单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27096 篇文献，本页显示第 25781 - 25800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 25781 | 2024-08-09 |
Microglial Function Is Distinct in Different Anatomical Locations during Retinal Homeostasis and Degeneration
2019-03-19, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.02.007
PMID:30850344
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研究论文 | 研究探讨了不同解剖位置的视网膜小胶质细胞在稳态和退化过程中的功能差异 | 首次展示了成年视网膜小胶质细胞在不同生态位中的功能差异，并揭示了其在视网膜退化模型中的转录重编程 | NA | 探究不同神经系统区域的小胶质细胞是否具有不同的功能 | 视网膜小胶质细胞及其在不同生态位中的功能 | NA | NA | 谱系追踪、单细胞转录组学、电生理学 | NA | 转录组数据 | 小鼠视网膜样本 |
| 25782 | 2024-08-09 |
Single cell RNA-seq identifies the origins of heterogeneity in efficient cell transdifferentiation and reprogramming
2019-03-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.41627
PMID:30860479
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了小鼠前B细胞向巨噬细胞的转分化及其向诱导多能干细胞（iPSCs）的重编程过程中的异质性 | 本文首次揭示了Myc活性在不同体细胞类型中对重编程效率的预测作用 | NA | 理解细胞转分化和重编程过程中的异质性 | 小鼠前B细胞的转分化和重编程 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠前B细胞 |
| 25783 | 2024-08-09 |
Insights into the Biology of Hearing and Deafness Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2019-03-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.02.053
PMID:30865901
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研究论文 | 本文介绍了一种从鼠类耳蜗中分离单个内毛细胞（IHCs）、外毛细胞（OHCs）和Deiters细胞（DCs）的方法，并利用单细胞RNA测序技术分析了这些细胞的转录组特征 | 本文首次成功分离并测序了从出生后15天到228天的鼠类耳蜗中的内毛细胞、外毛细胞和Deiters细胞，揭示了与耳聋相关基因的复杂异构体多样性 | NA | 深入了解听力和耳聋的生物学机制 | 鼠类耳蜗中的内毛细胞、外毛细胞和Deiters细胞 | 数字病理学 | 耳聋 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过200个鼠类内毛细胞、外毛细胞和Deiters细胞 |
| 25784 | 2024-08-09 |
Endothelial miR-30c suppresses tumor growth via inhibition of TGF-β-induced Serpine1
2019-03-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI123106
PMID:30855280
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研究论文 | 研究报告了在Cdh5-CreERT2 Tgfbr2fl/fl小鼠（Tgfbr2iECKO小鼠）中，通过后生删除Tgfbr2抑制血管内皮细胞（EC）中的TGF-β信号传导，从而抑制纤维蛋白介导的血管生成和肿瘤生长 | 通过使用血管趋向性纳米颗粒传递miR-30c antagomiRs绕过TGF-β信号传导，促进PAI-1依赖的肿瘤生长和增加纤维蛋白丰度，而miR-30c模拟物则抑制肿瘤生长并促进血管定向的纤维蛋白溶解 | NA | 研究miR-30c在肿瘤微环境中通过平衡EC中的Serpine1表达作为肿瘤抑制因子的功能 | 血管内皮细胞（EC）和肿瘤生长 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序，NanoString miRNA阵列 | NA | RNA | Cdh5-CreERT2 Tgfbr2fl/fl小鼠（Tgfbr2iECKO小鼠）的ECs，肺和乳腺肿瘤模型的ECs |
| 25785 | 2024-08-09 |
Generation and persistence of human tissue-resident memory T cells in lung transplantation
2019-03-08, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aav5581
PMID:30850393
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研究论文 | 研究了人类肺组织中记忆T细胞的生成、维持及其功能 | 首次在人类肺移植受者中追踪和定位供体和受体T细胞，并揭示了T细胞在肺移植中的持久性和功能 | NA | 探讨人类肺组织中记忆T细胞的生成、维持及其功能 | 人类肺组织中的记忆T细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 从人类白细胞抗原（HLA）不相容的肺移植受者中获取的气道样本 |
| 25786 | 2024-08-09 |
Evaluation of Wu et al.: Strengthening Single-Cell Bioinformatic Comparisons for Improving Organoid Differentiation
2019-03-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.02.010
PMID:30849359
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评论 | 本文是对Wu等人的论文《基于单细胞转录组学的人类PSC来源的肾脏类器官分化比较分析与改进》的同行评审过程的示例 | NA | NA | 展示对Wu等人论文的同行评审过程 | Wu等人的论文《基于单细胞转录组学的人类PSC来源的肾脏类器官分化比较分析与改进》 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 25787 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Cellular Heterogeneity of Pluripotency Transition and X Chromosome Dynamics during Early Mouse Development
2019-03-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.02.031
PMID:30840884
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠早期胚胎发育过程中EPI细胞的多能性转变和X染色体动态变化 | 首次揭示了EPI细胞在多能性转变过程中的三种细胞状态，并详细描述了X染色体在雌性胚胎中的重新激活和随机失活过程 | NA | 探究小鼠早期胚胎发育过程中EPI细胞的多能性转变和X染色体动态变化的分子机制 | 小鼠早期胚胎发育过程中的EPI细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 1,724个细胞 |
| 25788 | 2024-08-09 |
The Space-Time Continuum of Cortical Dysplasia
2019-01, Epilepsy currents
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/1535759718822039
PMID:30838928
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研究论文 | 本文探讨了mTOR通路基因突变在皮质发育不良中的作用 | 通过深度测序和单细胞测序技术，揭示了mTOR激活在皮质发育不良中的具体作用机制 | NA | 研究mTOR通路基因突变在皮质发育不良中的病理机制 | 皮质发育不良（FCD）和半巨脑症（HME）患者的大脑组织 | 神经科学 | 神经发育异常 | 深度测序，单细胞测序 | NA | 基因序列数据 | 66例FCD/HME患者的大脑组织 |
| 25789 | 2024-08-09 |
20 Years of Secretagogin: Exocytosis and Beyond
2019, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2019.00029
PMID:30853888
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综述 | 本文综述了钙结合蛋白Secretagogin在过去20年的研究进展及其在细胞信号传导中的作用 | 利用现代蛋白质组学技术，发现了大量Secretagogin的实际和潜在相互作用蛋白，揭示了其在神经细胞发育和成熟中的复杂作用 | NA | 回顾Secretagogin的最新发现，揭示其在细胞信号传导中的重要作用 | 钙结合蛋白Secretagogin及其相互作用蛋白 | NA | NA | 蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | NA |
| 25790 | 2024-08-09 |
Corrigendum: A Single-Cell Sequencing Guide for Immunologists
2019, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2019.00278
PMID:30863399
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25791 | 2024-08-09 |
State of the Future: Translational Approaches in Renal Cell Carcinoma in the Immunotherapy Era
2020-01-15, European urology focus
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.euf.2019.02.014
PMID:30827939
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review | 本文综述了在免疫治疗时代，肾细胞癌（RCC）中转化研究的新技术进展，特别是单细胞测序和基于PD-L1示踪剂的成像技术在生物标志物发现中的应用，以及体外肿瘤球体在创建肿瘤“免疫图谱”中的作用。 | 本文强调了单细胞测序和新型PD-L1示踪剂成像技术在RCC免疫治疗转化研究中的潜在价值，以及体外肿瘤球体在克服治疗抵抗中的应用。 | NA | 旨在通过新技术理解为何部分患者对免疫治疗无反应，并开发策略克服治疗抵抗，以识别哪些患者会对治疗有反应。 | 肾细胞癌（RCC）患者及其对免疫治疗的反应和抵抗机制。 | digital pathology | 肾细胞癌 | 单细胞测序 | NA | image | NA |
| 25792 | 2024-08-09 |
Therapeutic resistance and susceptibility is shaped by cooperative multi-compartment tumor adaptation
2019-Nov, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-019-0310-0
PMID:30824837
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研究论文 | 本文通过连续活检、下一代测序和单细胞转录组学技术，追踪了黑色素瘤自发性模型中多个细胞区室在一线治疗反应、复发和二线治疗干预期间的演变，揭示了治疗诱导的肿瘤复发中多个区室的变化及其对后续治疗效果的影响。 | 本文首次展示了治疗复发肿瘤在遗传稳定的情况下，通过肿瘤细胞分化状态、免疫浸润和细胞外基质（ECM）成分的显著变化，形成共享的抗性表型。 | 研究主要集中在黑色素瘤的自发性模型中，可能需要进一步的临床验证来证实这些发现。 | 探索肿瘤治疗抵抗和敏感性形成的机制，特别是在多区室肿瘤适应性方面。 | 研究对象包括肿瘤细胞、免疫细胞和细胞外基质等肿瘤微环境中的多个区室。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 下一代测序、单细胞转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 研究涉及多个肿瘤样本和细胞系 |
| 25793 | 2024-08-09 |
SinNLRR: a robust subspace clustering method for cell type detection by non-negative and low-rank representation
2019-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz139
PMID:30821315
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研究论文 | 本文提出了一种名为SinNLRR的新型单细胞RNA测序（scRNA-seq）细胞类型检测方法，基于相似性学习的非负和低秩表示的鲁棒子空间聚类方法 | 该方法通过在相似矩阵上施加非负和低秩结构，并采用交替方向乘子法解决优化问题，提出了一种自适应惩罚选择方法以避免对参数的敏感性 | NA | 开发新的scRNA-seq聚类方法以解决细胞异质性和多样性的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型检测 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 不同数据集 |
| 25794 | 2024-08-09 |
Destin: toolkit for single-cell analysis of chromatin accessibility
2019-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz141
PMID:30821321
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研究论文 | 本文介绍了Destin工具包，用于单细胞染色质可及性数据的生物信息学和统计分析 | Destin通过加权主成分分析进行细胞类型聚类，并利用现有基因组注释和公开的调控组数据进行加权，优于现有方法 | NA | 开发和评估一种新的生物信息学和统计框架，用于单细胞染色质可及性数据的全面分析 | 单细胞染色质可及性数据 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq | 加权主成分分析 | 单细胞数据 | 2088个成年小鼠前脑细胞 |
| 25795 | 2024-08-09 |
Compartmentalized distributions of neuronal and glial cell-surface proteins pattern the synaptic network
2019-08, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2019.01.025
PMID:30826628
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research paper | 本文总结了近期研究发现，表明来自神经元和胶质的细胞表面蛋白相互作用并协作，控制特定突触的连接性、结构和功能 | 本文强调了胶质细胞表面蛋白在塑造突触连接中的重要作用，这是以往研究中较少关注的 | NA | 探讨神经元和胶质细胞表面蛋白如何共同影响突触网络的模式 | 神经元和胶质细胞的细胞表面蛋白及其在突触连接中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 25796 | 2024-08-09 |
Cell lineage inference from SNP and scRNA-Seq data
2019-06-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz146
PMID:30820578
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研究论文 | 本文开发了一种方法，从scRNA-Seq数据中检测显著的、细胞类型特异性的序列突变，并展示了这些突变与表达数据结合可以提高重建模型的准确性 | 本文提出了一种新的方法，通过检测scRNA-Seq数据中的序列突变来重建细胞谱系，这种方法结合了表达数据，提高了模型的准确性 | 目前的方法存在局限性，如伪时间排序方法和使用CRISPR插入随机突变的方法都有其不足之处 | 开发一种新的方法来从scRNA-Seq数据中推断细胞谱系 | 研究对象包括scRNA-Seq数据和序列突变 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | RNA-Seq数据 | NA |
| 25797 | 2024-08-09 |
Conserved pathway activation following xenogeneic, heterotypic fusion
2019-06, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201801700R
PMID:30807240
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研究论文 | 本文研究了人类间充质干细胞与小鼠心肌细胞异种融合后的转录组变化，探讨了融合过程中是否涉及保守通路的激活 | 首次记录了在融合伙伴中潜伏的少数基因在杂交种中的表达，如人类生长激素1、小鼠核糖体蛋白S27和小鼠ATP合酶H转运线粒体Fo复合体亚基C2 | NA | 探索异种融合后细胞转录组的保守通路激活 | 人类间充质干细胞与小鼠心肌细胞的异种融合细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人类和小鼠的多种细胞类型 |
| 25798 | 2024-08-09 |
Role of alternative polyadenylation dynamics in acute myeloid leukaemia at single-cell resolution
2019-06, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2019.1586139
PMID:30810468
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序数据分析了急性髓系白血病（AML）中不同细胞类型的选择性多聚腺苷酸化（APA）动态变化 | 首次在单细胞分辨率下探讨了AML中不同细胞类型的APA动态变化，揭示了APA在白血病发展和红细胞生成中的广泛调控作用 | NA | 探讨急性髓系白血病中不同细胞类型的选择性多聚腺苷酸化动态变化 | 急性髓系白血病患者和健康个体的骨髓单个核细胞（BMMCs） | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 16,843个骨髓单个核细胞（BMMCs） |
| 25799 | 2024-08-09 |
Evolution of neuronal types and families
2019-06, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2019.01.022
PMID:30826503
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综述 | 本文综述了近年来在神经元和神经系统进化方面的概念进展，特别是通过比较单细胞转录组学来定义细胞类型，并探讨了如何利用单细胞数据识别和大规模比较神经元类型及其家族 | 利用比较单细胞转录组学方法，为解决神经元进化的关键问题提供了新的研究途径 | NA | 探讨神经元和神经系统的进化问题，包括神经元起源、神经元表型的趋同进化以及从简单神经网到复杂中央神经系统的转变 | 神经元类型及其家族，特别是脊椎动物前脑不同部位的GABA能神经元家族 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 25800 | 2024-08-09 |
A general computational approach to predicting synergistic transcriptional cores that determine cell subpopulation identities
2019-04-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz147
PMID:30820550
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研究论文 | 本文开发了一种新的计算方法，用于确定细胞群体中亚群的协同转录核心，这些核心决定了亚群的身份 | 该方法使用信息论度量来量化转录协同作用，并实现了一种新的算法来搜索最优协同核心，不依赖于任何候选基因或基因调控网络的先验知识 | NA | 开发一种计算方法来识别定义细胞亚群身份的转录因子协同组合 | 细胞亚群的转录因子协同组合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 八组已发表的单细胞RNA测序数据 |