单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27096 篇文献，本页显示第 25921 - 25940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25921 | 2024-08-09 |
DensityPath: an algorithm to visualize and reconstruct cell state-transition path on density landscape for single-cell RNA sequencing data
2019-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty1009
PMID:30535348
|
研究论文 | 提出了一种名为DensityPath的算法，用于在单细胞RNA测序数据的密度景观上可视化和重建细胞状态转换路径 | DensityPath算法通过采用弹性嵌入的非线性降维方法，揭示数据内在结构，并从单细胞多模态密度景观中提取高密度水平集簇的拓扑特征，重建细胞状态转换的最优路径 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中细胞发育轨迹的可视化和重建问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 弹性嵌入 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 25922 | 2024-08-09 |
Hypermutagenesis in untreated adult gliomas due to inherited mismatch mutations
2019-06-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.32054
PMID:30536544
|
研究论文 | 研究未治疗的成人胶质瘤中由于遗传性错配修复突变导致的超突变现象 | 首次识别出未经治疗成人胶质瘤中存在的新生超突变表型，并探讨了自发和治疗诱导的超突变进化 | NA | 揭示未治疗成人胶质瘤中超突变过程的新理解，并为胶质瘤治疗的免疫疗法提供临床意义 | 未经治疗和治疗后的超突变胶质瘤 | 数字病理学 | 脑瘤 | 全外显子测序（WES），全转录组测序（WTS），单细胞测序（SCS） | NA | 基因组数据 | 涉及未经治疗和治疗后的超突变胶质瘤样本 |
| 25923 | 2024-08-09 |
Deconstructing Retinal Organoids: Single Cell RNA-Seq Reveals the Cellular Components of Human Pluripotent Stem Cell-Derived Retina
2019-05, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.2963
PMID:30548510
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了从人类胚胎干细胞衍生的视网膜类器官在三个分化时间点的细胞组成 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示了视网膜类器官中关键细胞类型的有序生成过程 | NA | 探究视网膜类器官的细胞生物学特性及其相互作用 | 人类胚胎干细胞衍生的视网膜类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个时间点的视网膜类器官样本 |
| 25924 | 2024-08-09 |
Network Inference from Single-Cell Transcriptomic Data
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-8882-2_10
PMID:30547403
|
研究论文 | 本文探讨了利用单细胞转录组数据进行网络推断的优势和方法 | 利用单细胞转录组数据可以识别更复杂的非线性基因依赖关系，并推断特定条件下的调控网络 | NA | 研究如何利用单细胞转录组数据增强基因调控网络的推断 | 单细胞转录组数据中的基因依赖关系和调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 大量单细胞样本 |
| 25925 | 2024-08-09 |
Better Being Single? Omics Improves Kidney Organoids
2019, Nephron
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000496009
PMID:30554217
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术比较分析了两种肾脏类器官分化协议，并基于这些数据开发了一种新的分化协议以减少非肾脏细胞类型 | 开发了一种新的分化协议，旨在减少非肾脏细胞类型，同时不影响类器官上皮细胞的功能 | 文章指出，现有的分化协议未能产生纯净或全面的肾脏细胞，且存在非肾脏细胞类型的污染 | 比较不同肾脏类器官分化协议，并改进其功能 | 人类肾脏类器官及其分化协议 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及两种肾脏类器官分化协议的数据 |
| 25926 | 2024-08-09 |
Simultaneous multiplexed amplicon sequencing and transcriptome profiling in single cells
2019-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-018-0259-9
PMID:30559431
|
研究论文 | 描述了一种名为DART-seq的技术，该技术能够在单细胞水平上同时进行多重扩增子测序和转录组分析 | DART-seq技术具有多功能性，能够在单细胞中同时进行多重扩增子测序和转录组分析 | NA | 开发和应用DART-seq技术，以在单细胞水平上同时进行多重扩增子测序和转录组分析 | 非A尾的片段dsRNA病毒转录本和感染细胞的转录组，以及B淋巴细胞的天然配对可变区域重链和轻链扩增子和转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 单细胞 |
| 25927 | 2024-08-09 |
Single-cell and single-molecule epigenomics to uncover genome regulation at unprecedented resolution
2019-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-018-0290-x
PMID:30559489
|
观点 | 本文探讨了单细胞和单分子表观基因组技术在揭示基因组调控和动态方面的最新进展 | 介绍了这些技术如何用于识别新的基因调控模式，并强调了表观基因组技术在理解细胞多样性和发现基因调控机制中的重要性 | NA | 探讨单细胞和单分子表观基因组技术在基因调控研究中的应用 | 单细胞和单分子表观基因组技术 | 表观基因组学 | NA | 单细胞和单分子表观基因组技术 | NA | 表观基因组数据 | NA |
| 25928 | 2024-08-09 |
Virus-inclusive single-cell RNA sequencing reveals the molecular signature of progression to severe dengue
2018-12-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1813819115
PMID:30530648
|
研究论文 | 本研究利用病毒包含的单细胞RNA测序技术，分析了登革热患者和健康对照者的外周血单个核细胞的转录组，以揭示登革热严重进展的分子特征 | 首次采用病毒包含的单细胞RNA测序技术，分析了登革热患者外周血单个核细胞中的病毒RNA，并识别了与严重登革热进展相关的特定免疫细胞亚型和基因表达模式 | 研究样本量较小，仅包括六名登革热患者和四名健康对照者 | 揭示登革热病毒感染导致严重并发症的分子机制，并寻找预测严重登革热进展的生物标志物 | 登革热病毒感染的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 登革热 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 六名登革热患者和四名健康对照者的外周血单个核细胞 |
| 25929 | 2024-08-09 |
High-affinity allergen-specific human antibodies cloned from single IgE B cell transcriptomes
2018-12-14, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aau2599
PMID:30545888
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了食物过敏个体的单个IgE B细胞的基因表达和剪接模式 | 发现了IgE抗体在无关个体中经历相同基因重排的趋同进化现象，并获得了对花生过敏原Ara h 2和Ara h 3的高亲和力和意外交叉反应性 | NA | 揭示IgE B细胞转录组学特性并促进对该抗体类的生化分析 | 食物过敏个体的单个IgE B细胞 | 免疫学 | 过敏反应 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自食物过敏个体的单个IgE B细胞 |
| 25930 | 2024-08-09 |
MISC: missing imputation for single-cell RNA sequencing data
2018-12-14, BMC systems biology
DOI:10.1186/s12918-018-0638-y
PMID:30547798
|
研究论文 | 本文提出了一种名为MISC的新模型，用于解决单细胞RNA测序数据中高比例缺失值的问题 | MISC模型采用混合机器学习方法，通过二分类问题转换和回归模型来恢复缺失数据，提高了细胞类型分类的准确性 | NA | 旨在准确恢复单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 机器学习 | 慢性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | 混合机器学习模型 | RNA-seq表达矩阵 | 慢性髓性白血病数据、小鼠大脑初级体感皮层和海马CA1区域细胞数据 |
| 25931 | 2024-08-09 |
Heterogeneous Responses of Hematopoietic Stem Cells to Inflammatory Stimuli Are Altered with Age
2018-12-11, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.11.056
PMID:30540934
|
研究论文 | 研究探讨了长期造血干细胞（LT-HSCs）在炎症刺激下对年龄的异质性反应 | 通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）识别了在老年LT-HSCs中普遍存在的一种偏向髓系的LT-HSC亚群（mLT-HSCs），并鉴定了CD61作为mLT-HSCs的标记物 | NA | 研究LT-HSCs在不同年龄下对炎症刺激的反应差异及其分子机制 | 长期造血干细胞（LT-HSCs）及其在不同年龄下的功能变化 | NA | 髓系白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 25932 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Mouse and hESC-Derived Pancreatic Progenitors
2018-12-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2018.11.008
PMID:30540962
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了来自Neurog3-Cre; Rosa26胚胎的小鼠胚胎日15.5和18.5的胰腺细胞以及hESC衍生的GFP+细胞，以研究胰腺内分泌前体细胞的特征 | 本研究首次详细描述了小鼠和hESC衍生的内分泌前体细胞的单细胞转录组特征，并揭示了与前体细胞、内分泌细胞或先前未描述的细胞状态相关的标记物 | NA | 研究旨在通过深入了解β细胞在胚胎发育过程中的形成机制，以改进hESC分化为功能性β样细胞的协议 | 研究对象包括小鼠胚胎胰腺细胞和hESC衍生的内分泌前体细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了6,905个小鼠胚胎日15.5的胰腺细胞、6,626个小鼠胚胎日18.5的胰腺细胞和4,462个hESC衍生的GFP+细胞 |
| 25933 | 2024-08-09 |
An integrated enrichment system to facilitate isolation and molecular characterization of single cancer cells from whole blood
2018-12, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.23599
PMID:30549400
|
研究论文 | 本文介绍了一种集成富集系统，用于从全血中高效分离和分子表征单个癌细胞 | 该系统结合了磁性分离器和声学微流控聚焦芯片，实现了与荧光激活细胞分选（FACS™）和单细胞测序的在线富集，提高了癌细胞的回收率和下游分析的兼容性 | 目前仅在体外实验中验证了该系统的有效性，尚未在临床样本中进行广泛验证 | 开发一种高效的方法来分离和表征循环肿瘤细胞（CTCs），以支持个性化医疗和癌症诊断 | 循环肿瘤细胞（CTCs）及其在全血中的分离和分子表征 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞mRNA测序 | NA | 细胞 | 体外实验中使用了掺入的外周血中的前列腺癌细胞 |
| 25934 | 2024-08-09 |
Insights Into Local Orbital Immunity: Evidence for the Involvement of the Th17 Cell Pathway in Thyroid-Associated Ophthalmopathy
2019-05-01, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/jc.2018-01626
PMID:30517642
|
研究论文 | 本研究探讨了甲状腺相关眼病（TAO）中眼眶免疫微环境与疾病发展的关联，并发现Th17细胞途径在TAO中的重要作用。 | 首次揭示了TAO眼眶微环境中Th17和Th2细胞反应的增加，以及CD34+眼眶成纤维细胞在促进Th17细胞表型中的作用。 | NA | 研究甲状腺相关眼病（TAO）中眼眶免疫微环境与疾病发展的关联。 | TAO和对照组的眼眶结缔组织。 | NA | 甲状腺相关眼病 | 单细胞测序、多色流式细胞术、共培养实验和western blotting | NA | 细胞 | TAO和对照组的眼眶结缔组织样本 |
| 25935 | 2024-08-09 |
GABA promotes β-cell proliferation, but does not overcome impaired glucose homeostasis associated with diet-induced obesity
2019-03, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201801397R
PMID:30509117
|
研究论文 | 本研究探讨了γ-氨基丁酸（GABA）对健康和糖耐量受损/肥胖小鼠β细胞的影响，发现GABA能增加β细胞数量，但对高脂饮食诱导的胰岛素抵抗和糖耐量受损无改善作用。 | 本研究首次揭示了GABA在单细胞水平上对β细胞增殖的影响，并发现GABA处理后β细胞中特定基因表达的变化。 | 研究未探讨GABA对β细胞功能长期影响的机制，且样本量较小。 | 探讨GABA对β细胞增殖及糖代谢的影响。 | 健康和糖耐量受损/肥胖小鼠的β细胞。 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本 |
| 25936 | 2024-08-09 |
Mesenchymal Precursor Cells in Adult Nerves Contribute to Mammalian Tissue Repair and Regeneration
2019-02-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.10.024
PMID:30503141
|
研究论文 | 本文提供了证据，表明受伤的外周神经提供了间充质前体细胞的储备，这些细胞可以直接参与小鼠指尖再生和皮肤修复 | 本文首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术，识别出在正常和受伤的成年神经中转录上不同的间充质细胞群，包括具有间充质前体细胞特征的神经嵴来源的细胞 | NA | 研究外周神经在调节组织修复和再生中的作用 | 间充质前体细胞在成年神经中的作用及其对组织修复和再生的贡献 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25937 | 2024-08-09 |
High-throughput single-cell transcriptomics on organoids
2019-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2018.11.002
PMID:30504008
|
研究论文 | 本文探讨了在类器官系统中使用高通量单细胞转录组学技术进行高分辨率分析的方法 | 结合单细胞基因组学和类器官技术，为个性化医疗带来深远影响 | NA | 分析和操控人类发育，生成疾病特定模型 | 从人类干细胞培养的三维组织（类器官） | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | RNA | 涉及大脑、肠道、肝脏和肾脏等组织的类器官细胞 |
| 25938 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing in ovarian cancer: a new frontier in precision medicine
2019-02, Current opinion in obstetrics & gynecology
IF:2.2Q2
DOI:10.1097/GCO.0000000000000516
PMID:30507625
|
研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序数据在指导卵巢癌治疗决策中的进展、应用和挑战 | 单细胞测序技术提供了表征卵巢癌肿瘤组织异质性的手段，并有机会确定影响临床结果的关键分子特性 | 大多数研究使用的是批量样本，导致数据代表所有细胞的平均值 | 提高对肿瘤细胞异质性的理解，以指导个性化癌症治疗 | 卵巢癌的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 25939 | 2024-08-09 |
Autocrine regulation of mesenchymal progenitor cell fates orchestrates tooth eruption
2019-01-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1810200115
PMID:30509999
|
研究论文 | 本文研究了牙囊中的间充质祖细胞在牙齿萌发过程中的自分泌调节机制 | 揭示了PTHrP-PPR自分泌信号如何维持牙囊中间充质祖细胞的生理细胞命运，以建立功能性牙周附着装置并协调牙齿萌发 | NA | 探讨牙囊中间充质祖细胞的身份及其如何受PTHrP-PPR信号调控 | 牙囊中的间充质祖细胞及其在牙齿萌发中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了tamoxifen-inducible小鼠进行细胞谱系分析 |
| 25940 | 2024-08-09 |
Advantages of Single-Nucleus over Single-Cell RNA Sequencing of Adult Kidney: Rare Cell Types and Novel Cell States Revealed in Fibrosis
2019-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2018090912
PMID:30510133
|
研究论文 | 本文比较了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）在成年小鼠肾脏中的应用，特别是在纤维化肾脏中的表现 | snRNA-seq在成年肾脏中实现了与scRNA-seq相当的基因检测，同时具有减少分离偏差、兼容冷冻样本、消除分离诱导的转录应激反应等优势 | NA | 探讨单核RNA测序在成年肾脏研究中的优势，特别是在纤维化肾脏中的应用 | 成年小鼠肾脏，特别是纤维化肾脏 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA序列 | 总共生成了11,391个转录组 |