单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 25901 - 25920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25901 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptional profiling reveals the heterogenicity in colorectal cancer
2019-Aug, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000016916
PMID:31441872
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析结直肠癌患者的癌细胞，揭示了其细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析结直肠癌的细胞异质性，提供了对癌细胞群中不同细胞类型的无偏见分析 | 研究仅基于单一结直肠癌患者的样本，可能限制了结果的普遍性 | 揭示结直肠癌的细胞异质性，并为后续研究提供深入见解 | 结直肠癌患者的癌细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2824个细胞 |
| 25902 | 2024-08-09 |
A Tool for Visualization and Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data Based on Text Mining
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00734
PMID:31447887
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研究论文 | 本文介绍了一种基于文本挖掘的单细胞RNA测序数据可视化和分析工具 | 该工具采用TF-IDF模型进行数据转换，适用于处理稀疏和零膨胀的单细胞数据，并展示了其在区分不同细胞类型方面的优越性 | NA | 开发一种适用于单细胞RNA测序数据的新型计算流程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | TF-IDF | 文本 | 数千个细胞 |
| 25903 | 2024-08-09 |
scHinter: imputing dropout events for single-cell RNA-seq data with limited sample size
2020-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz627
PMID:31392316
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研究论文 | 提出了一种名为scHinter的方法，用于在小样本量的单细胞RNA测序数据中填补丢失事件 | scHinter采用基于投票的集成距离和合成少数过采样技术进行随机插值，并嵌入了分层框架以提高小样本的填补可靠性 | NA | 开发新的填补方法，提高对不同样本量数据的通用性 | 单细胞RNA测序数据中的丢失事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小样本量 |
| 25904 | 2024-08-09 |
Using multiple measurements of tissue to estimate subject- and cell-type-specific gene expression
2020-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz619
PMID:31400192
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研究论文 | 本文开发了一种基于经验贝叶斯方法，利用多个组织测量数据来估计个体和细胞类型特异性基因表达的方法 | 提出了一种新的方法来整合组织水平的基因表达数据和单细胞RNA测序数据，以估计个体和细胞类型特异性的基因表达 | 单细胞RNA测序数据可能存在噪声，并且通常来自少数个体 | 开发一种方法来估计个体和细胞类型特异性的基因表达，并应用于识别基因表达数量性状位点 | 基因表达数据，特别是来自多个脑区的数据 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序 | 经验贝叶斯方法 | 基因表达数据 | 数千个个体 |
| 25905 | 2024-08-09 |
Alternating EM algorithm for a bilinear model in isoform quantification from RNA-seq data
2020-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz640
PMID:31400221
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研究论文 | 本文介绍了一种名为XAEM的新方法，用于从RNA-seq数据中进行isoform水平的基因表达估计，该方法基于一个更灵活和稳健的统计模型，并使用交替期望最大化（AEM）算法进行实现 | XAEM方法考虑了Xβ作为一个双线性模型，其中X和β都是未知的，并通过多样本RNA-seq数据的联合分析进行联合估计，自动执行潜在未知偏差的经验校正 | NA | 开发一种新的方法来提高从RNA-seq数据中估计isoform水平基因表达的准确性 | RNA-seq数据中的isoform水平基因表达 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 双线性模型 | RNA-seq数据 | 多样本RNA-seq数据 |
| 25906 | 2024-08-09 |
Single-Cell Survey of Human Lymphatics Unveils Marked Endothelial Cell Heterogeneity and Mechanisms of Homing for Neutrophils
2019-09-17, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.06.027
PMID:31402260
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术对33,000个人类淋巴结中的淋巴管内皮细胞（LECs）进行了全面分析 | 揭示了六种主要类型的人类LECs，并发现了髓质淋巴管内皮细胞在人类免疫中的新作用 | NA | 全面表征淋巴管内皮细胞的异质性，并揭示其在人类免疫中的新角色 | 人类淋巴结中的淋巴管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 33,000个淋巴管内皮细胞 |
| 25907 | 2024-08-09 |
Author Correction: Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ductal adenocarcinoma
2019-Sep, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-019-0212-1
PMID:31409908
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correction | 对一篇关于单细胞RNA测序揭示胰腺导管腺癌内肿瘤异质性和恶性进展的论文进行修正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25908 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq identifies a reversible mesodermal activation in abnormally specified epithelia of p63 EEC syndrome
2019-08-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1908180116
PMID:31413199
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研究论文 | 本研究利用人诱导多能干细胞（iPSCs）建立了表皮分化模型，并分析了p63突变导致的EEC综合征患者iPSCs的分化缺陷 | 首次揭示了p63突变导致的表皮分化缺陷可以通过抑制中胚层诱导来逆转 | NA | 探究p63突变导致的表皮分化缺陷的细胞和分子机制，并寻找潜在的治疗策略 | p63突变导致的EEC综合征患者iPSCs的分化缺陷 | 数字病理学 | 发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 25909 | 2024-08-09 |
Dissecting the heterogeneity of DENV vaccine-elicited cellular immunity using single-cell RNA sequencing and metabolic profiling
2019-08-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-11634-7
PMID:31413301
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和代谢分析技术，探讨登革病毒疫苗引发的细胞免疫异质性 | 首次通过单细胞RNA测序和TCR克隆型纵向分析，识别出急性激活和克隆扩增的T细胞特有的转录特征，这些特征与记忆前体CD8 T细胞的持久性相关 | NA | 揭示登革病毒疫苗引发的T细胞免疫的分子机制 | 登革病毒疫苗引发的T细胞免疫 | 疫苗学 | 登革热 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25910 | 2024-08-09 |
m6A RNA Methylation Maintains Hematopoietic Stem Cell Identity and Symmetric Commitment
2019-08-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.07.032
PMID:31412241
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研究论文 | 本研究探讨了m6A RNA甲基化在维持造血干细胞身份和对称分化中的作用 | 首次揭示了m6A RNA甲基化在控制造血干细胞对称分化中的具体机制 | NA | 研究m6A RNA甲基化如何影响造血干细胞的对称分化 | 造血干细胞及其对称分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自对照组和Mettl3条件敲除小鼠的造血干细胞和祖细胞 |
| 25911 | 2024-08-09 |
BERMUDA: a novel deep transfer learning method for single-cell RNA sequencing batch correction reveals hidden high-resolution cellular subtypes
2019-08-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1764-6
PMID:31405383
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研究论文 | 本文介绍了一种名为BERMUDA的新型深度迁移学习方法，用于单细胞RNA测序数据的批次效应校正，揭示了隐藏的高分辨率细胞亚型 | BERMUDA通过深度自编码器基于迁移学习的方法，有效结合不同批次的scRNA-seq数据，增强生物信号 | NA | 利用单细胞RNA测序技术识别细胞谱系和真实转录信号，通过整合多实验数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度自编码器 | 基因表达数据 | 多个模拟和真实scRNA-seq数据集 |
| 25912 | 2024-08-09 |
Biological Significance of Tumor Heterogeneity in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2019-Aug-12, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers11081156
PMID:31409002
|
综述 | 本文综述了食管鳞状细胞癌（ESCC）的肿瘤异质性及其分子特征，重点讨论了基因组异常及其对癌症进化轨迹的功能贡献 | 介绍了单细胞测序和三维类器官等新型实验工具在理解肿瘤异质性方面的应用 | NA | 探讨肿瘤异质性的机制及其在开发食管鳞状细胞癌精准治疗中的潜力 | 食管鳞状细胞癌的肿瘤异质性 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 25913 | 2024-08-09 |
Mono- and multi-nucleated ventricular cardiomyocytes constitute a transcriptionally homogenous cell population
2019-08-09, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-019-0744-z
PMID:31399804
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了单核和多核成年心肌细胞的转录组特征，并探讨了在压力诱导的心脏肥大条件下心肌细胞的异质性 | 首次揭示了单核和多核心肌细胞在转录水平上的高度相似性，并阐明了心脏肥大过程中由于血管生长不均导致的细胞异质性 | 研究中非图像质量控制允许包含受损心肌细胞，导致人工细胞簇的形成，表明需要严格的排除标准 | 确定单核和多核成年心肌细胞的转录组特征，并研究在基础条件和压力诱导的心脏肥大中心肌细胞的异质性 | 单核和多核成年心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自健康和肥大心脏的单核和多核心肌细胞 |
| 25914 | 2024-08-09 |
High-dimensional analysis reveals a pathogenic role of inflammatory monocytes in experimental diffuse alveolar hemorrhage
2019-08-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.129703
PMID:31391335
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研究论文 | 本文通过高维分析揭示了炎症性单核细胞在实验性弥漫性肺泡出血中的致病作用 | 首次通过高维分析和单细胞RNA测序揭示了炎症性单核细胞在弥漫性肺泡出血中的关键作用，并发现干扰素调节因子8在疾病发展中的重要性 | NA | 探究弥漫性肺泡出血的病理生理机制及潜在治疗靶点 | 炎症性单核细胞在弥漫性肺泡出血中的作用 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮相关并发症 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用小鼠模型进行研究 |
| 25915 | 2024-08-09 |
Landscape of Intercellular Crosstalk in Healthy and NASH Liver Revealed by Single-Cell Secretome Gene Analysis
2019-08-08, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2019.07.028
PMID:31398325
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康和非酒精性脂肪肝（NASH）小鼠肝脏中非实质细胞的细胞间通讯网络 | 揭示了肝脏中细胞间信号传递的全局景观，并发现了NASH相关巨噬细胞（NAMs）和肝星状细胞（HSCs）在疾病中的新作用 | NA | 阐明健康和NASH状态下肝脏细胞间通讯的全球景观 | 健康和NASH小鼠肝脏中的非实质细胞 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康和NASH小鼠肝脏样本 |
| 25916 | 2024-08-09 |
Locally renewing resident synovial macrophages provide a protective barrier for the joint
2019-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1471-1
PMID:31391580
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研究论文 | 本文通过命运图谱、三维光片荧光显微镜和单细胞RNA测序技术，全面分析了健康和炎症关节中巨噬细胞亚群的组成、起源和分化，并研究了这些巨噬细胞在关节炎中的作用 | 发现了一种由CXCR1组织驻留巨噬细胞组成的动态膜状结构，这些巨噬细胞在滑膜衬里形成内部免疫屏障，通过紧密连接介导的盾牌限制炎症反应 | NA | 研究巨噬细胞在炎症性关节疾病中的确切起源和作用 | 健康和炎症关节中的巨噬细胞亚群 | NA | 风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 25917 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Transcriptome Helps Define the Limbal/Corneal Epithelial Stem/Early Transit Amplifying Cells and How Autophagy Affects This Population
2019-08-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.19-27656
PMID:31419300
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research paper | 利用单细胞RNA测序技术研究了野生型和自噬缺陷小鼠的角膜/结膜上皮干细胞及其早期过渡放大细胞，并探讨了自噬对这些细胞群体的影响 | 通过单细胞RNA测序技术，首次揭示了角膜/结膜上皮细胞的多个亚群及其分子特征，并发现了新的干细胞/早期过渡放大细胞调控因子 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人类样本中验证这些发现 | 探索角膜/结膜上皮干细胞及其早期过渡放大细胞的分子特征，并研究自噬对这些细胞群体的影响 | 野生型和自噬缺陷小鼠的角膜/结膜上皮细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | t-分布随机邻域嵌入 | 基因表达数据 | 野生型和beclin 1缺陷（beclin1+/-）小鼠的眼部前段组织 |
| 25918 | 2024-08-09 |
The single-cell sequencing: new developments and medical applications
2019, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-019-0314-y
PMID:31391919
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术的最新进展及其在肿瘤学、微生物学、神经学、生殖学、免疫学、消化系统和泌尿系统中的应用 | 介绍了单细胞测序技术在多个医学领域的最新应用 | NA | 探讨单细胞测序技术在医学领域的应用 | 单细胞的基因组、转录组及其他多组学特征 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组等多组学数据 | NA |
| 25919 | 2024-08-09 |
Growth Hormone Promotes in vitro Maturation of Human Oocytes
2019, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2019.00485
PMID:31396155
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研究论文 | 本研究探讨了生长激素（GH）在体外成熟（IVM）人卵母细胞中的作用 | 首次系统研究了生长激素在人卵母细胞IVM中的应用，并通过单细胞RNA测序分析了其对基因表达的影响 | 研究仅限于特定的生长激素浓度和特定的人卵母细胞样本 | 提高人卵母细胞体外成熟的成功率 | 人卵母细胞及其在体外成熟过程中的基因表达 | 生殖医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了不同浓度的生长激素处理的人卵母细胞样本 |
| 25920 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of T Cells
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9728-2_16
PMID:31396939
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研究论文 | 本文提供了一个实验和计算工作流程，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析T细胞 | 介绍了使用scRNA-seq技术研究T细胞异质性的新途径，并讨论了其在T细胞生物学中的未来方向 | 讨论了当前方法在T细胞生物学中的局限性 | 探索T细胞的异质性，并提供一个可重现的生物信息学管道 | T细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从基于板的排序T细胞中提取的数据，使用流式细胞术和全长转录组协议如Smart-Seq2 |