞测序分析 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 248 | 2025-11-05 |
Identification of novel differentiation trajectories and gene network associations with ectopic pregnancy in fallopian tube epithelium
2025-Nov-03, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf200
PMID:41183511
|
研究论文 | 通过单细胞转录组数据网络建模识别输卵管上皮细胞分化轨迹及其与异位妊娠的基因网络关联 | 发现新型OVGP1+上皮祖细胞及其双向分化轨迹，通过因果网络模型揭示输卵管与子宫内膜分泌细胞的功能差异 | 育龄妇女样本量有限，未进行候选基因的体外或体内验证 | 识别输卵管上皮细胞发育轨迹及其与异位妊娠的分子机制 | 输卵管上皮细胞和子宫内膜上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 异位妊娠 | 单细胞RNA测序, RNA速度分析, 网络建模, 表达数量性状位点分析 | 超图网络模型 | 单细胞转录组数据 | 13名女性的输卵管scRNA-seq样本和13名女性的子宫内膜scRNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2025-11-05 |
[Neural regulation mechanism in bone regeneration]
2025-Nov-03, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
综述 | 本文系统阐述了神经系统在骨再生过程中的调控机制，重点关注神经肽和神经递质的关键作用 | 提出'神经-骨骼'调控轴概念，系统梳理交感与副交感神经系统在骨再生中的相反调控作用 | 神经肽之间的相互作用网络尚未完全阐明，需要更先进的研究模型和技术支持 | 探讨骨再生过程中的神经调控机制 | 骨骼系统与神经系统的相互作用机制 | 骨再生医学 | 退行性骨病、创伤性骨损伤 | 单细胞测序、三维生物打印骨模型、类器官技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2025-11-05 |
Effector Functions of Conventional and Unconventional Mycobacterium tuberculosis (Mtb)-Specific T Cells
2025-Nov-03, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041829
PMID:41184129
|
综述 | 本文综述了结核分枝杆菌特异性T细胞的效应功能及其在免疫防御中的作用 | 整合单细胞和空间转录组学最新发现，揭示T细胞亚群的异质性、功能可塑性和空间区隔化 | NA | 探讨T细胞在结核分枝杆菌免疫防御中的效应功能和免疫病理作用 | 结核分枝杆菌特异性T细胞（包括常规和非常规T细胞） | 免疫学 | 结核病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 251 | 2025-11-05 |
STORIES: learning cell fate landscapes from spatial transcriptomics using optimal transport
2025-Nov-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02855-4
PMID:41184554
|
研究论文 | 提出了一种名为STORIES的新计算方法，利用最优传输从空间转录组数据中学习细胞命运景观 | 将最优传输扩展到空间转录组数据分析，能够学习空间信息化的细胞分化潜能 | NA | 从多个时间点的空间转录组数据推断细胞命运轨迹 | 空间转录组数据中的细胞分化过程 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输，神经网络 | 空间转录组数据 | 三个大型Stereo-seq时空图谱数据集 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 252 | 2025-11-05 |
Squidiff: predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2025-Nov-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02877-y
PMID:41184550
|
研究论文 | 提出基于扩散模型的生成框架Squidiff，用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 | 通过连续去噪和语义特征整合，学习瞬态细胞状态并预测时间和条件下高分辨率转录组景观 | NA | 预测细胞发育和对扰动的响应，促进细胞命运决定调控原理的理解 | 细胞分化、基因扰动、药物响应、血管类器官发育、中子辐射和生长因子响应 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 253 | 2025-11-05 |
Spatiotemporal dynamics of the cardioimmune niche during lesion repair
2025-Nov-03, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00739-6
PMID:41184578
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，重建了小鼠心脏损伤后纤维化微环境的时空动态变化 | 首次揭示了Trem2巨噬细胞通过沉默成纤维细胞增殖来防止过度纤维化的新机制，并发现了一群罕见的祖细胞样心肌细胞 | 研究仅限于小鼠模型，人类心脏组织的验证仍需进一步研究 | 探索心脏损伤修复过程中的细胞和分子调控机制 | 成年小鼠心脏组织和人心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 小鼠心脏损伤模型和人类心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 254 | 2025-11-05 |
Cell cycle-driven transcriptome maturation confers multilineage competence to cardiopharyngeal progenitors
2025-Nov-03, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00613-y
PMID:41184589
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了海鞘心脏咽部祖细胞在细胞周期进程中转录组成熟的动态过程及其对多谱系分化能力的影响 | 首次提出'转录组成熟'概念，发现细胞周期驱动转录组动态变化赋予祖细胞多谱系分化能力，并鉴定出关键调控基因Depdc1b | 研究基于海鞘模型，在哺乳动物系统中的普适性需要进一步验证 | 探究心脏咽部祖细胞在发育过程中如何获得多谱系分化能力 | 海鞘心脏咽部祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，转基因样本条形码技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 255 | 2025-11-05 |
MYEOV Is a Novel Marker of Differentiated Corneal Epithelium
2025-Nov-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.14.7
PMID:41186354
|
研究论文 | 本研究揭示了MYEOV作为角膜上皮分化特异性标志物的表达特征和调控机制 | 首次发现MYEOV在KRT12阳性角膜上皮细胞中特异性高表达，且受PAX6和KLF4调控 | 研究主要基于体外细胞实验和免疫染色，缺乏体内功能验证 | 表征MYEOV在人类眼表组织中的表达和调控机制 | 人类角膜上皮细胞、结膜上皮细胞及其他表面外胚层来源上皮 | 细胞生物学 | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序、免疫染色、基因敲低、Western blot、集落形成实验、EdU细胞增殖检测 | NA | RNA测序数据、蛋白质表达数据、细胞增殖数据 | 人类角膜组织及体外培养的角膜上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 256 | 2025-11-05 |
DISSyphilis and the Risk of HIV Infection: A Mendelian Randomization Study
2025-Nov, AIDS research and human retroviruses
IF:1.5Q4
DOI:10.1089/AID.2024.0005
PMID:39086230
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析评估梅毒对HIV感染的因果效应 | 首次使用孟德尔随机化方法证实梅毒与HIV感染之间的直接因果关系，并发现RPAIN基因变异在疾病进展中的关键作用 | 研究依赖于公开数据库的基因组数据，样本特征和人群异质性可能影响结果推广 | 评估梅毒对HIV感染的因果效应及潜在分子机制 | 梅毒和HIV感染相关的基因组数据及基因表达数据 | 生物信息学 | HIV感染/梅毒 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 基因组关联分析 | 加权中位数, MR Egger, 逆方差加权 | 基因组数据, 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库和基因组关联研究获取的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组关联分析 | NA | NA |
| 257 | 2025-11-05 |
BDNF as a Key Mediator in Eosinophilic Inflammation in CRSwNP: Insights From Transcriptomic and Functional Analysis
2025-Nov, International forum of allergy & rhinology
IF:7.2Q1
DOI:10.1002/alr.23628
PMID:40600933
|
研究论文 | 本研究通过转录组学和功能分析揭示了BDNF在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中作为嗜酸性粒细胞炎症关键介质的作用机制 | 首次在CRSwNP中系统阐明BDNF通过上皮细胞-嗜酸性粒细胞相互作用驱动嗜酸性炎症的分子机制 | 样本量相对有限（23例组织样本和95例鼻腔分泌物），且为观察性研究 | 探究BDNF在CRSwNP嗜酸性炎症中的调控作用和功能机制 | 鼻腔黏膜组织、鼻腔分泌物、原代人鼻上皮细胞和嗜酸性粒细胞 | 生物医学研究 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | bulk RNA测序, ELISA, 免疫荧光染色, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, Transwell实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质定量数据, 细胞功能数据 | 23例鼻腔黏膜样本和95例鼻腔分泌物样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2025-11-05 |
Single-cell transcriptome atlas and genome-wide Mendelian randomization reveal chemokine involvement in diverse immune cells in type 2 diabetes
2025-Nov, International journal of obesity (2005)
DOI:10.1038/s41366-025-01846-x
PMID:40684027
|
研究论文 | 通过单细胞转录组图谱和全基因组孟德尔随机化分析揭示趋化因子在2型糖尿病多种免疫细胞中的参与机制 | 整合孟德尔随机化、动物模型验证和单细胞RNA测序构建2型糖尿病免疫病理中趋化因子信号传导的系统级框架 | 研究主要基于小鼠模型和外周血单核细胞，需要进一步在人类组织和更多细胞类型中验证 | 阐明趋化因子在2型糖尿病免疫失调中的因果作用和细胞特异性机制 | 2型糖尿病相关免疫细胞和趋化因子信号通路 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 血清学数据 | 链脲佐菌素诱导的小鼠2型糖尿病模型的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 259 | 2025-11-05 |
Multi-omics integration reveals key miRNAs, immune inflammation, and signaling pathways in Alzheimer's disease: Implications for targeted therapy
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147874
PMID:41005404
|
研究论文 | 通过多组学整合分析揭示阿尔茨海默病中关键miRNAs、免疫炎症和信号通路的作用机制 | 整合三种组学数据集识别出AD相关关键miRNAs和信号通路，并提出免疫调节与神经再生相结合的治疗框架 | 候选miRNAs对成熟神经元标志物作用有限，需要合适的神经元环境才能诱导神经元分化 | 阐明阿尔茨海默病的分子机制并探索靶向治疗策略 | 阿尔茨海默病患者的多组学数据及神经元细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | miRNA-seq, RNA-seq, 单细胞转录组学 | NA | 测序数据 | 三种组学数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2025-11-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals LGALS9+ epithelial and COMP+ stromal cell crosstalk driving keratoconus pathogenesis
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147969
PMID:41022233
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示圆锥角膜发病机制中LGALS9+上皮细胞与COMP+基质细胞的相互作用 | 首次识别出圆锥角膜特异性细胞亚群——LGALS9阳性角膜上皮细胞和COMP阳性角膜基质细胞，并发现它们通过LGALS9-CD44/CD45和血小板反应蛋白信号通路形成促纤维化和促炎症网络 | 样本量较小（5例患者和5例对照），需要更大规模研究验证发现 | 研究圆锥角膜的细胞景观，揭示导致疾病进展的关键病理细胞群和信号通路 | 圆锥角膜患者和健康对照者的角膜组织 | 单细胞组学 | 圆锥角膜 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 免疫荧光, 蛋白质印迹 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质数据 | 5例圆锥角膜患者和5例健康对照的角膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |